Lorsqu'un meurtre semble être l'étrange copie de celui d'un livre, son auteur, Richard Castle, romancier très célèbre devient le premier suspect de l'enquête.

Au plus grand désarroi de Beckett, Castle a fait jouer ses connaissances avec le maire qui lui a permis de suivre Beckett afin de s'inspirer pour ses futures oeuvres littéraires. L'équipe enquête sur la mort de Sara Manning, une nourrice retrouvée morte dans la laverie d'un immeuble d'habitations. Beckett et Castle ont de forts soupçons envers son ancien patron, mais Castle découvre un indice qui fait basculer l'enquête...

Durant leurs investigations, le nouveau duo apprend peu à peu à se connaître, et Beckett découvre notamment une sensibilité inattendue chez Castle...

Un adolescent d'une riche famille désormais ruinée est retrouvé mort à Central Park, sur une barque. Les premières investigations mènent Beckett et Castle aux amis de la victime. D'abord silencieux, ils finissent par révéler que Donald était mêlé à un trafic de stupéfiants, et que son fournisseur serait le meurtrier. Mais alors que tout concorde, Castle ne semble pas convaincu. L'affaire prend une autre direction lorsqu'un autre adolescent de la bande est retrouvé mort...

Parallèlement, l'enquête fait naître quelques inquiétudes chez Castle au sujet des fréquentations de sa fille...

Un cadavre est découvert au cœur de New York, soigneusement enroulé dans ce qui fut un superbe et luxueux tapis. Castle et Beckett découvrent que la victime est Jeff Horn, un homme politique en pleine campagne électorale. Rapidement, ils suspectent un investisseur de la ville, en froid avec Horn, mais il finit par être innocenté. L'enquête s'oriente vers une autre piste lorsque l'équipe découvre une partie de la vie privée peu reluisante de la victime...

Parallèlement, Castle s'indigne du goût du café au commissariat, tandis que son nouveau roman "Storm Fall" sort en librairie...

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre d'une femme qui a été trouvée congelée et attachée à une structure métallique dans un hangar en travaux. L'autopsie de Lanie révèle que la victime était droguée, et qu'il s'agit de Mélanie Cavanagh, disparue depuis 5 ans. Beckett soupçonne d'abord son petit ami, mais découvre que celui-ci est mort assassiné il y a un an. Le policier chargé de l'affaire n'ayant pas réellement enquêté, l'équipe reprend donc tout au début...

Parallèlement, Beckett est touchée par l'affaire et de vieux souvenirs remontent à la surface, ce qui n'échappe pas à Castle...

Beckett enquête sur l'assassinat d'un immigrant torturé, dont le cadavre a été exposé à un rituel vaudou bien défini. Rapidement, Beckett et Castle comprennent que le suspect est à la recherche de quelque chose et qu'il tuera jusqu'à le retrouver. Lorsqu'un deuxième corps est découvert, ils remontent jusqu'à un marchand de contrefaçons, mais son entrepôt est couvert de symboles signifiant que l'on souhaite sa mort. L'équipe redouble alors d'efforts pour éviter de nouvelles victimes...

Parallèlement, Castle retrouve Meredith, sa première femme, et tous deux se remémorent leur bonheur passé, jusqu'à ce que Meredith annonce à Castle une nouvelle pour le moins surprenante...

L'équipe se penche sur le meurtre d'une riche propriétaire faisant suite à une vague de vols de bijoux dans la haute société new-yorkaise. En enquêtant sur le milieu des voleurs professionnels, Castle et Beckett soupçonnent un fabricant de pass pour serrures, mais celui-ci est rapidement innocenté. Faisant le rapprochement entre les victimes et une association regroupant de riches donateurs, Castle suggère à Beckett de se rendre à une soirée caritative où les coupables pourraient être en repérage. Tous deux débarquent alors en tenue de soirée...

L'enquête est aussi l'occasion pour Castle de renouer contact avec une vieille connaissance. Après des retrouvailles tendues, Powell s'avère être particulièrement important pour l'affaire en cours...

Au milieu de la nuit, Beckett et Castle sont appelés dans un hôtel sordide où le corps d'une mère de famille est retrouvé noyé dans une baignoire remplie d'huile de moteur. Lorsque Esposito commence à enquêter, il découvre avec stupeur que la victime, Allison Goldman, trompait tout son entourage en ayant caché sa véritable identité. Après quelques recherches, l'équipe relie Allison à une écrivain spécialiste des histoires criminelles, Lee Wax, qui révèle de troubles informations tout en s'intéressant beaucoup à Castle...

Dans le même temps, Castle et Beckett disputent des parties de poker en compagnie de leur entourage, mais celles-ci ne se déroulent pas vraiment comme elles devraient...

Will Sorenson, agent du FBI et ancien petit ami de Beckett, demande l'aide de celle-ci à Montgomery pour une affaire d'enlèvement. La petite Angela, 2 ans, a été enlevée en plein jour au domicile de ses parents adoptifs. Rapidement, les parents suspectent un ancien collègue de la mère d'Angela, qu'elle a fait licencier. Lorsque son alibi est vérifié, Beckett et Sorenson se tournent alors vers les parents biologiques. De son côté, afin de faire avancer l'enquête, Castle se porte volontaire pour faire le coursier lorsque les ravisseurs formulent une demande de rançon...

Parallèlement, l'enquête oblige Beckett à se remémorer une vieille enquête à l'issue douloureuse, ainsi que sa relation avec Sorenson. De son côté, celui-ci se livre à une guerre de jalousie avec Castle...

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre d'un chirurgien esthétique, porté disparu depuis près d'une semaine. L'homme a été retrouvé mort sur le siège avant de son véhicule. L'équipe s'intéresse alors au monde secret de la beauté plastique, des opérations et des patients obsédés par leur physique. Mais leur enquête les emmène peu à peu dans une direction inattendue, et l'affaire se révèle plus délicate que prévu, si bien que Beckett sollicite l'aide de Sorenson...

Parallèlement, Alexis se rend à son premier bal de promo, tandis que Castle poursuit discrètement ses recherches sur le meurtre de Johanna Beckett...

Beckett ne digère toujours pas l'initiative de Castle de s'être mêlé de sa vie privée, mais est contrainte d'accepter sa présence à ses côtés, en obligeant celui-ci à s'engager de quitter le commissariat une fois l'affaire close. L'équipe enquête sur la mort d'un assureur retrouvé mort dans un arbre en plein New-York. Pendant que Lanie reproche à Castle son comportement, des hommes cagoulés débarquent et volent le cadavre. Lorsque celui-ci refait surface, il est mystérieusement dépouillé de ses organes internes. Castle soupçonne la victime d'être une mule, et finit par enquêter sous couverture, sous la surveillance de Beckett...

Parallèlement, Alexis prévoit une sortie avec Owen, mais tout ne se passe pas comme elle l'aurait espéré...

Deux meurtres ont lieu le même soir : un règlement de compte personnel au domicile d'une jeune femme, et une agression dans la rue. Castle et Beckett enquêtent sur le premier meurtre tandis que Ryan et Esposito se chargent du second, et entrent ainsi dans une compétition féroce pour savoir qui résoudra leur affaire en premier. Alors que les suspects ne manquent pas pour chacune des victimes, aucune des pistes ne parvient à aboutir... jusqu'à ce qu'on découvre que les deux meurtres sont liés !

Une jeune femme est retrouvée morte dans une fontaine publique, sans chaussures. En découvrant sa profession de mannequin, Castle et Beckett plongent dans l'enfer de la mode : les pressions, la compétition, le chantage, la traque des admirateurs... Rapidement, l'enquête s'oriente vers un homme qui harcelait la jeune femme, mais lorsque l'équipe comprend que la victime originaire de la campagne allait devenir une star, la jalousie devient le mobile prioritaire...

Pendant l'enquête, Castle retrace la route d'une ancienne connaissance, sans se douter de qui il peut réellement s'agir...

Des élèves de primaire assistent au meurtre de Steven Fletcher pensant regarder l'un de ses reportages dans le cadre de son expédition au pôle nord financée par l'école. L'équipe examine la vidéo et comprend que la victime n'est jamais partie en Arctique, mais que l'homme réalisait ses reportages dans son appartement, avec un simple décor. Castle et Beckett découvrent alors que Fletcher avait volé plusieurs identités et que c'était un spécialiste des arnaques...

Parallèlement, Alexis a un nouveau professeur de violon, et Beckett explique à Castle qu'elle n'a pas encore lu son roman...

Une jeune femme tchèque a été tuée et jetée dans une bouche d'égout. Gouvernante pour un jeune couple fortuné, elle avait été renvoyée il y a peu pour son comportement étrange. Après avoir écarté la piste de l'ex-mari, Castle et Beckett soupçonnent une liaison avec son employeur qui se serait mal terminée. A moins qu'il n'y ait un lien avec l'enfant du couple, ce qui expliquerait le comportement étrange de la jeune femme... De son côté, Castle se voit offrir l'opportunité du siècle : poursuivre la saga de «l'espion britannique» légendaire. Mais accepter cette offre signifierait aussi tirer un trait sur les aventures de Nikki Hard...

Tandis que Richard Castle prépare sa fête d'Halloween, il est appelé par Kate Beckett pour un homicide dans un cimetière. Un «vampire» aurait été retrouvé poignardé avec un pieu !... Leur enquête les mène tout droit au cœur d'une communauté new-yorkaise clandestine, dont les membres vouent un culte quasi fétichiste aux vampires et autres buveurs de sang...

Alexis apprend via internet que Hayley Blue, une chanteuse rock qu'elle adore, a été retrouvée assassinée ! Chargés de l'enquête, Castle et Beckett font connaissance pour l'occasion avec un monde désenchanté, celui des fans inconditionnels, des managers ripous et des musiciens jaloux... Désireuse de les aider, Alexis découvre un indice déterminant en écoutant attentivement les paroles de la dernière chanson de sa chanteuse fétiche...

Castle et Beckett enquêtent sur la mort d'un coursier à vélo dans un accident avec délit de fuite. Ce dernier a délibérément été renversé pour être empêché de livrer un certain paquet, dont le contenu est susceptible de faire libérer de prison un individu condamné à tort. Suite à un étrange concours de circonstances, les enquêteurs remarquent que cette affaire semble liée à une autre sur laquelle le capitaine Montgomery avait enquêté quelque dix ans plus tôt... Pour résoudre leur enquête actuelle, Castle et Beckett vont devoir retourner dans le passé pour fouiller dans les secrets et autres scandales d'une célèbre famille new-yorkaise...

Jack Buckley, un procureur connu pour son intégrité, a été poussé du toit d'un parking. Beckett et Castle soupçonnent un voyou, John Knox, mais celui-ci a un alibi en la personne d'un révérend. Le beau-frère de Buckley a reçu des menaces d'un proxénète et avoue fréquenter des prostituées. L'une d'elle, Scarlett Price, révèle que le réseau est tenu par un certain Danton...

Sam Parker est retrouvé mort dans le conduit du vide ordures d'un immeuble. Beckett et Castle découvrent qu'il menait une double vie sous deux identités différentes. Il avait une femme et deux enfants dans le Connecticut et une fiancée et un travail à New York dans une société de recyclage qui avait mis au point un procédé révolutionnaire pour recycler les piles...

Un galeriste, Victor Fink, est retrouvé assassiné. Cinq balles ont été tirées mais on ne retrouve pas l'une d'entre elles. Les soupçons pèsent sur un attaché consulaire, Harun, qui fait du trafic de faux tableaux, mais celui-ci est couvert par son immunité diplomatique...

Castle revoit une ancienne petite amie le jour du mariage de la jeune femme, car l'une de ses demoiselles d'honneur a été retrouvée assassinée. C'est l'occasion pour ces «ex» de laisser de doux souvenirs remonter à la surface, tandis que Beckett se découvre en proie à d'étranges scrupules amoureux !

Alors qu'ils enquêtent sur la mort d'un parrain irlandais, Beckett et Castle mettent à jour une véritable guerre de territoire, liée à un trafic de stupéfiants... L'affaire prend soudain une tournure plus personnelle lorsqu'ils découvrent que l'assassin qu'ils recherchent, pourrait bien être impliqué dans le meurtre de la mère de Beckett...

Une famille new-yorkaise revient de vacances et trouve un homme mort dans le lit de leur petite fille. C'est Douglas Bishop, un homme ordinaire qui travaille dans une agence de voyages. Un appareil photo retrouvé sur les lieux révèle qu'un squatteur avait profité de leur absence...

Quand Cano Vega, une star cubaine du baseball aux États-Unis, est retrouvé battu à mort, Beckett et Castle découvrent qu'il était un peu plus lié à Cuba que ce qu'ils ne pensaient. Pendant ce temps-là, Alexis essaie de comprendre pourquoi Castle, qui ne connait pas l'identité de son père, n'a jamais essayé de savoir qui il était...

Les dominatrices et le sadomasochisme sont au cœur de l'enquête sur le meurtre d'une jeune femme, Jessica Margolis, dont le corps est retrouvé, couvert de caramel, suspendu par des menottes dans une aire de jeux. Beckett et Castle découvrent que la victime était une étudiante qui faisait des recherches sur le milieu du sadomasochisme et du bondage...

Un tueur en série obsédé par Nikki Hard défie Beckett de l'arrêter. Le FBI prend l'affaire en main. L'agent spécial et profiler Jordan Shaw impose son autorité et séduit Castle par ses capacités de déduction, ce qui déplaît à Beckett. Le tueur laisse des messages à Beckett en gravant des lettres sur ses balles : «Nikki sera brûlée». Castle va dormir chez Beckett pour s'assurer qu'elle est en sécurité...

