Megan Donner visszatér az egységhez, hogy egy repülőgép-szerencsétlenségen dolgozzon. Miközben túlélők után kutatnak, az egység tagjai egy női áldozatra bukkannak 5 km-re a baleset helyszínétől. A helyszínelők által rögzített nyomok alapján arra a következtetésre jutnak, hogy a haláleset mögött egyáltalán nem a baleset áll. Az ügy kivizsgálásához úgy tűnik, a gyilkosságiak néhány nyomozójára is szükség lesz.

Megszállott robbantó tartja rettegésben a lakosságot, akinek a következő célpontja Miami kolumbiai közössége. A nyomozás során egy gazdag kolumbiai importőrnél robbanószerkezetet találnak, csakhogy mind ő, mind pedig a bombaszakértő meghal a robbanásban, amikor hatástalanítani akarják a szerkezetet. A teszteken kiderül, hogy az érzékeny robbanószert házilag készítették.

Miami partjainál gyanús cápatámadás történik. Horatio és Megan a cápa gyomrában egy emberi törzset, abban pedig egy puskagolyót talál. A halott férfi karján lévő tetoválásból arra következtetnek, hogy az áldozat kubai menekült volt. Amikor a helyszínelők csapata egy elhagyatott hajón azonos puskagolyót, drogcsempészetre utaló több jelet és egy menekült holttestét találja, rájönnek, hogy egy titkos szökési akció sült el ilyen rosszul.

A tengerparton egy férfi holttestet találnak - átvágott torokkal és megégetett arccal. A közelében eszméletlen fiatal lányra bukkannak, akit megerőszakoltak, majd az óceánba dobtak. Miután kikérdezik az áldozat barátját, kiderül, hogy a pár egy pompás partin vett részt egy nagy múltú, politikai befolyással bíró család kúriáján. Amikor a bizonyítékok gyűlni kezdenek a család ellen, a nagy hatalmú Hamiltonok kezükbe veszik az irányítást, hogy bőrüket mentsék.

Egy papot lelőnek, és a helyszínen talált poháron lévő nyom alapján a 12 éves Cameron Medina lesz a fő gyanúsított. A fiú házában fizikai bántalmazásra utaló nyomokat találnak, ezért a helyszínelők felkutatják Cameron apját, akit agyonverve találnak meg, így több kérdés marad, mint válasz. Ezalatt Horatio és Delko egy megégett terhes nő tetemét vizsgálják, és egy gyémántot találnak a gyomrában. Horatio ösztönösen megérzi a gyilkost, de kézzelfogható bizonyítékot kell találnia, hogy elítéltethesse.

Az egész csapat egy ügyön dolgozik: egy ötéves kislányt holtan találnak az étterem játszóterének mosdójában. A nyomok arra utalnak, hogy a gyilkos ki akarta csempészni a kislányt. Bár a kuncsaftok között találnak egy nyilvántartott szexbűnözőt, az étterem kamerafelvételei alapján alibije van. A további kutatás egy szétmarcangolt ujj lenyomatához vezet, ami megmutatja, ki mire képes, hogy elkerülje a törvényt.

Horatio és csapata egy fiatal férfi sztriptíztáncos esetében nyomoz, akit holtan találnak egy szexpartit követően. Horatio mérgezésre gyanakszik, amit a fiú combján talált injekciónyom megerősít. Azonban új indítékok kerülnek felszínre, amikor kiderül, hogy a táncos megszállottjává vált egy nőnek a partin. Eközben Eric és Megan egy búvár ügyében nyomoz, akit az óceánon szúrtak le.

Egy családot kegyetlenül lemészárolnak otthonukban, Horatiónak és csapatának a helyszínen lévő bizonyítékok alapján kell megtalálnia a gyilkost. Az anya, az újszülött és két fiú meghalt, csak az apa és a negyedik gyermek maradt életben. A helyszínelőknek a házban talált vér alapján kell követni a nyomokat, hogy felépíthessenek egy logikai sort és rájöjjenek ki a gyilkos. Horatio azt gyanítja, hogy az anya a felelős a történtekért, azonban a bizonyítékok egészen más irányba mutatnak.

