Tous les agents présents dans le laboratoire de la police scientifique ont été incommodés par un gaz introduit sur les lieux. Seul Jesse est décédé, victime d'une chute après avoir perdu connaissance. Pour Horatio, tout est la faute de Bob Starling, suspecté d'être un tueur en série. Il promet de le faire juger pour ce meurtre et pour tous ses autres crimes. Or, pour l'instant, aucune preuve ne permet de l'inculper. Tous les indices dont il disposait ont été détériorés par le gaz diffusé dans les locaux. Malgré tout, l'examen d'un document imprimé, laissé par le serial killer, permet de relier l'encre utilisée à l'imprimante de Starling. Lentement, mais sûrement, l'étau se resserre...

Une adolescente, Lindsey Peterson, est enlevée près de la plage. Le seul témoin du drame, Ben Wilcox, est aveugle. Les kidnappeurs obligent Lindsey à retirer 50 000 dollars du compte bancaire de ses parents. Pour cela, elle doit d'abord les contacter afin d'obtenir leur numéro de code secret. Pendant toute l'opération, la jeune fille porte une veste bourrée d'explosifs, qui sauteront à la moindre tentative d'évasion. Grâce au témoin, Horatio parvient à identifier la banque. Les agents se rendent aussitôt sur place, mais il est trop tard. Ils voient au loin Lindsey et un inconnu s'engouffrer dans une camionnette et prendre la fuite...

La police de Miami parcourt sans relâche la ville à la recherche du reste des prisonniers ayant pris la fuite. Memmo Fierro, un des évadés, est le meurtrier de Marisol, épouse d'Horatio et soeur de Delko. Memmo tente de détourner un bateau après avoir assassiné son propriétaire et volé ses objets de valeur. Car le criminel est bien décidé à ne pas se laisser faire. Il est papa d'une fille de 11 ans, Elsa, qui vivait avec Ivonne, l'ex-compagne de Memmo. Mais depuis, la petite fille a été placée dans un foyer, Ivonne n'étant pas jugée apte à élever un enfant. Alors qu'elle travaille au pressing, Ivonne reçoit la visite de Horatio...

Jason Roger se réveille d'un cauchemar dans lequel il assistait à un meurtre. Lorsqu'il reprend ses esprits, il est entouré de toute l'équipe des experts. Selon Natalia, c'est lui-même qui a appelé les scientifiques. Alors qu'Horatio examine les alentours, il découvre une tête décapitée avant de tomber sur le cadavre de son propriétaire, caché dans le coffre d'une voiture. De retour au laboratoire, Jason confie à Delko qu'il n'a pas plus touché à la drogue depuis un an et qu'il essaie de reconstruire sa vie. Natalia lui montre alors ses dépositions. S'apercevant que ses déclarations ne tiennent pas la route, Jason demande l'assistance d'un avocat...

Une star de la télé-réalité vient d'être assassinée, apparemment sans véritable mobile apparent. Les experts enquêtent et remarquent, en examinant le cadavre de la victime, qu'elle a reçu un coup de couteau au niveau des tympans. La blessure a dû lui endommager le cerveau et lui faire perdre tout sens de l'équilibre. La jeune femme, enceinte et mariée, avait l'intention de mettre fin à sa carrière. Au fur et à mesure des interrogatoires, de ses proches aux fans de l'émission à laquelle elle participait, les choses s'éclaircissent. Les enquêteurs sont rapidement persuadés que le mobile du meurtre est à chercher dans le passé de la victime...

Brad Webb est en train de pêcher quand il remarque un jeune homme sur le point de se jeter d'un pont. L'homme crie pour décourager le suicidaire avant d'être la cible d'une rafale de balles dont il sort miraculeusement indemne. Le pêcheur confie aux experts qu'il n'a aucune idée d'où pouvait venir les tirs et qu'il ne voit pas qui pourrait lui en vouloir. Shane Newsom, le suicidaire, explique à Horatio qu'il ne voulait pas mettre fin à ses jours, mais qu'il cherchait juste à se faire peur, par amour du risque. Sceptique, le policier décide de ramener Shane Newsom au poste et place Brad Webb en détention provisoire par mesure de précaution...

Heather Chapman, une femme enceinte de huit mois, est violemment attaquée et laissée pour morte dans la rue juste après avoir déjeuné avec son amie Marcie Westerfield. Ryan et Walter décident de se tourner vers cette dernière lorsqu'ils apprennent que Heather avait envoyé un SMS à son mari, Gary, à propos d'une dispute avec Marcie. La jeune femme confie aux policiers qu'elle est parfois un peu jalouse de son amie, qui est tombée très rapidement enceinte alors qu'elle-même essaye d'avoir un enfant depuis des années, sans succès. Pourtant, elle nie catégoriquement avoir porté la main sur son amie...

