Tras los eventos de The Avengers, el agente de S.H.I.E.L.D. Phillip Coulson crea un pequeño equipo de agentes para investigar un grupo hackers conocido como Marea Creciente. De este modo conoce a Michael Peterson, un hombre que ha adquirido poderes sobrehumanos.

Phillip Coulson y sus agentes de S.H.I.E.L.D. viajarán a Perú para investigar un objeto de origen desconocido, con el nombre en código 0-8-4. Al llegar allí, Coulson se reencontrará con una vieja conocida, Camilla Reyes, y descubrirá que toda la maniobra es una emboscada para controlar su avión y quedarse con el artefacto.

Cuando el Doctor Franklin Hall es secuestrado, Phillip Coulson y su agentes de S.H.I.E.L.D. deben correr contrarreloj para localizarlo. Skye es el único modo de llevar el equipo al límite cuando sus planes se vuelven del revés.

El agente Phillip Coulson y su equipo de S.H.I.E.L.D. intentan localizar a una misteriosa mujer que por su propia cuenta ha cometido numerosos robos de alto riesgo. Pero cuando se revela la identidad de la mujer, un secreto inquietante atenta con arruinar a Coulson.

Una chica difícil de alcanzar y en un vestido de flores podría ser la clave para el misterio que trae a Phillip Coulson y su equipo a Asia para rescatar a un joven hombre con un poder inusual y peligroso. Skye tiene un secreto que pone en peligro su relación con el equipo, junto cuando ellos más la necesitan.

Cuando cuerpos flotantes aparecen, Phillip Coulson y los agentes de S.H.I.E.L.D. deben cazar a un escurridizo asesino. Nadie está a salvo, ni siquiera el equipo.

Los secretos dividen al equipo y se pueden perder vidas.

Una reliquia amenaza con destruir a un miembro del equipo.

Una fuerza misteriosa persigue al equipo.

Coulson lleva la guerra de vuelta a Centipede.

Se revelan secretos cuando el equipo va a rescatar a Coulson.

Coulson y May descubren información sobre el pasado de Skye.

El equipo aborda un tren que parece encaminado a la muerte.

Coulson va al ataque para salvar a Skye.

Coulson y su equipo son atacados por Lorelei.

El equipo está ya muy cerca del Clarividente.

Coulson y su equipo no tienen a dónde ir.

Coulson corre para salvar la vida del amor de su vida.

Maria Hill regresa para ayudar a Coulson.

La traición de Ward y los secretos de HYDRA se revelan.

Oscuros secretos se revelan mientras Coulson y su equipo ponen todo en juego para detener a Garrett, Ward y a las fuerzas de HYDRA. Pero Coulson no será el único en perseguirlos, ya que contará con la ayuda de un antiguo aliado.