Beckett a échappé de justesse à la mort dans l'explosion de son appartement. Jordan Shaw continue de travailler avec Beckett et Castle pour trouver le tueur en série qui vit sous une fausse identité pour pouvoir échapper aux forces de l'ordre. Comme son plan a échoué et que Beckett a survécu à l'explosion, il décide d'accélérer la fréquence de ses meurtres, ce qui rend sa capture encore plus urgente. Quand ils découvrent la véritable identité du tueur, les choses se compliquent : il réussit à enlever Jordan et il a prévu une fin en apothéose pour Beckett et Castle...

Will Medina, le conservateur adjoint du musée d'histoire naturelle de New York, est retrouvé mort dans d'étranges circonstances. Castle et Beckett concluent très vite au meurtre mais, en enquêtant au musée, ils apprennent que Will venait de découvrir la chambre funéraire d'un roi maya. Certaines personnes pensent qu'il est mort à cause de la malédiction de la momie puisque deux autres personnes ayant participé à cette découverte sont aussi mortes depuis. Castle et Beckett découvrent que Will avait une liaison avec une des employées du musée et qu'il vendait des antiquités à un ancien trafiquant de drogue...

Quand Castle se rend dans un talk-show pour promouvoir son livre, le légendaire présentateur Bobby Mann lui confie que quelqu'un veut sa mort. Lorsque Mann meurt plus tard cette même nuit, apparemment de causes naturelles, Castle convainc Beckett qu'il a en réalité été victime d'un assassinat. Au cours de l'enquête, Castle est séduit par Ellie Monroe, une actrice également présente le soir du show.

En enquêtant sur l'assassinat d'un voleur, Castle et Beckett sont surpris d'apprendre que Javier a un lien personnel avec le meurtrier présumé. Une autre surprise attend Castle lorsque le charmant détective Tom Demming leur prête main forte pour résoudre cette affaire et qu'il se montre sensible au charme de Beckett.

Un chef est retrouvé mort congelé dans la cuisine du restaurant où il travaille. Des complications s'ensuivent lorsque Castle et la propriétaire du restaurant, une ancienne amie de Beckett, dînent ensemble. Pendant ce temps, la relation entre Beckett et Tom s'intensifie.

Un vol avec homicide conduit Beckett à demander la collaboration de Demming sur l'affaire, Castle assistant ainsi à leur amour naissant. Quand il devient évident que les deux hommes ont des idées très différentes sur la façon de procéder, l'enquête se transforme en véritable compétition.

Rien n'est ce qu'il semble être dans l'enquête que mènent Castle et Beckett enquêter sur l'assassinat d'un agent des renseignements. Pendant ce temps, la romance de Beckett avec Demming menace sa relation avec Castle, ce qui conduit les deux partenaires à réfléchir à leurs sentiments.

Beckett n'a plus de nouvelles de Castle depuis qu'il est parti dans les Hamptons avec Gina il y a plusieurs mois, pour écrire son deuxième roman de Nikki Hard. Alors, quand Beckett et son équipe, à la poursuite d'un meurtrier, pénètrent dans un appartement, la dernière chose qu'ils s'attendent à voir c'est bien Castle, l'arme au poing, penché sur le corps d'une femme morte. Même si le romancier clame son innocence, Beckett n'a pas d'autre choix que de l'arrêter pour suspicion d'assassinat.

Quand une célèbre voyante est assassinée, Beckett et Castle cherche son assassin tout en débattant avec animation sur l'existence des capacités extra-sensorielles. Les preuves se multiplient des deux côtés, surtout quand arrive une lettre de la victime, écrite le jour où elle a été tuée et prédisant sa propre mort. Mais ne serait-ce pas l'oeuvre d'un tueur habile qui espère brouiller les pistes ?

Quand un document codé est découvert suite au meurtre d'un prêteur sur gages, l'imagination de Castle s'envole tandis que Beckett reste plus réaliste. Pour compliquer les choses, le duo voit débarquer l'ancien partenaire de Beckett, maintenant reconverti en chasseur de primes.

Castle et Beckett se penchent sur l'assassinat d'un jeune mathématicien, abattu avec une balle vieille de 200 ans. La théorie de Castle concernant cette affaire inclut un voyage dans le temps, particulièrement quand une DeLorean entre en scène.

Les mystères abondent lorsque lors d'un enterrement des porteurs funéraires font tomber un cercueil étonnamment lourd qui laisse apparaître une jeune femme morte aux côtés du défunt. Quand Castle et Beckett apprennent que la victime était médecin, leur enquête les mène dans le monde des amourettes de l'hôpital. Pendant ce temps, la relation de Castle et Gina est mise à mal quand cette dernière essaie de se lier avec Alexis.

Quand une jeune femme est retrouvée morte dans une ruelle, tous les indices présents sur place laissent à penser qu'elle est une victime du serial killer appelé le Triple Tueur. Ce dernier avait déjà terrorisé New York quatre ans plus tôt avant de disparaître mystérieusement. Castle et Beckett se battent contre le temps afin d'arrêter le meurtrier avant qu'il ne fasse d'autres victimes.

Répondant à un appel d'urgence pour le meurtre d'un policier, Castle et Beckett sont choqués quand, en arrivant sur place, ils découvrent que la victime n'était pas un flic mais un strip-teaseur déguisé. Cet assassinat les entraîne dans le monde des clubs et des acteurs.

Alors qu'il enquêtait sur l'assassinat d'un électricien du métro New-Yorkais trouvé mort dans Central Park, Castle et Beckett découvrent l'enlèvement choquant et violent d'un jeune garçon. Tout en luttant contre la montre, l'équipe doit découvrir le motif de ce kidnapping, livrer un meurtrier à la justice et sauver des vies innocentes.

Après que le corps d'une éminente astrophysicienne victime d'une décompression explosive ait été trouvé dans sa voiture, Castle plaisante en théorisant qu'elle a peut-être été tuée dans l'espace. Alors que Beckett et lui approfondissent la vie de la victime, ils sont confrontés à des preuves qui pointent vers l'impossible : un enlèvement par des extraterrestres.

Lorsque le corps d'un docker propriétaire d'un bar est retrouvé flottant dans l'East River, l'enquête de Castle et Beckett les conduit dans des tunnels oubliés et des passages secrets où ils découvrent un trésor resté intact depuis l'époque de la prohibition.

Le livre de Castle intitulé Vague de chaleur va être adapté au cinéma et Natalie Rhodes, l'actrice qui doit interpréter Nikki Hard, rejoint l'équipe pour quelques jours suite à l'invitation de Beckett afin de mieux comprendre le personnage qu'elle va jouer. Alors que la police enquête sur l'assassinat d'une entremetteuse de grande classe, Natalie joue le jeu à l'extrême en se transformant en portrait craché de Beckett, à la consternation de celle-ci et au plus grand plaisir de Castle.

Lorsque le propriétaire du magasin Drake's Magic Shop est retrouvé noyé dans le célèbre réservoir d'eau d'Houdini, Castle et Beckett pénètrent dans le monde de la magie pour trouver son assassin. Dans le cadre de leur enquête, le duo rencontre le grand magicien Tobias Strange. Parallèlement, la relation amoureuse entre Esposito et Lanie est découverte.

De vieilles blessures sont rouvertes quand l'inspecteur à la retraite qui s'est occupé du dossier sur l'homicide de Mme Beckett vient voir Kate avec de nouvelles informations. Malheureusement, il se fait abattre avant d'avoir pu lui dire ce qu'il sait. L'enquête sur sa mort conduit à une conspiration vieille de plusieurs décennies qui pourrait expliquer qui était derrière l'assassinat de la mère de Beckett et pourquoi. Avec de tels enjeux et tant d'émotions, le partenariat entre Castle et Beckett passe au niveau suivant.

Quand Castle et Beckett enquêtent sur l'assassinat brutal d'un gagnant de la loterie, les suspects ne manquent pas, qu'ils soient envieux ou furieux envers la victime, qui venait d'emménager dans un appartement de luxe. Alors que les policiers émettent des idées fantaisistes en imaginant ce qu'ils feraient s'ils gagnaient le gros lot, Martha se retrouve réellement confrontée à cette décision quand elle hérite d'une somme d'argent qu'elle ne pense pas mériter.

Castle et Beckett se retrouvent en conflit sur une affaire qui implique un ami avec qui Castle était à l'école et qui apparaît comme le principal suspect dans l'assassinat de sa femme. Alors que l'équipe tente de résoudre ce crime, Castle se rend compte qu'une de ces deux terribles choses doit être vraie : soit Beckett est sur le point d'arrêter un homme innocent, soit son vieil ami est un tueur de sang-froid.

Alors que Castle et Beckett enquêtent sur l'homicide d'un chauffeur de taxi qui a apparemment été tué suite à un vol, ils découvrent que la victime était impliquée dans un mystérieux complot, avec des conséquences inimaginables. Comme les enjeux sont énormes, l'agent fédéral Mark Fallon reprend l'enquête. Ensemble, Fallon, Beckett et Castle doivent se démener pour découvrir la vérité avant qu'il ne soit trop tard.

Alors que le temps presse, Castle et Beckett doivent mettre de côté leurs différents avec l'agent Fallon pour éviter une catastrophe dans la ville.

Un meurtre a été commis sur le tournage de Temptation Lane un des plus longs soap-operas que New York ait connue. Sarah Cutler, la scénariste en chef, a été tué avec une hache. Castle et Beckett vont rapidement découvrir que les drames qui se jouent en coulisses sont tout aussi scandaleux que ceux des scénarios. Par ailleurs, il s'avère que n'importe qui peut être responsable de cet assassinat.

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre d’un juré survenu en plein procès pour homicide. Durant le procès très médiatisé du meurtre de la fille d’un notable, un juré s’écroule brusquement de son siège, mort. Alors que Castle et Beckett apprennent que le juré a été empoisonné, leur enquête révèle que ce juré en apparence si innocent était impliqué dans l'affaire.

Un corps est retrouvé carbonisé dans le four d'une pizzeria. La victime était un journaliste d'investigation qui avait découvert que les quatre pizzerias qui se disputent le marché ont beaucoup de secrets à garder…

Un nageur est retrouvé noyé dans la piscine où il s'entrainait, et l'affaire se complique quand elle réunit des stéroïdes, un trafiquant biélorusse et une famille irlandaise. Pour l'aider, Castle propose à un jeune auteur de le seconder, mais celui-ci se montre plus intéressé par Beckett que par la victime.

L'ancien mentor de Beckett est retrouvé mort à New York, mais les pistes mènent Beckett et Castle pour Los Angeles. Entre les deux côtes, l'enquête met en scène un homme d'affaires violent, des balles qui fondent et le tournage de l'adaptation de Heat Wave.

Une reine de beauté est retrouvée morte sur la scène d'un concours prestigieux. La jeune fille de l'Illinois cachait plusieurs secrets, que Castle et Beckett découvrent. Pendant ce temps, Alexis est affectée par le départ de son petit ami pour la faculté.

L'affaire de la mort de la mère de Beckett resurgit quand le dernier policier est tué en prison et que son tueur s'évade. Beckett comprend vite qu'il y a un troisième homme, mais Castle a peur de voir cette traque mal finir.

Après avoir subi une importante intervention chirurgicale, Beckett prend trois mois pour récupérer avant de retrouver son poste à la police de New York. Elle ne parle plus à Castle depuis son opération et s'est séparée de Josh. Elle commence à chercher celui qui lui a tiré dessus mais Castle essaye de l'en dissuader car il estime que c'est trop dangereux pour elle, pourtant, il va découvrir qu'il va pouvoir en savoir plus sur le mystère de la mort de la mère de Beckett. Parallèlement, l'équipe enquête sur le meurtre de Sonia Gilbert l'ex petite amie d'un membre de groupe de rock.

Un truand est retrouvé découpé en deux dans une ruelle. Castle et Beckett découvrent qu'il s'agit d'un justicier masqué armé d'un sabre, inspiré d'un super-héros de comics, mais ciblant un certain gang.

L'équipe de Beckett et Castle enquête sur la mort d'un professeur qui voulait prolonger la vie. Plusieurs suspects sont dans la ligne de mire de Kate dont un producteur de porno et une compagnie de cryogénie. Alexis reçoit sa lettre d'admission de l'université de Stanford.

Castle et Beckett enquêtent sur la mort d'une jeune femme tuée par l'ancienne arme de service du lieutenant Ryan, celle qui avait été volée par le tueur en série, surnommé le triple tueur (3XK en VO), Jerry Tyson. L'enquête prend une nouvelle tournure quand les indices pointent vers la mafia chinoise.

L'équipe de Kate et Castle enquêtent sur la mort du directeur d'un musée, Brian Hayes, et du vol d'une sculpture représentant le « Poing du capitalisme ». Au cours de l'enquête, Kate et Richard se verront imposer par Victoria, la présence de Serenay Kaye, une ancienne voleuse d'œuvre d'art qui est devenue enquêtrice pour une compagnie d'assurances. Kate et Castle doivent apprivoiser leur sentiment vis-à-vis de l'autre.

Castle et Beckett sont confrontés au paranormal lorsqu'un célèbre chasseur de fantômes est mystérieusement assassiné alors qu'il enquêtait dans un manoir hanté de New York. Castle et Ryan suivent la piste des spécialistes du mystérieux quand Beckett se veut plus pragmatique. Dans cet épisode, Lanie et Esposito se séparent.

