ניקיטה מגלה רמזים לגבי הסיבה שגויסה למדור; ייתכן שאביה היה סוכן ויש לה קרבת דם למישהו המכונה "מ". קווין מעצבת מחדש את תוכנת הבינה המלאכותית של בירקוף כדי לבנות העתק הולוגרפי של מדלן.

אחרי הפיצוץ בבית אביה של ניקיטה, היא מגייסת את וולטר ואת ג'ייסון קרופורד כדי לפענח את תוכנו. בינתיים, אובריאן בוגד ניקיטה וחושף בפני מבצעים את מצבה הבריאותי המדרדר.

אחרי שמישהו פורץ למדור ומתפרץ לחדרה, ניקיטה נחושה יותר מאי פעם לגלות את האמת על הסיבה שהובאה למדור. בינתיים, קווין ממשיכה ללחוץ על מבצעים, אבל מה היא באמת רוצה?

ניקיטה סוף סוף פוגשת פנים אל פנים את אביה, מר ג'ונס האמיתי, אך מגלה שמר ג'ונס הוא איש עסקים של ממש לאחר שהוא שולח אותה למשימה; מציאת "חפרפרת" של הקולקטיב במדור 1.

ניקיטה ומר ג'ונס מצמצמים את האפשרויות של "חפרפרת" במדור ל-4 חשודים: מבצעים, קווין, וולטר ומרקו אובריאן המנוח. אך ישנו גם חשוד חמישי - מייקל. מבצעים יוצא לפקד על משימה נגד הקולקטיב.

מייקל מבקש מניקיטה לעזור לו לחזור למדור, אלא שחזרתו נתפסת כחשודה על ידי מר ג'ונס ומבצעים. מבצעים מגלים שהקולקטיב הסתנן למחשב המרכזי של המדור כדי לאתר ולחטוף את בנו של מייקל.

בפרק האחרון, סוכנים חדשים מתמודדים על מקום במדור. בנו של מייקל נחטף ועליו לנהל מו"מ על חייו. לאחר החילוץ, ניקיטה, שמפקדת כעת על מדור 1, משחררת את מייקל מחובותיו ומתירה לו לחיות עם בנו.