Coulson und die Vertreter von S.H.I.E.L.D. sind in der Zeit zurückgestoßen und 1931 in New York City gestrandet. Da der brandneue Zephyr jederzeit auf Zeitsprung eingestellt ist, muss sich das Team beeilen, um herauszufinden, was genau passiert ist.

Nachdem die Identität des Timeline-enträtselten "Threads" enthüllt wurde, führt die Mission des Teams, ihn um jeden Preis zu schützen, dazu, dass jeder Agent seine eigenen Werte in Frage stellt. Ist die Erhaltung der Zukunft der Welt, wie sie sie kennen, die Zerstörung wert, die sie verhindern könnten?

Ein überraschender Zeitsprung hat Henoch in 1931 gestrandet und das Team ist in einem weiteren unbekannten Jahrzehnt gelandet. Um zu verhindern, dass die Chroniken ihren neuesten Plan zum Abbau der Zukunft auf den zu Weg bringen, müssen die Agenten nun eine der sichersten Stützpunkte von S.H.I.E.L.D. infiltrieren.

Mit einem Chip auf der Schulter und einem Genre-Fehler in seinem System hatte Agent Phil Coulson eine Reihe von Ereignissen in Gang gesetzt, die hoffentlich die Zeitachse, wie wir sie kennen, bewahren und sicherstellen würden, dass diese lästigen Chroniken das Ende bekommen, das sie verdienen. Was könnte schiefgehen?

Nach einer holprigen Landung im Disco-Jahrzehnt vereint sich das Team - Daniel Sousa im Schlepptau - mit mehr als einem bekannten Gesicht beim S.H.I.E.L.D. Treffpunkt und erfährt genau, wie der neueste Plan der Chronicoms abgebaut werden kann. Aber wenn sie sich für Komfort zu nahe kommen, springt der Zephyr unerwartet wieder vorwärts, diesmal zu einem Datum, das nicht nur für die Zukunft von S.H.I.E.L.D. aber auch für die Zukunft von Regisseur Mack.

Der Einsatz ist höher als je zuvor.Das Team muss nach dem Aufgeben der Deckung und dem Schaden am Zephyr kämpfen, um Macks Eltern zu retten. f ... alles vor dem nächsten Zeitsprung. In der Zwischenzeit sind Daisy und Sousa gegenüber einem machtgierigen Nathaniel Malick und seinen Schlägern im Nachteil, und Coulson muss das tun, was er am besten kann, um die Zukunft zu retten.

Nachdem Mack 1982 unerwartet gestrandet war, zieht er sich in sein Elternhaus zurück, um den Tod seiner Eltern zu verarbeiten, während Deke sich an die Arbeit macht, um eine Gruppe neuer Agenten aufzuspüren. Ohne eine Ahnung zu haben, ob oder wann das Team für sie zurückkommt, scheint die Zeit endlich auf ihrer Seite zu sein ... zumindest bis die Killerroboter auftauchen.

Da der Zephyr-Zeitantrieb nicht richtig funktioniert, stürzt das Team buchstäblich auf eine Katastrophe zu, und Yo-Yo könnte ihre einzige Hoffnung sein. Das einzige Problem? Um ihre Kräfte zurückzugewinnen, muss sie die Hilfe eines alten Gegners in Anspruch nehmen und einen Teil ihrer Vergangenheit, der lange verborgen war, erneut betrachten.

Ein Zeitsturm verwüstet den Zephyr, treibt ihn in Richtung Zerstörung und zwingt Daisy und Coulson gleichzeitig, ihre fehlgeschlagenen Versuche, das Team zu retten, immer wieder zu wiederholen, bis sie eine Lösung finden oder vom Sturm verschluckt werden. Das Erreichen des nächsten Ziels erfordert Vertrauen, Mut und Opferbereitschaft von allen an Bord, aber es kommt darauf an, genügend Zeit zu haben.

Nachdem Henochs Opfer sie aus dem Zeitsturm gerettet hatt, kommt das Team 1983 an, wo Nathaniel und Kora hart daran arbeiten, eine Armee handverlesener anarchistischer Inhumanen im Jenseits aufzubauen. Als sich die Agenten trennten, um mehr Boden unter den Füßen zu haben, hat Daisy die Aufgabe, Jiaying zu beschützen, und ist gezwungen, ihre Mutter zum ersten Mal seit ihrem Tod zu konfrontieren. während die anderen schnell lernen, dass sie sich einem weiteren aufgeladenen ehemaligen Feind stellen müssen, um Malick aufzuhalten.

Sibyl und Nathaniel setzen ihren Kampf fort, um eine dunkle neue Zukunft für S.H.I.E.L.D. zu gestalten, und schaffen es, den Agenten auf dem Weg einen Schritt voraus zu sein. Wenn das Team dies ändern will, muss es kreativ werden und vielleicht sogar ein bisschen nicht von dieser Welt.

Mit dem Rücken gegen die Wand und Nathaniel und Sibyl rücken immer näher an der Beseitigung von S.H.I.E.L.D ran. Aus den Geschichtsbüchern geht hervor, dass sich die Agenten auf ihre Stärken verlassen müssen, um die Chroniken auszutricksen und zu überdauern. Dies ist ihr wichtigster Kampf, und es wird die Hilfe von Freunden und Teamkollegen aus Vergangenheit und Gegenwart erfordern, um zu überleben.