Alors que Castle et sa mère sont à la banque pour obtenir un prêt, un braquage de banque a lieu. Chacun des braqueurs se fait appeler par un docteur connu de la télé, le Dr Howser, le Dr Quinn, le Dr Huxtable et le Dr Trapper John. Castle, qui est au téléphone avec Kate au moment où le braquage commence, se fait prendre rapidement par l'un des docteurs. Sachant que Kate et la police sont sur place, Castle tente par tous les moyens de communiquer des informations de l'intérieur à Kate. Suite à cet événement, Alexis rompt avec Ashley.

Un propriétaire de casino d'Atlantic City est retrouvé assassiné dans un entrepôt abandonné. Tandis que Beckett et le capitaine Gates enquêtent à New York, Castle, Ryan et Esposito se rendent dans la « ville du jeu » dans l'espoir de résoudre l'affaire mais également d'organiser l'enterrement de vie de garçon de Ryan. De son côté, Alexis, afin d'oublier Ashley, commet une gaffe en organisant une fête.

Un sniper terrorise la ville en tuant des gens dans la rue, les victimes n'ayant aucun lien entre elles. Le tireur laisse derrière lui des poupées en carton découpées dans des peintures de grand maître d'art. L'équipe de Beckett et Castle enquête afin de trouver l'identité de ce tireur fou.

Au même moment, Kate subit les répercussions psychologiques de la fusillade dont elle a été la victime lors des funérailles du capitaine. Son psychologue lui demande de se retirer de l'enquête sur le tireur fou, mais Kate refuse.

Beckett se réveille et s'aperçoit qu'elle est couchée avec Castle, sur un matelas. Elle s'affole et remarque qu'elle est menottée à Richard. Elle s'imagine que c'est une idée coquine de Richard pour coucher avec elle. Elle réveille Castle et lui demande ce qui s'est passé.

Seulement, tout comme Kate, Richard n'a aucun souvenir expliquant la raison de leur présence dans ce lieu. Kate ressent quelque chose dans son dos. Richard découvre une trace de piqûre et en déduit qu'ils ont été drogués, d'où la perte de mémoire. Lentement, Kate et Richard tentent de retracer les événements qui ont pu les mener jusque là.

Suite à cet événement, Victoria Gates instaure un nouveau règlement au poste : préciser à un supérieur le lieu où se déroule l'intervention.

Castle et l'équipe de Beckett enquêtent sur la mort d'un homme, retrouvé nu au milieu d'un stand de fruits. L'équipe apprend que l'homme avait deux noms : Michael Bailey et Jake Hendricks. Au cours de l'enquête, l'équipe découvre la véritable identité de l'homme et son véritable « passe-temps ». Les faits impliquent Jenny, la future épouse de Ryan.

En parallèle, Jenny impose à Ryan une cure pour purifier le corps avant le mariage. Cela a des répercussions sur le comportement de Ryan. Esposito, qui est toujours célibataire depuis sa séparation avec Lanie, est jaloux que cette dernière l'ait déjà remplacé. Plus tard, le mariage de Jenny et de Ryan est célébré.

Castle et l'équipe de Beckett enquêtent sur la mort de Laura Cambridge, une brillante professeur qui a tout quitté pour devenir animatrice de téléphone rose pour une ligne érotique. Bien vite, les soupçons se portent vers le maire, Robert Waldon. Castle, qui croit en l'innocence du maire, doit prouver que le maire n'est pas coupable. Richard reçoit un appel de l'homme qui lui avait demandé de détourner Kate de son enquête sur la mort de sa mère. Il comprend assez rapidement que c'est cette même organisation qui est derrière la mort de Laura. Richard aimerait bien en savoir plus sur cette organisation, mais l'homme le met en garde.

Alors qu’un célèbre dresseur de chiens est assassiné, l’enquête pointe vers une star charismatique de la téléréalité : Kay Cappuccio. Kay, chouchoute des magazines et sites people, est devenue célèbre sans avoir fait preuve de talents particuliers. Il semblerait cependant qu’elle cache quelque chose…

Reggie Starr, le petit ami de Kay et le Dr Patty Barker une thérapeute aux talents reconnus, sont sollicités lorsque l’un des clients de Patty est témoin du meurtre.

En parallèle, Castle et Beckett se disputent la garde temporaire du chien de la victime. Pendant qu'Esposito s'aperçoit qu'il a le béguin pour Kay Cappucio et possède toujours de l'animosité envers Lanie, ce qui fait réagir cette dernière.

De son côté, Alexis part visiter une université avec son amie Bouton Dutton.

L'équipe enquête sur la mort d'un chasseur de trésor, Stan Bank, dans un ancien club du nom de Pennybaker club. Richard Castle, qui a découvert un vieux journal intime d'un détective privé de 1947, en lit plusieurs pages, en espérant découvrir la raison pour laquelle Stan Bank avait ce journal et pourquoi on l'a tué. Bien vite un lien est établi entre les événements que relate le journal et le meurtre de Stan Bank.

Alexis qui est à la recherche de ce qu'elle veut faire dans la vie, décide de suivre des stages. Comme elle n'a rien dit à son père, celui-ci découvre par hasard qu'elle fait un stage avec le Dr Lanie Parish. Richard n'apprécie pas trop de la voir évoluer dans ce domaine.

Entre temps, l'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un homme inconnu. Étrangement, selon Lannie, l'homme a été étranglé, poignardé, s'est fait tirer dessus, a un crayon planté dans le cou pour être ensuite jeté d'une fenêtre. Bien vite l'équipe de Beckett base leur soupçon sur Thomas Gage. Ce dernier n'avoue rien, mais informe Kate et Richard qu'il n'existe pas, pire encore, qu'il va disparaître. Comme de fait, Thomas Gage disparaît, mais aussi la victime de la morgue. Alexis s'en veut de s'être fait voler le corps sous ces yeux, mais Lannie la rassure.

Au cours de l'enquête, Kate et Richard découvrent que Thomas Gage est relié à un certain projet Pandora. Au moment où l'inventeur du projet Pandora commence à révéler ce que c'est, les malheurs commencent pour Kate et Richard.

L'histoire reprend quelques secondes après les derniers événements.

L'équipe de la CIA vient récupérer Kate et Castle sur le quai où se sont produits ces événements avec le créateur du projet Pandora et sous les yeux interrogateurs de l'équipe de Beckett.

Sophia écarte Kate et Richard de l'enquête, du moins officiellement car elle sait que Richard voudrait savoir comment l'histoire se termine. Kate et Castle continuent leur investigation et découvrent ce que le créateur du projet Pandora avait établi.

Thomas Gage sauve Kate et Richard d'un traquenard. Il les informe qu'il y a un traître au sein de la CIA qui lui fait porter la responsabilité des événements passés. Sophia et la CIA retrouvent Gage, Castle et Kate afin de les amener dans leurs locaux. Quand, quelques heures plus tard, Sophia retrouve Thomas Gage mort dans sa cellule, elle est forcée d'admettre l'existence d'une « taupe » à la CIA. Après avoir découvert qui est cette présumée « taupe », celle-ci réussit à s'échapper.

En parallèle, la CIA, Kate et Richard vont tout tenter pour arrêter l'exécution du projet Pandora sans quoi un petit événement isolé provoquera une catastrophe pour les États-Unis.

Sophia parle du père de Castle à ce dernier. Elle affirme qu'il aurait disparu à cause de la CIA. Richard se demande si Sophia disait la vérité ou si elle mentait à propos de son père.

Martha, la mère de Castle, veut lancer son premier One Woman Show. Elle veut y raconter sa vie, dont celle qu'elle partage avec Richard et Alexis. Richard confie à Kate que cela l'agace de voir sa fille faire un stage avec Lanie et sa mère raconter sa vie dans un spectacle. Cependant, Martha a invité Kate à son spectacle, ce qui ne plait pas à Castle.

Entre-temps, l'équipe de Beckett et Castle enquêtent sur la mort d'une femme dans Central Park, qui était habillée comme le « Petit Chaperon rouge ». Elle avait au visage des traces de griffes, ce qui laisse à penser à Richard et à Ryan que le coupable ne peut être que le « Grand Méchant Loup ». Kate ironise de la situation. L'affaire se complique quand l'équipe trouve une femme habillée comme « Blanche-Neige » avec une pomme à la main, morte également dans Central Park. Chacune des victimes ont retiré de leur compte en banque, le montant de 50 605 dollarsUS. Bien vite, Kate et Richard concluent à un tueur en série, fan de conte de fée, qui fait chanter ses victimes en réclamant cette somme. Au cours de l'enquête, l'équipe de Beckett et Richard découvrent une troisième victime, qu'ils réussissent à sauver, mais celle-ci est habillée comme la « Belle au bois dormant ».

Martha veut faire de la publicité pour son école de théâtre. Elle a la brillante idée d'inviter Oona Marconi, la critique de théâtre qui l'a sévèrement critiquée, pour un ancien rôle dans une pièce de théâtre. Richard, qui l'avait pressenti et avertie sa mère, s'aperçoit que la rencontre tourne au désastre. Plus tard, suite à une suggestion de Richard, Martha réussit finalement à avoir la publicité de son école dans un article de Oona Marconi.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'une participante de l'émission Night of Dance, Odette Morton. Elle a été retrouvée morte dans sa loge, alors que l'enregistrement de l'émission commençait. Au cours de l'enquête, l'affaire se complique lorsque l'équipe découvre une autre femme, du nom de Barbara Landau, qui ressemble à Odette Morton. Bien vite un lien est fait entre les deux femmes. L'équipe de Beckett et Castle découvrent bien plus qu'un simple changement d'identité entre les deux femmes.

De leur côté, afin de tester une théorie qui dit que les hommes récemment mariés sont ignorés par les femmes célibataires, Ryan prête sa bague de mariage à Esposito. Cependant, ce dernier n'arrive plus à retirer la bague de son doigt, ce qui affole Ryan.

Lors d'une manifestation « Occupons Wall Street », à New York, une bombe explose sur la place Boylan. Le FBI demande la collaboration de la police de New York pour l'enquête. C'est la capitaine Victoria Gates qui prend les commandes de celle-ci. Le FBI demande à Gates et son équipe de rechercher les témoins présents près de l'endroit où se trouvait la bombe, 47 secondes avant l'explosion. C'est avec minutie et précision que Castle retrace, avec les informations que Beckett et l'équipe lui ont apportées, les 47 secondes avant l'explosion pour découvrir le poseur de bombe.

Entre temps, cet événement fait réaliser à Richard qu'il n'a toujours pas déclaré ses sentiments à Kate. Sur les conseils de sa mère, Castle décide de les lui avouer, mais un événement vient perturber ses sentiments. En effet, il apprend de la bouche de Kate, lors d'un interrogatoire, alors qu'il arrivait à l'improviste, qu'elle se souvient à la seconde près des moindres détails où elle s'est fait tirer dessus, lors des funérailles de l'ancien capitaine. Castle est attristé de voir que Beckett lui a menti.

Kate demande à Lanie si elle a observé un changement de comportement chez Richard. Elle se demande pourquoi il est distant avec elle. Lanie demande à Kate si elle lui a déclaré ses sentiments. Kate affirme que non, car elle n'est pas prête. Lanie lui suggère de déclarer ses sentiments à Castle, car il n'attendra pas longtemps. Tout au long de l'enquête, Lanie tente d'aider Beckett à dévoiler ses sentiments pour Castle, sans succès.

Entre temps, l'équipe enquête sur la mort de Naomi Allen, une anglaise de 25 ans qui était mannequin pour le groupe Kittman. Son corps a été retrouvé dans un motel miteux. Bien vite, l'équipe de Beckett et Castle font la connaissance de l'inspecteur détective Colin Hunt, de Scotland Yard. Il connaissait et surveillait la victime. Colin fait une demande à Beckett et à Gate, afin de participer à l'enquête. Les deux acceptent, ce qui rend jaloux Castle par la suite. Ce qui, au départ de l'enquête, semblait être une histoire de bagarre dans une fête qui a tourné au meurtre, va prendre pour Kate, Colin et Castle, des dimensions internationales.

Castle tente de rendre jalouse, Kate, en sortant avec une hôtesse de l'air du nom de Jacinda.

Un homme est retrouvé mort avec un sac contenant trois têtes. Castle, qui souffre toujours du mensonge de Beckett, décide de changer de partenaire pour cette enquête. Il choisit Ethan Slaughter qui travaille aussi sur l'affaire des trois têtes, mais Castle découvre que son nouveau partenaire est violent, immoral et que ses techniques ne sont pas forcément légales.

De son côté, Beckett commence à se demander si ce n'était pas une erreur de prétendre une amnésie post-traumatique mais masque toujours ses sentiments. Alexis est reçue à Stanford mais ne sait pas comment réagir.

Alexis n'arrive toujours pas à faire son choix d'université. Ses choix se portent sur Oxford et Stanford. Suite à une remarque de son père, Alexis finit par faire un choix qui va en surprendre plus d'un.

