Jarod se fait interner dans un asile pour aider une jeune femme retenue prisonnière et droguée par un médecin qui a commis un meurtre... Tout le monde sort indemne de l'explosion provoquée par Sydney, sauf ce dernier qui est devenu aveugle. Mr Parker fait croire à sa fille qu'on lui a imposé un nouvel assistant. Il s'agit en fait de Lyle, qu'il a lui-même nommé à ce poste. Que cherche-t-il à cacher ?...

Jarod a enfin trouvé celui qui pourrait lui révéler l'identité de son père : un Indien qui répond au nom de Mike Brodie. Mais l'homme, poursuivi par des chasseurs de primes, prend la fuite. Jarod s'introduit chez lui et comprend qu'il est engagé dans la lutte contre une compagnie minière. Il est surpris dans ses investigations... Un peu plus tard, un passionné d'histoire locale lui apprend que son père avait sauvé Brodie, alors que celui-ci s'était égaré dans le désert. De son côté, Parker croit découvrir l'arme qui servit à tuer sa mère...

Après avoir vu un reportage sur la disparition d'une jeune fille, Sarah Rickman, Jarod abandonne la mission qu'il s'était fixée en Floride et visionne une simulation au cours de laquelle Sydney lui demandait de résoudre l'enlèvement d'une petite fille, Annie...

Jarod rencontre Tom Binner, un avocat chargé de recruter des incendiaires assez habiles pour maquiller leur travail criminel. Il agit pour le compte de Harold Kincaid, propriétaire de luxueuses demeures qui touche d'énormes primes d'assurances quand elles partent en fumée. Ce Kincaid engage Jarod, lequel avait fait la connaissance de son épouse, Kristi, dans un restaurant, où elle offrait sa place à un sans-abri....

Mlle Parker informe Broots d'une faille dans son nouveau logiciel de sécurité : trois dossiers secrets ont ainsi été transférés à l'annexe du Centre. Elle lui demande d'enquêter pour savoir qui a eu accès à ces informations confidentielles... Broots commence ses recherches à l'annexe quand un individu masqué surgit soudainement et abat tous les techniciens. Il pourchasse ensuite Broots, miraculeusement indemne mais qui est un témoin génant. Soupçonné de surcroit par le Centre d'être l'auteur du massacre, le fugitif doit se cacher...

Caché à San Diego, Jarod falsifie des rapports de police et des documents de justice afin de s'infiltrer dans le pénitencier de Mayfield : il prend l'identité d'un certain Robert Harmon qui aurait été tué lors d'un cambriolage. Une fois dans les murs, il reçoit un étrange avertissement de Jack Brevins, l'officier chargé de le libérer sur parole. Celui-ci fait comprendre au Caméléon qu'il a le pouvoir de le faire réincarcérer, sur un simple appel téléphonique. Jarod trouve à sa sortie Brevins qui lui remet un sachet contenant de l'héroïne. Il n'est pas au bout de ses surprises. De retour chez lui, il découvre une inconnue sous la douche...

Mlle Parker et Lyle apprennent que Jarod a détourné soixante millions de dollars sur les comptes bancaires du Centre. Broots tente de retrouver la trace des fonds manquants. Pendant ce temps, Jarod, qui se fait passer pour un marchand d'armes, rencontre Desmond Blake, un client. Il lui fait tester un lance-missiles sur la voiture, volée, de Lyle. Impressionné, Blake lui passe commande et demande que les armes soient livrées chez lui au Vénézuela...

Le fils de Sydney, Nicolas, est un bénévole qui apprend la lecture aux illettrés dans les Appalaches. Il se fait enlever, avec son groupe, par une milice qui réclame un million de dollars en échange de leur libération...

Jarod se fait passer pour le nouveau professeur d'une classe de petits génies qui étudient l'esprit criminel. Lorqu'il retrouve le corps de Clark, le précédent professeur disparu un an auparavant, il suspecte certains de ses élèves d'avoir voulu commettre le crime parfait...

