世界最新鋭の警備システム「ROMES」に守られた海の要塞、東京湾国際空港、通称”湾空”に成嶋優弥が降り立った。世界で最もROMESシステムに精通した若き天才である。しかし、湾空は成嶋の到着依頼次々と事件に見舞われることに。

砂村（安田章大）とまゆ子（川村ゆきえ）が「誘惑の女神」展の会場に閉じ込められた。やがてまゆ子を人質に逃走を図る犯人たち。しかしＲＯＭＥＳシステムで犯人を追跡し取り押さえた成嶋（大倉忠義）は、女神像が別のルートで運ばれたことを見破っていた。そして犯人チームの１人の裏切りが、天才・成嶋の予想をも超えた結末を招く。

国際的窃盗団から女神像を奪還してほっとしたのもつかの間、新たな脅迫状が東京湾国際空港に届けられた。その後、港内を走る車に花火が仕掛けられたり、トイレにニセ爆弾が置かれたり…。「脅迫状もいたずらではないか」と警備チームが思い始めたころ、ニセ爆弾を設置したと思われる女性の姿をＲＯＭＥＳが空港内で発見した。成嶋（大倉忠義）は砂村（安田章大）と元麻薬犬のハルを連れて現場に急行する。

元麻薬犬・ハルのお陰で爆発を逃れた砂村（安田章大）。成嶋（大倉忠義）は、爆発物の仕掛け方からＲＯＭＥＳをよく知る人物の仕業だと考え、黒部（渡辺裕之）に内部調査を依頼する。一方、爆発物の分析から、２０年以上前の成田闘争との類似点が見つかった。そして黒部の調査の結果、砂村の家族と成田闘争に接点が見つかる。成嶋の疑いの目を感じて意気消沈する砂村だが、「空港を守って認めてもらうしかない」と思い直す。

砂村（安田章大）の目前で不審な車が爆発。砂村は意識不明の重体だとＲＯＭＥＳチームは知らされる。実は砂村は奇跡的に無傷だったのだが、成嶋（大倉忠義）の策略で、彼の部屋に隠れて極秘のミッションに携わることになったのだ。砂村は地道に調査を続け、これまで事件が起こった場所に共通して姿を現す２人の人物にたどり着く。そのうちの１人、湾空フーズで働く筑森（草野イニ）をこっそりと訪れ、ある病院の名前を聞きだす。

木村まゆ子（川村ゆきえ）の車のトランクから女性の死体が出てきた。ＲＯＭＥＳルームに衝撃が走る。その直前にＲＯＭＥＳが監視カメラにとらえた爆破事件の容疑者・貝田（矢島健一）と女性（星野真理）の動きから、成嶋（大倉忠義）はごく身近に内通者がいることを読み取っていた。一方、殺された女性の名前から、再び事件と病院の接点に気づいた砂村（安田章大）は、ＲＯＭＥＳが指し示した人物に会いに行くことを決意する。

閑野専務（草刈正雄）の娘（美山加恋）が手術を受けるために離陸するのを阻止しようとする八坂葵（国仲涼子）。そこには葵の弟が被害者となった悲しい事故の記憶があった。弟のための復しゅうを矛盾だと言い切る成嶋（大倉忠義）。どうしても爆破のスイッチを押せずに崩れ落ちる葵を砂村（安田章大）が捕らえる。事件は終結し、サミットのＶＩＰ受け入れ準備が進むなか、成嶋は突如「湾空ではＶＩＰを迎えられない」と主張する。

いつもと違う成嶋優弥（大倉忠義）の様子を不審に思うＲＯＭＥＳチーム。やがて、成嶋のかつての恩師でテロリストに協力したデイビス教授（ジャンフランコ・シモーネ）の存在が浮かび上がる。ＲＯＭＥＳチームは「デイビスがサミットで来日する首脳陣を狙い、そこに成嶋を巻き込もうとしているのでは？」と疑念を募らせる。ＶＩＰ来日の日、黒部（渡辺裕之）の娘が誘拐されたという知らせが飛び込んでくる。