'제2의 9/11 사건' 이후 거의 3개월이 지난 시점, CIA 대테러센터 폭파 용의자 닉 브로디의 행방은 여전히 묘연하다. 사울은 폭파 사건과 관련된 테러리스트를 목표로 무모한 반격 작전을 짜지만, 캐리가 상원 의원의 청문회 대상으로 찍히면서 사울의 CIA 부활 계획은 위기를 맞는다.

사울은 본부를 폭격한 범인을 추적한다. 범행 자금의 흐름을 캐내기 위해 의외의 전문가를 고용한다. 퀸은 최근 작전의 추가 피해에 곤란해하다가, 직접 일을 처리하기로 한다. 캐리는 상황을 겪으며 누가 진정한 자기편인지 알게 되고, 브로디 가족은 망가진 가정을 수습하기 위해 상담 치료를 시작한다.

용의자 니콜라스 브로디는 자신이 곤경에 처했음을 알아채고, 자신의 신조를 다잡을 기묘한 기회를 얻는다. 워싱턴DC로 돌아온 캐리는 사울과 이어지려 애쓰는 한편, 의문의 인물이 나타나 캐리를 도와주겠다며 엄청난 대가를 요구한다.

캐리는 CIA라면 조직이 무너진 상황일지라도 필요한 역량을 발휘할 수 있음을 배운다. 데이나 브로디는 자취를 감추고, 제시카는 딸을 찾으려 경찰을 부를 수밖에 없다. 사울과 파라는 자금의 흐름을 추적하다 뜻밖의 장소를 발견하고, 캐리는 새 의뢰인과 조찬 자리를 갖는다

미국-캐나다 간 국경을 넘어 정체불명의 인물이 들어왔다. 워싱턴DC에서 캐리는 모종의 편의를 봐주려고 자신의 작전을 위험에 노출한다. 사울은 엘리트 차출 원정을 떠나며 자신의 숙적, 록하트 상원의원과 한배를 타게 된다. 도망중인 데이나는 자신의 도피 생활을 끝내버릴 정도로 놀라운 발견을 한다.

캐리는 폭격을 지휘한 배후의 계획을 뒤집어엎지만, 이란 최고의 실력자를 끌어들인 위험한 뒷감당을 해야 한다. 사울은 록하트 의원의 간섭을 저지하려 애쓰고, 데이나는 가족의 운명을 뒤바꿔버릴 극단적 결정을 한다.

사로잡힌 오랜 숙적을 두고, 사울은 직책을 건 도박을 한다. 캐리와 퀸은 지역 경찰 수사를 낚아채기 위해 달려들고, 미라의 혼사는 기로에 놓인다.

새로운 정보가 자취를 드러내고, 캐리와 퀸은 대테러센터 테러 사건의 주요 용의자를 쫓는다. 사울은 정치적 후폭풍을 수습하고, 파라는 정보기관 요원으로서 감당해야 할 일을 치른다. 한편, 브로디 가족은 놀라운 소식을 접한다.

브로디는 아주 중요한 작전에 참여하지만, 민감한 주변 상황 때문에 작전 전체가 위기에 빠진다. 퀸은 캐리의 불편한 진실을 발견하고, 갑작스레 닥친 위기는 파라의 재합류를 종용한다.

캐리는 작전 지원을 위해 테헤란에 잠입하지만, 브로디의 협조 서약은 브로디가 과거의 잔상을 마주하면서 흔들린다. 록하트의 약조가 희미해지면서, 사울은 성공과 실패가 갈리는 기로에 놓였음을 확인한다.

캐리와 브로디는 사막의 끝에서 피난처를 찾지만, 보안 요원들이 거리를 좁혀온다. 사울은 최후의 구출 작전을 계획하고, 브로디는 구원을 얻으려 분투한다.