능력자를 자꾸 놓치는 팀. 한 발 앞서 움직이는 저들은 누구인가. 인휴먼은 어디로 왜 끌려간 걸까. 경쟁 조직의 등장에 긴장한 동료들과 달리, 피츠는 다른 데 정신이 팔렸다.

피츠에게 힘을 보태는 동료들. 외계인까지 동원됐으니, 모놀리스의 비밀이 밝혀질 날도 머지않았는가. 워드를 함께 끝장내자는 헌터의 설득에도 메이는 선뜻 나서지 않는다.

수배령이 내려지면서 링컨 체포는 이제 시간 문제. 팀에서 선수를 치려 하지만 링컨의 행방은 묘연하기만 한데. 피츠는 시몬스가 적응할 수 있도록 지극정성으로 곁을 지킨다.

인휴먼을 죽이는 인휴먼이 나타났다! 콜슨이 ATCU와 협상하면서 두 조직의 불편한 협조 수사가 시작되고. 메이는 워드를 향해 폭주하는 헌터를 보며 불안감이 엄습한다.

피츠에게 외계 행성에서 조난됐던 시간을 들려주는 시몬스. 무슨 일이 있었으며, 왜 돌아가야 하는지. 그리고 '그것'과 그 사람에 관한 이야기까지. 진실을 말할 때가 됐어.

앤드류 사건으로 돌아온 메이. 바비까지 현장에 복귀시켜 함께 워드와 하이드라 추적에 나선다. 데이지는 ATCU에서 정보가 샌 정황을 포착한다. 누굴까, 내부 첩자가.

진실을 확인하러 달려가는 메이, 쉴드에 인휴먼 괴물이 있다는 링컨. 모든 단서가 한 사람을 향하고 있다! 피츠는 시몬스의 전화기를 복구하다가 중요한 단서를 얻는다.

콜슨이 로잘린드와 가까워진 또 다른 이유. ATCU가 인휴먼을 확보하는 진짜 목적을 알아내라! 먹이사슬의 꼭대기에 다가간 워드는 하이드라의 진짜 목적을 알게 된다.

사랑하는 이를 잃고 복수를 결심하는 콜슨. 적을 알아야 이기는 법. 모든 기억을 동원해 워드의 심리를 분석하라. 그 사이 포털의 비밀을 아는 피츠와 시몬스가 납치됐다!

두 행성으로 나뉘어 결전을 치르는 쉴드와 하이드라. 포털을 통과한 이들이 외계 행성에서 쫓고 쫓기는 사이, 지구에서는 소장 대행인 맥을 필두로 구출 작전이 진행된다.

하이드라 제거 의지가 어느 때보다 강력해진 콜슨. 대통령을 접견하더니 맬릭에게 접근할 묘안이 떠오른다. 한편 생전 처음 보는 능력자의 등장에 분주해진 팀원들.

인휴먼 대책 회의를 앞두고 탤벗에게 손을 내미는 콜슨. 인휴먼 정보를 수집하고 맬릭의 첩자도 찾자고 제안하는데. 이때 탤벗을 뒤따르는 수상한 존재가 감시망에 잡힌다.

ATCU가 습격당했다. 인휴먼 증오 발언을 쏟아내던 워치독이 행동을 개시한 것. 추가 피해를 막으려면 조직의 근원부터 찾아라! 결정적 단서는 현장에 있을지도 모른다.

죽음의 미래를 보여주는 인휴먼이 나타났다. 그와 접촉하는 순간 데이지의 눈에 비친 끔찍한 영상. 어떻게든 이 미래를 바꿔야 한다. 데이지의 기억을 촘촘히 복기하라!

우리가 본 게 '그것'이었을까. 각자 흩어져서 그의 정체를 파악하는 데 집중하는 팀원들. 맬릭의 집에 나타난 하이브는 맬릭과 측근들 앞에서 처음으로 진짜 모습을 드러낸다.

비행기가 하이드라에 장악됐다. 각지에 흩어진 시크릿 워리어즈를 소집해 기지 탈환에 성공하는 데이지와 링컨. 그러나 아직 안심하긴 이르다. 우리 중에, 변절자가 있어!

기지 재정비가 한창인 가운데, 팀원들이 유전학 전문가를 찾아 루마니아로 향한다. 떠나간 동료를 되찾고 추가 피해를 막을 유일한 해법이 그의 머릿속에 들어 있으므로.

하이브의 야심이 윤곽을 드러내고, 그에 맞서 콜슨도 저격을 준비한다. 작전에서 빠지자 치료제 실험에 자원하는 링컨. 목숨을 잃어도 좋다, 친구를 구할 수만 있다면.

인휴먼 등록제가 발효되면 쉴드는 끝이다. 콜슨이 정부 설득에 나선 동안 하이브 공격을 맡는 메이. 하이브의 최종 목표를 알아낸 다음, 무슨 수를 써서라도 막아야 한다!

모든 무기가 하이브 수중에 있다. 미사일 발사를 무력화하는 데 실패하면 지구 초토화는 시간 문제. 후유증에 시달리는 데이지는 언제쯤 어둠에서 벗어날 수 있을까.

하이브가 깨어나면서 전쟁이 재개된다. 기밀까지 유출된 불리한 상황. 자신을 제물로 바친 팀원의 희생은 어떤 결말을 가져올 것인가. 끝날 때까지, 끝난 게 아니다.