מורה צעירה, רבקה אדלר, סבלה מאיבוד שליטה בדיבור ומייד לאחר מכן מהתקף התמוטטות. היא נלקחת לד"ר האוס ושם הצוות שלו מנסה לברר האם גידול הוא הגורם לתסמינים שלה.

האוס וצוותו מטפלים בנער הסובל מסיוטים והזיות לאחר שקיבל מכה בראשו, אך מתקשים למצוא הסבר למצבו; האוס נאלץ להתמודד עם מטופל המבקש לתבוע אותו ועם אם שמפקפקת בחיסונים.

תלמיד קולג' התמוטט. בזמן שהאוס והצוות שלו מנסים לקבוע את הגורם, מצב הסטודנט ממשיך להידרדר והסימפטומים שלו מכפילים את מורכבות האבחנה.

כשווירוס מתפשט בקרב בית החולים ומדביק שישה תינוקות, האוס והצוות שלו חייבים להחליט החלטה שיכולה להציל את חיי התינוקות.

נזירה שידיה אדומות ונפוחות נשלחת להאוס. האוס, שחושד שזו תגובה אלרגית, נותן לה גלולות הגורמות לה קושי בנשימה. כשמצבה מחמיר, האוס וצוותו חייבים לגלות את הגורם לחולי.

להפתעת עמיתיו, מגלה האוס רגישות מיוחדת כלפי סכיזופרנית החולה במחלה סופנית ובנה המתבגר, המטפל בה במסירות. על רקע המקרה המורכב, חוגג האוס את יום הולדתו.

איש שיצא לג'וגינג חוזר לביתו ומגלה את אשתו חסרת הכרה. הסימפטומים שלה מהווים חידה לרופאים וכשכל הטיפולים נכשלים, האוס מסיק שיש לה מחלת שינה אפריקנית - אך לא האישה וגם לא בעלה היו מעולם באפריקה.

מוזיקאי מגיע לבדיקות בקליניקה, וכשנאמר לו שהוא גוסס מ-איי-אל-אס, הוא מבקש שלא להחיות אותו כדי להימנע ממוות איטי. האוס מתנגד לאבחנה ויוצא כנגד כולם. אבל כשמצבו משתפר באופן מפתיע, הצוות צריך למצוא את הסיבה.

פורמן חושב שמחוסרת בית מזייפת התקף אפילפטי כדי לזכות בארוחה בביה"ח. לעומתו, וילסון נחוש להשאירה. הסימפטומים שלה מהווים תעלומה מרתקת עבור האוס והצוות שלו, אבל במסתורין של זהותה וההיסטוריה הרפואית שלה טמונות אולי התשובות שיביאו להצלת חייה.

בזמן שמטופל צעיר לא מפסיק לדמם לאחר תאונת רכב, האוס מנסה להגמל ממשככי כאבים. המטופל גוסס וימות אם הצוות לא יוכל לקבוע מה מקור הדימום. האוס הופך ליותר קשוח ואכזרי מהרגיל, ופורמן וקמרון פוחדים שאולי הוא לא חושב בצלילות בגלל הגמילה.

שחקן בייסבול שובר את זרועו ומגיע כדי לראות את האוס. הביקור חשף מקרה רציני של בריחת עצמות והיסטוריה של צריכת סמים, ולמרות שבהתחילה הוא מכחיש, בסוף מתגלה שהוא צורך סטרואידים. כליותיו קורסות ואשתו מציעה לתרום לו.

נער מאמין שקולל אחרי שלוח סיאנס ניבא שהוא הולך למות. בינתיים, אביו המנוכר של צ'ייס - רופא ידוע באוסטרליה, מגיע לביקור, למרבה חוסר הנוחות של צ'ייס. כשהאוס מאבחן את מחלת הנער, המטופל נאלץ להתמודד עם הידיעה שאולי אביו לא היה כל מה שהוא האמין שהיה.

מיליונר משקיע בקליניקה והופך לראש הנהלת ביה"ח והאוס על הכוונת שלו. בינתיים, אשת עסקים שיש לה הכל מוצאת את עצמה בשיתוק בלתי מוסבר. כשהאוס מאבחן את המקרה המסתורי שלה, הוא חייב לסכן את עבודתו ואת רישיון הרפואה שלו כדי לגרום לה לקבל השתלה נחוצה.

בדיוק לפני שבריון אמור להעיד בבית משפט פדרלי, הוא מתמוטט. האם הוא רק מזייף את ההתמוטטות? צו בית משפט מורה להאוס לברר – ומהר. בינתיים, קאדי נאבקת בנסיון לשכנע את ווגלר שהאוס חיוני לבית החולים.

האוס מתמודד עם העובדה שהוא צריך לפטר אחד מהרופאים בצוותו. בינתיים, הצוות עצמו מתמודד עם ילדה בת 10 בעלת עודף משקל שסבלה מהתקף לב. במקביל, האוס נפגש עם אישה שלא מוכנה לעבור ניתוח להוצאת גידול בגלל שהיא רוצה להישאר בעלת עודף משקל.

סנאטור בשם גארי ה. רייט נהיה חולה אחרי שנאם באירוע התרמה. ווגלר נותן את המקרה לטיפולו של האוס ומציע להשאיר את הצוות של האוס בשלמותו - אם האוס ינאם בהצגת פרויקט חדש שעומד לצאת בחסות החברה של ווגלר.

האוס וצוותו נאבקים לגלות מה גורם להפרעה בתפקוד המוח והכליות של אישה הרה, אך לאחר שהאוס מזהה את המחלה, האישה ובעלה חייבים להתמודד עם החלטה שוברת לב. בינתיים, ווגלר מעוניין לפטר את האוס וקורא להצבעה, אבל כשוילסון מסרב, ווגלר מאיים לקחת את כספו חזרה.

בזמן שהתפשטות דלקת קרום המוח מהממת את הקליניקה, האוס מרוכז במטופלת אחת: ילדה בת 12 שהסימפטומים שלה לא בדיוק זהים לאלו של האחרים. האוס, פורמן, וצ'ייס חייבים לגייס דרכים חכמות ואלתור כדי לטפל במצבה השברירי של הילדה בתוך כל הבלגן.

האוס מעורר שבץ במטופל, אבל הנושא העיקרי שעומד לדיון הוא הדייט הממשמש ובא שלו ושל קמרון. האוס נאלץ להתמודד עם הורי המטופל שלא משתפים פעולה כשהוא מנסה להציל את חיי בנם. בינתיים, כולם מייעצים להאוס וקמרון למרות שבעצם הם מפקפקים בתוצאות.

חברתו לשעבר של האוס מופיעה ומבקשת עזרה. בעודו מתלבט בהחלטה, האוס נאלץ להעביר הרצאה לקבוצת סטודנטים תחת לחצה של קאדי. האוס שוזר בהרצאה שלושה סיפורים על שלושה מטופלים בעלי סימפטומים זהים, והופך אותה להרצאה שלא תישכח במהרה.

בפרק סיום העונה, דורשת סטייסי שבעלה יעבור בדיקות, אך האוס מתעקש שהעניין תחת שליטה. על אף שתוצאות הבדיקות תקינות, מצביעים התסמינים על כך שהוא גוסס. וילסון מודאג בגלל רגשותיו של האוס וקאדי מציעה להוסיף עובד חדש לקליניקה.