Szpiegowski świat Chucka Bartowskiego i jego zespołu stał się bardziej niebezpieczny, odkąd ten nie ma Intersektu w głowie ani wsparcia CIA. Gościnnie występują MARK HAMILL oraz CRAIG KILBORN.

As the team takes on a missing persons case, Chuck and company struggle to establish themselves as Carmichael Industries in the face of a rival security firm led by the tough and efficient Gertrude Verbanski. Meanwhile, Morgan continues to adjust to the Intersect while Chuck adjusts to being his handler. Also, the Buy More finds an unlikely spokesperson to help drum up business.

Bycie Intersektem pompuje ego Morgana, a Chuck przechodzi próbę jako jego opiekun i przyjaciel. Kapitan Awesome dokonuje odkrycia na temat Jeffa i Lestera. Gościnnie występuje CARRIE-ANNE MOSS.

Chuck i Sarah muszą odnaleźć zabójcę wśród pracowników podczas zjazdu sprzedażowego w Buy More. Jeff odsłania swoje odmienne oblicze. Gościnnie występują DAVID KOECHNER oraz CATHERINE DENT.

Chuck i Sarah mierzą się z Robyn Cunnings (REBECCA ROMIJN), bezwzględną kobietą szpiegiem, której nic nie powstrzyma. Tymczasem randka Ellie i Awesome'a przybiera niebezpieczny obrót.

Chuck i Sarah odkrywają, kto stoi za spiskiem dotyczącym zniszczenia Carmichael Industries. Tymczasem plany Ellie na idealne święta zaczynają się rozpadać. Gościnnie pojawia się STAN LEE.

Sarah natyka się na swojego pierwszego opiekuna, Kierana Rykera (TIM DeKAY) i obawia się, że skrzywdzi jej bliskich, w tym jej mamę (CHERYL LADD).

Gertrude Verbanski (CARRIE-ANNE MOSS) powraca z misją dla Chucka oraz propozycją dla Caseya. Wzmocniona inteligencja Jeffa sprawia, że razem z Lesterem zaczyna podejrzewać, że dzieje się coś niezwykłego.

Morgan stawia czoła konsekwencjom wydarzeń, w których uczestniczył jako Intersekt – musi poskładać w całość zapomniany weekend w Vail. Gościnnie występują BO DEREK oraz ANGUS MACFADYEN.

Sarah i Chuck muszą stawić czoła bezlitosnemu Nicholasowi Quinnowi (ANGUS MACFADYEN) na pokładzie japońskiego superszybkiego pociągu. Tymczasem przez wzgląd na misję Casey musi podjąć niemożliwą decyzję.

Po wstrząsającej misji Sarah powraca do Chucka z ogromnym sekretem. Tymczasem Ellie i Awesome otrzymują nową możliwość, która może zmienić ich losy. Gościnnie pojawia się ANGUS MACFADYEN jako Nicholas Quinn.

Odcinek finałowy: Chuck zatrudnia swoją rodzinę, przyjaciół oraz nieoczekiwanych sojuszników do powstrzymania Nicholasa Quinna (ANGUS MACFADYEN) przed zniszczeniem wszystkiego, na co Chuck pracował przez ostatnie pięć lat.