Dopo aver pestato un ausiliare del traffico, Stan viene processato in tribunale. Per scontare la sua pena, deve per un certo periodo a fare lo stesso lavoro della sua "vittima".

Grazie alla sua famiglia, Stan si rende conto che non ha amici. Così decide di pregare Dio affinché gli mandi un amico. Quando pensa di averne trovato uno, scopre che è ateo e cerca in tutti i modi di convincerlo dell'esistenza di Dio.

Stan e Francine ricevono la visita indesiderata dei genitori cinesi adottivi di lei, Mama e Baba. Ma tra le due famiglie c'è subito uno scontro tra culture. Stan decide di andare alla ricerca dei veri genitori e di farli conoscere a Francine. Intanto Steve tenta di far colpo su una ragazza, ma nell'impresa di attirare la sua attenzione, si rompe un dito a causa di un petardo.

Hayley vuole trasferirsi in Francia per sfuggire all'oppressione imperialistica americana, ma Stan cerca di trovare il modo per fermarla.

I colleghi della CIA scoprono che Stan non ha mai ucciso nessuno. La 'sconcertante' rivelazione fa subito scattare la ricerca della vittima sacrificale.

Stan, stanco delle stravaganze di Roger, litiga con Francine accusandola di difenderlo sempre. L'alieno si dispera, convinto che Stan non gli voglia più bene.

Francine si offre di diventare una madre surrogato per i vicini di casa gay, ma Stan non la prende affatto bene.

Stan è sulle tracce di Strappalacrime, un produttore che invita le celebrità nel proprio centro benessere per sostituirle con robot identici a loro.

La mamma di Stan non riesce a trovare un fidanzato. Francine, esasperata dall'averla in casa, le combina un appuntamento con Hercules, il suo macellaio greco. Quando i due sono al terzo appuntamento (quello in cui tutti gli uomini con cui Betty è uscita sono spariti misteriosamente), Francine li segue e scopre che Stan ha sempre rapito tutti gli uomini di sua madre perché non voleva che provasse altro dolore. Alla fine Stan capisce che deve lasciare che sua madre ed Hercules si sposino. Durante il viaggio di nozze in Grecia si vede la isola in cui Stan ha lasciato gli ex di Betty dopo averli rapiti.

Julie, la migliore amica di Francine, è disperata perché suo marito Craig, agente della CIA come Stan, è scomparso. Sapendo che Julie e Craig si dicevano tutto Francine cerca di fare lo stesso con Stan e ci riesce grazie a Roger. Quando Stan confessa a Francine di aver ucciso Craig poiché aveva parlato del lavoro con la moglie e che avrebbero dovuto uccidere anche lui, Francine non vuole più sapere niente e mantiene il segreto. Quando nota che Julie e Stan stanno legando molto facendo cose che spaventavano Stan (le fontane, le bibite con il ghiaccio ecc.), Francine confessa tutto a Julie che minaccia di andare alla polizia ma Francine la stordisce per proteggere il marito. Quando Julie tenta di suicidarsi Stan rivela di non aver ucciso Craig e che era tutto un piano creato insieme a Roger: Craig si sarebbe trasferito nel Laos e risposato poiché non sopportava la moglie e il fatto di dirgli tutto e che tutti i segreti che Stan aveva detto a Francine erano bugie. Alla fine dice solo una cosa: il suo colore preferito è il blu. Alla fine Julie viene curata dall'alter ego psicologo di Roger, il Dott. Pinguino.

Stan non ha tempo per aiutare il figlio a costruire un modellino di razzo per la gara scolastica. Decide allora di affidarlo al vicino russo.

Alla ricerca dell'albero di Natale perfetto per la sua famiglia, Stan muore prematuramente. Giunto nel limbo, apprende una sconvolgente verità.

Roger fa pubblicare le sue foto e la CIA avvia una task force contro gli alieni comandata da Jackson, da Stan e poi da Roger stesso sotto le mentite spoglie del fotografo.

Dopo aver rischiato di morire, Stan si rende conto di non aver fatto nulla di importante nella vita. Così inizia a cercare il tesoro di Oliver North, l'ex proprietario della casa che avrebbe nascosto l'oro sotto casa sua. Intanto la situazione con Steve e Haley peggiora: lui si fa un aspirapolvere come fidanzata e lei molti più percing. Quando trova l'oro la struttura crolla Stan sviene e vede come sarà la sua vita: sarà morto, famoso e avrà un museo tutto suo ma sarà disprezzato per come sono finiti i suoi figli: Steve si è fatto un robot femmina e Haley è piena di percing e ha addirittura un piatto sul mento che gli serve per l'elemosina. Stan si salva e raddrizza i figli capendo che sono loro il suo lascito.

Stan viene colto dalla gelosia nello scoprire che un ex di Francine era un pilota, precipitato poi con il suo aereo. Francine sa che il pilota è sopravvissuto. Stan credendo che Francine avesse scelto lui poiché Travis (il pilota) era sicuramente morto, decide di fingersi disperso con il suo aereo con Roger quando in verità è in un'isola della CIA dalla quale controlla con delle telecamere (non così nascoste alla fine) la situazione in casa e infatti Francine inizia una storia con Travis. Purtroppo l'isola viene distrutta da uno tsunami lasciandone solo uno scoglio. Alla fine Stan, tornato a casa con Roger dopo essere stati tratti in salvo da una nave scopre che Francine sapeva del suo piano (come detto prima le telecamere non erano così nascoste) e aveva finto di stare con Travis e si riconciliano. Intanto Steve per strada trova un gatto che però viene investito sopravvivendo ma diventando aggressivo attaccando Steve che se ne va indignato. Il giorno dopo va con Snot a vedere il gatto che però non attacca l'amico che non crede a Steve. Ma quando questi se ne va Steve nel provare ad accarezzarlo viene di nuovo attaccato. Giorni dopo Steve dopo un'esibizione con violino a scuola rivede il gatto e rinuncia a una ragazza pur di abbracciarlo, venendo attaccato per l'ennesima volta. Stavolta Steve lo uccide (si rivelerà vivo poi) con il violino. Il gatto però arriva a casa Smith (era il nuovo cappello di Roger) e , fuori dall'immagine, attacca Steve.

Roger torna a casa ubriaco e trova l'intera famiglia che lo aspetta, pronta a fargli la predica. Tutti si lamentano del suo egoismo e del suo atteggiamento prepotente.

Francine, annoiata dalla routine matrimoniale, parte per una settimana per andare ad accudire il padre che ha subito un'operazione all'ernia.

Stan diventa il tuttofare del suo capo e per non deluderlo si sente in dovere di svolgere qualsiasi compito gli venga richiesto. Francine però non è d'accordo.

È tempo di eleggere il presidente del consiglio studentesco. Lisa si è ricandidata e non ha avversari, ma Steve convince Debbie a candidarsi per dare voce ai nerds.

Steve è entrato nel periodo della pubertà e i suoi genitori ne sono allarmati. Così, grazie a un ritrovato della CIA, lo fanno regredire all'infanzia e poi lo fanno diventare vecchio.

Il sosia di Stan si fidanza con Hayley e Francine, che scambia il sosia per Stan, si sente male. Intanto Stan scopre che il sosia sta tentando di insidiare sua moglie.

La C.I.A. Deve raccogliere dei soldi per finanziare le torture Roger propone a Stan di organizzare un Theleton per raccogliere fondi. Ma Stan si appropria dell'idea e perciò Roger decide di vendicarsi travestendosi da fantasma dell'opera e sabotando il telethon ma Stan riesce a catturare Roger.