Sheldon og Penny deler intime hemmeligheter mens Leonard er til sjøs. Når Leonard vender tilbake, blir Sheldons følelser knust. Samtidig blir Raj trøstet etter bruddet med ekskjæresten.

Leonard og Sheldons vennskap blir satt på prøve. Wolowitz' forhold til moren fører til en uvanlig trussel mot hans mannlighet.

Hele gjengen deltar i et rebusløp der gutta må samarbeide med kjæresten til en av de andre. Løpet får fram både det beste og det verste i dem.

Sheldon sverger hevn etter at Amy ødelegger en av hans favorittfilmer, «Indiana Jones: Jakten på den forsvunne skatten». Samtidig oppdager Leonard hvordan han kan få Penny til å gjøre alt han vil, og Raj og Stuart prøver seg på nettdating.

Sheldon må bestemme seg for hvor mye «Amy-tid» som er for mye når hun får seg jobb ved universitetet. Samtidig tilbringer Howard natten på sofaen til Raj etter en krangel med Bernadette.

Sheldons store vitenskapelige gjennombrudd får ham til å føle seg som en bedrager. Samtidig lar Penny seg inspirere av Howards romantiske fremstøt overfor Bernadette.

Sheldon føler seg forbigått når Professor Proton ber Leonard om råd i stedet for ham. Som hevn innynder han seg hos en annen TV-legende, Bill «the Science Guy» Nye. Samtidig blir Raj sjalu når Howard blir med på jentekvelden uten å være invitert.

Leonard prøver å forhindre at Sheldon overreagerer når en tidligere tabbe blir brakt til overflaten. Men Sheldon straffer Leonard ved å tvinge ham til å gå en dag i hans sko. Samtidig konfronterer Penny ekskjæresten til Raj, Lucy.

Sheldon protesterer når gjengen drar ham med hjem til Mrs. Wolowitz på Thanksgiving. Samtidig må Penny og Leonard rette opp en tabbe fra Pennys fortid.

Da den vitenskapelige oppdagelsen, som Sheldon oppdaget ved en tilfeldighet, blir motbevist, må Amy og Leonard hjelpe ham med å håndtere skammen og skuffelsen. Howard og Bernadette åpner hjemmet sitt for Raj i en uke, som fort setter ekteskapet på prøve.

Mens Sheldon er i Texas for å besøke familien, samles alle de andre for å pynte juletreet i leiligheten. Der forestiller de seg hvordan livene deres hadde vært hvis de aldri hadde møtt Sheldon.

Leonard sliter med å trøste Penny etter at hennes store sjanse som skuespiller mislykkes. Samtidig prøver Sheldon å lære seg å være morsom, mens Raj tørrtrener på sjekketriks.

Sheldon blir tvunget til å ta ferie, men i stedet for å slappe av, tilbringer han det meste av tiden sammen med Penny. Samtidig sliter Leonard med å støtte Penny, og Bernadette får hjelp fra Stuart med å erstatte en av Howards tegneserier.

Når gutta ikke får tak i billetter til Comic-Con, bestemmer Sheldon seg for å arrangere sin egen tegneseriekonferanse - og ender opp med å tilbringe kvelden med James Earl Jones (stemmen til Darth Vader i Star Wars-filmene).

Amy overtaler Sheldon til å bli med på en romantisk utflukt til Napa Valley sammen med Howard og Bernadette for å feire valentinerdagen. Samtidig må Leonard og Penny ta med hunden til Raj til dyrlegen.

Sheldon blir tvunget til å revurdere alle endringene i livet sitt etter at Leonard kjøper et nytt spisebord. Samtidig får Wolowitz en ny mulighet til å dra til verdensrommet, mens Bernadette er usikker på om hun skal oppmuntre ham eller ikke.

Howard tar med seg Sheldon til Houston i et forsøk på å forbedre vennskapet deres. Penny blir tilbudt en flau filmrolle, mens Raj ber Amy om damehjelp.

Sheldon får seg en stor overraskelse når han besøker moren i Houston. Samtidig skaper Raj sin mordmysteriekveld konflikter innad i gjengen.

Raj er tynget av skyldfølelse når han dater to damer på én gang. Penny vurderer å ta en rolle i en dårlig film. Sheldon sliter med å velge mellom to spillkonsoller.

Sheldon opplever en personlig krise når han innser at han har kastet bort livet sitt på stringteori. Howard og Bernadette går på dobbeltdate med Raj og Emily.

To prepare for a date with Emily, Howard acclimates Raj to horror movies. Penny and Sheldon are upset when they discover Amy and Bernadette lied to avoid hanging out with them.

Sheldon og Leonard må håndtere Professor Protons bortgang, samtidig som de forbereder seg på Star Wars-dagen. Under begravelsen diskuterer Leonard og Penny sitt forsøk på å fri til hverandre.

Penny mister rollen i filmen hun skulle være med i og funderer over livet sitt. Raj ser Emily på date med en annen mann på kino. Howard og Bernadette må ta hånd om Howards mor da hun brekker foten.

Sheldon går en usikker framtid i møte og vurderer å gjøre en drastisk endring i livet sitt. Raj og Emily tar forholdet til et nytt nivå. Howard og Bernadette prøver å finne en pleier som orker å ta seg av mrs. Wolowitz.