Plusieurs mois se sont écoulés pour les rescapés. Autour de Rick, ils continuent de lutter pour leur survie. Face à eux, les zombies se montrent plus féroces, plus nombreux et plus dangereux. Les hommes aussi sont une menace, en particulier le gouverneur, plein de rancune à l'égard de Rick.

Patrick tombe malade et, faute de soins adaptés, meurt rapidement. Peu de temps après, il se met à attaquer les survivants dans la prison. D'autres rescapés, atteints de la grippe comme Patrick, décèdent et se tranforment en morts-vivants. Pour sauver la communauté, Rick décide de mettre les malades en quarantaine...

L'épidémie de grippe n'est toujours pas maîtrisée. La plupart des survivants sont en quarantaine, y compris Sasha et Glenn. Face à l'urgence de la situation, Daryl décide de suivre les conseils de Hershel et d'aller récupérer des médicaments dans une ex-école vétérinaire, située à quelques kilomètres de la prison. Tyreese veut retrouver la personne qui a brûlé vif David et Karen...

Plusieurs mois se sont écoulés pour les rescapés. Autour de Rick, ils continuent de lutter pour leur survie. Face à eux, les zombies se montrent plus féroces, plus nombreux et plus dangereux. Les hommes aussi sont une menace, en particulier le gouverneur, plein de rancune à l'égard de Rick...

En attendant les médicaments, Hershel fait tout ce qu'il peut pour maîtriser l'épidémie, soignant les uns et achevant ceux qui se transforment en zombies. Rick rentre à la prison sans Carol, ce qui ne manque pas de susciter des interrogations parmi les survivants. Avec l'aide de Carl, il tente de repousser une horde de morts-vivants qui ont réussi à détruire le grillage...

À l'extérieur de la prison, les événements se précipitent. Un fait survenu dans un camp proche du pénitencier a des conséquences aussi graves qu'inattendues. Dans la prison, qui est devenue le refuge le plus sûr des survivants, l'arrivée de nouveaux rescapés provoque des tensions. La paix fragile qui règne entre les hommes est menacée...

Dans la prison, les survivants sont soulagés : le calme est revenu. Chacun baisse la garde, prêt à s'installer dans une certaine forme de normalité. Seul Rick se montre préoccupé. Malheureusement, le danger n'est pas loin. Le Gouverneur est en train de recruter des hommes pour lancer un assaut massif contre la prison...

Les survivants se sont séparés à la chute de la prison. Ceux qui sont demeurés dans le pénitencier mènent une vie presque parfaite. Mais d'autres sont en fuite dans les rues de Woodbury, en danger et vulnérables. Rick et Carl, eux, tombent par hasard sur une maison vide en pleine forêt, tandis que Daryl et Beth se rendent compte qu'ils sont observés par un mystérieux inconnu : une nouvelle menace pointe...

Les groupes de survivants, qui s'étaient dispersés, se rassemblent à nouveau à Woodburry. Malheureusement, il apparaît vite que le mystérieux tueur rôde peut-être encore dans les parages...

Dans la maison qui leur sert de refuge provisoire, Rick tente de retrouver des forces. Michonne et Carl en profitent pour aller chercher du ravitaillement. Rick s'assoupit, mais il est réveillé par des hommes en armes qui ont investi les lieux. Plus loin, Glenn et Tara sont en compagnie d'Abraham Ford, un ancien militaire, et de ses deux amis, Rosita et Eugene : selon Ford, Eugene doit rallier Washington à tout prix...

Perdus dans les bois peuplés de zombies, Beth et Daryl tentent de survivre : ils doivent échapper aux rôdeurs et trouver de quoi manger. Soudain Beth a envie de prendre un verre mais devant l'attitude sceptique de Daryl, elle doit s'employer à le motiver et à ne pas plonger dans le pessimisme ambiant...

Après avoir découvert une maison, dont les placards sont pleins de nourriture, Daryl et Beth pensent avoir trouvé un refuge sûr. De leur côté, Sasha, Bob et Maggie sillonnent les routes, en quête d'un lieu tranquille et sécurisant...

Tyreese, Carol, Lizzie et Mika découvrent une petite maison dans un endroit qui semble protégé du monde extérieur. Alors que le petit groupe décide de s'y arrêter pour reprendre des forces, Carol et Tyreese se rendent compte que Lizzie est particulièrement confuse dans son approche des morts-vivants. Elle continue de penser qu'ils sont inoffensifs et que l'on peut vivre avec...

Pendant que Daryl tente de s'adapter au groupe mené par Joe, Glenn et Tara décident d'emprunter un tunnel peuplé de zombies pour rejoindre plus rapidement le groupe de Maggie, après que Glenn a eu la confirmation que celle-ci est bel et bien vivante...

Protégée dans l'enceinte de la prison, la communauté des survivants s'est organisée au fil du temps. Au dehors, les zombies rôdent, mais ils ne sont pas la seule menace. Le Gouverneur, plein de rancune à l'égard de Rick, prépare sa vengeance.