Un misterioso milionario Finch, si avvicina a John Reese, un operativo della CIA che è creduto morto e gli offre la possibilità di farlo diventare una sorta di vigilantes sponsorizzato.

La Macchina individua un individuo deceduto come possibile persona d'interesse e questo porta Finch a ripercorrere i passi che lo hanno portato a costruire la Macchina e a scoprire come sia possibile che l'errore si sia verificato.

Reese va sotto copertura per scoprire la minaccia che circonda la nuova persona sulla lista di Finch : un giovane veterano dell'esercito di nome Joey Durban.

La Macchina indica la dottoressa Megan Tillman, una promessa nel campo della medicina e Reese comincia a sorvegliarla per scoprire quale pericolo sta correndo. Intanto Fusco sta scappando dal cartello dei Torero che sono alla ricerca dei soldi rubati dal partner di Fusco.

Reese e Finch devono proteggere il giudice Samuel Gates che non vuole avere niente a che fare con le loro attività extra legali, anche se questo potrebbe costargli la vita.

Reese sta lavorando come autista per il nuovo soggetto, una donna molto affascinante che però fa degli affari poco puliti. Intanto Carter indaga su un omicidio collegato alle prove rubate per il caso Elias.

Reese e Finch aiutano un insegnante scolastico che è stato preso di mira dalla mafia dopo che ha assistito a un omicidio.

Reese e Finch scoprono che le loro conoscenze tecnologiche non sono di molto aiuto quando si tratta di proteggere la nuova persona, un uomo che ha delle connessioni con spie risalenti alla Guerra Fredda.

Reese, Finch e Fusco devono proteggere il Detective Carter senza farsi scoprire e senza svelare le loro vere identità.

Reese e Finch devono fare gli straordinari quando la Macchina elabora i nomi di quattro persone. Carter è ancora alle prese con le conseguenze del recente attentato alla sua vita. Il passato di Reese si rifà vivo.

Carter si sta avvicinando sempre di più a Reese e Finch i quali stanno investigando su un nuovo caso.

Carter incontra Reese per la prima volta e le chiede di aiutarlo a trovare il loro prossimo obiettivo, una giovane avvocatessa che è finita su una brutta strada e corre il rischio di rimetterci la pelle.

La Macchina da a Reese e Finch il numero di un uomo, un povero disperato che ha raggiunto il limite e per trovarlo devono chiedere aiuto a una persona che hanno aiutato in passato, Zoe Morgan.

Reese e Finch si occupano della nuova persona che la Macchina ha predetto, un teenager il cui fratello è stato assassinato da poco. Finch è preoccupato perchè pensa che Will, il figlio del suo partner deceduto, si sta avvicinando troppo alla verità.

Reese si infiltra in una gang di trafficanti in modo da proteggere l'ultima persona indicata dalla Macchina.

La nuova persona di cui si devono occupare è un giovane che si occupa di transizioni economiche e rimane coinvolto in una truffa da svariati milioni di dollari. Reese deve far finta di essere un ricco investitore per risolvere il caso.

Reese e Finch si ritrovano a occuparsi di un neonato di sei mesi indicato dalla Macchina come prossimo obiettivo. Carter intanto comincia a mettere in discussione la sua alleanza con loro dopo che Elias si fa vivo.

Reese e Finch scoprono che la loro prossima 'persona' non ha impronte digitali e conduce una doppia vita.

Finch e Reese scoprono che i prossimi cinque numeri sono corrispondenti ad altrettanti boss del crimine di New York e si rendono conto che Elias sta mettendo a punto un piano per il completo controllo della criminalità organizzata.

La Macchina espelle i nomi dei cinque rappresentanti delle famiglie criminali più influenti di New York e Reese e Finch sospettano che Elias intenda sbarazzarsi della competizione.

E' il compleanno di Reese e Finch decide di regalargli una giornata di vacanza, specie per evitare che si occupi dell'ultimo caso, che potrebbe risvegliare ricordi dolorosi.

La nuova persona che bisogna proteggere è in pericolo a causa della sua eccessiva curiosità, specie quando si ritrova coinvolto in una cospirazione governativa. Reese intanto scopre qualcosa del passato di Finch.

Reese rimane intrappolato con la persona segnalata dalla Macchina in una parte della città pesantemente sorvegliata e deve affidarsi all'aiuto di Finch, Carter e Fusco.

Reese e la Macchina uniscono le loro forze per rintracciare Finch che è stato rapito dal misterioso Root.

Reese sta indagando su un vecchio caso e si avvicina sempre di più a Finch e al suo rapitore, Root.