Martha fait la leçon à Richard quant à son attitude et comportement envers Beckett. Elle lui implore de dévoiler ses sentiments à Kate et de cesser de la punir, en changeant de coéquipier ou en paradant avec une hôtesse de l'air.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Daniel Lock, 29 ans, un jeune trader dont on a retrouvé le corps dans le parking souterrain de l'endroit où il travaille. Le corps porte des marques de morsures, comme celles d'un chien. Après quelques recherches, l'équipe va retrouver un témoin, Charles Coleman, trader, qui lui aussi porte les mêmes marques de morsures que Lock. Ce témoin, vivant, affirme que ce sont des zombies qui ont tué Lock et qui l'ont agressé. Alors que Castle se réjouit d'être tombé sur une affaire de zombies, Beckett arrête Coleman pour meurtre. Malheureusement, elle devra revoir sa position et relâcher Coleman, quand son équipe lui apportera une preuve tangible de l'existence du zombie meurtrier.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un jeune militaire hispanique de 20 ans, ancien voleur repenti, du nom d'Orlando Costas, dont le corps a été retrouvé dans une ruelle: Costas s'est fait tuer par deux armes à feu différentes. De plus, les marques retrouvées sur son cou et ses épaules indiquent qu'il portait sur son dos un objet lourd d'une quinzaine de kilos. Bien vite, la conjointe d'Orlando, Marisol Castenada, devient suspecte, puisqu'elle tente de fuir la ville. Comme celui-ci était membre d'un gang de rue avant qu'il ne devienne militaire, ses autres membres sont suspectés. Beckett réussit à faire parler l'un d'eux et trouve une église où Costas avait rendez-vous avec un homme. L'équipe en déduit qu'il est militaire de la même division que Costas, nommé Cole Maddox. Kate demande à Ryan et Esposito de retrouver ce Maddox.

Au cours de l'enquête, un vol de dossier et d'ordinateur chez l'ancien capitaine de police, Roy Montgomery, vient confirmer la thèse que le meurtre de Costas est lié au tireur qui a failli tuer Beckett un an plus tôt, et au meurtre de la mère de celle-ci. R.Castle demande alors à Kate de se retirer de l'enquête sur la mort de Costas, lui avouant avoir été en contact avec un ami de Montgomery qui connaît celui qui a tué la mère de cette dernière. Il lui déclare par la même occasion ses sentiments mais Kate refuse de se retirer de l'enquête. Castle dit alors partir définitivement, refusant de voir Beckett se faire tuer.

Kevin réclame à Javier d'informer la capitaine Victoria Gates des recherches et de la visite que Kate veut effectuer chez C.Maddox, mais Javier refuse, laissant Kevin indécis.

Kate va finalement, avec Esposito, retrouver ce Maddox dans un hôtel, mais très vite ce dernier met Kate dans une situation critique avant de disparaître. Attendant une mort inéluctable, Kate croit entendre la voix de Richard, mais est en réalité sauvée par des policiers emmenés par Gates et Ryan. Suite à cet événement, Kate remet sa démission au capitaine Gates, avant de se rendre chez Castle lui déclarer ses propres sentiments et se donner à lui.

De son côté, Alexis doit faire un discours le jour de sa remise des diplômes. Elle n'en dort plus et manque d'inspiration. Richard lui donne quelques pistes à suivre afin de l'aider.

Au moment où Alexis fait son discours de remise des diplômes, Cole Maddox rend visite à un certain monsieur Smith, ami de Roy Montgomery qui protège Beckett. Il demande à Smith les preuves qu'il détient sur son client et qui protègent celle-ci. Une fois qu'il aura obtenu les preuves, Cole Maddox déclare vouloir en finir avec Kate Beckett...

Le lendemain de leur nuit ensemble, Castle et Beckett se prouvent alors qu'elle n'était pas basée sur un coup de tête quand Martha rentre plus tôt que prévu et interrompt leurs ébats matinaux : Alexis a une gueule de bois au lendemain du bal des diplômes. Castle demande alors à Beckett de se cacher dans le placard ce qui la rend particulièrement de mauvaise humeur.

Ryan, avec la supervision du capitaine Gates, poursuit l'enquête sur Cole Maddox. Sans avertir Victoria, il va demander l'aide de Beckett et de Castle, car il a trouvé une piste. C'est ainsi qu'ils remontent à Michael Smith, le dernier lien qui protégeait Beckett. Malheureusement, Beckett et Castle arrivent trop tard car ils retrouvent Smith dans un sale état et le dossier a été brûlé par Maddox. Juste avant de partir en ambulance, Smith donne un indice important à Castle, ce qui lui permet de trouver le vrai dossier. De son côté, Esposito réussit à découvrir la véritable identité de Cole Maddox. Kate et Richard se rendent dans un immeuble de logements désaffectés pour chercher le véritable dossier. Sur place, ils sont piégés par Maddox qui les enferme dans une salle de bain. Esposito vient à leur rescousse et les libère. Ils se mettent alors à rechercher Maddox, mais celui-ci a trouvé le dossier si important et le prend. Cependant, le dossier étant piégé, Maddox meurt dans l'explosion, le dossier original est aussi détruit.

Plus tard, Castle et Beckett rendent visite à Smith, qui est à l'hôpital. Ce dernier conseille à Beckett de disparaître, comme lui s'apprête à le faire, mais celle-ci refuse. Quelques minutes après leur départ, Castle et Beckett reviennent dans la chambre de Smith afin d'avoir sa coopération dans l'affaire, mais celui-ci est mort d'une mystérieuse crise cardiaque.

À la suite de cela, Ryan apporte à Kate, Castle et Esposito les morceaux du dossier détruit dans l'explosion. L'équipe va assembler des morceaux de papier afin de reconstituer le dossier. C'est ainsi qu'ils vont trouver le nom de l'homme qui a commandité le meurtre de la mère de Kate. Il s'agit de William Bracken, un sénateur qui fait campagne à New York ; à l'époque, celui-ci finançait ses campagnes en prenant sa part dans les rançons des mafieux enlevés par les policiers.

Alors que Castle dormait, Kate se prépare à rencontrer Bracken. Au réveil de Castle, trouvant le lit vide, celui-ci panique à l'idée que Kate commette l'irréparable. Avec l'aide de Ryan et Esposito, ils arrivent à l'hôtel où se trouvent Bracken et Kate. Avant l'arrivée des garçons, Kate passe un marché avec Bracken : s'il lui arrive quelque chose à elle ou à un de ses proches, le dossier deviendra public, ce qui compromettra Bracken.

Enfin, Beckett demande la permission à son chef de reprendre son job de flic. Gates accepte mais Kate doit d'abord terminer sa mise à pied. Castle lui demande alors ce qu'elle veut faire pendant ce temps. Elle lui répond qu'elle trouvera bien quelque chose alors que l'ascenseur se referme.

C'est le premier jour de travail de Kate. Elle avertit Richard qu'elle et lui sont deux célibataires et que personne, au travail, ne doit savoir qu'ils sont en couple. Malheureusement, toute l'équipe remarque un changement, ce qui rend Beckett plus nerveuse.

L'équipe enquête sur la mort d'une miss météo, Mandy Michaels, dans le parc Paley. Plusieurs suspects potentiels au cours de l'enquête dont une autre miss météo et un homme que la victime voyait en secret, sont en cause. L'équipe de Beckett découvre trois possibilités sur cet homme mystérieux : Reggie Blake, un joueur de basketball en fin de carrière, le journaliste Miles Haxton et un propriétaire d'usine de fabrication de tapis, Georges Cazuli.

Richard est jaloux, car il y a un journaliste sportif qui veut sortir avec Kate. Celui-ci rend Kate jalouse, parce qu'il a accepté un dîner en tête à tête avec la sulfureuse journaliste Kristina Cottera, en prétextant avoir trouvé le meilleur moyen de renforcer leur prétendu célibat aux yeux de tous.

Alors que Richard se prépare pour aller rejoindre Kristina Cottera, celle-ci arrive chez-lui. Kate reçoit un appel involontaire de Richard qui semble en pleine bagarre avec Kristina. Il ne lui en faut pas plus pour accourir chez Castle. En ouvrant la porte, Kate découvre Castle le nez dans les seins de Kristina. En apercevant Kate, il lui annonce qu'il a résolu l'affaire. Cette image de Richard et Kristina hante Kate.

En parallèle, il y a une certaine animosité entre Esposito et Ryan, depuis les évènements avec Cole Maddox, ce qui dérange Kate. Leur solidarité lors d'un pugilat vient aider leur amitié fragile.

C'est un grand jour pour Alexis, elle part vivre à l'université. Tout en faisant ses cartons, Martha annonce à Richard qu'elle est au courant pour lui et Kate. Elle lui demande de l'annoncer à Alexis avant qu'elle ne le découvre. Kate est affolée lorsque Richard lui annonce qu'il en a parlé à Alexis, car elle a peur que leur relation vienne aux oreilles de Gates.

L'équipe enquête sur la mort de Wendy Dupree, 25 ans, une serveuse de Philadelphie. Avant de mourir, elle avait écrit les lettres Lie avec son sang. Au cours de l'enquête, l'équipe de Beckett découvre que Wendy avait un frère jumeau du nom de Wendell Dupree. Ce dernier est mort dans un accident de métro. Cependant, la sœur suspectait que son frère ait été la victime d'un meurtre. L'équipe de Beckett apprend la raison pour laquelle Wendy était à New York, et soupçonne plusieurs personnes, dont la très riche Angelica Henley.

Richard et Kate trouvent très difficile de cacher leurs sentiments au travail. Pour ne rien ébruiter, ils se donnent la main en guise de câlin.

Richard a décidé d'emmener Kate en week-end, dans sa maison dans les Hamptons. Au moment du départ, Alexis et la mère de Richard lui donnent les dernières recommandations pour ne pas décevoir Kate, alors qu'au poste de police, Esposito et Ryan complotent afin de trouver qui est le nouveau petit ami de Beckett.

Lors de leur arrivée et la visite de la maison, le couple se prépare à prendre un bain de minuit, quand un homme ensanglanté vient s'écrouler dans la piscine de Richard. La victime est Randall Franklin, un employé d'une banque. L'affaire se classe rapidement, avec l'arrestation d'un dealer de drogue, mais Richard a un doute. Kate supplie Richard de ne pas penser au meurtre de Franklin, car ils sont en vacances, mais il réussit à convaincre cette dernière d'enquêter sur le meurtre. Avec l'aide de Ryan et Esposito, qui sont à New York, Richard, Kate et le chef Brady (des Hamptons) réussissent à trouver le meurtrier.

En parallèle, après avoir vérifié les ex-petits amis de Kate, Ryan découvre, lors de l'enquête sur le meurtre de Franklin, qui est le nouvel amoureux de Kate. Il demande à Esposito de ne pas essayer de découvrir qui est le nouvel amoureux de Kate.

Alexis est de retour à la maison et en profite pour dévaliser le frigo de Castle.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Tessa Horton. Elle a été retrouvée accrochée avec du fil barbelé, au plafond du salon et un symbole gravé sur le front. Les premiers soupçons vont se tourner vers son mystérieux petit ami, mais les résultats des empreintes et des preuves vont désigner Richard Castle comme le suspect numéro 1 de l'affaire. Bien vite, Richard est arrêté pour le meurtre de Tess. Richard continue à clamer son innocence. Alors qu'il est en cellule au poste de police, Richard a la désagréable surprise d'avoir la visite de Jerry Tyson, le triple tueur (3XK), qui lui avoue avoir préparé ce piège pour que Richard aille en prison, afin de se venger. De son côté, Kate tente désespérément d'innocenter Richard.

En parallèle, Kevin raconte à Javier que Kate et Richard sont en couple et qu'il le sait depuis le week-end du couple aux Hamptons, mais cela doit rester secret pour ne pas perturber l'enquête. Kate raconte à Lanie qu'elle est amoureuse de Richard, mais ne sait pas si elle doit croire les preuves quant à ce qu'il a fait.

Richard Castle est à une convention de fans, en train de signer des autographes pour la bande dessinée sur Derrick Storm, quand Kate vient le chercher. Elle lui annonce qu'il y a une personne morte à l'intérieur du vaisseau de la série "Nebula 9". Croyant à une plaisanterie, Richard se voit contraint de pénétrer à l'intérieur du vaisseau de la série, qu'il trouve ringarde et nulle. La victime est Annabelle Collins, 28 ans. Elle est la "propriétaire" de la série qu'elle a rachetée quand celle-ci a quitté les ondes, et l'idéatrice de sa résurrection à la convention de fans de Science-Fiction. Plusieurs personnes sont suspectées par l'équipe de Beckett, soit Gabriel Winster (comédien dans la série Nebula 9), Audrey et Davis (amis d'Annabelle), Stephanie Fry (comédienne dans la série Nebula 9) et Simon Wesport (un fan de la série). C'est par un malheureux concours de circonstances que Kate et Castle démasqueront le meurtrier.

Au cours de l'enquête, Castle croise Alexis à la convention des fans, dans une tenue très sexy. Cela perturbera Castle, mais Kate tentera de minimiser la chose.

Au cours de l'enquête, Castle découvre que Beckett est une fan de la série "Nebula 9" et qu'elle se déguise comme les personnages de la série. Déçu de découvrir que Beckett aime une série que lui déteste au plus haut point, Richard tentera de se racheter en demandant à Kate de porter le costume de la série qu'elle a. Kate accepte, mais cela se fera à ses conditions.

Le guitariste d'un groupe de rock qui émerge est tué. Kate et Castle mènent l'enquête, mais ils sont suivis par des caméras, car un documentaire est tourné sur le groupe. Grâce à une demande auprès de Gates, ils obtiennent le droit de filmer l'enquête. Castle, Esposito, Ryan et Lanie se laissent prendre au jeu, mais Beckett déteste que des personnes s'introduisent dans sa vie privée. Dans un moment de tendresse Castle caresse la joue de Kate, mais celle-ci s'aperçoit trop tard que les caméras l'ont filmé. Plusieurs personnes sont suspectées par Kate : un fan, une groupie, un membre du groupe et le gourou d'une secte. L'équipe de Beckett finit par attraper le tueur. Plus tard, Beckett et Castle sont convoqués dans le bureau de Gates. Ils craignent le pire car Gates a vu des enregistrements du documentaire. Gates fait uniquement des reproches à Castle qui faisait le clown derrière la caméra pendant qu'elle parlait.