Miami belvárosában, a tipikus reggeli csúcsforgalomban három embert ölnek meg. Horatio a fejen található szem körüli lövésekből orvlövészre gyanakszik. Amikor egy negyedik holttestet találnak, a bizonyíték összezavarja a csapatot, mert nem lehet összefüggésbe hozni az előző hárommal. A ballisztikai vizsgálat eredményei alapján megtalálják az orvlövész fészkét egy belvárosi épület tetején. Hogy elfoghassák a gyilkost, ki kell deríteniük, ki a következő célpont.

Egy helyi egyetem liberális szellemű professzorát felakasztva találják egy fán. A népszerű professzort legalább négy óráig kínozták, mielőtt megölték. Ahogyan a csapat összerakja a professzor dokumentumainak darabkáit és megvizsgálják nem mindennapi tanítási szokásait, rájönnek, hogy egyik tanítványa valószínűleg "túlságosan is megtanulta a leckét". Eközben Delko és Megan egy vízbe süllyedt autó ügyében nyomoznak, amelynek csomagtartójában egy holttestet is találnak.

Egy ismeretlen lány tetemét találják egy szigorúságáról híres rehabilitációs tábor mellett. A helyszínen lévő keréknyomok a táborba vezetnek, ugyanakkor a lánynak látszólag nem volt köze a helyhez. A helyszínelők szerint az egyik kadét létfontosságú információt rejteget az üggyel kapcsolatban. Miután azonosítják a lányt, és kapcsolatba lépnek az anyjával, a csapatnak követnie kell a nyomokat egy olyan végkifejlethez, melyre egyikük sem számított.

Horatio és a csapat egy prostituált ügyében nyomoz, akit többszöri késszúrással meggyilkoltak, majd egy helyi nyaraló ágya alá rejtettek el. A szoba alapos átvizsgálása során kiderül, hogy a tettes megtisztította a bűntény helyszínét, és a hullát is megmosdatta. Egy véres ujjlenyomatot azonban mégis találnak, de Horatio úgy gondolja, hogy a nyomot nem a tényleges gyilkos hagyta. Eközben a városban egy benzinkútnál Calleigh és Delko megpróbálják kideríteni, hogy miért lőttek le egy német turistát.

Horatio és Speedle egy férfi halálának ügyében nyomoz, aki vegyszereket lélegzett be abban a házban, ami mozgatható droglaboratóriumként is működik. A vizsgálatok alapján a drogok halálosak, ezért a nyomozóknak meg kell találniuk az elkövetőket mielőtt újabb holttest kerül elő. Közben Calleigh és Delko egy idős hölgy halálának körülményeit vizsgálják, aki látszólag kegyetlen támadás áldozata lett egy nyugdíjas otthonban.

A csapat egyik fele Horatio vezetésével egy rablásai során nemi erőszakot is elkövető bűnöző különös halála után nyomoz. A rabló házában megtalált bizonyítékok a korábbi sértettek felé irányítják a nyomozást. A többiek egy menő szórakozóhely volt alkalmazottjának megkerült holtteste ügyében vizsgálódnak. A háttérben véres konkurenciaharc szálai bontakoznak ki.

Miami utcáin holtan találnak egy kábítószerest törött nyakkal, kezében egy köteg pénzzel. Amikor a holttestet alaposabban szemügyre veszik, kiderül, hogy radioaktív anyagok okozták a testén található égési sérüléseket. A nyomozás során szándékosság gyanúja merül fel, amely elvezeti Horatióékat egy sugárzással kapcsolatos ügyeken dolgozó környezetjogi ügyvédhez, akit szintén végzetes radioaktív hatás ért. A nyomozóknak nem sok idejük maradt hátra, hogy kiderítsék az igazságot mielőtt az utolsó élő tanú meg nem hal.

Egy városi tanácstag férjét házvezetőnőjük meggyilkolásával vádolják. Kiderül ugyanis, hogy a férfinak titokban viszonya volta nővel. Mielőtt azonban Horatio tanúskodhatna az ügyben, a nyomozók tudomására jut, hogy a korábbihoz hasonló gyilkosság történt, mialatt a vádlott a fogdában ült. Ha az előzetes letartóztatásban lévő férfi tényleg valóban ártatlan, Horatio szerint egy sorozatgyilkos szedi az áldozatait.

