형사 처벌 위기에 직면한 셜록은 그간 소원하게 지내던 아버지가 뉴욕에 온다는 소식에 다급하게 뉴욕 경찰국의 선처를 구한다.

셜록과 조안은 3인 살해 사건에 대한 FBI의 수사를 돕고, 셜록의 아버지는 이 둘을 뉴욕 경찰국에 복직시켜 주겠다 한다. 하지만 여기엔 어떤 대가가 따를까?

서로 닮은 두 남자의 살해 사건을 수사하던 셜록과 조안은 첨단 기술이 사용된 시스템을 발견한다. 한편 셜록은 아버지와 타협을 본다.

셜록과 함께 연구소 기술자 실종 사건을 조사하던 조안은 형사 한 명이 자신의 사생활을 파헤쳐 왔음을 알게 된다.

어느 고고학자의 죽음으로 셜록과 조안은 1980년대 매립지를 뒤져야 하는 신세가 된다. 알프레도는 셜록이 자신을 왜 피하는지 알아내려 한다.

소설이 발표되면서 조안과 양아버지의 갈등이 드러난다. 셜록과 조안은 은퇴한 FBI 요원의 살해 사건을 한 납치 사건과 연관짓는다.

임산부 살해 사건을 수사하던 셜록과 조안은 악명높은 연쇄살인범 사건에 빠져든다. 한편 마커스는 커리어를 한층 더 쌓을 준비를 한다.

러시아 억만장자가 살해되자 천재 해커에 대한 추적이 시작된다. 조안은 셜록의 아버지로부터 심상치 않은 요청을 받고 고민에 빠진다.

셜록은 아버지가 숨기는 비밀을 알아내려고 갖은 애를 쓴다. 한편 수사팀은 논란이 되고 있는 한 대학이 연루된 2건의 살인 사건을 수사한다.

셜록은 시체 안치소 폭발사건 발생 후 범죄 현장 2곳 사이에서 연계성을 찾고자 한다.조안은 적대 관계에 있는 사람이 도움을 요청하자 의아해한다.

셜록은 무장 범죄단을 상대로 계략을 꾸미고, 조안은 최근 사건에 연루된 한 인물을 만나 흥미로운 점을 발견한다.

교수의 아파트에서 끔찍한 사건이 발생하자 셜록은 독버섯을 찾아 나서고 누군가 지독한 원한을 품었음을 알게 된다. 조안은 말썽 많은 이웃과의 문제에 대처한다.

아버지가 암살 대상으로 지목되자 수사를 진행하던 셜록은 해묵은 상처를 건드리고 만다. 3명이 살해된 사건으로 인해 두 중국계 조직 간의 갈등이 격화된다.

셜록은 한 할머니가 발코니에서 떨어져 죽은 사건이 단순 사고가 아님을 증명하려 한다. 조안은 그렉슨 경감의 연애 문제에 도움을 준다.

한 부유한 남성이 센트럴 파크에 느닷없이 나타난 발광 생명체에 쫓겨 목숨을 잃자 셜록과 조안은 이 살인 괴물의 배후를 밝히겠다고 다짐한다.

망토 차림으로 거리의 범죄와 싸우던 남자가 변사체로 발견되고 수사팀은 남자의 정체를 밝히려 한다. 조안은 셜록의 아버지가 준 선물에 대가가 따름을 알게 된다.

의사 실종 사건으로 셜록과 조안은 베일에 싸인 부자 생존주의자들의 세계를 접하게 된다. 피오나는 셜록의 유별난 행동에 대해 따지고 든다.

거액의 판돈이 걸린 포커 게임 중 무장 강도가 들이닥치고, 셜록과 조안은 이 사건에서 심상찮은 점을 발견한다. 한편 가족의 충격적인 비밀이 드러난다.

헬스장 밖에서 젊은 여성이 총에 맞아 사망하고 셜록과 조안은 논란이 되고 있는 사진 전시회와 수상쩍은 옛 살인 사건 간의 연관성을 캐낸다.

셜록은 연출된 차량 탈취 사건의 진실을 파헤치고, 조안은 비밀리에 셜록의 아버지인 몰란드를 조사하다 충격적인 반전을 맞는다.

셜록은 살인 사건의 배후 조종자가 아버지일 것이라 추측한다. 한편 살인 청부업자가 경찰에게 또 다른 범죄에 대해 귀띔해 준다.

셜록은 아버지인 몰란드의 사무실에서 폭탄을 발견하고 모리아티와 긴밀한 관계의 인물을 추적한다. 또 다른 사이코패스의 극단 행위로 수사팀은 충격에 빠진다.

목숨이 위태로워진 셜록과 조안은 몰란드와 협력하여 과거 모리아티 조직의 두목을 잡으려 하나, 상황은 계획과는 달리 꼬여만 간다.