En el universo paralelo, Olivia se las ingenia para escapar de las garras de Walternativo y toma a un taxista, Henry, como rehén para trasladarse por Nueva York. Paralelamente, Walter y Peter se preparan para seguir sus vidas sin sospechar que Olivia en realidad es su versión alterna encubierta.

El equipo de 'este lado' está investigando un caso en el que la gente entra en un estado de trance que los lleva a la muerte. La principal sospechosa: una misteriosa caja. Mientras, la Olivia del otro lado se vuelve muy seductora.

Una serie de sucesos anómalos lleva a la División Fringe del "otro lado" a investigar incidentes mortales con inimaginables coincidencias. El equipo se encuentra en una carrera contra el tiempo para proteger a las víctimas potenciales. Mientras, el Secretario Bishop comparte su plan estratégico con el Coronel Broyles y Olivia se enfrenta a una visión de infarto.

Newton se ve obligado a despertar a un cambiaformas. Cuando Walter y el resto del equipo buscan pruebas, llevan la investigación a Massive Dynamic, donde 'la otra' Olivia da la alarma y Walter se mete en una situación peligrosa.

'La otra' división Fringe investiga una alteración de la seguridad producida cuando un chico libera a su gemelo de un área de cuarentena. Mientras tanto, el Walter alternativo experimenta con Olivia, a la que siguen persiguiendo visiones de Peter.

Cuando un secuestrador en serie del otro lado vuelve a actuar, el caso golpea emocional y familiarmente al coronel Broyles, quien manda a Olivia a obtener más información sobre los secuestros. Mientras tanto, Olivia se reencuentra con Henry, el taxista, para pedirle ayuda para volver a casa.

Olivia trata de volver a su universo y consigue ayuda de un aliado inesperado. Mientras tanto, la estratagema de la Olivia alternativa es descubierta, por lo que intenta huir hacia el otro lado.

El equipo investiga una serie de casos en los que se han extraído órganos vitales a las víctimas. Mientras tanto, Peter y Olivia empiezan a lidiar con los sentimientos encontrados que han albergado durante los últimos hechos que han vivido.

Un Observador contacta con el equipo para que le ayude a corregir un error que supuestamente ha sido cometido. Walter, por su parte, se hace amigo de su icono musical, Roscoe Joyce, teclista de su banda favorita, Violet Sedan Chair. Además, se entera del motivo de la separación del grupo, y se da cuenta de que sus vidas se solapan de una forma extraña e inesperada.

Al visitar Massive Dynamic, Walter se preocupa por la relación entre Peter y la superarma del otro lado, por lo que pide ayuda a Nina Sharp.

Un científico muere cuando sus huesos se desintegran después de aspirar una nube de polvo azul y el Centro de Control de Enfermedades sospecha que podría ser un ataque con armas biológicas. Alguien del pasado de Walter pero con lazos que le unen a Olivia accede a regañadientes a colaborar en la investigación del caso.

De vuelta en el universo alternativo, la ausencia del Coronel Broyles ha cambiado el funcionamiento de la División Fringe.

Una serie de eventos lleva al equipo Fringe a casa de una mujer que tiene encuentros con su marido muerto. Mientras, Peter y Olivia hacen todo lo que pueden par reparar la brecha emocional que los separa.

En 1985, Walter investiga cuál es el sentimiento que potencia las habilidades de la pequeña Olivia, y su mujer no consigue que Peter confíe en ella.

La División Fringe sigue la pista de unos ladrones capaces de desafiar la gravedad. Walter descubre antiguas investigaciones de William Bell.

Bell, en posesión del cuerpo de Olivia, promete que no le va a hacer daño y que va a dejar su cuerpo una vez que encuentre un huésped adecuado. Paralelamente, el equipo Fringe, con la ayuda de un agente del FBI, Lincoln Lee, siguen la pista de una mujer aparentemente inmortal llamada Dana.

La Olivia del 'otro lado' se hace pruebas para averiguar si padece una enfermedad. Lincoln averiguará cosas sorprendentes sobre su compañera.

Al darse cuenta de que el alma de Olivia está en peligro de desaparecer debido a la posesión de William Bell, el equipo lucha desesperadamente para extraer la consciencia de Bell del cuerpo de Olivia. Por eso, Peter y Walter entran en su mente, donde interaccionan con un Bell en forma de animación.

Una serie de acontecimientos provocados desde el otro universo hacen que la máquina construida en Massive Dinamics cobre vida propia. Peter cree que la única forma de detenerla, y con ello salvar al mundo, es introduciéndose en ella.

Una serie de tormentas secas amenazan la costa este de Estados Unidos. Olivia une fuerzas con el misterioso Sam Weiss en una lucha contrarreloj.

20 de mayo de 2026. La División Fringe del futuro tiene ciertos cambios, como la incorporación de la sobrina de Olivia, Elle Dunham, o la baja de Walter, que está en la cárcel. Pero las amenazas a las que se enfrentan parecen no tener solución, y para poder tener un futuro deberán enmendar errores del pasado.