Continuando donde el final de la temporada anterior quedo, Sam y Dean deben hacer frente a la oscuridad que se ha desatado. Castiel se ocupa de los efectos del hechizo de Rowena y recuerda su brutal batalla con Crowley.

Dean ayuda a Jenna a volver a casa con seguridad y luego se pone en marcha para ayudar a Sam con un pueblo infectado por un misterioso y mortal gas. Sin embargo, cuando Jenna cae en manos peligrosas, ella llama a Dean por ayuda y Sam le dice a que regrese con ella. Desafortunadamente para Sam, él no es capaz de manejar el pueblo tan fácilmente como se pensaba.

Mientras Rowena intenta consolidar su poder para protegerse de los Winchester, Sam y Dean buscan un bebé desaparecido conectado a la Oscuridad. Mientras tanto, Castiel se esfuerza por sanar y Crowley trata de encontrar una manera de utilizar la oscuridad para su propio beneficio personal.

Visto en su totalidad desde el punto de vista de la Impala, Sam y Dean van en un viaje por carretera para luchar contra los monstruos y demonios.

Sam y Dean investigan una serie de asesinatos en un B&B local, que también es la antigua casa de Lizzie Borden. Cuando un hombre de la localidad, Len, les dice que vio a una niña cerca del B&B en el momento de los asesinatos, los hermanos se dan cuenta de que Amara puede ser la responsable.

Castiel busca la ayuda de Metatron para detener la Oscuridad. Sin embargo, Metatron es muy feliz con su nueva vida como camarógrafo freelance para la prensa local y no quiere ayudar a los Winchester o Castiel. Mientras tanto, Crowley está perdiendo su dominio sobre Amara.

Sheriff Donna llama a Sam y Dean en busca de ayuda después de un horrible asesinato con elementos sobrenaturales que sucede en su ciudad. Sam sigue teniendo visiones.

Sam esta shockeado cuando su amigo imaginario de la infancia Sully hace una inesperada visita. Sam no puede entender porque el vería a Sully ahora pero lo que es más sorprendente es que Dean lo puede ver también. Un Flashback revela la amistad del joven Sam con Sully y porque el lo necesita.

Amara desata su poder sobre los habitantes de un pueblo mientras se enfrenta a un desafío impactante. Dean intenta entender mejor la conexión que guarda con Amara, mientras que Sam y Drowley idean un plan que podría tener desastrosas consecuencias.

Ahora que tiene a Sam con él en la jaula, Lucifer le ofrece a Sam una manera de salir, pero con un alto precio. Dean y Castiel miran dentro del angel golpeado que pudo haber matado a Amara.

Sam y Dean visitan a Jody Mills, Claire y Alex después de recibir una llamada aterrorizada de Claire. Pero Jody les dice que Claire ha estado imaginando monstruos últimamente.

Sam y Dean investigan una serie de asesinatos cometidos el día de San Valentín. Descubren que se trata de una antigua maldición: una vez besada por la maldición, la persona se queda marcada para morir.

Con la esperanza de encontrar un arma para derrotar a Amara, Dean convence a Castiel para que viaje en el tiempo.

Dean y Sam asisten al funeral de su ídolo de lucha de la niñez dando un respiro a su búsqueda de la Oscuridad. Pero deben seguir investigando cuando otro luchador aparece muerto.

Enfrentados a una criatura peligrosa, Sam y Dean descubren que Bobby Singer y Rufus Turner en otro tiempo siguieron al mismo monstruo.

Sam y Dean luchan contra una pareja de hombres lobo que han capturado a dos víctimas. Justo cuando los hermanos están a punto de ganar, uno de los hombres lobo dispara a Sam. Dean saca a su hermano y a las víctimas fuera de la casa pero descubre que una manada de hombres lobo le siguen el rastro con el fin de matarlos a todos.

La épica batalla por el poder comienza cuando Lucifer se da una vuelta por el cielo y trata de reafirmarse a sí mismo. Mientras tanto, Crowley le dice a Sam y Dean que tiene una manera de acabar con Amara.

Sam y Dean se encuentran con un par de cazadores en un pequeño pueblo de Colorado, donde cada 27 años ocurren misteriosas desapariciones.

Cuando Amara desata otra mortífera niebla de la oscuridad, causando la locura en una pequeña ciudad, Sam y Dean tratan de ayudar. Mientras tanto, Chuck regresa con una propuesta.

Amara muestra a Dean la forma en la que está torturando a Lucifer. Preocupados por Castiel, Sam y Dean idean un plan para rescatarlo de las garras de Amara.

En la cuenta atrás, Rowena hace su jugada, mientras que Sam y Dean se enfrentan a su mayor reto.

En el final de temporada, Dios toma una decisión con respecto a Amara que repercute directamente en Sam y Dean.