Rutinfeladatként indul egy csempészektől lefoglalt, kábítószerrel megpakolt teherautó megsemmisítése. Váratlanul azonban rajtaütnek a rendőri konvojon, megölnek két rendőrt és megsebesítik Speedle-t. Horatiónak feltűnik, hogy a támadók csak a kokaint vitték el, a többi értékes drogot viszont nem. A helyszínelők kellemetlen helyzetbe kerülnek, amikor belső nyomozást kezdeményeznek náluk, hogy kiderüljön, ki adta ki az információt a drogszállítmányról. Újabb és újabb kérdések merülnek fel, amikor az egyik helyszínelőnél pozitív eredményt mutat ki a drogteszt.

Egy előkelő miami hotel medencéjének a partján holtan találnak egy nőt. Miközben azonosítják a holttestet, a helyszínelők felhívják magukra az FBI figyelmét, és Horatio összeütközésbe kerül velük. Kiderül, hogy a nő igazából egy tanúvédelmi program tagja volt a barátjával együtt, aki éppen vallani készült egy droggal kapcsolatos ügyben. Horatio ki akarja kérdezni a nő barátját, hogy megtalálhassa a gyilkost, de ezt az FBI és néhány magas rangú amerikai katonatiszt nem nézi jó szemmel.

Horatiót megkeresi egy férfi, akit korábban maga Horatio juttatott börtönbe. Most a rendőr segítségét kéri, hogy találja meg a fiát. A nyomozás kezdetén kiderül, hogy a fiú eltűnésében szerepet játszott a kábítószer is. Hamarosan Calleigh olyan fára bukkan a segítséget kérő férfi háza közelében, amelybe több száz golyót lőttek. A temetőben egy másik fiú holttestére találnak. A kisebb-nagyobb nyomokat követve összeáll a kép, s Horátióék megsejtve a közelgő tragédiát, versenyt futnak az idővel, hogy mielőbb megtalálják az elveszettnek hitt, életveszélyben lévő fiút. Eközben Timothy egy fulladásos halált szenvedett férfi ügyében nyomoz. Az első számú gyanúsított maga a férfi barátnője, aki azonban nem közömbös Timothy számára sem.

Két halott főiskolás miatt riasztják a helyszínelőket. Horatio és Speedle egy lány ügyében nyomoz, akinek a holttestét a tengerparton találták meg törött nyakkal és emberi harapásnyomokkal a lábain. Eközben Calleigh és Delko egy fiatal férfi halálának körülményeit vizsgálja, akire egy úszómedencében találtak rá, és aki hirtelen halt meg még mielőtt a vízbe esett volna.

Egy divatos éjszakai klubban a pirotechnika miatt tűz üt ki, 16 ember halálát okozva. Speedle és Delko épp hogy megmenekül. A csapat kideríti, hogy a tűz egyáltalán nem volt véletlen, miután megtalálják az egyik csapos leszúrt testét. Már csak Horatión és a csapaton áll, hogy összeillesszék a bizonyítékokat és rájöjjenek, mi történt aznap este a klubban.

Horatio, Speedle és Delko éppen egy kábítószerfüggő brutális halála ügyében nyomoz, amikor majdnem maguk is áldozatok lesznek egy robbanás során. A bizonyítékok java megsemmisül, így a nyomozás sikere érdekében utat kell találjanak a kábítószerfüggők kétes világába. Az ügy személyessé válik, amikor kiderül, hogy a fő gyanúsított ismerte Horatio halott bátyját. Eközben Calleigh-t egy gyilkosság helyszínére hívják, ahol az áldozat Alex egyik legközelebbi barátja.

Horatiót a miami börtön udvarára hívják, ahol agyonszúrtak egy elítéltet. Amikor a helyszínre érkezik, három elítélt megszökik egy helikopterrel. Horatio rájön, hogy a gyilkosság csak ürügy volt arra, hogy eltereljék a figyelmet a nagyszabású szökésről, és vadászni kezdi az elítélteket. Az ügy személyes lesz, amikor kiderül, hogy az üldözött bűnözők közül kettőnek már volt köze a helyszínelők csapatához.