אדם מסתורי במסכה ושמו "קיוטי" משחרר את חברי "הלהקה" מהכלא וממנה עצמו כמנהיג הלהקה במטרה לנקום בגרגולים. הכעס של לקסינגטון כלפי "הלהקה" מעכיר את כושר שיפוטו ומסכן את השבט.

אנשים נחטפים מרחובות העיר ונופלים לידי ניסויים גנטיים שאמורים להפוך אותם ליצורים דמויי גרגולים. שלא במפתיע, שובל הראיות מוביל למעבדותיו של זאנאטוס.

קולדסטון מתעורר שנית, אך בעקבות הנזק הנרחב שנגרם למערכותיו הוא מבולבל לחלוטין ואינו מסוגל לשלוט בפעולותיו.

חפירות ארכאולוגיות חושפות מגילות עתיקות עם לחשיו של מרלין. מקבת שולח שכירי חרב להשיגן, אך הגרגולים מצליחים למנוע זאת. במהלך המבצע נפרדים האדסון וברודוויי כשבידי כל אחד מגילה.

דימונה גונבת ראי קסום על-מנת לזמן שדון קסום בשם פאק, כדי שתוכל לגרום לו להשתמש בקסמים שלו נגד גוליית ובני האנוש. אולם התוצאה כלל אינה מה שהיא ציפתה לה.

מאט נעלם לפתע בעודו עוסק באובססיה הקטנה שלו - האילומינטי, וברודוויי מתעקש להתלוות אל החקירה של אליסה בעקבותיו.

זאנאטוס מציע נישואין לפוקס, ובמתנה מעניק לה את עינו של אודין. זמן קצר לאחר מכן מופיע בעיר יצור ענק דמוי זאב המשמיד כל הדבר העומד בפניו בחיפושיו אחר מזון.

זאנאטוס ופוקס נישאים והחתן המיועד מבקש מגוליית להיות לו לשושבין. שלא במפתיע, זו מתבררת כעוד אחת ממזימותיו של זאנאטוס, הפעם בניסיון להשיג את "שער הפיניקס".

בעוד דימונה מתכוננת להטיל לחש על העיר כולה על-ידי שידורו בטלוויזיה, היא נזכרת בחייה בתקופה שלאחר הפיכתם לאבן של גוליית ויתר הגרגולים.

הגרגולים מתעוררים ומגלים שכמעט כל תושבי ניו-יורק הפכו לאבן. כאלף שנים קודם לכן, אדם צעיר בשם מקבת חייב להחליט כמה הוא מוכן להקריב בשביל האהבה.

זאנאטוס מנסה להסיר את הלחש בזמן שסיפורו של מקבת מגיע לעימות בינו לבין אחיו, המלך, לאחר שאחיות הגורל צופות את עלייתו של מקבת לכס המלוכה של סקוטלנד.

התוכנית להסרת הלחש יוצאת לפעולה, אך לדימונה יש כוונה לסקל אותה. בינתיים בעבר, מקבת חייב להחליט האם הברית שלו עם הגרגולים חשובה יותר ממלחמה עם אנגליה.

מקבת ודימונה עובדים יחדיו - הם גונבים את קולדסטון ומשתמשים בו כפתיון כדי לפתות את הגרגולים לתוך מלכודת. אליסה נאלצת להתמודד מול דימונה כדי להציל את השבט.

סייבר-ביוטיקס משיקה מבצר אווירי חדש, ובעקבות חשד כי זאנאטוס עלול לנסות משהו, גוליית עוקב אחריו מקרוב. אלא שהבעלים מחכה לו, רוצה לנקום על חורבן המבצר הקודם.

מקבת משליך אבקת קסם על האדסון, ולמחרת הגרגול הזקן נשאר לישון באבן בעוד האחרים מתעוררים...

מאט בלוסטון מגלה סוף סוף את האמת על גרגולים בזכות אדם מכת האילומינטי, כדי לפצות על שקריה של אליסה, מאט מגייס את עזרתו של גוליית כדי לחשוף את האילומינטי, שמבקשים לתפוס אותו.

תצפיות מסתוריות של גרגול שנראה ונשמע כמו גוליית מובילים את גוליית ואת ואליסה אל השיבוט שלו - 'תיילוג', שמשתמש בשלושת "אבותיו": גוליית, זאנאטוס וסבריוס, כדי להשיג שליטה באנושות.

לאחר שהלהקה מובסת על-ידי הגרגולים בפעם המי יודע כמה, זאנאטוס מציע להם גופים קיברנטיים חדשים ומשופרים.

דרייקון מופתע לגלות שמישהו מגן על חייו, השוטרת - אליסה מאזה.

אליסה, שנזכרת באחיה במהלך התכנסות משפחתית, מחפשת אחר מטאלון בניסיון לתקן את מערכת היחסים ביניהם. היא נכשלת, אך מיידעת אותו כי סבריוס לא מת. זמן קצר לאחר מכן, הרופא נעלם.

המשטרה מוצאת אדם מוזר הלבוש בשיריון קרב שלם וחרב מסתובב בעיר... לדבריו הוא מחפש אחר מפלצת בשם גוליית. וכך יוצאת החבורה לחקור את הנסיבות שהביאו את אדם זה למציאות שלהם.

