2147 год. Максим спасает Аню и Артёма из бункеров, где проходил их карантин, и они отправляются в опасное путешествие через леса на поиски родителей Ани. По пути дети встречают дозор Первого поколения, который приводит Аню и Артёма в Последний город.

Когда ученые программы «Наследие» готовили Первое поколение к зачатию детей, выяснилось, что это поколение полностью бесплодно, однако именно ему удалось захватить власть и превратить Второе поколение в рабов. Пока Аня живет со Вторыми, на жестокого лидера Первых готовится покушение.

В прошлом Максим на приеме у психолога рассказывает, что ему снится неизвестная девочка. Титов увеличивает дозу лекарства, но Максим не пьет его, а по ночам проводит разведку, составляя карту бункера. В настоящем времени в Последнем городе Аня готовит побег Второго поколения.

Иван находит в морге труп Егора, рассказывает Первым о его смерти и провале программы «Наследие». Первые устраивают бунт, в результате которого начинается пожар. Всем, кроме Ивана, удается бежать из бункера.

Когда Иван приходит в себя, оказывается, что в бункере заперты медицинские сотрудники Нина и Роман. Вместе они начинают искать выход. В настоящем Максим и Аня встречают ученых программы «Наследие» Штудберга и Озерову.

Аня, Максим и ученые направляются к центральному бункеру. По дороге Озерову ранит стрела ловушки для животных. Пока Штудберг отвлекает охрану Первых, остальные проникают в бункер. Иван не может поверить в слова Ани и Максима о том, что Лидия стала тираном, и отправляется в Последний город, чтобы поговорить с ней.

Лидия приказывает убить Титова и привести к ней родителей Ани. Титов и Второе поколение выходят на вылазку в горы. В Последнем городе происходит смена власти.

Финал сезона! Добравшись до цели, Аня запускает разморозку криокапсулы мамы и обнаруживает еще одну капсулу. Увиденное шокирует ее.