Lorsque Sandy Ryerson est renvoyé, Will Schuester, le professeur d'espagnol, décide de reprendre la chorale de l'école. Mais la mission est loin d'être facile ! Le Principal, qui entreprend des restrictions budgétaires, refuse de financer une activité qui ne lui rapporte rien. Et les élèves ne se bousculent pas pour s'inscrire au cours. Comment motiver les élèves ?

Le Glee Club fait une représentation pour la première fois devant toute l'école et pousse la performance jusqu'à la limite. Quand Quinn réalise que Rachel a des sentiments pour Finn, elle va tout faire pour garder son homme. Pendant ce temps, la femme de Mr Schuester révèle de surprenantes nouvelles, forçant Will à trouver une nouvelle façon de joindre les deux bouts.

Will propose à ses élèves de constituer des duos pour exprimer leurs sentiments dans des ballades. Il n’est pas très à l’aise lorsque Rachel tire son nom au sort et choisit d’interpréter le très romantique «Endless Love». En effet, Will a déjà vu une de ses étudiantes s’enticher de lui et il ne tient pas à revivre ceci. Préoccupé par ses problèmes, Finn ne parvient pas à se concentrer sur sa prestation avec Kurt, qui éprouve un faible pour lui. Invité à dîner chez les parents de Quinn, il décide de révéler qu’elle attend un enfant.

Comme elle doit prochainement être interviewée par un magazine, Sue exige que Mercedes et Kurt perdent du poids. Elle a également réservé l'auditorium pendant toute une semaine pour permettre aux pom-pom girls de répéter à loisir. Will est dans l'obligation de trouver un autre endroit pour répéter. Lorsqu'il se rend à la piste de patins à roulettes, il retrouve April, qui y travaille désormais. Par ailleurs, Finn n'accepte pas que sa mère veuille se débarrasser des

meubles de son père et découvre qu'elle a un petit ami...

Craignant une influence néfaste sur les lycéens, le principal Figgins exige que Tina délaisse son style gothique, sans quoi elle sera renvoyée. En espionnant les rivaux de Vocal Adrenaline, Rachel découvre qu'ils préparent un hommage à Lady Gaga. Pour faire d'une pierre deux coups, à savoir aider Tina à trouver un look qui lui convienne et faire explorer à ses élèves la notion de théâtralité,

Will demande à la chorale de travailler des titres de l'extravagante chanteuse. Les filles et Kurt sont enchantés, les garçons un peu moins enthousiastes. Par ailleurs, Carole et son fils emménagent chez les Hummel, et Finn est particulièrement énervé lorsqu'il découvre qu'il partage la chambre de Kurt.

New Directions est surpris de découvrir Vocal Adrenaline dans son auditorium : la chorale rivale est venue l'intimider en se produisant dans son lycée et en saccageant sa salle de répétition. Les élèves de McKinley sont au désespoir, persuadés que les finales régionales sont perdues d'avance. Pour leur redonner confiance, Will leur conseille de s'aventurer dans un genre que leurs adversaires ne pratiquent pas : le funk. Par ailleurs, le professeur signe enfin son divorce d'avec Terri. Lassé des piques incessantes de Sue, qui croit la fin de la chorale proche et ne manque pas de le lui rappeler, Will échafaude un plan machiavélique pour piéger sa collègue.

Le jour tant attendu des finales régionales est enfin arrivé. Catastrophés, les membres de New Directions découvrent que, tout comme Josh Groban et Olivia Newton-John, Sue Sylvester fait partie du jury chargé de départager les chorales en compétition. Ils pensent que leurs chances de l'emporter sont quasi-nulles et se découragent. Will demande conseil à Emma et tente de remotiver ses troupes, leur demandant de faire contre mauvaise fortune bon coeur. La première école propose un medley des titres d'Olivia Newton-John et de Josh Groban.

Finn traverse une crise existentielle quand il croit voir le visage de Jésus sur son croque-monsieur. Parallèlement, le reste de la troupe se rallie autour de Kurt, dont le père tombe dans le coma après une attaque cardiaque, les amenant à de grandes discussions entre non-croyants et croyants.

