Los agentes del servicio secreto estadounidense Pete Lattimer y Myka Bering son premiados con un traslado a un almacén llamado Almacén 13. Ahora son los responsables de la recolección de diferentes objetos relacionados con lo sobrenatural. Después de los eventos pasados, los agentes del servicio secreto estadounidense Pete Lattimer y Myka Bering siguen buscando en Iowa el artefacto que canaliza a Lucrecia Borgia.

Pete y Myka van tras un equipo de ladrones de bancos que cuentan con un arma muy especial. Mientras, Artie investiga un problema de seguridad.

Pete y Myka son enviados a investigar un pueblo en el que las mentes de sus habitantes están siendo alteradas de manera que éstos actúan sin pensar.

El robo de una escultura lleva a Myka y Pete a una cueva India sagrada que alberga un antiguo secreto de la creación... y la destrucción, y que está en relación con la tribu Lenape.

Mientras investigan el lugar de una supuesta explosión de gas, Pete y Myka se sorprenden al descubrir el cuerpo de otro agente del Almacén. Las cosas se complican aún más cuando el objeto que buscan se une a la columna vertebral de Pete. Esto hace que tenga que canalizar cantidades peligrosas de electricidad, lo que le enfada y lo hace muy peligroso.

Pete y Myka regresan a Washington para interceptar una espada de samurai que se va a presentar al presidente, y descubren a MacPherson, un competidor para los artículos que pertenecen al Almacén. Se revela que Artie tiene antecedentes penales.

Pete y Myka van a Las Vegas en busca de un artefacto que está ayudando a un par de jugadores, pero la misión se tuerce cuando Myka cambia de lugar con Alice Liddell quedando atrapada en el espejo de Lewis Carroll.

Artie envía Pete y Myka a una prisión en Florida con el fin de investigar las denuncias de un número inusualmente alto de suicidios inexplicables; Claudia descubre un uso práctico para uno de los artefactos del Almacén mientras realiza el inventario.

Artie recibe una invitación para merendar con la señora Frederic, quien no deja de hacerle preguntas. Pronto descubre que varios de sus superiores se encuentran en el mismo restaurante y que quieren saber cosas sobre Artie y su antiguo compañero, MacPherson. Los jefes pretenden que le dé caza. Mientras tanto, Pete, Myka y Claudia se quedan atrapados en el almacén por culpa de un error informático en el ordenador de esta última.

El padre de Myka es víctima de la libreta de notas de Edgar Allan Poe, mientras que un joven enamorado utiliza la pluma de este escritor para crear estragos en su instituto; siendo todo esto planeado por MacPherson para obtener ambos artefactos.

La señora Frederic descubre que Artie y MacPherson discutieron sobre si utilizar uno de los artefactos para salvar la vida de Carol. Artie no ha confiado en nadie desde entonces. Por otro lado, Claudia encuentra el bolígrafo de Edgar Allan Poe a la venta en Internet, pero cuando Artie pincha en el enlace, un virus se introduce en su ordenador. Mientras tanto, MacPherson trata de vender los artefactos que robó del almacén en una subasta privada. El equipo tratará de encontrar el lugar donde se está celebrando para dar así con su antiguo compañero.