Callen, Sam, Kensi és a sérült, eszméletlen Deek próbálnak kijutni Mexikóból, miközben a kartell főnöke rájuk vadászik.

Ellopják egy katonai öltözet prototípusát egy haditengerészeti bázisról és kirabolnak vele egy ékszerüzletet. A csapatnak meg kell találni, ki tulajdonította el, és mi a következő cél.

Callen és Sam egy hercegre vigyáznak, aki ellen merényletet próbáltak elkövetni. Kensi és Deeks az aktuális ügy mellett próbálják szervezni az esküvőjüket.

A csapat veszélyben van, ugyanis egy olyan sorozatgyilkos után nyomoznak, akinek ők is a listáján vannak.

Deeks aggódik Tiffany Williams miatt, akit letartóztattak mialatt egy titkos küldetésen vett részt. A csapat megpróbálja megmenteni a nőt a börtöntől.

Mosley gyanúsítottá válik egy bérgyilkos megölésében, és a csapatnak nyomon kell követnie őt, hiszen minden jel arra mutat, hogy a nő elárulta őket.

Egy fegyverkereskedő meggyilkolása kapcsán az NCIS csapata az Külügyminisztériummal közösen egy olyan bűncselekmény sorozatot próbál felderíteni, amelyeket egy különleges kiképzett elit katona hajthatott végre. Callen meglátogatja Anna Kolcheckz ATF ügynököt börtönben.

Ochoa igazgatóhelyettes azt a feladatot adja a csapatnak, hogy segítsenek egy, a szélsőséges katonai erőt támogató terrorista csoporttal szemben.

A csapat egy korrupt tanácsadó céget vizsgál, egy banki rablást követően. Közben továbbra is folyik a vizsgálat Kensi, Deeks, Sam és Callen ellen.

Az NCIS csapatához csatlakozik Nicole DeChamps különleges ügynök, hogy megtalálják az a PTSD-s tartalékos tengerészgyalogost, aki részegen egy veszekedést követően eltűnt.

Kensi és Deekes a nászútjukat tervezik, de nem tudnak megegyezni. Közben érkezik egy ügy, melyben egy esetleges terrorista fenyegetést kell kivizsgálni. Kiderül hogy a haditengerészeti állomás logisztikai főnökét valaki távol akarja tartani amíg ellopnak egy fegyvert.

A csapat egy kémiai fegyvereket gyártó cég után nyomoz. Kensi és Deeks találkoznak egy férfival, akit megtámadtak, ugyanis bizonyítéka van az elkövetők ellen.

The NCIS team partners with the FBI to locate a terrorist cell in Los Angeles believed to be preparing for an imminent attack.

As the team continues to search for a terrorist cell in Los Angeles, Callen and Sam remain trapped in a movie theater after multiple bombs have detonated and every remaining exit is wired with explosives.

The NCIS team investigates the murder of a journalist who was writing an exposé on a mishandled classified military operation. Also, as their wedding day quickly approaches, Kensi and Deeks work on the last remaining items on their to-do list.

After months of planning, the NCIS family celebrates the wedding of Kensi and Deeks. Also, an old acquaintance, Anatoli Kirkin, pays Deeks a surprise visit on his wedding day and he isn’t alone.

Sydney turns to her sister Nell for help after her high school crush, Andre Martinez, is mixed up in a Russian plot to steal intelligence from the Department of Defense. Also, Special Prosecutor John Rogers conducts mandatory performance reviews with the team.

Sam assists a Department of Justice agent with locating a former U.S. boarder patrol officer who disappeared after the cartel threatened him; Kensi partners with a special agent from the Criminal Investigative Department to recover a stolen hard drive with sensitive military information.

After a Navy Seal is attacked while moonlighting at a security job for a successful marijuana dispensary, Sam personally vows to apprehend the suspect out of respect for the Navy Seal brotherhood

After Anna Kolcheck escapes from prison with her cellmate, Callen and the NCIS team assist with the investigation and search for her whereabouts.

The NCIS team travels to Cuba for an unsanctioned mission after Callen gets a lead on Anna Kolcheck's (Bar Paly) whereabouts.

Callen and Sam travel to the USS Allegiance in the Persian Gulf to work with Navy Captain Harmon "Harm" Rabb, Jr. (David James Elliott) when the NCIS team uncovers ISIS sympathizers who are targeting military locations.

Callen and Sam work with Navy Captain Harmon "Harm" Rabb, Jr. (David James Elliott) to locate a group of ISIS sympathizers aboard the USS Allegiance. Also, Hetty enlists her friend, Lieutenant Colonel Sarah "Mac". Mackenzie (Catherine Bell), to help obtain information from a Russian diplomat.