U prvoj epizodi nove sezone, Oliver traži identitet izvan Arrowa. Ali čim se opusti, pojavi se novi zlikovac i Oliver opet stupa u akciju.

Lance zove Arrowa kad se u gradu pojavi novi strijelac i počne ubijati poduzetnike. Diggle koristi ARGUS kako bi otkrio identitet drugog strijelca. To je Simon Lacroix koji je poznat pod kodnim imenom Komodo. Međutim tim nailazi na nevolje i dobiva pomoć od začuđujućeg izvora - Laurel. Dotle, Oliver se brine jer mu se Thea ne javlja, pa mu Roy govori istinu zašto je otišla iz grada. Ray Palmer zavodi Felicity. U sjećanju, Maseo Yamashiro govori Oliveru da je Amanda Waller naredila njegovo prvo ubojstvo. Kako Oliver gleda niz ciljnik, vidi da je meta njegov najbolji prijatelj Tommy. Unatoč obećanju sestri, Laurel razmišlja da Lanceu kaže tajnu o Sari.

Oliver odlučuje da je vrijeme da se Thea vrati u Starling City, stoga se pakira za Corto Maltese, gdje je Felicity otkrila da se Thea nalazi. Lyla moli Digglea da ide s Oliverom jer je jedan njezin agent, Mark Shaw, nestao na Corto Malteseu i željela bi da on to istraži. Roy se smatra odgovornim za Thein odlazak, pa se pridružuje Oliveru i Diggleu na putovanju. Shaw uspijeva prevariti Digglea, te dovodi u opasnost mnoge agente ARGUS-a, uključujući Lylu. Dotle, Laurel se nalazi s Tedom Grantom, a Felicity se prilagođava na novi posao.

Bijesna Nyssa al Ghul vraća se u Starling City i sukobljava se s Oliverom zbog Sarine smrti. Kad Oliver sazna da je Malcolm Merlyn živ, sumnja da je Merlyn ubio Saru. Oliver i Nyssa se udružuju i kreću za Crnim Strijelcem, odlučni u namjeri da Sarina ubojicu privedu pravdi. Laurel drži distancu od Nysse jer za sestrinu smrt krivi njezinu povezanost s Ligom ubojica. Dotle, Oliver i Roy rade na popravljanju odnosa s Theom koja se vratila kući. Nyssa razgovara o Oliveru s ocem, Ra's al Ghulom.

Kad cyber napad sruši Starling City na koljena, Oliver i Felicity moraju dati sve od sebe da ograniče uništenje. Život postaje kompliciraniji za Felicity kad njezina majka Donna svrati u iznenadni posjet. Dotle, Ted Grant propitkuje Laurelin motiv, a Thea kupuje stan Malcolmovim novcem, što jako ljuti Olivera.

Nakon što je u Wildcatovoj teretani otkriveno obješeno truplo, Ted Grant postaje glavni sumnjivac. Oliver i Laurel se svađaju zbog Tedove nevinosti. Dotle, u sjećanjima, kad Maseo traži Olivera da se sjeti gdje je doušnik Chine White pohranio informacije, traži od Tatsu da osvježi Oliverovo pamćenje. Roy govori tajnu Felicity.

Oliver mora zaustaviti serijskog ubojicu opsjednutog Arrowom, Carrie Cutter, koja je uvjerena da je Arrow njezina prava ljubav i ne preza ni pred čime da zadobije njegovu pozornost. Nažalost, želi zadobiti njegovu pozornost ubojstvima. Dotle, Ray moli Felicity da mu bude pratnja na radnoj večeri s važnim klijentima. Thea traži nove DJ-eve za Verdant i upoznaje Chasea, drskog DJ-a s kojim se odmah sukobljava.

U drugom dijelu prijelazne epizode Arrow/Flash, Oliver, Arsenal i Diggle tragaju za Diggerom Harknessom, ubojicom koji koristi bumerang, no iznenađeni su kad se suoče s timom ARGUS. Diggle pita Lylu zašto je ARGUS upleten, ali ona mu ne odgovara, pa Harkness napada zgradu, ubija nekoliko agenata i namjerio se na Lylu. Arrow ulazi u bitku i dobiva pomoć starog prijatelja - Flasha. Harkness uspijeva pobjeći i Oliver se udružuje s Barryjem kako bi ga pronašli prije nego što dođe do Lyle. Kad Harkness postavi pet bombi u gradu koje će eksplodirati u isto vrijeme, timovi moraju surađivati kako bi spasili grad.

Nyssa al Ghul vraća se u Starling City i govori Oliveru da je njezin otac Ra's al Ghul dao Oliveru 48 sati da pronađe Sarina ubojicu ili će Liga ubojica početi ubijati građane Starling Cityja. Laurel je iznenađena kad od oca dobije poseban božićni dar - majku Dinu. Dotle, Ray se pokušava pomiriti s Felicity i Oliver dogovara sastanak s Ra's al Ghulom.

Nakon Oliverove borbe s Ra's al Ghulom, Diggle i Arsenal nastavljaju štititi grad dok Arrowa nema. Međutim, nakon što im se Oliver nije javio tri dana, boje se da se njihovu prijatelju nije dogodilo ono najgore. Felicity odbija vjerovati da je Oliver mrtav dok Merlyn ne dođe u iznenadni posjet timu. Thea sumnja da se nešto krije iza Oliverova nestanka i traži od Merlyna uslugu. Dotle, Ray testira novi dio svog odijela, a Laurel postaje Crni Kanarinac.

