Dopo la morte del suo psichiatra, Monk è profondamente depresso e decide di acquistare una nuova abitazione, che spera sia proprio la casa dei suoi sogni, dove c'è un'indagine sulla morte di un anziano che appare molto sospetta.

Linda Kloster è la moglie di un famoso giocatore di scacchi. Inaspettatamente Linda si presenta a casa di Monk lasciandogli un cospicuo assegno, perché è certa che suo marito la ucciderà e vorrebbe che Monk, dopo la sua morte, gliela facesse pagare scoprendo la verità...

Dietro il duplice omicidio di una conduttrice televisiva e di un appassionato del gioco del lotto, si nasconde una truffa ordita dal fonico dello studio in cui si effettua l'estrazione dei numeri vincenti. Ne rimangono implicati anche Natalie e il capitano Stottlemeyer...

Una direttiva impone a Monk di superare un difficile test di idoneità fisica per poter continuare a collaborare con la polizia come consulente. Essendo molto fuori forma, chiede a Natalie di aiutarlo ad allenarsi, ma la difficoltà della prova lo convince quasi ad arrendersi...

Natalie riceve la visita di un amico del suo defunto marito, un sottotenente della marina americana scosso dall'apparente suicidio di un suo amico, nonché comandante in seconda del sottomarino nel quale presta servizio.

Un criminale di guerra, noto per aver commesso stragi nel suo Paese, la Zemenia, rifugiatosi a San Francisco sotto le mentite spoglie di un anonimo tassista, viene trovato assassinato a bordo del suo taxi.

Il detective Adrian Monk deve risolvere il suo centesimo caso di omicidio. Il conduttore televisivo James Novak, che ha seguito e ripreso l'indagine con il permesso della Polizia di San Francisco, dà un party in onore di Monk, per assistere alla messa in onda del suo programma 'In Focus', in una puntata dedicata alla vita del detective, e alla possibile soluzione del caso: quattro belle giovani donne strangolate da un serial killer...

Monk sta indagando sulla scomparsa di Sally Larkin, un'attrice sposata ad un ricco immobiliarista dal quale si sta separando. Casualmente Monk incontra Harold, che gli consiglia il suo nuovo terapista, che cura tramite l'ipnosi. Monk, incuriosito, prende appuntamento e lo incontra...

Willie, un barbone, è stato ucciso e i suoi tre amici chiedono a Monk di investigare, in quanto si sentono in colpa per non aver creduto a Willie, che sosteneva di essere inseguito. La pista seguita dal detective porta ad un monastero che contiene una fontana dai poteri miracolosi.

Un uomo è ricercato per essere evaso dal carcere e aver ucciso Lindsey Bishop, un'assistente sociale molto benvoluta dai detenuti del penitenziario. Il fuggitivo irrompe in casa di Monk, che lo scopre. Sta per chiamare la polizia, ma si ferma quando l'uomo gli rivela di essere il suo fratellastro...

Mentre sta investigando il banale furto della bicicletta di proprietà di uno scienziato, l'amministratore delegato di un'azienda che si occupa di biotecnologie, nasconde in realtà un grave caso di spionaggio industriale, Monk viene raggiunto da un proiettile e costretto a muoversi con la sedia a rotelle.

Due importanti squadre di football stanno per disputare i playoff del campionato al Summit Stadium e Monk ha ricevuto due biglietti omaggio da un famoso giornalista sportivo. Stottlemeyer è al colmo della felicità poiché accompagnerà Monk alla partita.

Monk scopre con orrore che Roderick Brody, il nuovo cliente procuratogli da Natalie, è un suo vecchio compagno di scuola, che da piccolo lo terrorizzava, e a cui attribuisce gran parte delle sue fobie. Brody gli affida l'incarico di seguire la moglie Marylin, pensando che lo tradisca.

Kevin, un vicino di casa di Monk un po' invadente, oltre a essere commercialista, fa il mago dilettante, e si occupa della contabilità del grande mago Karl Torini, a cui fa presente che le compagnie aeree, probabilmente, gli fanno pagare un sovraccarico durante le tournée all'estero.

Il misterioso omicidio di una coppia di turisti tedeschi, ritrovati senza vita su di un molo nella baia, è collegato all'uccisione di una consigliera comunale. Monk si batte per evitare la demolizione del parcheggio dove morì sua moglie undici anni addietro, ma la sua battaglia personale si incrocia proprio con questi omicidi.