Cristina se s Meredith vrací z líbánek a hledá Burkea, ale ten není k nalezení. Meredith, Cristina, Izzie a Alex stráví první den jako rezidenti s vlastní skupinkou stážistů – mezi něž patří George, který jako stážista opakuje, protože nesložil zkoušku – a Lexie Greyová, Meredithina poloviční sestra, se kterou se Meredith ještě nesetkala. Vztah Dereka s Meredith se dostal do emočně slepé uličky, a tak Derek hledá přátelství u svých kolegů doktorů. Baileyová si teď není jistá svým postavením v nemocnici, když její bývalí stážisti nyní podléhají nové šéfce rezidentů, Callie. Richard dál zaujímá svou pozici šéfa chirurgů.

Rezidenti a stážisti léčí oběti obřího výbuchu obytné budovy. Burkeova matka se vrátí pro věci svého syna. Lexie se pokouší upřímně promluvit s neochotnou Meredith.

Georgeovy schopnosti oslní nové stážisty. Meredith polovičatě pomůže Lexie s jejím prvním akutním případem. Sloan a Richard se pokusí o radikální novou operaci, aby zachránili ženinu schopnost mluvit. George řekne Callie o své nevěře s Izzie.

Manželka šéfchirurga, Adele, přivede do nemocnice svou neteř, která v Seattle Grace měla svůj maturitní ples. Izzie poví o svých citech k Georgeovi společnému kamarádovi, ale reakce je jiná, než očekávala. Derek Cristině ukáže, jak jako rezident lépe učit. Nejstarší žijící stážista na světě, Norman, špatně diagnostikuje Meredithinu pacientku.

Halloween si pro doktory ze Seattle Grace připravil mnohá překvapení. Alexe nečekaně navštíví bývalá pacientka. Meredith si myslí, že ji straší popel její matky. Cristinu urazí chirurgyně, kterou obdivuje.

Šéf se svými kolegy chirurgy uspořádá pánský večer. Cristina a Izzie se snaží získat stejné operace a přízeň doktorů, kteří je budou vést. Meredith léčí muže, který přežil nehodu při seskoku s padákem.

George a Izzie vyzkouší, jestli mezi nimi přeskočí jiskra. Derek od Meredith žádá víc než jen fyzické spojení. Mark se zamiluje do kolegyně chirurgyně. Callie, která velkou část své práce delegovala na Baileyovou, zjistí, že je její pozice šéfrezidentky ohrožená.

Po nehodě školního autobusu je pohotovost plná puberťáků. Baileyová léčí pacienta, do kterého byla na střední škole zamilovaná. Derek jde na rande se svou kolegyní doktorkou. Thatcher přijde na pohotovost a hledá Meredith.

Nehoda sanitky ohrozí životy přítomných zdravotníků, Meredith a šéfchirurg se je v místě nehody snaží zachránit. Baileyová léčí pacienta, který odmítá její pomoc. Ava se vrátí pro Alexe a seznámí se s jeho druhou přítelkyní.

Manželství Baileyové se rozpadá a její rodina čelí traumatu. Georgeova matka přijede na nečekanou návštěvu. Léčitel zpochybní víru Ericy a Alexe v tradiční medicínu. Derek musí čelit následkům svého polibku s Rose.

Šest týdnů poté, co Derek a Meredith ukončili svůj vztah, soupeří Meredith, Alex, Izzie a Cristina v chirurgické soutěži a Baileyová je posuzuje. George a Lexie si zvykají na svůj nový špinavý byt. Callie se spřátelí s Ericou.

Addison se vrátí do Seattle Grace, aby provedla operaci, a je překvapená, jak se její bývalí kolegové změnili. Do klinického testu Dereka a Meredith vstoupí první pacient. Rebecca se za Alexem vrátí s překvapivou novinkou.

Stížnosti zdravotních sester ohledně dostaveníček Marka Sloana vyústí v nutnost hlásit vztahy. Zprávy o nejnovějších úspěších Burkeovy kariéry přinutí Cristinu čelit svým citům ke svému bývalému. Meredith a Derek přijmou do svého klinického testu vojenského veterána. Callie se v těžké chvíli obrátí na Sloana.

Doktorka Wyattová je proti tomu, aby Meredith ukončila terapii. Alex zjistí pravdu o zdravotním stavu Rebeccy. Šéfchirurg trvá na tom, aby Erica na jeho mentorovi provedla riskantní operaci.

Ve dvouhodinovém finále řady Chirurgů mají Meredith a Derek ve svém klinickém testu poslední šanci na úspěch. Ostatní chirurgové se společně snaží osvobodit chlapce, který uvízl v bloku cementu. Izzie pomáhá Alexovi s léčbou nemocné Rebeccy. Lexie odhalí zásadní informace o Georgeově postavení stážisty.

Ve dvouhodinovém finále řady Chirurgů mají Meredith a Derek ve svém klinickém testu poslední šanci na úspěch. Ostatní chirurgové se společně snaží osvobodit chlapce, který uvízl v bloku cementu. Izzie pomáhá Alexovi s léčbou nemocné Rebeccy. Lexie odhalí zásadní informace o Georgeově postavení stážisty.