仓库被摧毁象征着潘多拉魔盒被打开，世界陷入绝望。为了拯救人间，一行人循着怀表线索去寻找能让时间倒转到24小时前的藏物。时间越来越紧迫，为了大局倒下的探员越来越多，最后只剩阿迪手握藏物，守护藏物的人告诉阿迪，如果他使用了藏物，他将亲手孕育出一个终生跟随的恶魔。阿迪毅然选择了拯救仓库，却梦到克劳迪亚在追杀他，与此同时，克劳迪亚消失在风雨交加的午夜中。

克劳迪亚用节拍器复活了金克斯，然而却没有得到董事会的允许，董事们都为使用藏物产生的副作用而担心，阿迪也在竭力调查使用星盘后释放出的恶魔会与克劳迪亚有何关系。皮特和麦卡到费城执行任务，很多人声称他们看到怪物，而实际上受到他们攻击的只是普通人。

麦卡和皮特去找塞克斯收起的藏物，然而已经被小贼捷足先登，并典卖到典当行，阿迪琳娜、克劳迪亚金克斯和麦卡皮特兵分三路寻找散落的藏物。路途中，阿迪的秘密，金克斯的副作用初露端倪。

阿迪派皮特和克劳迪亚去接收雨果通过快递收到的藏物弹珠，雨果把弹珠给侄子展示，然而不幸这批让人注意力集中又能导致极端暴力的弹珠有几颗在校园流行开来。麦卡和金克斯去调查一起医生的重症病人一夜之间康复的案件，金克斯告诉了麦卡使用节拍器的副作用，那就是对他的伤害会全部反噬在克劳迪亚身上。阿迪使用星盘的秘密终于被发现了，守护星盘的兄弟会向阿迪宣战，阿迪这才意识到原来雨果收到的弹珠早已被他回收，然而兄弟会取走并寄给雨果以作警告。

麦卡和皮特去加拿大调查一起伤人案。一名冰球运动员在比赛时受伤，但他不仅继续完成了比赛，甚至还将对手撞出玻璃了墙外。麦卡和球员发展出了一段暧昧情愫，然而案件调查中途，麦卡竟然怀孕了，大肚婆身手可就没有以前那么灵敏了。另一方面阿迪发现他亲手收集的藏物全都被盗了，虽然在金克斯的协助下，重新找到了失物，但金克斯恐怕已经散失了一些。至于克劳迪亚，则在F夫人的引领下，体验了一次生命与爱创造的美妙。

兄弟会继续攻击阿蒂的生活，目标是与他关系密切的人爱丽丝·利德尔，道奇森镜子中被囚禁的灵魂。与此同时，克劳迪娅了解到她和史蒂文之间的联系。

当皮特和米卡调查一系列与神器相关的成长爆发时，阿蒂不情愿地带着史蒂夫和克劳迪娅一起去追踪阿德里安兄弟，以免他从仓库偷走更多神器​​。

皮特和米卡前往西弗吉尼亚州调查钢铁工人中类似锈病的感染，史蒂文和克劳迪娅则前往史蒂文的家中寻找一种方法来打破节拍器对他的控制。与此同时，海伦娜、莉娜和弗雷德里克夫人质问阿蒂，他们了解阿蒂所做的一切。

艾德里安修士把藏物寄给了皮特的前妻，麦卡的妹妹和克劳迪亚的哥哥，三人连忙前往。阿迪决心结束这一切，无暇顾及其他，这一次的难题他们则只有靠自己化解了。F夫人和金克斯前往梵蒂冈兄弟会调查，却发现艾德里安修士与其他兄弟会成员四个月来都被困在一幅画中，原来阿迪口中的一切都是他的幻觉，这便是使用星盘的副作用。阿迪也发现了真相，混乱中精神崩溃黑化，F夫人吩咐琳娜快走，琳娜不忍丢下阿迪，正赶回仓库的皮特有一种前所未有的不好预感，他们打电话回仓库中，而琳娜已经倒在了血泊中。

团队没有时间哀悼倒下的战友，因为他们正在追捕责任人，自从阿蒂使用麦哲伦星盘拯救世界以来，这个宿敌就一直在跟踪他。

世界的命运掌握在他们手中，皮特和米卡找到治愈出汗症的唯一希望是一位醉酒的历史教授。与此同时，史蒂文和克劳迪娅进入阿蒂的潜意识，试图在他永远消失之前将他从昏迷中唤醒。

皮特和克劳迪娅前往俄勒冈州寻找一件用来杀死环保运动敌人的神器，而阿蒂则在处理莉娜之死的后果。

皮特和米卡前往拉斯维加斯调查两起莫名其妙从高处坠落的死亡事件，而克劳迪娅和史蒂文则调查伦敦的两名骑师，他们在赢得比赛后陷入昏迷。与此同时，阿蒂邀请一位访客来到仓库。

H.G. 在威斯康星州为自己创造了新生活，但当她遇到不明物品时，她打电话给特工。与此同时，阿比盖尔和其他人一起在仓库的地板上寻找可能摧毁建筑物的神秘震动的来源。

皮特、米卡和史蒂文与一名美国法警联手追捕两名使用熔岩喷射神器越狱的囚犯。然而，他们发现元帅是史蒂夫的前任。与此同时，阿蒂和克劳迪娅试图找到导致阿蒂失聪的人工制品的一部分……

封闭社区中有人正在使用一件神器来实施报复，米卡和皮特前去调查。与此同时，阿蒂和克劳迪娅帮助一名患有危险幻觉的青少年，史蒂文和阿比盖尔清理仓库。

特工们找到了一批由臭名昭著的咆哮丹·西维从 12 号仓库偷走的文物……并由他的鬼魂看守。与此同时，夏洛特·杜普雷斯在内部人士的帮助下采取了行动。

皮特、米卡和夏洛特必须找到萨顿，他是唯一知道在哪里可以找到帕拉塞尔苏斯的人，并用贤者之石交换石碑，以将克劳迪娅从青铜囚禁中解救出来……在她崩溃之前。

皮特和米卡抓住了帕拉塞尔苏斯，但在他使自己变得不朽之前。当米卡的癌症恶化时，皮特必须与帕拉塞尔苏斯达成协议以治愈他的伴侣。与此同时，克劳迪娅从阿蒂那里收到了一些令人震惊的消息。