Finch è di nuovo nella Biblioteca mentre Reese ritorna sul campo per affrontare il suo caso più difficile, proteggere la figlia di un diplomatico brasiliano.

Reese e Finch sono presi in un conflitto morale quando la Macchina tira fuori il nome di un mafioso che necessita protezione. Cosa fare? Agire secondo i loro parametri come fatto fin'ora o lasciare che il karma segua il suo corso facendo giustizia?

Reese si sta occupando della protezione di una giornalista, ma gli riesce difficile farlo senza suscitare la sua curiosità e diventare anche lui uno dei suoi reportage.

Reese sta lavorando sotto copertura in un quartiere apparentemente idilliaco per occuparsi dell'ultima persona indicata dalla Macchina.

Reese e Finch si occupano della protezione di un dirigente, che deve sottoporsi a una procedura chirurgica segreta, e della moglie del chirurgo in questione, entrambi in pericolo per via di un ex agente dell'MI6 e di un gruppo di ex agenti dell'SAS.

Il team stavolta avrà molto da fare visto che la Macchina ha indicato non una ma ben due persone, un uomo e sua moglie.

Finche e Reese sono messi a dura prova nel caso riguardante un tassista di New York, il cui assassino potrebbe essere chiunque dei suoi clienti.

L'ultimo caso di Reese si trasforma in una faccenda personale quando scopre che la persona che deve proteggere è la sorella di un soldato caduto sul campo di battaglia.

Mentre sta lavorando sotto copertura nel ruolo di insegnante supplente, Finch protegge un giovane genio che gli ricorda sè stesso. Carter è alle prese con un pericoloso incarico per l'FBI.

Carter è impegnato in una guerra di astuzia con l'FBI per far sì che Reese riesca ad evitare l'agente Donnelly. Reese intanto è alle prese con nemici vecchi e nuovi, mentre il detective Fusco è costretto a lavorare da solo mentre cerca di proteggere la top model Karolina Kurkova.

Reese viene rapito da una persona del suo passato che sta organizzando un massiccio e letale attacco nel cyber-spazio.

Finche Reese sono alle prese con un miliardario esperto di tecnologia che minaccia di esporre la loro operazione.

Reese e Finch stanno cercando di salvare la vita di una cameriera d'albergo, ma il numero di sospettati è davvero elevato. Carter intanto riceve un'offerta interessante dall'FBI.

Un'agente governativa che si occupa di neutralizzare minacce terroristiche prima che abbiano luogo si trova in fuga da un pericolo imminente e Reese e Finch decidono di aiutarla. Tuttavia l'impresa è più facile a dirsi che a farsi.

Finch e Reese sono con l'acqua alla gola perché stanno cercando di proteggere sei persone contemporaneamente. Le indagini li portano in una città costiera e durante una tempesta i due sono costretti a rifugiarsi nella stazione di polizia locale con un gruppo di cittadini, con la consapevolezza che tra di loro si nasconde un assassino.

Finch e Reese si recano ad Atlantic City per indagare sulla vita dell'ultima Persona indicata dalla Macchina, un anziano scommettitore la cui vita però sembra assolutamente ordinaria. A New York Carter sta portando avanti una battaglia per smacchiare la reputazione di un collega, ma la sua ricerca la porta pericolosamente vicino al dipartimento delle Risorse Umane.

La Macchina indica una dei principali leader nel settore tecnologico e quando Finch s'infiltra nella sua compagnia per raccogliere informazioni non riesce a determinare se la donna sta lavorando per il successo della società o se intende distruggerla dall'interno. Carter continua a sospettare dell'integrità del Detective Beecher, specialmente dopo che quest'ultimo procura delle prove incriminanti su un collega.

Reese e Carter sono in lotta contro il tempo per salvare la vita di un luminare della medicina che è stato avvelenato con una sostanza che agisce lentamente ma porta a morte certa. Carter intanto decide di prendere in mano la situazione con l'IAB quando Fusco viene accusato dell'uccisione di Stills.

Reese e Finch scoprono che la Macchina è affetta da un virus che ha compromesso la sua capacità di individuare i prossimi obiettivi. Mentre cercano di trovare una soluzione, sono allo stesso tempo a lavoro per rintracciare un ricco genio della tecnologia che ha fama di essere un eremita. Carter è determinata a mettere le mani sull'assassino di Cal Beecher ma l'organizzazione criminale dell'HR sta seguendo ogni sua mossa.

La Macchina è offline e non può fornire informazioni di nessun genre, Finch e Reese devono chiedere aiuto ad alleati inaspettati per risolvere la situazione.