Ο λαμπρός αλλά βαριεστημένος μαθητής λυκείου Light Yagami ξαφνικά βρίσκει τον εαυτό του να κρατάει τη δύναμη της ζωής και του θανάτου - τη δύναμη του Death Note. Αποφασίζει να απαλλάξει τον κόσμο από το κακό - σκοτώνοντας τους εγκληματίες έναν προς έναν. Όταν οι δολοφονίες αρχίζουν να συσσωρεύονται, ο ιδιοφυής ντετέκτιβ L αναλαμβάνει την υπόθεση και μια επική πνευματική μάχη ξεκινά.

Ενώ οι εγκληματίες του κόσμου συνεχίζουν να πέφτουν νεκροί, ο L συναντιέται μέσω υπολογιστή με εκπροσώπους από διάφορα έθνη. Ζητά να συσταθεί μια ειδική ομάδα στην Ιαπωνία, υπό την καθοδήγηση του Soichiro Yagami, του πατέρα του Light.

Ο Ryuk, Shinigami, ή ο θεός του θανάτου, ο οποίος έριξε το Death Note στον ανθρώπινο κόσμο, προειδοποιεί τον Light ότι κάποιος τον ακολουθεί. Ο Light προβληματίζεται που δεν μπορεί να ανακαλύψει την ταυτότητα του ιχνηλάτη του και ο Ryuk προτείνει μια καταπληκτική συμφωνία ...

Ο Light - τώρα γνωστός στον κόσμο ως Kira - δοκιμάζει το Death Note για να κατανοήσει το εύρος των δυνάμεων του σκοτώνοντας έξι καταδίκους με διάφορους τρόπους - και επιβεβαιώνει ότι μπορεί να ελέγξει τις ενέργειες των θυμάτων του πριν πεθάνουν.

Ο Soichiro Yagami ζητά να συναντηθεί με τον L προσωπικά όταν ανακαλύπτει ότι ο L έφερε κρυφά πράκτορες του FBI στην Ιαπωνία. Ο Light, εν τω μεταξύ, βρίσκει τρόπο να απομακρύνει αυτούς τους πράκτορες του FBI - μόνιμα ...

Ο Light συναντά μια γυναίκα στο Αστυνομικό Τμήμα με ένα επείγον μήνυμα για την ειδική ομάδα εναντίον του Kira. Ως γιος του επικεφαλής ερευνητή, ο Light ακούει την ιστορία της και ξαφνιάζεται όταν ανακαλύπτει ότι έχει πληροφορίες που θα μπορούσαν να οδηγήσουν στη σύλληψή του.

O Light χρησιμοποιεί το Death Note για να προσπαθήσει να απαλλαγεί από τη γυναίκα που θα μπορούσε οδηγήσει στην αιχμαλωσία του και σοκάρετε όταν δεν λειτουργεί. Συνειδητοποιώντας ότι πρέπει να του έδωσε ψευδώνυμο, έχει μόνο λίγα λεπτά για να ανακαλύψει το πραγματικό της όνομα προτού πει την ιστορία της στην ειδική ομάδα.

Ο L επιμένει να τοποθετήσει κοριούς και κάμερες στα σπίτια του αρχηγού Yagami και του αναπληρωτή διευθυντή Kitamura - τους οποίους παρακολουθούσε η Raye Penber. Αλλά ο Light είναι ένα βήμα μπροστά ως συνήθως - ξέρει ότι παρακολουθείται.

Οι δολοφονίες συνεχίζονται και ο L υποψιάζεται την υπερβολικά τέλεια συμπεριφορά του Light και αποφασίζει να τον ερευνήσει μόνος του. Για να τον πλησιάσει, ο L εγγράφεται στο ίδιο πανεπιστήμιο και αποκαλύπτεται.