Arsenal i Diggle upozoravaju Laurel o tome da kreće sestrinim stopama i žele da prestane prije nego što pogine. Međutim, Brick otme gradske vijećnike i prijeti da će ih sve pobiti ako policija ne evakuira Gladese, pa svi junaci djeluju zajedno. Dotle, Ray pomaže Lanceu i policiji u borbi s Brickom - te pokazuje Felicity novu stranu njezina šefa. Malcolm govori Thei da Ra's al Ghul proganja njega i njegovu obitelj i da odmah moraju pobjeći iz grada.

I dalje rade bez Olivera i žele zaustaviti Bricka, pa tim Arrow razmišlja da pristanu na Malcolmovu ponudu da im pomogne - jer Malcolm se želi osvetiti tom kriminalcu. Roy i Laurel govore da timu treba pomoć kako bi se spasili nevini građani Gladesa, no Felicity je odlučna protiv toga. Svi očekuju od Digglea da donese odluku. Dotle, u sjećanjima vidimo kako se Malcolm pretvorio iz brižnog oca i muža u hladnokrvnog ubojicu nakon ubojstva njegove supruge.

Oliver je zapanjen promjenama u timu Arrow. Naviknut je na to da on donosi odluke, ali vidi da je tim evoluirao dok ga nije bilo i ubrzo dolazi do tenzija u skrovištu. Oliver je bijesan što je Laurel djelovala kao Crni Kanarinac i govori joj da prestane riskirati život, ali kad Vertigo opet napadne grad, Laurel ne sluša Olivera, nego pronalazi Vertiga koji joj daje punu dozu droge. Laurelini najveći strahovi vezani su uz njezinu sestru Saru, pa Vertigo uzrokuje halucinaciju u kojoj dolazi do epske bitke između Kanarinca i Crnog Kanarinca. Dotle, Chase iznenađuje Theu, a Roy je upozorava da se kloni Malcolma.

Malcolma je zarobio Ra's al Ghul i odveo ga je u Nandu Parbat. Zbog njegove ljubavi prema Thei, Oliver razmatra da spasi Merlyna. Dotle, Ray je opsjednut time da dovrši svoje odijelo Atom kako bi spasio grad, ali Felicity se boji da kreće istim putem kao Oliver i pokušava ga odvući od laboratorija.

I dalje opterećen zbog posljednjeg susreta s Ra's al Ghulom, Oliver se vraća kući i otkriva da je novi zlikovac sa svojom pratnjom počeo terorizirati Starling City. To je Michael Amar zvan Murmur, čovjek kojem su usta zašivena. Dotle, Laurel i Nyssa se zbližavaju zbog problema s očevima i Nyssa daje Laurel ponudu. Thea se mora pomiriti s ocem nakon što Oliver dovodi Malcolma u njezin stan da se oporavi. A Lance odustaje od Laurel i Arrowa.

Vrijeme je za slavlje jer se Diggle i Lyla vjenčaju. Međutim, Deadshot prekida njihov medeni mjesec i govori im da Samoubilačka jedinica ima novi zadatak: spasiti američkog senatora Josepha Craya iz talačke krize u Republici Kasniji. Amanda Waller im objašnjava misiju i predstavlja im novog člana Samoubilačke jedinice, Kupida. U međuvremenu, Oliver saznaje za Rayev novi kostim Atom i njih dvojica se posvađaju. Odnos Felicity i Raya se pogoršava.

Tijekom napada na gradonačelnikov ured, Ray je teško ozlijeđen. Felicity je ugodno iznenađena kad se njezina majka, Donna Smoak, pojavi u bolnici da joj pruži potporu. Policija je u potrazi za napadačem, a Oliver i njegova ekipa nastoje biti korak ispred policije u potrazi za krivcem. Međutim, dolazi do problema kad Ra's al Ghul otme kapetana Lancea.

Lance nastavlja misiju da ulovi Arrowa, pa Felicity naređuje Oliveru da pazi što radi. Međutim, kad metačovjek Jake Simmons, koji ubija ljude udarima energije i plazme, počne napadati Starling City, Oliver mora tražiti pomoć od Raya. Neobični par mora surađivati kako bi spasili grad od DC Comicsova zlikovca zvanog Deathbolt.

Ra's al Ghul napokon daje Oliveru ponudu koju ne može odbiti. Tim odlazi s Oliverom na putovanje u Nandu Parbat gdje razočarana Felicity uzima stvar u svoje ruke.

Oliver prolazi rigoroznu transformaciju, a Liga ubojica namjerila se na Nyssu koja u Starling Cityju trenira Laurel. Kad Nyssa shvati da dolaze, sprema se suočiti s njima sama, ali Laurel moli Felicity i Digglea da joj pomognu zaštititi njezinu novu prijateljicu.

Oliver dovršava trening kao Al Sah-him i ostaju mu još dva posljednja zadatka da postane novi Ra's al Ghul. Ra's prijeti Nyssi i prenosi joj šokantne vijesti. Dotle, Malcolm nudi iznenađujuću ponudu timu Arrow i Thea odlazi vidjeti Roya.

Svima su životi ugroženi u napetom finalu sezone jer Ra's al Ghul pokreće svoj posljednji plan. Dotle, Oliver/Al Sah-him mora odlučiti je li dovoljno jak da preuzme novu ulogu i što će to značiti za sve u timu Arrow -- i za njegovu dušu.