Richard et Kate reçoivent à dîner leurs parents respectifs : Martha pour Richard et Jim pour Kate. Le repas tourne en querelle quand Martha et Jim découvrent que l'opinion de l'un sur un sujet est tout le contraire de l'autre. Cette situation est ensuite source de conflit entre Kate et Richard durant la nouvelle enquête.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un prêtre de 52 ans, le Père Joe McMurtry, qui a été tué par balle. Aucun indice n'a été retrouvé sur place. Cela laisse penser à Kate que c'est l'œuvre d'un professionnel. Beckett et Castle retrouvent un témoin du nom de Leo. Malheureusement, des membres de la famille O'Reilly, dont Michael Dolan est à la tête, poursuivent ces derniers afin d'éliminer Leo. Kate et Richard feront tout pour protéger la vie du témoin.

Le monde de Richard Castle s'écroule à la veille de Noël. Alors qu'il est en train d'installer les décorations de Noël avec Alexis, cette dernière lui annonce qu'elle ne sera pas présente au réveillon. Alexis a un nouveau petit ami, qui se prénomme Max et elle veut le voir avant qu'il parte pour les vacances de Noël. Richard est déçu car il espérait perpétuer la tradition de Noël de sa famille. En plus de sa déception, Kate annonce à Richard qu'elle ne peut pas aller à son réveillon de Noël puisqu'elle est de garde au poste de police. Castle découvre que Kate lui a menti sur sa garde et ne comprend pas la raison.

Au poste de police, Gates est furieuse à l'idée de passer un autre réveillon de Noël avec sa belle-mère. Alors qu'Esposito et Ryan passent habituellement leur réveillon ensemble, Kevin lui annonce qu'il va plutôt passer Noël avec Jenny. Esposito découvre la raison de ce refus de poursuivre la tradition. Javier drague à nouveau Lanie.

En parallèle, l'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un père Noël, dans un parc de la ville. Un couple a vu le père Noël tomber du ciel avant que son corps s'écrase près d'eux. Après avoir examiné le corps, l'équipe de Beckett découvre l'identité de ce père Noël : Kriss Kringle. Son adresse est le Pôle Nord. Ces indices amènent Castle à diverses théories sur l'existence du père Noël. Au cours de l'enquête, l'équipe découvre une école qui apprend comment devenir le père Noël et dont la victime faisait partie. Derrière cette histoire se cache une affaire de justice que ni Kate, ni Richard n'auraient soupçonnée.

Alexis est malade. Elle a la mononucléose et reste chez Richard en attendant d'aller mieux. Au même moment, Meredith, l'ex-femme de Castle et la mère d'Alexis, débarque chez Richard. Cela ne fait pas l'affaire de Kate, qui vient vivre chez Richard, car son appartement s'est fait gazer au fumigène. Cette cohabitation entre Meredith et Kate agace cette dernière. Lanie en profite pour mettre la pression sur Kate pour défendre son couple devant Meredith. Meredith invite Kate à dîner, sans Richard. La situation va stresser Castle au plus au point se demandant ce qu'elles vont dire sur lui. Au moment où Meredith part pour Paris, elle révèle à Kate la raison pour laquelle elle a divorcé. Cela va créer un doute en Kate sur la relation qu'elle a avec Castle.

En parallèle, l'équipe de Beckett enquête sur la mort de Michelle Twohey, une avocate qui s'est spécialisée dans les divorces. Elle n'avait que des femmes pour clientes. Au moment de mourir, Michelle avait en sa possession une adresse et le nom de R. Garrison. Il s'agit de Rob Garrison, un comptable. Au cours de l'enquête, l'équipe va avoir plusieurs suspects : Corey Francis (l'amoureux de Michelle), Herman Poquille (photographe travaillant pour Michelle), Samantha Voss-peterman (cliente de Michelle qui a perdu son divorce), Walter Voss (ex-mari de Samantha), Billy Pipper et sa femme Leann Pipper. L'un des suspects disparaît. Quand Javier et Kevin le retrouvent, le suspect les met sur la voie de la vérité concernant la mort de Michelle Twohey.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Holly Rhodes, alias « DJ Beat », survenue lors d'une fête organisée par la chanteuse Regina Cane où Josie Lang, une autre chanteuse, était invitée. Sur la main de la victime, un numéro de téléphone a été inscrit. Au cours de l'enquête, Kate et son équipe dévoilent un stratagème de vol assez ingénieux mis au point par « DJ Beat » et un mystérieux assistant. L'équipe découvre qu'il s'agit d'un adolescent de 14 ans, du nom de Joey Malone. L'équipe déduit que Joey est derrière les vols et qu'il connaît l'assassin de Holly Rhodes. Malheureusement, Joey est muet comme une carpe sur l'identité de celui qui l'a engagé pour voler. Esposito, dont le passé est celui d'un jeune délinquant, va tout mettre en œuvre pour faire craquer Joey et ainsi le ramener sur le droit chemin. Après quelques tentatives infructueuses, Esposito réussit à faire craquer Joey. L'enquête avance et l'identité du tueur ainsi que la raison de son geste créent une surprise de taille pour l'équipe de Beckett.

Castle a découvert le « vlog » (un blog sous forme de capsule vidéo) d'Alexis. Il est furieux de voir que sa fille donne des informations personnelles et intimes de sa vie sur ce site. Martha et Kate tentent de le raisonner sans succès. Alexis s'explique avec son père sur son « vlog ».

L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Beau Randolph qui a été étranglé avec un soutien-gorge dans un bar de la boîte de nuit où se tenait une soirée organisée par la compagnie de la victime : College Girl Gone Crazy. Beckett et son équipe suivent plusieurs pistes, dont celle de l'ex-petite amie, de la garde du corps de Beau, de la fille et du fondateur de la voix de la décence. À ces suspects, se rajoutent le producteur porno de la version masculine de l'entreprise de Beau, College Guy Gone Nuts qui voulait s'associer à Beau et une entreprise qui vend des jouets d'enfants, la petite grenouille. C'est en suivant et en validant chacune des informations des suspects que Kate et Richard découvrent le mobile et le vrai coupable, que personne n'avait suspecté.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Melanie Rogers, 27 ans, une ingénieure en écologie du New Jersey qui aurait une liaison avec un homme marié vivant à Washington DC. Kate et son équipe vont découvrir qu'il s'agit du sénateur William Bracken. Au cours de l'enquête, l'équipe de Beckett va découvrir que celui qui était le suspect numéro un du meurtre de Melanie Rogers est en fait la prochaine victime d'un assassinat, et la victime était un témoin gênant. Kate doit plier sur son orgueil et protéger le sénateur Bracken. Bien vite un suspect est identifié en la personne de Robert McManus, un schizophrène tenant Bracken pour responsable de la mort de son fils. Il est arrêté, mais plusieurs détails font douter Kate de sa culpabilité. Après réflexion, elle en vient à élaborer une théorie selon laquelle McManus a été piégé. Richard ne trouve rien pour démolir la théorie de Kate. Alors que le sénateur Bracken allait donner une conférence à l'hôtel Widmark, Kate exige de faire évacuer l'hôtel pour chercher une bombe que le vrai tueur y a cachée. La fouille s'avère infructueuse, quand un indice important saute aux oreilles de Kate, qui sauve la vie du Sénateur Bracken au moment où la bombe explose. Richard réussit à rattraper le vrai meurtrier. À la suite des événements, William Bracken s'arrange pour faire arrêter un adversaire politique, qu'il soupçonne de vouloir l'éliminer, afin de montrer sa gratitude envers Kate.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'Hannah Green, 23 ans, poignardée avec un couteau de cuisine. Richard fait remarquer à l'équipe que le couteau de cuisine coûte dans les 200 $. La victime travaillait sur l'émission de télé-réalité Les femmes de Wall Street, basée sur les épouses de traders ruinés par la crise qui ont repris les rênes de leurs familles. Bien vite, les soupçons se portent sur l'une des candidates, Penelope, mais celle-ci est innocentée. De fil en aiguille, les suspectes et suspects seront : Bob, l'époux de Penelope ; Margo Cowan, une autre candidate ; Peter Monroe, producteur de l'émission ; le milliardaire Chilean, vedette de l'émission Pool Shark et Stone Gower, le fils de Margo Cowan. L'équipe de Kate, avec l'aide du Capitaine Gates, vont découvrir la vraie raison qui a poussé le meurtrier à tuer Hannah, mais aussi un meurtrier qu'ils ne soupçonnaient pas.

En parallèle, Jenny et Kevin essaient d'avoir un bébé. Lanie et Javier vont à un dîner de la Saint-Valentin. Richard tente de savoir le cadeau que Kate va lui offrir pour la Saint-Valentin, mais celui de Castle tombe par malchance entre les mains de Victoria.

Martha tente de faire avouer à Richard que sa fille lui manque, mais ce dernier tente de philosopher sur la situation, tout en niant l'évidence. L'équipe de Beckett enquête sur la mort de Hasim Farouk, étudiant saoudien, frappé par un van alors qu'il tirait sur le conducteur. En cherchant dans son appartement, Esposito et Ryan trouvent un arsenal d'armes et d'équipements de surveillance. L'équipe pense qu'il s'agit d'un terroriste ou d'un espion. L'histoire se complique lorsque l'équipe découvre que le matériel de surveillance sert à espionner Sara El-Masri, étudiante et fille d'un homme d'affaires égyptien. Peu de temps après, Kevin découvre une vidéo de surveillance montrant Sara El Masri se faisant enlever en pleine rue. C'est alors que Richard conclut qu'Hasim Farouk protégeait Sara. Cela donne l'occasion à l'équipe de sortir toute sorte de théories sur le lien qui unit Farouk à Sara. Après avoir parlé au père de Sara, Castle découvre le véritable travail d'Hasim Farouk : il était le garde du corps de Sara et a été engagé par son père. L'équipe de Beckett travaille par la suite avec le FBI afin de retrouver Sara El-Masri. L'agent Harris prend alors en charge l'enquête de l'enlèvement. Au cours de l'enquête, Castle et Beckett découvrent que Sara se rendait à une conférence à l'Hôtel Beaumont. Castle découvre que sa fille était présente à la conférence et commence à devenir inquiet quand il retrouve son téléphone parmi les objets perdus. Richard conclut qu'Alexis et Sara étaient ensemble et ont été enlevées toutes les deux. L'agent Harris explique à Castle et Beckett les circonstances de l'enlèvement d'Alexis et leur annonce que le FBI a identifié le chauffeur. Kate et Martha tentent de réconforter Castle. Richard découvre comment les ravisseurs étaient au courant de l'amitié entre Alexis et Sara. L'équipe réussit à retrouver le van. Cela rend Castle très nerveux. Kate tente de le réconforter. Ils réussissent à retrouver le partenaire de Roger Henson, Douglas Steven, l'homme qui conduisait le van lors de l'enlèvement. Après avoir parlé avec Richard, Douglas donne l'adresse d'une ferme où pourraient se trouver les filles. Le FBI envahit la ferme mais ne trouve pas les filles, seul gît Roger Henson, mort et torturé. Alexis et Sara sont détenues dans un local dont elles parviennent à s'échapper, et Alexis parvient à appeler son père avant d'être retrouvée par les ravisseurs. Seulement, le FBI localise l'appel et découvre qu'Alexis est détenue à Paris.

Ayant découvert qu'Alexis et Sara ont été amenées à Paris, Richard décide d'aller enquêter sur place afin de sauver sa fille, au grand désarroi de Kate et de Martha. Richard va découvrir, grâce à son contact français, l'endroit où Alexis et Sara ont été séquestrées. Au cours de l'enquête, Kate va apprendre que ce n'était pas Sara qui était la cible des ravisseurs, mais Alexis. De son côté, Richard va faire la connaissance de son père qui est un espion et qui est la véritable raison de l'enlèvement d'Alexis. Le père de Castle a suivi de loin la vie de Martha, Richard et Alexis. Le père de Castle fait ses adieux à Richard au moment d'aller sauver Alexis.

Castle et l'équipe de Beckett enquêtent sur la mort de Val Butler qui a été retrouvée morte de peur dans son appartement. Les premiers soupçons se portent sur son ex-petit ami, Freddie Baker, mais quand celui-ci annonce que Val a reçu un paquet et qu'elle lui a dit des propos concernant le pouvoir maléfique, Kate doit l'innocenter et part à la recherche de ce mystérieux paquet. Dans l'appartement de Val, Kate et Richard trouve le paquet : il s'agit de plusieurs DVD. Richard écoute l'un d'eux et croit qu'il est la prochaine victime. Il élabore une théorie sur un esprit meurtrier.

Du côté de la morgue, le médecin légiste conclut à une mort de cause inconnue, ce qui alimente la peur de Castle. Comme personne ne veut regarder le DVD, Kate se dévoue et ne croit nullement qu'elle va mourir au bout de 3 jours. Au cours de l'enquête, l'équipe de Kate vont retrouver d'autres victimes du mystérieux DVD. Alors que l'enquête n'avance pas, Richard soumet l'une des images du DVD à ses fans, ce qui va permettre de relancer l'enquête. Kate et Richard vont découvrir derrière cette histoire paranormale, une histoire bien réelle dont ils ne se doutaient pas.

Beckett annonce à Castle qu'il parle en dormant. À plusieurs reprises, alors qu'il dormait, Richard a prononcé le prénom de Jordan. Cela intrigue Kate qui lui demande sans cesse qui est Jordan. Castle finit par lui avouer la vérité à propos de cette personne.

