פני ולנארד בפינישים לקראת החתונה, ברנדט והווארד עומדים להרחיב את המשפחה, שלדון מקבל החלטה גורלית לגבי מגורים עם איימי, וראג' מבלה יום שלם עם ברנדט.

הווארד, לנארד ושלדון מקבלים הצעה מחיל האוויר. פני חושפת בטעות את ההיריון של ברנדט בעבודה.

שלדון מתקשה עם השעות הארוכות שדורשת העבודה על הפרויקט. ברנדט דואגת שהיא לא מוכנה להיות אימא.

כשאיימי נאלצת לפנות את דירתה, היא ושלדון מנסים לגור יחד. הווארד וברנדט לא רוצים לדעת את המין של התינוק, אבל ראג' מגלה אותו.

היחסים בין איימי לשלדון נמצאים בסכנה לאחר ששלדון מאשים אותה בכך שהיא לא פועלת לפי לו"ז חדר האמבטיה שלו. בינתיים, "הנופש" של הווארד וברנדט הופסק במפתיע כשפולשים התגנבו לג'קוזי שלהם.

הווארד יוצא עם ראג' לבולמוס קניות לקראת הלידה הקרבה. בינתיים, שלדון ואיימי מארחים לבראנצ', ופני מוזמנת לכנס מד"ב לאור הופעתה יוצאת הדופן בסרט הקופים.

איימי רוצה להישאר השותפה של שלדון, וחוששת מהתיקונים שנעשו בדירתה. יותר מאוחר, התכנית "כיף עם דגלים" משודרת מדירתה של פני.

לאחר ניסוי מוצלח בו שילבו את הגנים שלהם, שלדון לא יבחל באמצעים כדי לשכנע את איימי שעליהם להתרבות. קוטרפלי נבוך לספר לחבורה מה האישה החדשה שאיתה הוא יוצא עושה למחייתה.

שלדון רואה שמישהו אחר זוכה במילגה נחשבת בתחום הגיאולגיה, ונהפך לירוק מקינאה. הווארד רוכש צעצוע חדש, וזוכה לביקורת מכל כיוון אפשרי.

קרב רציני מתפתח כששלדון ולנארד צריכים לחלק ביניהם את החפצים המשותפים. כשברנדט צפויה ללדת ממש בקרוב, ראג' וסטיוארט רבים ביניהם לגבי מי מהם יעניק לה יותר עזרה.

ההתרגשות גוברת כאשר התינוק של הווארד וברנדט מגיח לאוויר העולם, בזמן ששלדון ואיימי חוגגים את יום הולדתה.

שלדון ואיימי חושפים בפני לנארד ופני את פרטי ההרפתקה הלא מוצלחת שלהם, כאשר ביקרו את אימו של שלדון בטקסס בתקופת החגים.

לאחר מחלוקת עם לנארד, פני לוקחת את איימי לסופשבוע של ספא ופינוקים, בעוד שלדון מנסה להשכין שלום בין בני הזוג. בינתיים, הווארד וראג' מנסים לטפל בריצפה הרועשת בחדר התינוק.

ראג' מקים קבוצת מיקוד של האקסיות שלו במטרה לאבחן את הגורם לכשלונות של מערכות יחסיו הקודמות, ולהגיע לתובנות בעזרת הממצאים.

שלדון מפריע להתקדמות פרויקט ההדרכה והחבר'ה מגלים שהדרך היחידה לחזור למסלול היא להסיח את דעתו. פני ואיימי מבריחות את ברנדט לערב בנות, ומשאירות את היילי בידי ראג' וסטיוארט.

איימי מגלה שכולם ברחבי האוניברסיטה יודעים על המפגשים הרומנטיים שלה עם שלדון. בינתיים, ראג' מהרהר לגבי היכולת לחיות ללא התמיכה הכלכלית של אביו.

מחוסר מתמיכתו הכלכלית של אביו, ראג' מרגיש חנוק מבחינה כספית ופונה לשלדון שיעזור לו לצאת מהתסבוכת. בינתיים, פני שוקלת לנפץ לבנים את מסורת ההגעה לכנס קומיק-קון השנתי.

לנארד ופני מציעים את החדר הישן של שלדון לראג' שעזב את הדירה שלו, אך המעבר גורם לקונפליט בין כל החברים, ולויכוח בין איימי לאמא של לנארד.

ראג' עובר לגור עם לנארד ופני, ומתחילה תקופת הסתגלות משעשעת בין השלושה. בינתיים, שלדון המרוכז בעצמו מפגין התעניינות מפתיעה ומחשידה לגבי עבודתה של איימי.

שלדון דוחף את עצמו לקצה גבול היכולת כשהוא משתתף בפרוייקט של לנארד והאוורד, וגם בשל איימי, ושניהם באותו יום. בינתיים, חופשת הלידה של ברנדט עומדת להסתיים ועליה לחזור לעבודה.

עכשיו כשהיא חוזרת לשיגרת העבודה, לברנדט קשה לשים את הילדה בגן. ברט הגיאולוג מחפש חברה חדשה, אבל הקולגות שלו חושבים שלבחורה יש אינטרסים חבויים.

לנארד, שלדון והווארד נתקלים בהפתעה לא נעימה לאחר שהם מסיימים את העבודה על הפרויקט הסודי של חיל-האוויר, בינתיים, איימי מקבלת הצעת עבודה מעניינת לקיץ.

פרק סיום העונה. ד"ר ראמונה נוביצקי, המעריצה לשעבר של שלדון קופצת לביקור פתע בזמן שאיימי מבקרת בפרינסטון, והחבר'ה מאוד מודאגים מכל העניין.