Lors d'une de ses chasses nocturnes, Dexter tue un homme inconnu qui l'agresse. Il vient de bafouer le Code de Harry : il a ôté la vie à un innocent, frère du procureur qui plus est. De plus, sa vraie cible a disparu dans la nature, après avoir vu le visage de Dexter. L'affaire est confiée à Debra, qui espère passer détective. De son côté, Dexter se rapproche de plus en plus de Rita, qui lui annonce qu'elle est enceinte...

La grossesse de Rita est confirmée, mais Dexter a d'autres soucis. Il doit retrouver Freebo et l'éliminer avant que ses collègues ne lui mettent la main dessus. Miguel Prado s'impatiente et, alors que personne ne voit le coup venir, Debra pourrait bien répondre à ses attentes en reliant son enquête à celle d'Angel.

Depuis le meurtre de Freebo, Miguel Prado multiplie les marques d'affection envers son "complice". Dexter, peu habitué à ce genre de rapprochement, est plutôt embarrassé. Le procureur est rapidement rattrapé par l'affaire Chicky Hines, un criminel qu'il inculpe sans avoir pris en compte un témoignage le disculpant du meurtre. Maria Laguerta commence à s'interroger sur le véritable fond de son ami de toujours. Le corps mutilé d'une nouvelle victime est découvert dans un parc de Miami. Il s'agit d'un témoin interrogé quelques jours plus tôt par Deb dans l'affaire Freebo...

Rita veut que Dexter vienne vivre avec elle et les enfants, mais pour cela il faut acheter une maison plus grande, ce qui ne l'enchante pas. Peu enclin à en discuter, il préfère suivre les indications de Miguel Prado et traquer un tueur. Deb retrouve Wendell, le gamin qui surveillait l'entrée de la maison de Freebo.

Alors que Miguel connaît la véritable nature de Dexter. Celui-ci décide de le mettre à l'épreuve pour vérifier ses convictions. Ils montent ensemble un plan d'assassinat contre un néo-nazi. Debra, toujours sur l'enquête du dépeceur, se met à suspecter Ramon Prado.

Excité à l'idée de débarrasser le monde de ses «méchants», Miguel Prado propose à Dexter une nouvelle cible. Il s'agit d'Ellen Wolf, une excellente avocate dont l'unique crime est de faire sortir des assassins de prison. Un défaut insuffisant aux yeux de Dexter. Le serial killer entre alors dans un questionnement sur la finalité et le sens de son code. Doit-il le modifier pour ne pas décevoir Miguel ? Pendant ce temps, l'enquête sur l'écorcheur piétine et Batista décide de se servir d'Anton comme appât pour appréhender le tueur en série. Deb, en désaccord avec son supérieur, continue ses propres investigations et suit à présent une piste intéressante. Placée en soins palliatifs, Camilla supplie Dexter de l'aider à mourir

La nouvelle piste découverte par Deb conduit les enquêteurs à interroger des élagueurs, toujours présents sur les scènes de crime de l'écorcheur. Deb, qui a passé la nuit avec Anton, lui apprend qu'il n'est pas un véritable indic et qu'aucune charge n'est retenue contre lui. Il est donc libre de collaborer ou non avec la police de Miami. Le lendemain, Anton est introuvable. Miguel Prado désire passer à l'étape supérieure : tuer. Il présente à Dexter leur nouvelle cible, Billy Fleeter, un joueur de football américain raté, contraint à tuer pour rembourser sa dette auprès d'un bookmaker. Malgré les avertissements d'Harry, Dexter enseigne alors à Miguel les rudiments du parfait meurtrier. Mais attention, l'élève pourrait bientôt dépasser le maître...

En enseignant à Miguel les rudiments du parfait meurtrier, Dexter a créé un monstre. Le lendemain du premier meurtre orchestré par son élève, Dex apprend que celui-ci n'est pas directement rentré auprès de Sylvia. Ellen Wolf est introuvable et le tueur en série fait rapidement le rapprochement entre l'aversion de son ami pour l'avocate et sa disparition. Dexter tente de provoquer le procureur adjoint afin que sa vulnérabilité soit palpable par les enquêteurs... Depuis le kidnapping d'Anton, toutes les patrouilles recherchent activement George King. Doutant de la sincérité de son ami, Dexter analyse le sang de la chemise offerte en gage de confiance et s'aperçoit qu'un monstre l'a manipulé

Dexter ne digère pas le comportement de Miguel à son égard et prépare sa vengeance. Les enquêteurs mettent la main sur Toby Edwards, un barman qui aurait rendu visite à Ellen Wolf la nuit de son meurtre. Dexter y voit une excellente occasion d'effrayer le procureur adjoint, en lui soufflant la possibilité d'un témoignage. Le sergent Batista se rend au chevet de sa compagne, battue par l'un de ses clients, tandis que Debra remet en question sa relation avec Anton. Doit-elle prendre le risque de perdre sa plaque pour une simple relation avec le témoin clé de l'enquête sur laquelle elle travaille ? Sylvia, certaine que son époux la trompe, débarque à l'improviste chez Maria Laguerta et y découvre Miguel. La jeune femme évoque l'absence de son mari la nuit de l'assassinat d'Ellen. Dexter se rend chez son ancien meilleur ami et y fait une surprenante découverte...

Dexter participe à l'enterrement de sa vie de garçon organisé par ses collègues de travail et auquel participe aussi Miguel. Alors que Dexter prend la décision d'éliminer Miguel et qu'il réfléchit à la façon dont il va s'y prendre, la lieutenant LaGuerta commence à se douter de l'implication de Miguel dans l'assassinat de l'avocate Ellen Wolf.

Le corps de Miguel Prado est retrouvé dans un parc de Miami. Les enquêteurs songent immédiatement à l'écorcheur. Fier de la réussite de son plan, Dexter joue à l'ami endeuillé, se réfugiant dans le travail. Mais Ramon Prado, loin d'être dupe, menace le tueur en série et saccage son appartement. En gage de gratitude pour son professionnalisme dans l'affaire de l'écorcheur, Angel Batista offre à Debra la promotion de sa vie : la plaque d'inspecteur qui la faisait tant rêver. Mais Deb est rapidement rattrapée par ses relations douteuses avec Anton, le témoin clé de l'enquête. Ce conflit d'intérêt pourrait nuire à son nouveau statut. La veille de son mariage, Dexter se retrouve dans une situation familière : il est ligoté sur une table. Dans le rôle du bourreau : George King...