Η υποψία του L για τον Light βαθαίνει, αναγκάζοντάς τον να προσκαλέσει το Light στην έρευνα. Στη συνέχεια, όμως, ένα τηλεφώνημα τους ειδοποιεί ότι ο Soichiro Yagami υπέστη καρδιακή προσβολή!

Όπως είχε προβλεφθεί στις κασέτες που στάλθηκαν στην Sakura TV, οι ειδήσεις και οι σχολιαστές που εξέφραζαν αμφιβολίες για τον Kira πεθαίνουν ένας προς έναν. Μετά από περαιτέρω έρευνα, ο L καταλήγει στο συμπέρασμα ότι αυτός ο Kira δεν είναι ο αρχικός - υπάρχει και ένας δεύτερος Kira!

Με τον δεύτερο Kira τώρα ελεύθερο, ο L ζητάει από τον Light να ενταχθεί στην ειδική ομάδα και να εμφανιστεί ως ο πραγματικός Kira για να πιάσει τον μιμητή. Ο Light συμφωνεί, ελπίζοντας να εκτρέψει την υποψία από τον εαυτό του. Προς έκπληξή του, o νέος Kira έχει μια ειδική ικανότητα που ακόμη και ο Light δεν έχει…

Ο Light πηγαίνει στο Aoyama για να ανακαλύψει την ταυτότητα της δεύτερης Kira πριν ο L γίνει πιο ύποπτος. Αλλά η Misa Amane, η νέα Kira, χρησιμοποιεί το ασυνήθιστο δώρο της για να βρει τον Light πριν την βρει εκείνος.

Ο Light και η Misa δείχνουν ο ένας στον άλλο τα Death Note τους, και ο Light ζητά από τη Misa να κάνει το shinigami Rem να σκοτώσει τον L. Αλλά η Misa ζητά από τον Light σε αντάλλαγμα να την ερωτευτεί!

Τα στοιχεία δείχνουν ότι η Misa Amane είναι η δεύτερη Kira. Σε μια προσπάθεια να την απαλλάξει, η Rem αναγκάζει τη Misa να στερηθεί την ιδιοκτησία του Death Note.

Η Misa βρίσκεται σε περιορισμό, αν και οι αναμνήσεις της για το Death Note έχουν εξαφανιστεί εντελώς. Όταν περιορίζεται και ο Light, οι δολοφονίες σταματούν και η καχυποψία για τον Light μεγαλώνει. Στη συνέχεια ξαφνικά, οι δολοφονίες συνεχίζονται.

Μετά από πενήντα ημέρες περιορισμού, οι δολοφονίες συνεχίζονται και οι Misa και Light απελευθερώνονται. Αλλά ο L έχει επινοήσει ένα σχέδιο για να διασφαλίσει ότι δεν θα συμβούν άλλες δολοφονίες, και βάζει τον πατέρα του Light, Soichiro, να πάρει τους δύο για μια βόλτα που μπορεί να είναι η τελευταία τους.

Αν και ο L εξακολουθεί να είναι καχύποπτος ότι οι αναμνήσεις των Light και η Misa, σβήστηκαν, επιστρέφουν στα κεντρικά γραφεία, όπου ο Light παρατηρεί μια περίεργη σχέση μεταξύ των πρόσφατων δολοφονιών του Kira και του Ομίλου Yotsuba.

Ο Matsuda, το μέλος της ειδικής ομάδας που έχει αναλάβει να παρακολουθεί τη Misa, είναι πρόθυμος να ξεχωρίσει, έτσι, ενώ σε μια δουλειά με τη Misa, αποφασίζει να ψάξει μόνος του στα γραφεία του Yotsuba Group στο Τόκιο.

Η ομάδα του L ανακαλύπτει ότι ο Όμιλος Yotsuba συναντιέται κρυφά για να συζητήσει την εξάλειψη ατόμων που ενοχλούν την εταιρεία τους, και καταλήγει στο συμπέρασμα ότι o Kira πρέπει να είναι ένα από τα οκτώ στελέχη.

