Проходит всего неделя после того, как обе Вселенные заключили договор и согласились работать вместе. Оливия расследует случай, когда агент Линкольн Ли стал свидетелем гибели своего напарника при загадочных обстоятельствах. Уолтер Бишоп видит Питера сначала в своей лаборатории, а затем и дома и очень пугается, так как думает, что сходит с ума.

В другой вселенной совершено 23 жестоких убийства, которые совершил профессор Джон МакКлеллан. Он скрылся, и подразделение «За гранью» попросило Оливию перевезти Джона МакКленнана из нашей вселенной, чтобы он смог помочь в поисхах другой своей версии. Уолтер начинает слышать голос Питера, просящего его о помощи.

Двое мальчиков, пропавших всего несколько часов назад были найдены мертвыми на последней стадии разложения. Уолтер понимает, что убил их некоторый аморфный организм типа плесени, который развил нейросистему наподобие человеческой. Уолтер продолжает видеть и слышать Питера и понимает, что помочь ему может только лоботомия. Оливия вовремя останавливает его и рассказывает Уолтеру, что видела того же человека во сне. Они понимают, что Питер - реальный человек.

Оливия обнаруживает опасные силы, которые могут быть связаны с прошлыми экспериментами кортексифана. Расследование заставляет Уолтера покинуть лабораторию впервые за многие годы и поехать в «Мэссив Дайнемик», чтобы изучить старые файлы. Уолтер испытывает сложности, так как он сталкивается лицом к лицу со страхами из прошлого.

События обостряются с появлением гибридов. Бывший сотрудник «Мэссив Дайнемик» неохотно становится частью событий. Нина Шарп присоединяется к Уолтеру в лаборатории.

Команда должна найти связь между временными сдвигами. Выясняется что их причиной являются электротехник Реймонд и его жена Кейт. Питер начинает подозревать что вернулся не в свой мир.

Какая-то невидимая сила убивает человека, и его тело начинает приобретать призрачный белый цвет. Это не единичный случай. Существуют основания связывать невидимого убийцу с кем-то, кто умер из-за неизвестной генетической болезни.

Оливия и Линкольн вынуждены принять срочные меры для борьбы с гибридами с прозрачной кожей. Одновременно они пытаются помочь Питеру найти дорогу домой.

Питер все ещё находится в параллельной реальности, где подразделение «За гранью» сталкивается со старым противником подразделения «За гранью» из другого времени.

Оливия все ещё не в себе от ужасного предостережения наблюдателя. А Питер и другие члены подразделения «За гранью» пытаются предупредить преступление с помощью девушки со сверхъестественной способностью предсказывать смерть.

Оливия, Питер и Уолтер сталкиваются лицом к лицу с загадочным и устрашающим сверхъестественным явлением. Более того, они оказываются в ловушке в городе, из которого нет выхода.

Команда «За гранью» изучает душевно больного человека, связанного с несколькими убийствами. Ужасающие улики и догадки приводят Оливию к шокирующему открытию.

Оливию похищает Джонс для эксперимента с лампочками. Вместе с ней похищают и Нину, которую используют как средство воздействия на Оливию. Команда пытается их отыскать. При изучении одной из зацепок в лабораторию приходит раненый Сентябрь.

После шокирующих и эмоциональных открытий Питер оценивает возможные пути решения проблем, которые у него есть. А в это время команда «За гранью» преследует убийцу, цель которого - любовь.

Подразделение сталкивается со случаем, который кажется Питеру очень знакомым, хоть и происходит в новой реальности. Уолтер очень рад тому, что Питер и Оливия вместе, и понимает, что ему очень не хватало семьи.

Действие происходит в параллельной вселенной. Агент Ли, доставлявший подразделению «За гранью» материалы о Дэвиде Роберте Джонсе, становится частью расследования дела о ранней версии оборотней. Это может вывести команду на след Джонса. Погибает капитан Ли.

В обеих Вселенных происходят идентичные трагедии. Подразделения «За гранью» объединяются, чтобы вместе выяснить в чем дело. Другая Оливия подозревает, что это дело рук Джонса и, после похорон напарника, пытается найти крота. Поиски предателя заканчиваются шокирующим открытием.

Альтернативное будущее. События происходят в Бостоне 2036 года. Наблюдатели захватили контроль над миром. Первое подразделение «За гранью» считается уничтоженным. Но девушка Генриетта с уникальными способностями обнаруживает команду в янтаре и, вызволяя их оттуда, находит то, что давно потеряла - своих родителей.

Обеспокоенный Уолтер собирает представителей всех версий подразделения «За гранью» на «мосту», полагая, что он понял замысел Джонса - создание нового мира, где законы физики созданы и контролируемы им самим. А тем временем, Джонс активирует детей, на которых испытывали кортексифан, чтобы создать коллапс двух миров. Старый друг Оливии отказывается ей помочь, и чтобы остановить разрушение, команды «За гранью» принимают решение о закрытии "моста". Агент Ли остается с другой Оливией в параллельной вселенной.

Команда «За гранью» обнаруживает, что эскалатор в торговом центре заражен нанитами, которые находясь в теле человека при движении вызывают спонтанное самовозгорание. Выжившая девушка по имени Джессика Холт вызывается добровольцем, чтобы помочь Уолтеру приготовить антидот. Выясняется, что заражение - дело рук Джонса. Уолтер понимает, что Джонс не мог создать таких совершенных нанитов, и думает, что это дело рук Уильяма Белла. Они с Астрид отправляются на его поиски. Тем временем Джонс готовит новый теракт, Питер и Оливия пытаются его остановить. Оливия открывает в себе много удивительных новых способностей, которые спасают Питеру жизнь.

Коллапс двух вселенных начался. Кусочки паззла складываются в голове у команды «За гранью». Они понимают, что Уильям Белл жив и похитил Уолтера на свой «Ковчег», чтобы разделить вместе с ним новый мир. Питер и Оливия пытаются остановить разрушение мира. Им придется пойти на необычайные жертвы, чтобы избежать необратимых последствий.