Au poste de police, l'équipe enquête sur la mort d'un pâtissier, Jimmy Whelan, dont le corps a été retrouvé dans un mélange de chocolat. Au début de l'enquête, Esposito trouve une mallette contenant 50 000 dollars dans le bureau de Whelan. Personne ne sait pourquoi il avait cette mallette, même pas son assistant. Bien vite, un lien est fait entre Whelan et la mafia irlandaise de New York. Alors que Kate avait terminé d'interroger Siobhan O'Doul, cette dernière tombe sur Kevin et l'embrasse devant Jenny. Kevin doit s'expliquer. C'est alors qu'arrive l'agent Sam Walker du FBI, un ancien collègue de Ryan, pour les aider à capturer le meurtrier et à y voir plus clair dans l'affaire. Kevin se propose de reprendre sa couverture, sous les traits de Fenton O'Connell afin de capturer Bobby S et récupérer « la Bible », un livre qui contrôle le gang de Bobby S.

En parallèle, Kevin et Jenny vont passer des tests afin de se rassurer sur leur fertilité.

À la suite d'un accident de ski, Castle est coincé chez lui avec la jambe cassée, seul, sans sa mère. Pour faire une blague à son père, Alexis lui a donné une paire de jumelle afin d'espionner ses voisins. Alors qu'il s'ennuie Castle se met à espionner ses voisins et assiste au meurtre d'une jeune femme. Lorsqu'il en parle à Beckett, celle-ci ne le croit pas. Richard tente alors de lui prouver qu'il a bel et bien été témoin d'un meurtre et avec l'aide d'Alexis, il échafaude un plan.

Beckett et l'équipe enquêtent sur le meurtre de Clara Dewinter, 35 ans, mariée, assassinée avec une batte de baseball dans une ruelle. Alors que le meurtre a été filmé, ils ne peuvent identifier le meurtrier, car une lumière, identifié par l'équipe comme une caméra infrarouge, cache le visage du meurtrier ainsi que le véhicule. Au cours de leur investigation, l'équipe découvre que la victime souhaitait changer d'identité et cachait une partie de ses revenus à son mari.

Castle n'en revient pas car de la nourriture disparaît depuis un mois. Il demande à Martha si c'est elle qui l'aurait mangée, mais celle-ci l'accuse d'avoir consommé la nourriture en pleine nuit, alors qu'il dormait. Alexis élabore une théorie de petits hommes qui viennent voler dans le réfrigérateur, mais Castle ne la croit pas. Il élabore un plan pour attraper le voleur de nourriture.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'une femme qui a été éjecté d'un véhicule en mouvement, près d'un hôpital, à 4 heures du matin. Lors de l'examen avec le médecin légiste, Kate et Richard voit le visage abîmé de la jeune femme. Le légiste suppose que cela a été fait par un pied-de-biche ou un ouvre-boite. Il émet même l'hypothèse que la jeune femme a été attaqué par un animal. Au cours de l'enquête, Beckett et son équipe identifient la victime comme étant Anne Cardinal, 27 ans, elle a grandi dans la réserve Onagonda. La victime travaillait avec des primates, retraité du monde de la télévision et du cinéma. L'équipe suit plusieurs pistes afin de trouver le vrai lieu du crime ainsi qu'une grande empreinte. Il n'en faut pas plus à Castle pour élaborer une théorie impliquant le « Bigfoot ». Plus tard, ils découvrent l'existence d'une émission de télévision qui propose de l'argent à celui ou celle qui prouve l'existence du « Bigfoot ». L'équipe découvre aussi plusieurs indices dont un pendentif qui se trouvait dans l'estomac de la victime et une lentille de caméra qui se trouvait dans sa tête. L'enquête prend l'allure d'une compétition où les preuves de l'existence du « Bigfoot » (Castle et Ryan) et celle d'un fugitif meurtrier en fuite (Kate et Javier) s'accumulent.

Alors qu'elle s'apprêtait à passer une soirée romantique avec Castle, Kate est furieuse de s'apercevoir que Richard doit choisir entre son jeu vidéo et elle. Cette déception vis-à-vis de Richard va se refléter tout au long de l'enquête et engendre beaucoup de questions au sein du couple notamment sur le fait d'être acquis l'un pour l'autre.

L'équipe de Kate enquête sur la mort d'Arthur Felder, 54 ans, un riche investisseur, mort sur la table d'un restaurant après une bouchée. Parmi les témoins se trouvent Eric Vaughn, un milliardaire qui séduit Kate, au grand désarroi de Richard qui en devient maladivement jaloux et fera tout pour l'éloigner d'elle. Au cours de l'enquête, Kate et Richard apprennent que le serveur à échanger par erreur les plats. La vrai victime qui était visée est Eric Vaughn. L'affaire se complique pour le couple Beckett-Castle, quand ils apprennent qu'Eric Vaughn a exigé uniquement Beckett pour assurer sa sécurité. Richard prend alors l'enquête et l'équipe en main, mais accumule les gaffes. Au terme de l'enquête, Kate se pose de plus en plus de question sur le couple qu'elle forme avec Richard.

Cela fait quelques jours que Castle n'a pas parlé et vu Kate. Cette dernière travaille sur l'enquête d'une explosion d'un appartement. Castle tente de retenir Kate afin de passer un peu de temps romantique avec elle, mais celle-ci privilégie son enquête, ce qui déçoit Richard. Cette enquête permet d'identifier Archibald Fosse comme étant l'auteur. Au moment où l'équipe de Beckett envahit l'appartement d'Archibald Fosse, ce dernier s'enfuit mais est vite rattrapé par Esposito et Ryan. Malheureusement, ce que l'équipe de Beckett ne sait pas, c'est que l'appartement d'Archibald Fosse cache une bombe. Fosse l'a activé lors de son arrestation. Beckett s'aperçoit que sous ces pieds, quelques choses a cédé et pense tout de suite à une bombe. Après que les démineurs ont fouillé l'appartement, la confirmation est établie : Beckett a belle et bien mis les pieds sur une bombe. Elle ne doit pas bouger, sans quoi, l'immeuble va exploser. Après quelques tentatives, Esposito et Ryan tente de faire parler Fosse sur la bombe mais Archibald se suicide et meurt sans révéler quoi que ce soit sur celle-ci. Les démineurs doivent donc travailler à l'aveugle. Alors que Kate est debout, immobile, sur la bombe, Castle en profite donc pour discuter de leur relation, des meilleurs moments depuis qu'ils se sont connus et régler ses comptes avec Beckett.

Au terme du sauvetage de Kate, Victoria annonce à Kate et Richard qu'elle est au courant pour leur relation et espère que le couple restera professionnel

L'équipe de Beckett enquête sur l'explosion d'une automobile et de son occupant lorsque les agents fédéraux viennent enlever la voiture et le corps. L'équipe ne peut malheureusement enquêter, mais bien vite Esposito rapporte à Kate l'identité de la victime : Dale Tanner. Plus tard, Kate et Richard découvrent que la moitié du gouvernement s'intéressait à Dale. Depuis que son père a été injustement emprisonné et décédé, Dale consacre sa vie à faire sortir des innocents de prison. L'équipe de Kate découvre que la bombe qui a fait exploser la voiture provenait du ciel. Richard en conclut que Dale Tanner a été tué par un drone (missile) mais refuse de croire que des militaires sont derrière le meurtre. En allant sur la base militaire de Fort Drummond, Beckett découvre l'homme qui était sur les lieux du crime, mais elle n'a pas l'autorisation de lui parler. Elle jure de tout faire pour parler à cet homme et d'avoir une réponse au meurtre de Tanner. Elle finit par l'interroger et s'aperçoit que son identité est fausse. De surcroît, l'homme refuse de parler. À la suite de l'intervention du procureur général, l'homme se présente comme Jared Stack, de la section d'investigation spécial du bureau du procureur général et révèle pourquoi il suivait Dale Tanner. Kate et Richard veulent continuer l'enquête avec Jared, mais celui-ci refuse. Kate et Richard vont découvrir que la mort de Dale est reliée à une triste histoire de famille. Au terme de l'enquête, Jared Stack propose à Kate de travailler pour le procureur général et ainsi travailler avec lui. Kate ment à Richard sur la discussion avec Stack et ne sait plus quoi penser

Kate est à Washington pour passer un entretien d'embauche, à la suite de l'offre de l'agent Stack. Pendant ce temps, Alexis questionne son père sur le fait qu'il n'a pas envoyé l'argent à son professeur pour le voyage dans la forêt tropicale. Richard tente de convaincre Alexis de ne pas y aller. Alexis tente de le raisonner et finit par le convaincre d'envoyer l'argent à son professeur.

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'une femme qui a été retrouvée dans la réserve d'eau d'un hôtel. Il s'agit de Crystal Sky et vit dans l'immeuble depuis 10 jours. Esposito en profite pour taquiner Castle sur les noms qu'il choisit pour mettre dans ses romans. Ryan fait des recherches sur la victime et découvre que tout est faux et que sa véritable identité est Erika Albroock, une des meilleures étudiantes d'Harvard. Au cours de l'enquête, les témoins désignaient la victime comme une prostituée, mais les analyses démontrent qu'elle n'en était pas une et qu'elle en a donné l'image. L'équipe de Kate va découvrir qu'Erika était en fait une pirate informatique. Les journées avant le meurtre, Erika piratait le système informatique d'un bureau d'avocats. Un suspect est vite identifié par l'équipe, mais malheureusement la police arrive trop tard. L'enquête va révéler trois morts où il n'y a aucun témoin, aucune trace d'ADN et tous pointeront le cabinet d'avocats comme principal suspect. Esposito et Ryan s'aperçoivent de l'humeur changeante de Beckett et s'interrogent sur ce qui ne va pas. Ryan en profite pour annoncer à Esposito qu'il va être papa. En parallèle, Victoria annonce à Kate qu'elle a appuyé fortement sa candidature au FBI. Elle lui annonce aussi qu'elle a de très fortes chances d'avoir le poste à Washington. Kate se confie à Lanie sur sa relation avec Castle et de son futur boulot à Washington, afin de pouvoir prendre une décision. Castle découvre un billet d'avion pour Washington. Kate lui explique qu'elle a eu un entretien d'embauche pour travailler au FBI. Castle est furieux que Kate lui ait menti. Il lui reproche de ne pas l'avoir inclus dans ses projets d'avenir. Kate reçoit un appel de Washington lui disant qu'elle a le poste. Kate consulte son père, Jim, sur ce qu'elle doit faire à propos de l'offre de travail et de sa relation avec Castle. Kate rencontre Richard afin de lui faire part de sa décision, mais ce dernier la demande en mariage

Washington, deux mois après la demande en mariage de Castle. Cela fait maintenant six semaines que le couple ne s’est pas vu. Castle se rend à Washington où Beckett vient de terminer sa séance de formation. Il lui est demandé d’enquêter sur le vol d’un module de cryptage pour l’armée. Son utilisation permettrait à son possesseur de paralyser tous les systèmes satellitaires militaires ! Castle tente de s’immiscer dans l’enquête. Mais très vite, il est écarté par la coéquipière de Beckett, l’agent Rachel McCord, ce qui ne l'empêchera pas de persister…

Castle se trouve dans les bureaux de la sécurité du ministère de la Justice. Il existe un antidote pour juguler les effets nocifs du poison. Mais il a été volé en même temps que la toxine. Beckett exploite un élément donné par Castle et laissé par Bronson : "Dreamworld" !

Il s’avère qu’un journaliste avait tenté d’enquêter sur le sujet. L’homme, Brad Parker, révèle que Dreamworld est une base militaire située en Afghanistan d’où partaient toutes les opérations de frappes aériennes ciblées.

Il confie que Bronson y était militaire. Ce dernier avait même permis d’éliminer le numéro 2 dans le pays de l’organisation terroriste Al Quaïda. Vengeance d’un membre de la famille ?

Des caméras de surveillance montrent Bronson en train d’être suivi quelques jours plus tôt par un certain Waqas Rasheed, cousin de la cible éliminée…

Une ancienne gloire d’une série de télévision est retrouvée pendue au crochet d’une grue d’un d’immeuble en construction. Que faisait-il là ? Charlie Reynolds avait connu la célébrité dans les années 90 en devenant le héros de la sitcom Pas de bol, y’a école. Le jour de sa mort, il a été vu dans un taxi se disputant violemment avec un autre personnage de la sitcom en question, le dénommé Ramon Rousseau. Bien qu’il fut prévu comme le personnage principal du programme, Ramon Rousseau en était devenu le second rôle quand le personnage de Reynolds avait pris de l’ampleur. Il s’avère qu’un film tiré de la série est en cours de tournage actuellement. Et le réalisateur Hank Harper s’est adjoint tous les acteurs de l’ancienne production pour l’événement. Ramon reconnaît avoir rencontré Reynolds. Déjà à l’époque les deux hommes se haïssaient…

Un jour d’anniversaire mouvementé pour Emma Riggs, 31 ans : à son réveil, la jeune femme trouve à ses côtés son petit ami assassiné de trois coups de couteau. Les policiers tambourinent déjà à la porte. Emma Riggs récupère une arme et prend la fuite par la fenêtre. Elle entre dans un cabinet dentaire et prend en otage les cinq personnes qui s’y trouvent. La jeune femme demande à parler à Castle dont elle connaît la collaboration avec la police. Elle jure être innocente du meurtre d’Angelo Vasquez. Ce dernier n’était même pas censé se trouver chez elle. Pourtant, la police retrouve un SMS sur le portable de Vasquez dans lequel Emma Riggs lui demande de venir la rejoindre. Celle-ci se rappelle être rentrée seule chez elle après le travail puis s’être versée un verre de Whisky, ensuite c’est le trou noir !