Une explosion d'une grande violence vient de ravager une raffinerie de sucre. Dans les décombres, les enquêteurs de police trouvent un cadavre complètement carbonisé. Il s'agit du corps d'Eduardo Santana. Très vite, les soupçons de Delko se portent sur le directeur de l'établissement, un certain Roger Cavanaugh. L'expert est persuadé que Roger Cavanaugh, le patron de la raffinerie de sucre, ne suivait pas les mesures de sécurité nécessaires au bon fonctionnement d'une telle entreprise et que ce sont ses négligences qui ont entraîné l'explosion mortelle...

Accompagné de Ryan, Horatio se rend au domicile d'un jeune homme fortuné dont le cadavre est en piteux état. En effet, le défunt a été retrouvé déchiqueté dans la piscine. D'après le médecin légiste, tout porte à croire qu'il a été partiellement dévoré. Rapidement, Horatio et Ryan découvrent l'alligator responsable de cette mort atroce et sont contraints de l'abattre. Pour Horatio, l'affaire n'est pas résolue pour autant : comment ce reptile est-il arrivé là ? Horatio trouve des morceaux de viande sanguinolents dispersés çà et là dans les environs de la maison pour attirer l'alligator vers la piscine. Autre détail troublant : le défunt était au téléphone au moment de son décès...

Une voiture détruit une bouche d'incendie, provoquant une rupture de canalisation. La conductrice du véhicule, Rebecca West, a été tuée d'une balle dans la tête. A proximité du véhicule, on découvre un autre cadavre, celui de Marvin Hill, lui aussi tué d'une balle dans la tête. Tout porte à croire que Marvin a supprimé Rebecca avant de se suicider. Mais la police scientifique découvre bientôt que tous les deux ont en fait été tués par la même balle. Marvin a été touché en premier, la balle a ricoché dans son crâne, est ressortie et a mortellement touché Rebecca, qui passait par là au volant de sa voiture...

Wrath of Connie, de son vrai nom Connie Briggs, une étoile montante de l'équipe de roller derby les «Masochists» de Miami, a été retrouvée assassinée dans les vestiaires, lors d'une rencontre avec les Loca Ratons. Le docteur Loman détermine que Connie a été tuée d'un coup violent. Tous les soupçons se tournent dans un premier temps vers Olivia, une joueuse de l'équipe adverse, et Debbie, une de ses coéquipières...

Nicholas Chandler, le nouveau procureur général, est assassiné par des tueurs en voiture au cours d'une conférence de presse, organisée à l'occasion d'une importante saisie de matériel destiné à la fabrication de drogue. Le chauffeur du véhicule, un certain Felix, est rapidement appréhendé. Felix est membre de la Mala Noche, une redoutable organisation criminelle. Bientôt, une avocate est tuée à son tour par un individu tatoué, portant un masque de vieillard...

Une jeune fille est retrouvée morte. La police criminelle du comté de Miami-Dade isole la scène : le cadavre a été retrouvé ligoté sur le terrain de foot d'un lycée. La victime présente tous les signes d'une mort par surdose. Elle fréquentait depuis longtemps cet établissement sans histoires. Menée par Horatio Caine, l'équipe des experts tente de déterminer s'il s'agit réellement d'un accident lié à la prise de drogue ou s'il faut soupçonner un jeu idiot qui a tourné à l'homicide. En effet, l'ambiance parmi les camarades de la défunte se révèle particulièrement électrique. Ce genre d'attitude laisse Calleigh particulièrement dubitative...

Les experts sont appelés sur le lieu d'un crime. Une jeune femme, Bridget Walsh, a en effet été retrouvée assassinée dans une maison abandonnée. Bientôt, d'autres victimes sont localisées. Les agents pensent qu'il s'agit d'un tueur en série car le mode opératoire est toujours le même. Les ongles des victimes ont été arrachés. Un événement inattendu vient relancer l'enquête lorsque Michelle Baldwin, une des personnes attaquées par le meurtrier, réussit à échapper à son tortionnaire. Les enquêteurs attendent beaucoup de son témoignage, qui pourrait permettre de dresser une liste de suspects. Mais la jeune femme est encore sous le choc...