אחרי שהם מגלים על האיום של הקוסם, גוליית, אליסה, וברונקס מגיעים לאבלון כדי לגלות מה עלה בגורל בני בריתם האנושיים לאחר שגוליית הצטרף לשבט שלו בשינת האבן שלהם לפני 1000 שנים.

כשמזימתו של הקוסם מתקרבת לשלמותה, גוליית מחליט שעליהם להשיג את אחד הפריטים שנותנים לו את כוחו. אליסה והמאגוס חוקרים את האגדה הישנה על המלך הישנוני - ארתור פנדרגון.

הקסם של אבלון שולח את החבורה בחזרה לטירת ויוורן, שם משהו מתחיל לשחק בתפיסת המציאות של גוליית, ומזכיר לו זכרונות ישנים וכואבים.

כמה מילדיו של אוברון חיים בעולם האנושי, אך אסור להם להתערב ישירות בענייני בני האדם. אנג'לה נראית אינטליגנטית מאוד וצייתנית, בעוד גוליית מזנק לפני שהוא מסתכל.

בנסיון למצוא את מנהטן שוב באמצעות הקסם של אבלון, הם מגיעים בסופו של דבר ללוך נס, שם סביירוס מנסה לתפוס את המפלצת המפורסמת עבור הניסויים שלו.

גוליית והאחרים מוצאים עצמם בפראג, שם רב מנסה לעורר מחדש את הגולם כדי להגן על האזרחים מפני הפשע המאורגן.

בפריז, החברה נתקלת בדימונה, תיילוג ומקבת, בתוך משולש של בגידה.

לאחר שהוא נשלח ללונדון, גוליית נתקל בשרידים של שבט גרגולים מקומי, אלא שהוא מואשם בגרימת מותו של אחד מהם - 40 שנים קודם לכן.

במצרים, החבורה מוצאת את הלהקה עובדים על עוד אחת ממזימותיו של זאנאטוס - בניסיון לחלץ אלמותיות מתוך ידיו של אל המוות בעצמו.

כשהם מודאגים לגבי אליסה וגוליית, הגרגולים הנותרים מחפשים אחר רמזים למקום הימצאם. ברוקלין יוצר קשר עם טאלון, ומגלה מאבק כוחות המתפתח בין המוטנטים.

באירלנד, גוליית, אליסה ואנג'לה מוצאים את עצמם לכודים בידי הבאנשי, שמאמינה שהם שליחיו של אוברון שהגיעו להחזיר אותה לאבלון.

בני אדם שהופכים לפנתרים (או פנתרים שהופכים לבני אדם), ציידים ואמא של אליסה ממתינים לחבורה כשהם מגיעים לניגריה.

בעודו מחפש אחר אקסקליבר בלונדון, ארתור פוגש את גריף, ויחד הם נשלחים למנהטן על ידי אבן הגורל שם, כך נאמר, שוכנת החרב. למרבה הצער, מקבת' חש בקסם רב העוצמה.

In Norway, the company is met by a mysterious one-eyed man who wants the Eye of Odin. When Goliath refuses to give it to him, he says they will regret it... especially Elisa, who isn't dressed for the cold.

In the middle of nowhere, the company finds the hidden city of New Olympus, where the creatures of Greek myth have retreated, and humans are outlawed.

Cyberbiotics are cutting down the rainforest in Guatemala, and have hired Jackal and Hyena to take care of the local Gargoyle clan.

Arriving on Easter Island, Elisa is taken by a strange being. When she is found again, she has no memories of herself... or the gargoyles.

Gargoyles and humans have lived in peace in a Japanese village for centuries, but a businessman plans to exploit that trust for financial gain.

Xanatos is buying up Native American land, and Elisa's father and sister decide to find out what he plans to do with it.

The company hopes for some rest upon returning to Avalon. But the peace is short lived, as Oberon appears, demanding that humans and gargoyles leave the island to make way for the return of his children.

Fortune smiles upon the company, as they spot the Statue of Liberty through the mists. The city is not as they left it... Rather, it is a devastated ruin controlled by Xanatos' robot sentries.

Oberon has gathered his children... save one. Puck remains somewhere in the mortal realm, and Oberon takes a gargoyle hound to Manhattan to track him. Meanwhile, Xanatos' and Fox's families have their own gathering to celebrate a birth.

Oberon besieges Xanatos' skyscraper, determined to let nothing stand between him and the child.

Three vengeful souls seek to make the gargoyles pay for ruining their lives.

Tomas Brod tries to establish himself in New York by throwing out Dracon. Having infiltrated his gang, Elisa ends up right in the middle.

When the Manhattan Clan captures Demona, they and the Mutates decide to be her permanent jailers, unaware that they are falling into an elaborate trap.

Puck's first magic lesson for Alexander causes no end of confusion amongst the gargoyles, as they transfer two of Coldstone's personalities into Broadway and Angela, while possessing two other gargoyles themselves.

Elisa is transferred to the night shift and given a new partner. Demona is stealing large quantities of a powerful disinfectant from Xanatos. And there's a new hunter in town, out to make sure every last gargoyle is dead...

Goliath swears revenge against the Hunters for what they did to Angela, and flies out to take the battle to them.

After learning that the Clan survived the destruction of the clock tower, the Hunters expose their existence to the public while Demona prepares her masterplan to exterminate humanity.