У Ватсон и её сводной сестры Лин возникают противоречивые реакции, когда умирает их биологический отец. Кроме того, Холмс и Ватсон охотятся за украденной партией плутония, которую, как они опасаются, будут использовать для создания грязной бомбы после того, как инспектор Министерства энергетики был убит с помощью световой пушки.

Холмс и Ватсон попадают в мир редких древностей, когда расследуют дело, в котором жертва была убита во время реконструкции Войны за независимость. Кроме этого, по мере того, как Холмс разочаровывается в продолжительности своего когнитивного восстановления, он находит утешение в дружбе с Майклом.

Ватсон считает необходимым изменить свою жизнь после прочтения собственной терапевтической карты, в то время как она и Холмс расследуют убийство её бывшего психолога.

Холмс и Ватсон пытаются отследить шаги Холмса после того, как он обнаружил у себя отрубленную голову, и не помнит последние шесть часов или почему она у него оказалась.

Холмс и Ватсон попадают в мир ядерной безопасности, когда расследуют убийство бывшего члена якудза. Кроме того, капитан Грегсон оказывается ошеломлён личным признанием своей дочери, сержанта полиции, Ханны.

Холмс и Ватсон открывают охоту на маньяка после того, как их близкий круг сотрясает убийство. Кроме того, неврологическое восстановление Холмса ухудшается, и его трезвость колеблется, поскольку его стремление поймать убийцу превращается в одержимость.

Поиск убийцы женщины, найденной в цементе, приводит Холмса и Ватсон в индустрию экологически чистых технологий. Кроме того, Ватсон делает гигантский скачок вперед в отношении своего интереса к усыновлению.

Бывший куратор Холмса по трезвости, Альфредо, просит его о помощи в нелегальном деле, чтобы спасти своего брата. Кроме того, Холмс и Ватсон расследуют отравление профессора биологии, который работал над секретным генетическим проектом до того, как был убит.

Шерлок и его отец, Морланд Холмс, пытаются наладить свои напряжённые отношения, узнав о смерти в своей семье. Кроме того, Холмс и Ватсон обнаруживают связь между своим последним делом и миром египетских древностей, когда ищут убийцу, который пытался мумифицировать свою жертву.

Холмс привлекает старого врага, чтобы защитить своего отца после того, как узнаёт, что Морланд рискует быть убитым. Кроме того, Холмс и Ватсон ищут убийцу, связанного с табачной промышленностью, когда убивают адвоката, находившегося в процессе рассмотрения финансов крупного дистрибьютора сигарет.

Детектив Белл рассматривает возможность ухода из полиции Нью-Йорка, когда ему предлагают уникальный шанс продвинуться в карьере. Кроме того, частный клиент нанимает Холмса и Ватсон для расследования исчезновения молодой женщины, которая вела двойную жизнь в интернете в качестве финансовой доминатрикс.

Холмс и Ватсон расследуют отравление эксперта по переселению и обнаруживают, что перед смертью этот человек десятки лет вёл тайную карьеру наёмного убийцы. Кроме того, желание Ватсон усыновить ребёнка терпит неудачу, в то время как она готовится к домашнему визиту от сотрудника социального агентства.

Холмс и Ватсон спешат помочь детективу Беллу, когда он становится жертвой биотеррористической атаки в участке и отделение находится на карантине. Во время изоляции капитан Грегсон и детектив Белл начинают подозревать, что заперты вместе с преступником. Кроме того, Ватсон сталкивается с трудной задачей помочь своей матери, Мэри, признать, что её прогрессирующая болезнь Альцгеймера требует большей медицинской помощи.

Расследование Холмса и Ватсон по делу об убийстве профессора религии приводит их к охоте на убийцу, связанному с оккультизмом. Кроме того, Холмс и Ватсон курируют список потенциальных замен для детектива Белла, в ожидании когда офицеру предложат присоединиться к службе маршалов США.

Шерлок и Джоан обнаруживают, что убийство инженера-робототехника может быть связано с его новаторскими секретными исследованиями в области реальной телепортации. Кроме того, когда детектив Белл завершает курс обучения, чтобы получить степень магистра и присоединиться к маршалам США, он обнаруживает, что у инструктора курса есть личные причины для отказа ему в доступе.

Холмс и Ватсон расследуют несколько мотивов убийства, когда убивают зоолога из-за его многочисленных любовных романов или его новаторских исследований. Кроме того, Холмс становится жертвой кражи личных данных, когда похищают его медицинские записи.

Холмс и Ватсон ищут убийцу, выбирающего жертв на основе предсказаний человека, который утверждал, что предвидит будущие смерти других людей, включая убийство Шерлока Холмса.

Холмс и Ватсон участвуют в розыске пропавшей женщины, когда Харлан Эмпл (Рич Соммер), друг Холмса и "временный" эксперт по математике становится главным подозреваемым в её исчезновении.

Смертельный конфликт Холмса и Ватсон с бывшим другом Шерлока Майклом усиливается, когда его новая жертва оказывается последней добычей серийного убийцы.

Холмс и Ватсон сталкиваются со своей самой большой проблемой, когда расследование убийства угрожает разрушить их партнёрство.