Efter att Sheldons pappa och Leonards mamma tillbringat natten tillsammans blir det en pinsam morgon för alla. Dessutom kommer Pennys familj till bröllopsceremonin, inklusive hennes ångestfyllda mor, Susan, och hennes narkotikalangande bror, Randall.

Howard får besök av en Air Force-kapten angående sin uppfinning. Penny berättar för sina medarbetare att Bernadette är gravid, utan att veta Bernadette ville hålla det hemligt.

Bernadette anförtror sig till Raj om att hon är inte säker på att hon är redo att bli mamma. Penny följer med Amy till ett universitetsmöte och Sheldon tar till extrema metoder för att hjälpa Howard med hans militära projekt.

Det blir översvämning i Amys lägenhet och hon ska bo hos Sheldon, Leonard och Penny, vilket naturligtvis inte går smärtfritt. Howard och Bernadette vill inte veta om deras bebis är en pojke eller flicka och de blir upprörda när Raj får veta före dem.

Leonard och Penny måste skilja de grälande Sheldon och Amy åt när deras samlevnad inte går som planerat. Howard och Bernadette hittar oväntade gäster i sitt hus när de bestämmer sig för att stanna hemma från en planerad semester.

För att kunna fortsätta att bo hos Sheldon ljuger Amy om reparationerna som görs i hennes lägenhet, och de spelar in ett avsnitt av Fun With Flags i Pennys lägenhet. Leonard får veta att Penny magasinerat hans fina samling.

Efter ett lyckat experiment med att slå ihop sina gener gör Sheldon allt för att övertala Amy om att de ska fortplanta sig. Raj skäms för att berätta för gänget vad hans nya flickvän gör för att försörja sig.

Sheldon blir till sig av svartsjuka när geologen Bert vinner ett fint pris. Howard köper en leksak som alla har en åsikt om.

Sheldon och Leonard är oense om hur de ska dela på sina ägodelar. Koothrappali och Stuart slåss om att vara den bästa hjälpen till Bernadette under de sista veckorna av graviditeten.

Amys förhoppning om ett födelsedagsfirande slås i spillror när Howard och Bernadette åker till BB.

Sheldon och Amy hälsar på Leonard och Penny för första gången sedan semestern och berättar om sin fruktansvärda resa till Texas.

Leonard och Penny vill ha hjälp av Sheldon och Amy för att få tillbaka romantiken i sitt äktenskap. Howard och Raj tar till extrema metoder för att få stopp på oväsendet från Halleys sovrum.

Sheldon testar en uppfinning efter att ha hört att den kan hjälpa honom förstå andras känslor. Leonard kan inte dölja sina känslor när Penny meddelar att hennes bror ska komma på besök och Raj bjuder in sina exflickvänner för att ge honom dejtingråd.

Leonard och Wolowitz försöker distrahera Sheldon när han blir en bromskloss i utvecklingen av deras styrsystem. Penny och Amy tar med Bernadette på en kväll på stan och medan Raj och Stuart ska ta hand om bebisen Halley.

Sheldon och Amy har sitt första gräl sedan de flyttade ihop medan Raj får en chock när hans pappa ställer in underhållet och den ekonomiska verkligheten slår till.

Raj får inget underhåll från sin pappa längre och han vill istället ha hjälp av Sheldon. Penny tänker följa med Leonard på seriehjältemässan Comic-Con.

När Raj flyttar ut ur sin lägenhet erbjuder Leonard och Penny honom att flytta in i Sheldons gamla rum.

Leonard, Penny och Raj försöker anpassa sig till sitt nya boendearrangemang medan Sheldon intresserar sig för Amys arbete.

Sheldon måste pressa sig till det yttersta när han samarbetar i olika projekt med Leonard, Howard och Amy på en och samma dag. Bernadette närmar sig slutet på sin mammaledighet och måste snart återvända till jobbet.

Howard och Bernadette har svårt att lämna Halley på dagis när det är dags för Bernadette att börja jobba igen. Bert presenterar gänget för sin snygga flickvän, Rebecca.

Pennys före detta pojkvän, Zack, erbjuder henne ett jobb och hon överväger att acceptera det. Leonard är dock inte fruktansvärt förtjust i den idén.

Leonard, Sheldon och Howard firar färdigställandet av det superhemliga flygvapenprojektet men då möts de av en obehaglig överraskning. Amy erbjuds ett jobb som gästforskare.

Leonard och kompisarna blir oroliga när Sheldons gamla beundrare, doktor Ramona Nowitzki, dyker upp medan Amy är på besök i Princeton.