Mlle Parker, Lyle, Sam et Willie capturent, dans le repaire de Jarod, un certain Francis. L'homme leur apprend qu'un mystérieux Mr Lee est lui aussi sur les traces de Jarod. Pendant ce temps, dans un entrepôt de Chinatown, Mr Lee, un aveugle, s'entretient avec quelqu'un au téléphone. Il explique à son interlocuteur qu'il a lu tous les dossiers concernant Jarod et qu'il doit maintenant interroger sept personnes ayant eu des contacts avec lui. Après cela, il sera en mesure de retrouver le Caméléon...

Jarod retrouve à Atlantic City son vieil ami Argyle. Ce dernier s'est embarqué dans une sale affaire en empruntant une somme importante à un gros bonnet, Sonny Faddis...

Jarod est en train de boire un verre dans un bar quand il aperçoit une jeune fille qui s'apprête à abattre un homme. Il l'en empêche...

Jarod envoie à Mlle Parker un paquet contenant un rosaire. Lorsque cette dernière découvre le contenu, elle s'évanouit en réclamant Faith, et est conduite à l'hôpital. De son côté, Jarod a un accident d'avion et s'écrase en plein milieu des montagnes...

Ryan, le nouvel ami de Jarod, est sérieusement blessé dans un accident de la route. Pour être sauvé, il doit avoir recours à la greffe d'un rein. Malheureusement, Cindy, sa mère, n'est pas compatible. Plus étrangement, son père ne l'est pas non plus...

Jarod remplace un animateur radio très controversé, Neil Roberts. L'homme a disparu à la suite d'une violente altercation avec un auditeur menaçant, qui se fait appeler «Les puissances au pouvoir».

Jarod prend l'identité d'un inspecteur du fisc pour piéger Hoyt et Winston, un avocat et son responsable de la sécurité. Les deux hommes sont en relation avec un trafiquant de drogue qui va passer en jugement. Mais tous les témoins disparaissent mystérieusement. De son côté, Mlle Parker annonce à son père qu'elle part vivre avec Thomas dans l'Oregon...

Mlle Parker s'est décidée à partir vivre avec Thomas dans l'Oregon. Elle s'apprête à lui annoncer la bonne nouvelle quand elle le découvre tué d'une balle dans la tête... La police la suspecte car Thomas a été abattu d'une balle de 9 mm, comme celles de son pistolet...

Jarod s'apprête à quitter Atlanta après l'arrestation d'un policier véreux. En écoutant les ondes radio de la police, il apprend qu'un jeune prodige des échecs, Bryce Banks, a été enlevé dans la nuit. Il enquête et découvre que Bryce disputait des parties sur l'internet, et qu'il avait rendez-vous, le soir où il a disparu, avec un certain Joshua. Il reçoit bientôt l'aide d'un célèbre "profiler" du FBI, Samantha Waters...

Note : 1ère partie d'un crossover avec Profiler. Suite et fin dans l'épisode 3.19 ...Et mat de la série Profiler.

Quelqu'un a tenté de s'infiltrer dans le système informatique du Centre. Il s'agit du major Charles, le père de Jarod. Ce dernier retrouve sa trace dans l'Arctique, à la base de recherches du Pôle Nord... Là, dans la peau d'un spécialiste des conditions climatiques, il apprend que, dans le cadre du projet "Alpha", le Centre menait des recherches sur le génome humain, et notamment sur le sien... Mlle Parker part elle aussi à la recherche du major Charles, qu'elle tient pour responsable de la mort de sa mère.

Jarod est toujours à la recherche du major Charles, son père. Il découvre l'existence d'un étrange projet Gemini financé par le Centre. Il part pour la Caroline du Nord où se trouve son père. Arrivé à l'adresse indiquée, Jarod constate qu'il a disparu. Il suit sa trace jusqu'à une école de pilotage et au siège d'une société... Pendant ce temps, Mlle Parker apprend, elle aussi, l'existence du projet Gemini, auquel était farouchement opposée sa mère...

Jarod est toujours à la recherche du major Charles, son père. Il découvre l'existence d'un étrange projet Gemini financé par le Centre. Il part pour la Caroline du Nord où se trouve son père. Arrivé à l'adresse indiquée, Jarod constate qu'il a disparu. Il suit sa trace jusqu'à une école de pilotage et au siège d'une société... Pendant ce temps, Mlle Parker apprend, elle aussi, l'existence du projet Gemini, auquel était farouchement opposée sa mère...