La mère de Sue Sylvester vient rendre visite à sa fille, après une longue période d'absence, afin d'assister à son mariage. Dans le même temps, Kurt prend une décision importante après que Karofsky l'a poussé dans ses derniers retranchements. Enfin, la chorale se réunit lors de la célébration du mariage de la mère de Finn et du père de Kurt.

Un championnat local de football est organisé. Will et le coach Beiste essayent de faire travailler la chorale et les Titans ensemble. Sue fait tout ce qu'elle peut pour être sûre de remporter un nouveau championnat national avec les Cheerios.

Rory, un étudiant d'un programme d'échange arrive à McKinley et habite chez Brittany, il tombe sous le charme de la belle, et celle-ci le prend pour un Leprechaun. Pendant ce temps, Mercedes tente de recruter des nouveaux membres pour le nouveau Glee Club de Shelby Corcoran, tandis que la campagne de Sue pour le Congrès commence à s'échauffer.

Will demande aux New Direction de l'aider pour sa demande en mariage, des dangers commencent à profiler autour du triangle Sam-Mercedes-Shane. Parallèlement, Finn prends des décisions importantes, tandis qu'il apprend une nouvelle bouleversante sur un membre de sa famille. Becky tombe amoureuse d'Artie qui lui-même tombe amoureux de Sugar.

L'amour prend la scène à McKinley High à l'approche de la Saint-Valentin. Un nouvel élève intègre le lycée et fait partie du God Squad, un club de chanteurs chrétiens. Rachel annonce au Glee Club son mariage avec Finn tandis que ses pères apprennent malencontreusement ce projet. Des histoires d'amour naissent tandis que d'autres font face à des complications.

C'est l'heure des Régionales, les New Directions sont face à leur principaux rivaux, les Warblers. Pour leur assurer une victoire, Sebastian manigance un chantage auprès de Rachel. Un évènement bouleversant remet tout le monde en question. Au même moment, Quinn, revigorée, tente de retrouver sa place au sein des Cheerios tandis que Sue se confie à elle. Finn et Rachel prennent une décision finale concernant leur avenir.

Dans un contexte de fin des années lycée, les terminales des New Directions disent au revoir à Mc Kinley en se remémorant le passé tout en se posant des questions sur leur futur. Les relations sont remises en question. Les directions finissent par être déroutées et de nouveaux choix sont pris. De son côté, Quinn tente d'aider Puck dans son examen de rattrapage. La classe 2012 de McKinley est diplomée.

Mike et Mercedes coachent les New Directions pour préparer les Régionales, Kurt est aussi de retour à Lima pour rendre visite à son père pour ses examens médicaux, son retour n'est pas sans déplaire Blaine qui souhaite raviver la flamme de son ex. Artie est accepté en école de cinéma mais son refus étrange d'y aller intrigue Kitty qui lui vient en aide. A New-York, Cassandra apprend le rappel de Rachel pour le rôle principal de Funny Girl et a une réaction inattendue.

Finn est décédé et tous ceux qui le connaissaient sont anéantis. Pour lui rendre hommage, Monsieur Schuester décident de réunir à McKinley les anciens et les nouveaux du Glee Club. Chacun leur tour, ses amis, ses proches, ceux qui l'aimaient vont lui dire un dernier adieu, en chansons, en se remémorant des souvenirs...

Épisode hommage à l'acteur Cory Monteith, décédé le 13 juillet 2013. Un épisode émouvant durant lequel le Glee Club fait ses adieux à l'acteur et au personnage de Finn Hudson.

Les New Directions vont à Los Angeles avec Sam comme leader.

C'est le grand jour pour deux couples phares de la série. Deux mariages vont avoir lieu dans cet épisode, l'un sera prévu et l'autre sera en quelque sorte improvisé...

Avant l'éclat de Glee voyons comment la vie des personnages ont progressé dans cinq ans sur route.