새벽에 한적한 교차로에서 교통사고가 발생해 과학 수사대원들이 달려간다. 사망자는 다름 아닌 유명 여배우 올리비아 해밀튼. 올리비아의 차를 한 SUV가 들이받아 올리비아가 즉사한 것이다.

한 숲속에서 처참하게 맞아 죽은 한 젊은 남성의 시체가 발견된다. 그런데 손목의 상처를 살펴보던 부검의가 이상한 물체를 발견한다. 라디오 주파수 인식 칩이 손목에 이식돼 있었던 것이다.

총성을 듣고 LA 근교 빈민가에 출동한 핀 경관은 한 흑인이 뒤돌아서 총을 쏘는 것만 보고 함께 발포한다. 하지만 조사 결과 죽은 흑인 역시 경찰임이 밝혀지고 핀이 과잉 진압을 하지 않았냐는 추측들이 난무한다.

풋볼 팀 머스탱을 이끄는 밀러 감독은 모두에게 존경받고 신뢰를 얻은 인물이다. 원칙과 도덕을 중시하는 밀러는 선수들에게 팀에 대한 충성이 제일 중요하다고 강조한다. 어느 날 그는 자기 집에서 머리를 여러 번 얻어맞아 과다출혈로 사망하고 만다.

한 골목에서 청년이 심하게 구타당했다는 신고가 들어와 캐서린과 닉이 현장에 나간다. 캐서린은 현장에서 증거를 채집하고 닉은 병원으로 피해자를 따라가서 진술을 들으려 하는데, 피해자는 난데없이 닉에게 화를 내며 협조를 거부한다.

탠지어스 호텔의 정원에서 한 여자가 목을 베인 채로 발견된다. 피살자는 전형적인 매춘부의 소지품을 가지고 있었는데, 현장에 온 데이빗은 그녀가 TV에 나오는 다른 카운티의 기상 캐스터인 디디 체이스라고 알려 준다.

한 볼링장에서 X맨이라 불리는 케빈 채츠와 셰비 식스의 볼링 대회가 열린다. 마지막 프레임을 남겨 둔 셰비, 마지막 공으로 챔피언이 가려지는 순간인데 리턴에서 볼링공이 아닌 사람 머리가 나오고 순식간에 대회장은 아수라장이 된다.

헨리의 생일을 맞아 닉과 그렉, 하지스는 그를 데리고 유명한 바비큐 식당을 찾아간다. 그런데 외진 곳에 있는 식당을 찾아가던 도중, 중앙선을 침범해 달려오던 한 차와 충돌해 차가 한 바퀴 구르고 만다.

리날디 총기상에서 난데없이 총격전이 벌어져, 그 가게를 운영하던 들로레스 리날디는 사망하고 아들인 행크는 총상을 입는다. 그리고 손님인 에드 스미스까지 총에 맞아 죽는다.

순찰 헬기가 한 황무지에서 수상한 트럭을 발견해 순찰대가 운전자를 체포한다. 그런데 놀랍게도 운전자의 트럭에는 한 남자애의 시체와 인간 장기들이 들어 있었다. 레이는 그것도 지킬 박사의 소행으로 추정한다.

푸시다 골프 대회의 전날 라운드에서 새로운 최저타수를 기록한 대니 나가노가 연달아 실수하며 경기를 어렵게 풀어나간다. 그런데 한창 경기가 진행되던 중 골프 코스에서 난데없이 한 남자의 시신이 발견된다.

트레버 벡이 학교에서 시비가 붙었다가 별다른 외상 없이 쓰러져 죽는다. 그의 여자 친구인 신디 워너 역시 전날 밤부터 실종되면서 사건은 미궁으로 빠져든다.

컨트리 음악 밴드 래스컬 플래츠의 한 멤버가 공연 도중 감전을 당해 부상을 입어 과학 수사대가 나섰다. 한편 2차 세계대전 때의 물건을 지닌 신원 미상의 한 남자가 호숫가에서 발견된다.

익명의 남성이 길가에서 시신을 봤다는 제보를 한다. 과학 수사대가 달려간 곳에는 어린 소년의 시체가 있다. 윌 서터라는 14살짜리 학생의 손톱 밑에서 아내를 살해해 복역 중인 사이먼 로즈의 피가 나오며 사건은 미궁으로 빠져든다.

한 호텔에서 잠복근무가 진행된다. 엑스터시의 남서부 지역 최대 공급자인 에버렛과 벨이 호텔에서 엑스터시를 만들어 파티에서 판매하는 것을 덮치기 위한 작전. 그런데 호텔의 하역장에서 한 여성의 시신이 발견된다.

한 평화로운 동네의 주택에서 참혹한 살인 사건이 발생한다. 부부와 그 집의 개가 총에 맞아 살해된 것이다. 살인범이 현장에 남긴 확실한 단서는 금속 가루 뿐인데...

레이가 뇌진탕으로 병가를 내자 호지스가 레이 대신 견습생들의 실습을 돕게 된다. 의욕 넘치는 한 견습생이 호지스를 CSI 대원으로 오해하고 진짜 사건에 기초한 수사를 해 보고 싶다고 의견을 피력하자 호지스는 케이티와 그의 팀을 도전에 초대한다.

비가 억수같이 쏟아지는 어느 날 제퍼슨 고등학교 근처 하수구에서 숀 베커의 시체가 발견된다. 숀은 냉혹한 인종차별주의자로 늘 사고만 일으키다가 최근에 퇴학당한 제퍼슨 고교 학생이었다.

30년 전 유명한 코미디언으로 콤비를 이뤄 쇼를 했던 너클스와 내쉬가 오랜만에 컴백 무대를 갖기로 하고 열심히 리허설을 한다. 그런데 내쉬는 너클스와 달리 늘 대사를 까먹고 재치를 발휘하지 못한다.

주말에 결혼식을 앞둔 브렌다와 친구들은 술에 취한 채로 신나게 고속도로를 달리다가, 자넷을 치고 만다. 브래스의 친구인 자넷은 3년 전에 남편과 두 아이 모두를 실종당했는데, 사건은 아직 미결 상태로 남았다.

연쇄 살인마 지킬 박사를 뒤쫓던 한 여기자가 쓰레기장에서 주검으로 발견된다. 과학수사대가 여성이 출입한 카지노 영상을 판독한 결과, 레리 랭스턴도 같은 시간에 같은 장소를 방문했다는 사실이 밝혀진다.

해스켈은 연쇄 살인범인 지킬에 대한 정보가 있다고 레이 랭스턴에게 연락해 온다. 정보를 얻기 위해 해스켈을 경찰청으로 데려오지만, 그는 순순히 정보를 제공하지 않는데...