Une enquête troublante mène Castle et Beckett à un suspect qui dit avoir voyagé dans le temps pour empêcher de terribles événements de se dérouler. Est-il simplement un tueur fou ou dit-il la vérité ?

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre étrange d’une jeune femme retrouvée dans une position qui suggère un rituel. Quand l’équipe retrouve une collection de symboles dans son appartement et que le suspect principal est un mystérieux moine, Castle est convaincu qu’ils sont plongés dans une conspiration à la Da Vinci Code. Pendant ce temps, Castle doit également accepté le fait qu’Alexis et Pi aient décidé de vivre ensemble.

Alexis demande l’aide de Castle pour prouver qu’un homme, condamné à mort, Frank Henson, a été condamné à tort. Avec seulement 72 heures avant son exécution, Castle et Alexis (avec l’aide de Beckett) enquêtent sur le meurtre mais découvrent des secrets explosifs qui pourraient sceller le sort de Frank.

Une thérapeute reconnue spécialisée dans les relations de couples est assassinée. Il semblerait qu’elle ait été ciblée à cause des secrets de ses puissants clients. Quand Castle et Beckett découvrent que la victime était en possession d’un objet rare valant des millions de dollars, ils réalisent que l’affaire pourrait être plus compliquée, et plus dangereuse, qu’ils ne le pensaient.

Quand une femme ressemblant à Lanie est assassinée, l’équipe pense que le tueur pourrait cibler des membres du poste de police.

Un homme en sang se précipite dans une église et, avant de mourir, tend un paquet. Quand ce paquet se révèle être un petit garçon, Castle et Beckett deviennent nounous pour le nouveau-né. S’ils déterminent que le bébé et la victime de sont pas liés, ils découvrent que ses parents pourraient être plus difficile à trouver que le meurtrier.

Quand Castle et Beckett découvrent que la victime d’un incendie a été tué avec une arme à feu, ils partent à la recherche d’un pyromane en série devenu tueur. Pendant ce temps, la femme de Ryan, Jenny, ressent ses premières contractions. Mais un désastre pourrait bien transformer ce moment en cauchemar.

Le meurtre d’un jeune employé d’un magasin de location de vidéo prend un tournant inattendu quand l’équipe découvre qu’il avait eu à faire dans le passé à un pirate informatique. Mais ce n’est rien comparé au choc qui attend Castle quand l’enquête les conduit tout droit à son père, Jackson Hunt.

Castle et Beckett enquêtent sur la mort de Mandy Sutton, une jeune pop star qui vit sous le feu des projecteurs et alimente la presse people avec ses excès. Les tabloïds s’intéressent aussi à la vie privée de Castle qui, apparemment, se serait remis avec son ex-femme…

Quand l’assistant de l’éditrice du magazine Modern Fashion, Matilda King, est découverte morte, Castle et Beckett sont plongés dans le monde difficile de la haute couture. Pendant ce temps, le passé de Beckett dans le monde de la mode lui permet d’accéder à une surprise pour son mariage.

Le meurtre d’une adolescente conduit Castle dans les couloirs de son ancienne école où il se remémore de vieux souvenirs. L’enquête le pousse aussi à penser qu’une adolescente avec des pouvoirs de télékinésie serait responsable.

Alors que le corps d’un acteur vient d’être retrouvé dans une chambre d’hôtel, une femme se présente au commissariat pour confesser le meurtre, fournissant des détails que seul le coupable peut savoir. Seulement, elle se trouvait ailleurs lorsque le crime a été commis…

Beckett est recrutée par les Narcotiques pour une mission d’infiltration qui tourne mal. Cette dernière doit alors maintenir le plus longtemps sa couverture alors qu’elle s’enfonce dans le monde souterrain de la criminalité et fait une choquante découverte.

Beckett enquête sur la mort mystérieuse d’une danseuse de ballet japonaise. Quand Castle croisera la route d’un ninja, l’écrivain sera convaincu que ce dernier est responsable du crime.

Kate et Richard discutent de l'endroit où ils vont se marier, Richard suggère de le faire dans un manège au style d'une montagne russe. Kate n'est pas très enthousiaste à cette idée. Tout au long de l'enquête, le couple discute de leur liste d'invités. Plus de 400 personnes seront inscrites mais aucun des deux ne veut enlever de nom. Richard demande des conseils à Kevin afin de savoir comment il a constitué sa liste d'invités à son mariage, mais cela s'avère vite une mauvaise idée quand le lieutenant affirme qu'une partie de sa famille le déteste pour ne pas l'avoir invitée.

À la suite de la demande de Richard, pour les fleurs qu'il devrait y avoir à son mariage, Martha fait plusieurs suggestions d'arrangements floraux qui ne plaisent malheureusement pas au couple. Cela déçoit beaucoup Martha qui se fâche. Kate suggère à Richard de trouver un projet pour leur mariage dont Martha pourrait s'occuper mais il ne trouve pas d'idées.

Quand un skateboarder professionnel est abattu par un motard, Castle et Beckett sont plongés dans le monde des sports extrêmes où les cascades ne sont pas les seules choses qui peuvent être mortelles.

Une enquête secrète menée par Beckett à propos du meurtre de sa mère part en live quand un homme qu’elle surveillait est tué. Quand les évidences lient Beckett à la victime, elle et Castle deviennent les victimes d’une chasse à l’homme qui les met en danger.

Castle et Beckett sont à quelques jours du mariage quand ils découvrent que Kate est mariée depuis 15 ans. L’enquêtrice part à la recherche de l’homme en question pour lui faire signer les papiers de séparation, mais les choses se compliquent vite.

Lorsque Kate découvre que Castle n’est pas dans la voiture en feu, commence alors une enquête pour retrouver l’écrivain. Seulement, la vérité pourrait bien être beaucoup plus qu’une simple histoire d’enlèvement.

Castle et Beckett enquêtent sur la mort du P.D.G. d’une compagnie de jouets décédé dans des conditions étranges. De son côté, l’écrivain tente de résoudre le mystère de sa disparition.

Un spécialiste du billard est tué alors qu’il jouait une partie chez lui. Castle et Beckett débutent alors une enquête qui va rapidement tourner vers le paranormal, au plus grand plaisir de l’écrivain.

Un vendeur de glace est retrouvé mort dans son camion. Pour arrêter l’assassin, Castle et Beckett doivent retrouver le témoin du meurtre, qui semble être un enfant de CE1.

Une starlette du Web est retrouvée assassinée chez elle. Très vite, l’enquête prend un détour public lorsqu’il s’avère que le meurtrier poste les photos de ses crimes ainsi que des indices pour la police sur Internet.

Lors d’une enquête, Castle et Beckett se retrouvent séparés. Arrivant tant bien que mal au commissariat il retrouve alors Kate, Esposito et Ryan. Problème : ils ne se souviennent pas de lui.

Une jeune femme est découverte morte à New York, mais il semble qu’elle se soit faite empoisonnée en Arizona. Castle et Beckett partent alors dans une ville qui reprend les codes de l’époque du Far West.

Un homme est retrouvé assassiné dans un parc. Ryan et Esposito partent interroger une personne pouvant les aider à retrouver le tueur, mais en se lançant à sa poursuite, Esposito se retrouve pris en otage dans une rame de métro.

C'est le grand jour pour Kate : elle emménage officiellement chez Richard en tant qu'épouse. Alors qu'elle fait le tri dans ses affaires, Castle n'arrête pas de passer des commentaires désobligeants sur son appartement et son voisin. Cela déçoit Kate. Plus tard, durant l'enquête, elle confie à Lanie sa déception sur la réaction de Richard à propos de son appartement et de son voisin.

L'équipe enquête sur la mort d'un acteur de cinéma du nom de Lance Delorca. Il était la vedette des films Hard Kill et Les Indestructibles, films d'action des années 1980. Richard, grand fan de ce type de film, reconnait la star, alors que les autres avouent ne pas la connaître. Richard, qui sait que Lance vit à Los Angeles, se demande pourquoi il est à New York. Puis, il décide de faire des recherches sur la victime. Castle dit que Lance était membre du CNI, l'agence d'espionnage espagnole. Puis, au commissariat, Richard montre le film Hard Kill à Esposito et Ryan. Il les renseigne sur chacun des acteurs et actrices du film. Cela déplaît beaucoup à Kate qui ne voit pas un grand intérêt. Richard fournit alors à Kate, une première piste pour aborder l'enquête : Kate Kingsley, l'épouse de Lance et actrice. Cette dernière les envoie vers Brock Harmon, acteur, qui hébergeait Lance. Les propos de Castle sur le fait que Lance était un membre du CNI sont confirmés par Brock. Il n'en faut pas plus à Richard pour élaborer une théorie comme Jason Bourne. Malheureusement pour Richard, sa théorie et sa croyance envers Lance vont s'effriter quand un agent d'Interpol venant d'Espagne, Enrique Gomez, va informer l'équipe que Lance n'était pas un membre du CNI et qu'il était éleveur de chèvres dans les Pyrénées. Cependant, Richard élabore une autre théorie où cette fois, les acteurs et actrices du film Hard Kill deviennent leur personnage dans la réalité. Au grand dam de Kate, cette dernière théorie de Castle semble tenir la route. En effet, chaque indice que l'équipe va trouver va renforcer cette théorie. Cependant, un petit détail que Kate va trouver va démolir la théorie de Castle et ainsi permettre d'arrêter le meurtrier.

Après l'enquête, Kate fait ses adieux à son appartement.

Un docteur est retrouvé mort dans une vitrine de magasin, apparemment tué par un Père Noël. Lorsque les détectives découvrent que le médecin entretenait des liens avec la mafia, un homme est arrêté, mais un ancien contact, concerné par l’affaire, demande à Rick d’enquêter pour eux.

Une femme est retrouvée morte dans son appartement et son chien a disparu. Toujours mis à l’écart de la police de New York, Castle obtient sa licence de détective privé et une compétition se met en place entre lui et Beckett pour savoir qui des deux résoudra l’affaire en premier.

Une star montante de la telenovela est retrouvée morte dans une allée. Alors que Castle a du mal à lancer son business de détective privé, Kate lui propose d’enquêter sur la disparition du sac à main de la victime. Les deux vont alors vite se retrouver sur l’enquête.

Une femme mariée, ancienne amie de Castle, rentre dans le bureau du détective privé en lui demandant de prouver que son mari entretient une liaison. Alors qu’il vient chez elle pour lui apporter les photos compromettantes, il entraperçoit le meurtre de sa cliente.

Des preuves sur le corps d'une jeune femme assassinée incrimine le docteur Kelly Neiman, petite amie du tueur en série 3XK, némésis de Castle et Beckett.

L'épisode reprend quelques minutes après l'enlèvement de Kate. L'équipe découvre la voiture de Kate dans la rue, là où elle a été enlevée. Castle soupçonne Boudreau d'avoir enlevé Kate en compagnie de Nieman et d'Amy. Le commissariat déploie toutes ses forces pour retrouver Kate. Gates théorise sur le fait que Boudreau est Boudreau et que le vrai Tyson agit dans l'ombre. Castle réfute cette théorie. Castle reçoit un appel de Kate. Lorsque l'appel est localisé, Esposito, Ryan et Castle s'y rendent. Ils y découvrent un enregistreur vocal avec l'appel que Castle a reçu. L'enquête continue et Castle décide de prendre des risques afin de retrouver Kate. Ces risques ont de lourdes conséquences sur Richard, qui sait que Boudreau (Tyson) joue et les manipule, lui et la police, décide de tenter de le battre à son propre jeu. De son côté, Kate découvre avec horreur le plan du docteur Kelly Nieman. Kate met tout en œuvre pour tenter de s'échapper de ses griffes. Boudreau (Tyson) et le docteur Kelly Nieman se font tuer par la police. À la suite de ces événements, Castle retrouve son droit d'enquêter avec Kate au commissariat, commué de privilège en travaux d'intérêt général pour avoir agressé Boudreau chez lui.

Un homme est retrouvé mort sur ce qui s’apparente être la planète Mars. Alors que Castle est aux anges, l’équipe découvre en réalité qu’il s’agit d’une simulation réalisée pour préparer les personnes choisies aux conditions de la planète. Pendant ce temps-là, l’appartement des Castle devient de plus en plus peuplé.

Un ami de la même promotion que Beckett est devenu capitaine, laissant la détective réfléchir sur ce qu’elle a déjà accompli. Alors qu’elle et Rick enquêtent la mort d’un repo man, ils découvrent vite qu’une femme est liée à toute à cette affaire.

Une étoile montante de la politique et membre du Congrès est visée par une tentative d’assassinat qui finit par tuer une de ses collaboratrices. Le problème est que tout cela se passe sous la protection de Ryan, qui va dès lors être plongé dans un complot qui pourrait bien le dépasser.

Lorsque Richie "The Pitbull" Falco, un brillant avocat qui aidait les petites gens est retrouvé mort dans une allée et plusieurs personnes pourraient y avoir un rôle à jouer. Pendant ce temps un pari se met en place entre Beckett et Castle d’une part et entre Ryan et Esposito de l’autre.

Rick commence à rêver des deux mois où il a été absent. Sur les conseils de Beckett, il choisit d’aller voir un psychologue, de façon à mieux se souvenir. Alors que ses rêves sont plutôt loufoques, il demande quand même à Ryan, Esposito et Kate d’enquêter sur ce mystère.

Castle et Alexis sont dans un avion en direction de Londres. Après quelques turbulences, ils découvrent que l’agent de sécurité de l’avion est mort. Dès lors, Rick et sa fille se joignent à l’équipage pour mener l’enquête.

