スターリング・シティの犯罪は、アローたちのおかげで減少する。オリバーは、“アロー”と“オリバー・クイーン”のバランスが取れた生活が送れると思い、フェリシティをデートに誘おうとしていた。だがそんなオリバーの前に、新たなヴィランが現れ、身近な人物を傷つける。

ランスがアローを呼ぶ。街にもう一人の射手が現れビジネスマンを襲い始めたからだ。射手の名はサイモン・ラクロア。 “コモド”というコードネームで呼ばれている。そして、彼を捕らえようと奮闘するチームは、意外な人物に助けられる。

オリバーは、妹テアがそろそろスターリング・シティに帰ってくるべき時だと思い、フェリシティが調べてくれた居場所、コルト・マルテーゼに向かう。そしてライラは、オリバーと一緒にコルト・マルテーゼに行き、消息を絶った現地諜報員のマーク・ショウについて調べてほしいとディグルに頼む。テアの行動に責任を感じているロイは、オリバーとディグルに同行する。

怒りに震えたナイサ・アル・グールがスターリング・シティに戻り、サラの死についてオリバーを問い詰める。だが、マルコム・マーリンが生きていることを知ったオリバーは、マルコムがサラを殺したのではないかと疑う。やがてオリバーとナイサは、サラを殺した者に法の裁きを受けさせるため協力する。

スターリング・シティがサイバー攻撃に遭い、大きなダメージを受ける。オリバーとフェリシティは、これ以上の被害を阻止しようと奔走し、限界まで追い込まれる。そんな中、フェリシティの母ドナが突然彼女のもとを訪れ、フェリシティは驚きひどく動揺する。

ワイルドキャットというスポーツジムで吊されている遺体が発見され、主犯の容疑者としてテッド・グラントの名が浮かび上がる。オリバーとローレルは、テッドが犯人なのか無実なのかをめぐって議論する。そんな中、過去の映像がフラッシュバックする。

オリバーは、アローに夢中の連続殺人犯キャリー・カッターを絶対に止めなければならない。キャリーは、自分が心から愛する人はアローしかいないと思い込み、彼の気を引くためなら何でもするつもりだ。だが恐ろしいことに、彼女は、アローの気を引くために“殺人”を犯しているのだ。

「アロー」と「フラッシュ」のクロスオーバー・イベント、パート2。オリバーとアーセナルとディグルは、ディガー・ハークネスというブーメラン使いの殺人者の居所を突き止めるが、そこにA. R. G. U. S.(アーガス)チームがいたことに驚く。ハークネスは、ビルを攻撃し、チームの数人を殺し、ライラを狙う。

ナイサ・アル・グールがスターリング・シティに戻ってくる。彼女はオリバーに、父ラーズ・アル・グールからのメッセージを伝える。“サラを殺した犯人を48時間以内に捜せ。さもないと暗殺者同盟の束縛を解き、彼らはスターリング・シティの市民を殺し始めるだろう”。

オリバーのラーズ・アル・グールとの戦いのあと、ディグルとアーセナルは、アローのいないスターリング・シティを守ろうとしていた。だが、オリバーからは3日間も連絡がないので、2人は彼に最悪のことが起きたのではないかと恐れる。

妹に代わって正義のために悪と闘おうとしているローレル。アーセナルとディグルは、そんなローレルが自分自身の命を危険にさらしていることを警告し、やめさせようとする。だが、ブリックが市議会議員を誘拐し、警察がある人物を退避させないと議員をすべて殺すと言ってスターリング・シティを脅すと事態は一変する。

チームアローは、ブリックを止めるため、オリバーが不在のまま必死に戦っている。だが、ブリックに個人的な貸しのあるマルコムが、彼の悪事を阻止するために協力を申し出ると、チームはマルコムからの協力について検討し始める。

オリバーは、自分が不在だった間にチームアローが大きく変化していたことに気づいて驚き、ローレルが“ブラック・キャナリー”として街を出歩いていることを知り激怒する。だが、ローレルは、身の危険を冒すなというオリバーの忠告を聞かずヴァーティゴを追跡し、ついに彼から相当量のドラッグを投与されてしまう。

マルコムは、オリバーとテアを危険極まりない状況に陥れる。かつての敵デスストロークと一緒にリアン・ユー島に上陸させたのだ。そんな中、過去の映像がフラッシュバックする。オリバーは、オメガ化学兵器を取り戻すため、マセオと一緒にスターリング・シティに帰ってくる。

マルコムは、ラーズ・アル・グールに捕らわれ、ナンダ・パルバットという所に連れていかれる。一方、オリバーは愛する妹テアのために、マーリンを助けることを真剣に考え始める。そんな中、レイはアトム・スーツを完成させるために全力を注いでいく。それが完成すれば、彼はスターリング・シティを救うことができるはずなのだ。

ラーズ・アル・グールに会ってからいまだに意気消沈しているオリバーが、スターリング・シティに戻ってくる。だがそこに待ち受けていたのは、街をテロの恐怖に陥れようとする新たなヴィラン、縫い付けられた口を持つマーマーことマイケル・アマールとその一味だった。

ディグルとライラが結婚し、みんなが祝福する。だが2人の新婚旅行は、スーサイド・スクワットに新たな使命が下されたと言うデッドショットに邪魔される。それは、カスニア共和国で人質になっている米国の上院議員ジョセフ・クレイの救出だった。そんな中、アマンダ・ウォラーは、スーサイド・スクワットに新しいメンバー、キューピッドが加わったことを発表する。

市長のオフィスが襲撃され、その間にレイが重傷を負い病院に運ばれる。フェリシティはベッドのそばで彼を見守っていたが、そこへ母のドナ・スモークが突然現れ彼女を驚かす。そしてフェリシティは、ドナが自分を助けに来てくれたことを喜ぶ。そんな中、スターリング・シティ警察は、襲撃の犯人を突き止めようと全力を挙げるが、捜査は困難を極めていた。

引き続き“打倒アロー”を使命とするランスのことを考えて、フェリシティは、オリバーに目立った行動を絶対にとらないよう忠告する。だが、ジェイク・シモンズという名のメタヒューマンが現れ、爆発的なエネルギーとプラズマを武器に人々を殺害し、スターリング・シティを恐怖のどん底へ陥れると、オリバーは、彼と戦うためにレイに協力を要請することになる。

ラーズ・アル・グールが、ついにオリバーにある提案をする。だがそれは提案というより、オリバーが決して断ることのできない交換条件のようなものだった。ラーズ・アル・グールは、オリバーが提案を受け入れなければ、彼の周囲にいる大事な人たちを巻き込み恐ろしいことをしようとしている。

オリバーが恐ろしいまでの変貌を遂げる。時期を同じくして、ナイサがローレルをトレーニングするためスターリング・シティへ戻ってくる。だが暗殺者同盟はナイサを標的にし、彼女を確実に捕らえるための画策を練っていた。一方、暗殺者同盟に狙われていることを知ったナイサは、武装して一人で彼らに立ち向かう決意をする。だが、彼女の友達はそれを許さなかった。

スターリング・シティで、すべての人の命が危険にさらされる。ラーズ・アル・グールが、ついに恐ろしい武器を使用する最終計画を打ち出したからだ。その武器は、一瞬にして人間に多大な被害を及ぼし彼らの命を奪う。