Enrique, un Cubain, et Jean, un Haïtien, sont arrivés illégalement dans le pays avec la promesse d'une nouvelle liberté. Après les avoir marqués comme des animaux, un groupe de junkies en manque d'adrénaline décide d'organiser une véritable chasse à l'homme et se met à les traquer dans les Everglades. Peu de temps après, la police découvre le corps d'Enrique, abattu par une flèche haut de gamme. L'analyse de la flèche permet aux enquêteurs de remonter jusqu'à la boutique d'où elle provient. Ils découvrent que le propriétaire de la boutique a une clientèle peu commune, adepte des sensations fortes...

Au cours d'une de ses livraisons, un jeune conducteur de camion, Doug Govoli, est assassiné. Les experts sont chargés d'enquêter sur ce crime. Alors qu'ils interrogent divers suspects, ils sont mis sur la piste d'un autre meurtre, qui pourrait être connecté à leur enquête. En effet, une mère de famille, qui apparaît sur la liste de livraison du conducteur, est retrouvée morte. Elle tenait une entreprise de jouets et distribuait notamment des poupées. En recoupant les deux affaires, les enquêteurs se rendent compte que les deux victimes étaient liées à un trafic de drogue. Les poupées serviraient à la transporter...

Une étudiante, Cara Laundry, est retrouvée morte. Elle a été assassinée par un évadé de prison, Patrick Clarkson. Celui-ci sélectionne ses proies sur Internet. Il prend rendez-vous et, une fois chez elles, les assassine froidement. A la suite de ce meurtre, Natalia se rend sur le campus pour donner une conférence sur les dangers du Web. Alors qu'elle retourne à sa voiture, elle est enlevée par Patrick. Malgré la peur, elle parvient à distraire son agresseur, mais provoque un accident à la faveur duquel Clarkson parvient à s'échapper. Natalia souhaite creuser davantage le dossier de Clarkson et met au jour de nouvelles informations sur le compte de ses victimes...

Horatio a pour mission de protéger un champion en art martial, Logan Shepherd. Ce dernier est menacé par un de ses anciens rivaux, Dante Kroll. Shepherd avait témoigné contre lui, ce qui l'avait conduit en prison. Mais Kroll s'est évadé. Les experts parviennent à remonter sa piste après qu'il a battu à mort un agent de sécurité qui travaillait à la salle de combat où Logan doit disputer un championnat. Kroll s'est emparé de l'uniforme de sa victime et de ses passes. Malgré ces événements, Logan ne veut pas abandonner le combat. Pendant ce temps, Molly et Ryan partent à la recherche de Kroll. Des indices leur permettent de le localiser. Ce qu'ils trouvent dans son repaire les déstabilise....

Monica Dow fait figure de suspecte principale dans une affaire de meurtre. Cette étudiante en arts partageait une chambre avec Corinne Palmer. Or, cette dernière a été retrouvée assassinée dans le spa de l'université. Horatio découvre que Monica souffre de troubles de la personnalité très handicapants. Il lui arrive d'avoir des absences et de se réveiller en adoptant un comportement aberrant, comme si elle était une toute autre personne. Quelque chose de traumatique, dans le passé de Monica, la pousse à éloigner sa peine en créant cet alter ego. Le petit ami de la victime est également interrogé. Les agents apprennent que Monica est sortie avec lui...

Une bagarre éclate dans une boîte de nuit huppée après qu'un comptable, un certain Neal, a pris la défense d'une serveuse qui a malencontreusement renversé des boissons sur un autre client. Peu après, un homme va aux toilettes et découvre une mare de sang. Il ouvre la porte et trouve Neal debout à côté du cadavre de l'homme avec lequel il s'est battu durant la soirée. Neal clame son innocence. Les inspecteurs arrivent sur place et découvrent que Neal et le corps ont disparu......

Le tueur en série Jack Toller est ramené en avion à Miami, escorté par Horatio et Frank. Mais, à l'approche de l'aéroport, l'appareil change de trajectoire. Suspicieux, Caine demande au pilote de s'expliquer et c'est à ce moment-là que le steward sort une arme. C'est un guet-apens en plein vol ! Suite à un échange de tirs et un atterrissage de fortune, Toller s'évade. Quelques minutes plus tard, toutes les forces de l'ordre sont en état d'urgence. En cavale, le criminel attaque une jeune femme en voiture, la tue et récupère son véhicule. Mais la fuite loin de Miami n'est pas à son programme. Il semble vouloir régler une affaire avant de disparaître...