Le présentateur du Saturday Night Tonight est retrouvé mort dans un ascenseur. Très vite Castle et Beckett entrent dans le monde d’une émission qu’ils adorent, et découvrent que la victime avait beaucoup de secrets. Pendant ce temps-là, Martha prépare son retour à Broadway.

Un mort dans les bois replonge Castle dans un épisode traumatisant de son enfance. L'enquête vire à l'obsession lorsqu'il tient absolument à obtenir des réponses sur cette tragédie, pendant que Beckett pense à son futur.

La première journée de Beckett en tant que capitaine du 12e arrondissement tourne au cauchemar lorsqu'un mystérieux appel téléphonique provoque sa disparition. Castle, Ryan et Esposito tentent de retrouver sa trace, aidés dans leur recherche par Alexis et Hayley Shipton, un enquêteur privé anglais. Ils découvrent que son équipe de la division «enquêtes spéciales» a complètement été décimée, y compris l'ancienne partenaire de Beckett à Washington, Rachel McCord, laissant croire à un gang de tueurs à gages. Castle est de plus en plus inquiet et décide de demander l'aide du prisonnier William Bracken. Celui-ci révèle à Castle que l'obsession de Beckett finira par la conduire à sa perte...

Rita, agent de la CIA, épouse de Jackson Hunt et belle-mère cachée de Castle, apporte son aide à Beckett et Vikram Singh. Singh avait transmis à McCord et son équipe un projet appelé Loksat. Lorsque McCord a été tuée, Singh a contacté Beckett. Braken avait un partenaire qui utilisait les avantages de la CIA pour introduire de la drogue dans le pays. Beckett réalise que le complot n'a pas été démantelé, et que le procureur général en fait partie. Le complice de Bracken est toujours en liberté, et sa prédiction, qui indiquait que Beckett serait totalement dévorée par son obsession devient réalité, au risque de perdre Castle...

Kate étant partie, Richard trouve l'appartement un peu vide. Pour combler le départ de Kate, il a commandé un système informatique parlant qui s'appelle Lucy. De son côté, Kate s'entraine avec Vikram. Elle lui propose de travailler avec elle à résoudre des meurtres. De leur côté, Esposito et Ryan se demandent pourquoi Kate s'est séparée de Richard. De mèche avec Esposito, Lannie tente d'en savoir plus sur la séparation, auprès de Kate, sans succès. L'équipe enquête sur la mort de Peter Garber, un étudiant en marketing de la faculté d'Hudson, retrouvé empalé sur une branche dans Central Park.

Kate est surprise par Martha, débarquant au commissariat afin d'essayer une nouvelle fois de retourner auprès de Castle, en vain. De leur côté, Ryan se plaint à Esposito du comportement de Jenny sur l'arrivée prochaine du second enfant du couple et de l'argent dont il va avoir besoin.  L'équipe enquête sur la mort de Dave Johnson, alias P.J. Moffet, un écrivain de 52 ans, retrouvé mort par balle, dans une église. 

Quand une oeuvre d'art inestimable est volée pendant le transport, Castle et Beckett travaillent avec un témoin pour traquer le coupable.

Le détective Slaughter revient pour demander l'aide de Castle dans la résolution d'un vol à main armée. Mais quand un corps est retrouvé lié au crime, Slauhgter devient le suspect numéro un dans la casse qui a tourné en assassinat, pendant que Castle doit déterminer s'il est coupable ou aider à prouver qu'il est innocent.

Afin de traquer le meurtrier brutal d'un séducteur mesquin, Castle et Beckett doivent enquêter dans l'Elite de New York, pendant ce temps, Rick prévoit de surprendre Beckett pour leur premier anniversaire de mariage.

Castle et Beckett enquêtent sur le meurtre d'un artiste de navires de croisière, mais se retrouvent pris au piège en mer avec le tueur.

Quand un mort est trouvé dans le théâtre du dernier spectacle de Martha, l'enquête de Castle et Beckett les conduit dans l'inattendu et dangereux monde de la compétition a capella.

Castle obtient enfin sa journée au tribunal quand il vient à la barre en tant que témoin clé d'un meurtre datant d'il y a cinq mois. Mais lorsque de nouvelles informations surviennent tout à coup, lui et Kate doivent lutter contre la montre pour éviter une erreur judiciaire.

Castle a acheté pleins de cadeaux pour le bébé de Jenny et Kevin. Il demande l'aide à Martha qui a alors l'idée de montrer le cadeau parfait qu'Alexis a trouvé pour le bébé de Jenny et Kevin. Cela décourage Richard, mais Martha (avec l'assentiment d'Alexis) le rassure, car elles aiment le voir se démener. Suite à cela, Alexis aborde le changement de comportement de Richard à propos de Kate. 

L'équipe de Beckett enquête sur la mort d'un Russe, Grigory Mishkin, le fils d'un employé du consulat russe de New York. Au consulat russe, Pavel Oborin, le consul, insiste auprès de Kate pour qu'un agent russe dépêché par leurs soins se joigne à l'enquête. Il s'agit de Vasily Zhirov, un employé faisant partie du service de sécurité diplomatique russe et un grand fan de Richard Castle et de ses romans.

Alors qu'il croyait aller rencontrer Stephen King pour parler d'un projet, Richard est enlevé en pleine rue au 143 Nicholas Street. Quelques minutes plus tard, c'est au tour de Kate d'être enlevée à cette même adresse. Les deux se retrouvent isolés dans un décor d'une salle de classe. Richard est avec trois autres hommes, alors que Kate est avec deux autres femmes. Chaque groupe doit résoudre une série d'énigmes afin de pouvoir sortir sain et sauf. Malheureusement, la panique s'empare de chaque groupe. Kate et Richard doivent, chacun dans leur groupe respectif, tenter de calmer les prisonniers, tout en trouvant les réponses aux énigmes. Chaque groupe finit par se retrouver, mais est vite piégé à nouveau par le ravisseur.

Richard a le syndrome de la page blanche et rien ne peut le calmer. Il a l'idée de chercher l'inspiration parmi les lettres qu'il a reçu lors de sa disparition, mais en vain. L'équipe de Kate enquête sur la mort d'Eddie Ramirez, un soigneur d'animaux salvadorien, travaillant au zoo de Central Park, la nuit. Le corps de la victime a été retrouvé dans la fosse aux serpents. Les premières informations de l'enquête démontrent que Ramirez recevait des menaces par textos et était prêt à payer une personne d'une forte somme. Du côté de Richard Castle investigations, Alexis et Hayley sont à classer les affaires résolues. Castle leur reproche de choisir des affaires qui manquent de piquant, de mystère. 

Richard, Hayley et Alexis sont à Los Angeles afin de découvrir la raison pour laquelle Richard s'y trouvait quand il a disparu. Le trio est à peine installé dans la suite de l'hôtel, que Richard reçoit une enveloppe avec un sceau, avec un message l'invitant à aider la police de Los Angeles à résoudre le meurtre d'un homme retrouvé mort dans un cimetière. Le message est signé du G.D.S., une société secrète de détectives considérée comme une légende urbaine. En compagnie de Hayley, Richard arrive au cimetière où a été retrouvé le corps. Le prenant par surprise, Hayley est présenté au détective Kurt Menendez de la police. La victime s'appelle Phillip Harris, un détective privé. Le tueur lui a pris le cœur. Menendez aimerait parler à la sœur de Phillip, qui vit à New York. C'est ainsi que Richard mêle Esposito et Ryan à l'affaire. Grâce à la sœur de Phillip, Esposito et Ryan, ainsi que Castle et Hailey, ont pu savoir que Phillip enquêtait sur un tueur en série, qu'il avait baptisé "le fantôme" et qui sévit à New-York et Los Angeles. Phillip a dit à sa sœur qu'il avait pratiquement identifié le tueur en série. Lannie découvre que "le fantôme" a fait sept victimes, quatre à Los Angeles et trois à New York.

Kate enquête sur la mort d'une recrue de l'académie de police où elle a étudié. Elle remarque l'une des étudiantes qui lui rappelle la jeune recrue qu'elle était. Du côté de Richard, il hésite à divulguer à Kate les informations qu'il a trouvé à Los Angeles. Sous la pression d'Hailey, Richard révèle finalement le contenu du film. Cela déçoit Kate, mais elle décide de continuer à enquêter sur Locksat en compagnie de Richard.

L'équipe de Kate enquête sur la mort d'un chauffeur blindé en transport d'argent. Les premières informations recueillies portent à penser qu'il s'agit des mêmes individus qui opéraient, il y a neuf ans, sur une affaire dont Javier Esposito s'occupait. À l'époque, il était fiancée avec Sonia Ruiz. Ils doivent à nouveau travailler ensemble, malgré les sentiments d'Esposito et le passé de Ruiz. Chez Richard, la jalousie s'installe entre Kate et Lucy, la voix informatisée. Après avoir lu le manuel d'instruction à l'insu de Richard, Kate change la voix de Lucy pour Linus.

Castle et Beckett profitent d'un matin en amoureux, quand Martha surgit avec une nouvelle idée pour la promotion de son livre : une interview avec Oprah Winfrey et elle compte sur son fils pour la lui décrocher. Un nouveau meurtre est signalé : Lars Cross, un spécialiste des fouilles souterraines, est retrouvé décapité par un cimeterre après avoir été torturé. La victime qui revenait de Turquie, semblait avoir gagné beaucoup d'argent. Castle remarque dans les affaires de la victime, son intérêt pour les Contes des 1001 nuits. Il n'en faut pas plus à Castle pour élaborer une théorie sur un génie tueur. Au cours de l’enquête, Castle est approché plusieurs fois par une mystérieuse femme blonde qui semble être au courant des démêlés de Lars. Malheureusement pour Richard personne ne semble l'avoir remarqué. Rapidement, la vérité sur le séjour en Turquie de Cross est découvert : il aurait trouvé la tombe du roi Salomon. En parallèle, l'accouchement de Jenny se complique, si bien que la vie de la mère et du bébé est en jeu. 

Hailey fait équipe avec Marcus Janek afin de s'introduire dans l'immeuble de la Manchester Energy et d'y installer un logiciel espion dans l'ordinateur du Vice-Président. À la Manchester Energy, Hailey découvre le corps de Marcus. Elle s'inquiète et tente de trouver des indices qui pourraient expliquer sa mort, mais elle découvre des indices pouvant l'incriminer et prétexte la contamination. L'identité de Marcus Janek est vite retrouvé par les policiers. Chez Richard, celui-ci fait une agréable surprise à Kate...

Alors que Castle et Beckett se demandent comment ils vont évoluer une fois l'affaire Loksat classée, ils sont appelés sur une affaire très étrange : Alan Masters, un inspecteur sanitaire sans histoire, est retrouvé sans vie chez lui, mais quand Lanie conclut à la mort par empoisonnement par tétrodotoxine, la victime reprend conscience, apparemment sain et sauf. Castle devient vite fasciné par la victime, qui veut juste reprendre sa vie. Il oriente donc la police vers un laboratoire qu'il a condamné à une forte amende pour avoir mal manipulé un produit chimique dangereux. Mais peu après avoir fait sortir la police de chez lui, il est victime d'un piège l'électrocutant. En parallèle, Vikram parvient à réunir des preuves contre Caleb Brown, l’avocat de Loksat. 

L'équipe enquête sur la mort de l'acteur Zane Cannon, retrouvé poignardé avec une plume d'oie à la gorge, sur les planches d'un théâtre où il répétait Hamlet. La première suspecte est son ex-petite amie, Naomi Fox, actrice aux méthodes extrêmes devant incarner Ophélie, qui aurait tué Zane, mais les révélations d'un paparazzi qui suivait Zane démontrent qu'il fréquentait la mafia espagnole de Harlem. C'est alors que Richard est enlevé par El Oso, légende de la mafia mexicaine en fuite, afin de lui prouver son innocence sur la mort de Zane.

Alors que le temps est à l'orage et qu'une coupure de courant arrive subitement, Alexis et Haley sont surprises chez Richard Castle Investigation par un homme ayant une hache qui annonce la fin des temps en latin, avant de s'écrouler, mort. Cela effraie Alexis et Haley qui alertent Richard grâce au système d'alarme. Arrivée aux bureaux de Richard, Richard et Kate découvre le nom de la victime sur le poignet : Gabriel Shaw, un patient d'un hôpital psychiatrique. Au cours de l'enquête, l'équipe découvre que Gabriel Shaw était un fanatique religieux qui se préparait à combattre le Mal. Il n'en faut pas plus pour Richard pour croire au retour du démon. Cela exaspère Kate qui tente de lui prouver le contraire. Entre temps Richard découvre qu'il est marqué par une croix lumineuse, lorsqu'il se prend en photo, augmentant sa paranoïa.

Vikram, Kate et Richard sont au rendez-vous dans le parc pour attendre les instructions de Locksat, grâce au téléphone que Caleb leur a fourni. À l'heure dite, ils reçoivent l'appel qui demande à Caleb de remettre une clef USB contenant des numéros de compte dans une cabine d'un entrepôt abandonné. Avec l'aide d'Hailey, ils investissent l'entrepôt abandonné. Au moment où l'auto de Caleb arrive près de la cabine, Kate reçoit un appel d'Esposito, lui disant que Caleb est mort brûlé dans une automobile. C'est alors que Kate comprend, trop tard, qu'ils ont été piégés par Locksat. Au moment où tout semble perdu, un véhicule, conduit par Mason Wood, arrive et sauve Kate et Richard. C'est Rita, la belle-mère de Richard, qui a demandé de l'aide à Mason, mais Kate doute sérieusement.