Richard a Lily vychovávají společně malou Isabelle, která je už šest měsíců. Žijí spolu v domku v horách za malým městem. Místní náboženský fanatik všem rozdává letáky, že skupina 4400 jsou přívrženci ďábla, a když Jordan Collier vydá knihu o 4400, vtrhne do místního krámku s tím, že prodavač musí knihy okamžitě stáhnout z prodeje. V krámku je však i Lily s Isabelle.

Tom and Diana investigate a mysterious structure being built at a psychiatric hospital, based on the drawings of one of their patients who's a 4400.

Plus d'un an s'est écoulé depuis le retour des 4400. Tom a repris son travail au NTAC mais a été assigné à une tache purement bureautique. Diana, qui a adopté Maia, réussit finalement à le faire réintégrer à son ancien poste. Ils font de nouveau équipe pour enquêter sur les événements entourant les 4400. De leur côté, Richard et Lily se sont réfugiés dans la montagne pour protéger leur bébé. Enfin Jordan ouvre un nouveau Centre destiné aux personnes ne faisant pas partie des 4400 et qui veulent les comprendre. Il est aidé par Shawn qui accepte de soigner les riches bienfaiteurs du Centre...

Tom und Diana untersuchen einen mysteriösen Fall von Massenverwirrung. Insassen und Personal einer Nervenheilanstalt fangen an, ein merkwürdiges Konstrukt zu bauen. Initiiert scheint das Ganze von Tess Doerner, einer der 4400, zu sein. Soll hier ein Sender konstruiert werden, über den man mit der Zukunft in Kontakt treten kann?

בפרק הפותח את העונה השניה, דיאנה שצוותה לסדרת שותפים לא מתאימים, מצליחה לפרוץ את נוקשות הבירוקרטיה ולהשיב אליה את טום, וזאת במקביל לתהליך האימוץ הרשמי של מאיה.

Tom és Diana egy pszichiátrián nyomoznak, mely kórházban egy skizofréniával küszködő 4400-as van, Tess Doerner. Richard-nak meg kell védenie a családját, amikor kiderül, hogy ő és Lily 4400-asok.

È passato un anno dal ritorno dei 4400. Dopo un periodo di intensa osservazione medica, Tom torna all'NTAC, ma viene relegato a svolgere esclusivamente mansioni d'ufficio. Diana trova finalmente un modo per aggirare la burocrazia e riprendersi Tom.

Kyle tenta visitar o primo Shawn. Richard e Lily querem proteger a filha, Isabelle, de Collier e outros maníacos, e um esquizofrênico 4.400 quer um dispositivo de comunicação.

Диана официально удочеряет Майю, у которой уже 4 месяца не появляются видения. Кольер умело использует исцеляющий дар Шона. Одна из вернувшихся, Тесс Доэрнер, страдающая шизофренией и проходящая лечение в психиатрическом центре, рисует странные картины, похожие на чертежи какой-то башни. Внезапно другие пациенты приступают к сооружению этой конструкции во дворе больницы. Через некоторое время к ним подключается и персонал больницы. Тесс считает что это устройство поможет ей вернуться обратно в будущее, но у башни совсем другое назначение, НКОУ пытается помешать строительству.

Тем временем Ричард и Лили Тайлеры ищут убежище, вдобавок ко всему прочему их преследуют воинственно настроенные религиозные фанаты.

Det har gått ett år sedan de 4400 återvände. Allmänheten är delad i två läger - de som välkomnar dem och de som fruktar dem.