일년 전, 딘은 리사의 집으로 들어가 건설 노동자로 일하며 평범하게 살려고 노력한다. 그러던 어느날, 딘이 정령의 흔적을 발견하고 그를 쫓을 때 위기를 겪게된다.

네 가족이 살해당하고 그들의 아이들이 없어지는 사건이 일어났다. 샘은 보안회사가 이 일에 연루되어있다는 것을 알아낸다.

딘과 샘은 두 명의 경찰관의 미스터리한 죽음을 조사하러 펜실베니아 주 동부로 향한다. 그들은 세 경찰관이 한 소년을 살해하고 이를 정당화하려했다는 것을 알아낸다.

바비가 크라울리를 소환하고, 그가 자신의 영혼을 돌려줄 생각도 없다는 것을 알게된다. 한편, 딘과 샘은 위스콘신에서 사람들을 죽이고있는 악마가 누군지 묻는다.

어느 마을에서 일주일만에 6명의 소녀들이 사라졌다. 딘과 샘은 마지막으로 사라진 소녀가 뱀파이어의 팬이며, 한 이상한 남자와 데이트를 했다는 사실을 알게된다.

형제는 네 건의 자살사건을 조사하던 중, 진실의 여신이 사건과 연관되어 있음을 알게된다. 여신의 다음 표적, 딘은 샘에게 지옥에서 돌아온 후의 일을 묻는다.

형제는 새뮤얼의 팀에 들어가 뱀파이어 알파를 쫓고 딘은 새뮤얼이 알파를 심문하기 위해 밴으로 데려가는 것을 몰래 지켜본다. 그러다 알파가 탈출해 샘을 위협한다.

딘과 샘은 크라울리의 밑에서 일하게 된다. 만약 그들이 알파를 데려오는 데 성공한다면 샘의 영혼을 돌려주겠다고 약속하고 형제는 뉴욕으로 향한다.

인디아나의 엘우드에서 네번째로 실종된 사람이 생기고 목격자들은 자신들이 외계인에게 유괴당했었다고 주장한다. 딘과 샘은 마을로 찾아가 UFO를 조사하려한다.

딘과 샘은 크라울리의 은신처를 알길 원하는 메그에게 붙잡힌다. 샘은 알려주는 대신 자신의 영혼을 찾아와달라고 제안한다.

형제는 새뮤얼의 팀에 들어가 뱀파이어 알파를 쫓고 딘은 새뮤얼이 알파를 심문하기 위해 밴으로 데려가는 것을 몰래 지켜본다. 그러다 알파가 탈출해 샘을 위협한다.

죽음은 딘에게 자신의 반지를 끼고 역할을 대신해달라하고 딘은 자연의 섭리는 거스를 수 없음을 깨닫는다. 샘은 영혼을 되찾는 것을 막기위해 바비를 죽이려 한다.

실종된 여자 4명에 대한 메시지를 받고 샘과 딘은 사건 현장으로 떠난다. 샘은 1년 전에 마을에 왔었던 기억을 떠올리며 일어났던 사건들이 연결되어있음을 확신한다.

딘과 샘은 미스터리한 살인 사건을 조사하기 위해 뉴저지로 떠난다. 하지만 벤이 딘을 불러 긴급 상황이 생겼다고 말하자 그는 샘을 떠나 리사의 집으로 향한다.

샘과 딘을 라파엘의 공격으로부터 지키지 위해서, 발타자르가 그들을 평행세계로 보내버린다. 그 세계는 형제가 '수퍼내추럴'이라는 TV 쇼에서 살고있는 세계이다.

잔인한 연쇄 살인 이후 딘과 샘, 그리고 바비는 이를 조사하기 위해 떠나고 루퍼스를 만난다. 그들은 모든 괴물들의 어머니를 찾는다.

펜실베니아 주의 체스터에서 일어난 이상한 연쇄 죽음 이후 딘과 샘은 발다자르가 타이타닉 참사를 피하기 위해 역사를 바꿨다는 사실을 알아낸다.

카스티엘은 샘과 딘을 1861년으로 보내 용의 재를 구해오게 한다.

딘,샘 그리고 카스티엘은 이브가 오레곤 주의 작은 마을에 있는 것을 알자 잡으러 떠난다. 이브를 만나자 그들은 크라울리의 비밀에 대해 알게된다.

카스티엘은 자신에 대한 이야기를 하며 몇몇 선택에 대해 말한다.

크라울리는 리사와 벤을 인질로 삼아 딘과 샘을 물러서게 한다. 딘과 샘은 리사와 벤을 찾아 나서고 바비는 1937년에 있었던 사건의 진실에 대해 조사에 나선다.

크라울리는 새로운 파트너 라파엘과 함께 도착하여 연옥의 문을 열기 위해 처녀의 피를 필요로하고, 샘은 기억상실에서 깨어나 딘과 바비를 만나러 간다.