Местонахождение машины теперь никому неизвестно. Она получила полную самостоятельность, однако Финч продолжает получать номера. Очередной след приводит к офицеру флота, который оказался в городе во время проведения парада. Но найти его крайне сложно, так как на берег сошло множество моряков. Картер понижают до патрульного. Рут пытается освоиться в психбольнице.

Риз вынужден защищать владельца корпорации Уэйна Крюгера, промышляющего торговлей конфиденциальной информацией. Учитывая количество жертв Крюгера, пострадавших от разглашения их персональных данных, и даже подавших на него коллективный иск, круг подозреваемых оказывается весьма широким. Между тем у Картер появляется новый напарник.

Молодой человек, получивший хорошее наследство и успешно ведущий свой бизнес, становится объектом внимания машины. В его квартире Риз обнаруживает архив данных привлекательных девушек с сайта знакомств. Предположив, что это будущие жертвы преступлений, Риз и Финч устраивают ловушку.

Очередной номер, выданный Машиной, принадлежит успешной женщине-адвокату из Нью-Йорка, арестованной по обвинению в убийстве мужа, погибшего при весьма сомнительных обстоятельствах. Пока герои выясняют, кому было выгодно подставить именитого юриста, новый напарник Картер открывается с неожиданной стороны.

Шоу поручено следить за десятилетней эмигранткой из России, номер которой выдала Машина. Девочка оказывается большой любительницей шпионажа, и случайной свидетельницей переговоров между представителями HR и русской мафией. Между тем миссия Картер по разоблачению HR оказывается на грани провала.

После успешного побега Рут получает первое задание: любой ценой привлечь агента Шоу для помощи Машине. Пока Финч пытается защитить следователя по недвижимости, чей номер выдала Машина, Риз пускается на поиски пропавшей Сэм.

Ушлый психолог ловко выуживает у своих клиентов секретные слова и пароли, используя их счета по своему усмотрению. Таким манёвром он неплохо зарабатывает, пока однажды не попадается Ризу и Финчу.

Однажды утром машина выдаёт целых 38 номеров. Всех этих людей связывает одно: все они полицейские. Остаётся понять, станут эти люди жертвами или преступниками.

Машина снова выдаёт несколько номеров. Все эти номера принадлежат одному человеку, живущему под разными именами. Этот человек — Джон Риз.

После гибели Картер Риз идёт по следам Симмонса, намереваясь его убить. Финч со своей командой пытается его остановить.

Риз и Фаско отошли от дел, однако Финч уступает уговорам Гроувз и берётся за расследование очередного номера. Новый подзащитный представляет собой загадку: у него опухоль мозга, и охранники в больнице не оставляют его ни на минуту.

Финч с Артуром и Самин пытаются получить из банковской ячейки диски программы, но попадают в засаду. Тем временем Фаско пытается убедить Риза вернуться к делам.

Риз оказывается в самолёте, на борту которого находится человек, выбранный машиной. Риз вынужден вмешаться.

Машина выдаёт номер оператора службы спасения, Сандры. Финч внедряется в штат сотрудников, чтобы решить проблему.

История переносится в прошлое, когда Финч и Риз работали по разные стороны баррикад. Однако та и другая сторона стремятся защитить одного человека.

Рут ведёт свои собственные игры, а Финч тем временем получает номер человека, для которого эта девушка представляет опасность. Рут же, направляемая Машиной, на самом деле пытается уберечь обладателя номера от организации Decima, которая стремится активировать вторую Машину — «Самаритянина».

Пока Decima собирает свои ресурсы, чтобы построить новую машину, команда получает номер Марии Мартинес — инженера-электрика, оказавшейся втянутой в международные интриги, пытаясь помочь своему другу, иракскому переводчику, получить убежище в США.

Команда Финча не успевает спасти обладателя очередного номера. Теперь остаётся только понять, кому была выгодна эта смерть. Пока Финч и Фаско разбираются с этим делом, Риз и Шоу отправляются на вечер выпускников в одну из школ, чтобы защитить новую потенциальную жертву.

Команде приходится разделиться. Шоу с Гроувз отправляются на побережье, а Риз и Финч занимаются номером в Вашингтоне: помощь требуется конгрессмену США. Вскоре Ризу, чтобы обеспечить защиту своего клиента, приходится пойти на крайние меры. И он сам становится объектом преследования полиции.

В отсутствие Финча «Десима» охотится на Риза и Шоу, используя ресурсы «Самаритянина». Тем временем «Десима» устраивает ловушку для Финча, похищая его прежнюю возлюбленную Грейс.

Все, кто когда-либо помогал Финчу, объединяются, чтобы спасти его и остановить работу машины «Самаритянин».

Команда целеустремлённо работает, чтобы предотвратить включение "Самаритянина" в сеть; борьба с террористической группировкой "Бдительность" подходит к шокирующему финалу.