Wanneer Leonard en Penny wederom een huwelijksceremonie willen gaan houden, zodat iedereen er bij kan zijn, hebben ze te maken met de aankomst van Penny's familie en Leonards vader die de nacht heeft doorgebracht met Sheldons moeder.

In tegenstelling tot Sheldon maken Leonard en Howard zich zorgen dat defensie hun project probeert over te nemen voor militaire doeleinden. Ondertussen praat Penny haar mond voorbij en weet het farmaceutische bedrijf, waar zij en Bernadette werken, dat Bernadette zwanger is, met alle gevolgen van dien.

Sheldon, Leonard en Howard zijn zwaar vermoeid als zij proberen de door defensie gestelde deadline te halen. Amy neemt Penny mee naar een feestje dat gegeven wordt door Bert de geoloog. Raj probeert Bernadette te helpen met het inrichten van de babykamer.

Als Amy noodgedwongen haar huis uit moet, omdat er reparaties uitgevoerd moeten worden, spreekt ze een woonregeling af met Leonard, Sheldon en Penny. Howard en Bernadette willen het geslacht van hun baby niet weten, maar Raj komt erachter wat het is.

Sheldon en Amy gaan vanwege hun woonregeling door een aanpassingsperiode heen. Howard en Bernadette zijn genoodzaakt om thuis hun vakantie te vieren wanneer Bernadette ziek wordt, niet wetende dat Raj en Stuart gebruik willen maken van hun bubbelbad.

Penny is verrast dat ze fans heeft door haar optreden in "Serial-Ape-ist," wanneer ze met Leonard naar het Van Nuys Comic Con gaat. Amy organiseert een Sheldon-style brunch in Penny's appartement. Wolowitz zit behoorlijk in de stress over de baby die eraan komt, hierdoor doet hij een impulsieve aankoop.

Amy verzuimt aan Sheldon te vertellen dat haar appartement gerepareerd is. Leonard en Penny zoeken samen een manier om gebruik te maken van Sheldon's kamer.

Sheldon doet een voorstel, dit voorstel laat Amy gechoqueerd achter. Raj toont belangstelling in iemand van de universiteit.

Bert ontvangt subsidie voor geologie, hierdoor kan Sheldon zijn jaloezie niet langer verbergen.

Het verdelen van de bezittingen wordt een heuse oorlog tussen Sheldon en Leonard. Stuart vraagt aan Howard en Bernadette of het goed is dat hij bij hen komt wonen. Intussen staat hij Raj bij met de voorbereidingen voor de baby.

Amy haar verlangen om een intieme nacht te hebben met Sheldon op haar verjaardag wordt onderbroken, omdat Bernadette gaat bevallen.

De groep komt terug bij elkaar nadat ze de vakantie apart gevierd hebben. Sheldon en Amy vertellen over hun verschrikkelijke trip naar Texas, Leonard en Penny over hun avontuur met een kerstboom en Howard en Bernadette over hun eerste dagen als ouders.

Leonard en Penny vragen raad aan Sheldon en Amy om de romantiek terug in hun huwelijk te krijgen. Howard en Raj nemen extreme maatregelen om ervoor te zorgen dat de vloer in de kamer van Halley niet meer kraakt.

Sheldon test een MIT uitvinding nadat hij erachter komt dat dit hem zou kunnen helpen bij het lezen van emoties. Leonard kan zijn gevoelens niet verbergen wanneer Penny haar broer uitnodigt.

Leonard en Wolowitz proberen Sheldon af te leiden wanneer hij hun begeleidingsprogramma probeert te vertragen. Penny en Amy nemen Bernadette een avondje mee uit.

Sheldon en Amy hebben hun eerste ruzie sinds ze samenwonen en Koothrappali komt erachter hoe het is zonder financiële steun van zijn vader.

Nu Koothrappali geen financiële steun meer krijgt van zijn vader, schakelt hij de hulp van Sheldon in om van zijn schulden af te komen. Penny denkt erover om met Leonard naar Comic-Con te gaan.

Koothrappali vertrekt uit zijn appartement en krijgt de oude kamer van Sheldon aangeboden door Leonard en Penny.

Leonard, Penny en Koothrappali moeten wennen aan hun nieuwe woonsituatie. Sheldon raakt geïnteresseerd in het werk van Amy.

Sheldon werkt samen met Leonard en Wolowitz aan een project terwijl hij diezelfde dag ook aan project met Amy werkt. Bernadette moet weer terug naar haar werk na haar zwangerschapsverlof.

Howard en Bernadette hebben het er maar lastig mee om Halley op de kinderopvang achter te laten. Bert introduceert Rebecca aan de groep.

Leonard is er alles behalve blij mee wanneer Penny een baan aangeboden krijg van haar ex-vriend Zack. Penny denkt erover de baan aan te nemen.

Amy krijgt de mogelijkheid aangeboden onderzoek te doen aan Princeton. Raj zorgt ervoor dat hij ergens anders kan wonen. Het gyroscoop project loopt helemaal uit de hand.