Η ειδική ομάδα χρησιμοποιεί τη Misa ως τρόπο για να πλησιάσει την εταιρεία Yotsuba. Αλλά τα πράγματα γίνονται περίπλοκα όταν η Rem προσπαθεί να επικοινωνήσει μαζί της.

Χάρη στη Misa, η ειδική ομάδα γνωρίζει τώρα την ταυτότητα του νέου Kira και ο L σχεδιάζει ένα περίπλοκο σχέδιο για να τον κάνει να φανερωθεί.

Οι L, Light και Misa παρακολουθούν από το κτίριο της ομάδας και αναρωτιούνται σε ποιον μιλά. Ο L αναρωτιέται αν ο Higuchi μιλάει σε ένα shinigami. Η Rem πείθει τον Higuchi να πάει στο σταθμό, αλλά έχει τα δικά της εγωιστικά κίνητρα.

Ενώ ο Higuchi συλλαμβάνεται, ο Light ξαναβρεί ακούσια τις αναμνήσεις του ως Kira.

Ο Light, με την μνήμη του ανακτημένη, διατάζει τη Misa να αρχίσει να σκοτώνει μετά τον θάνατο του Χιγκούτσι. Η Shinigami Rem συνειδητοποιεί ότι όλα πάνε σύμφωνα με το σχέδιο του Light και ότι ο L θα συλλάβει τη Misa ως Kira-εκτός αν η Rem ενεργήσει γρήγορα.

Μετά το θάνατο του L, ο κόσμος χρειάζεται έναν νέο μεγάλο ντετέκτιβ. Μπορεί το ορφανοτροφείο Wammy, από όπου προέρχεται ο L, να βρει έναν νέο ντετέκτιβ που να μπορεί να ολοκληρώσει το κυνήγι του L για τον Kira;

Ένας νέος ερευνητής εμφανίζεται, ονόματι Near, μια κεντρική φιγούρα στο SPK, μια οργάνωση που προσπαθεί να πιάσει την Kira χωρίς να βασίζεται στον L. Ο Near γνωρίζει την ύπαρξη των Death Notes και θέλει να αποκτήσει ένα.

Ο Light, ενεργώντας ως L, αποκαλύπτει στον Near ότι η αδερφή του Sayu έχει απαχθεί από κάποιον που θέλει να την ανταλλάξει για το Death Note. Ο Near ανακαλύπτει ότι η ανταλλαγή θα γίνει στο Λος Άντζελες και υπόσχεται να βοηθήσει, ενώ σχεδιάζει κρυφά να κλέψει το Death Note και να συλλάβει τον Kira.

Ντροπιασμένος που άφησε το Death Note να πέσει στα χέρια του Mello για να σώσει την κόρη του, ο Soichiro βάζει τον εαυτό του σε κίνδυνο για να το πάρει πίσω.

Ο Mello μπαίνει στην έδρα του SPK για να ανακτήσει μια φωτογραφία του για να βεβαιωθεί ότι δεν θα σκοτωθεί από τον Kira. Σε αντάλλαγμα του Near που του δίνει την εικόνα, ο Mello λέει μια σημαντική υπόδειξη για τα Death Notes: ορισμένοι από τους κανόνες είναι ψεύτικοι.

Ο Near επικοινωνεί με την ιαπωνική ειδική ομάδα και διαπιστώνει ότι ο Kira είναι μεταξύ των μελών τους. Ζητά εμπιστευτικές πληροφορίες και ο Aizawa, που αρχίζει να αμφιβάλλει για τον Light, ανταποκρίνεται. Ο Near υποπτεύεται ότι το νέος L είναι πραγματικά ο Light Yagami και ότι ο Light είναι ο Kira.

Ο παρουσιαστής ειδήσεων Kiyomi Takada γίνεται ο εκπρόσωπος του Kira στον κόσμο, αφού Demegawa διαγράφεται από την Mikami, η οποία ήταν τυχαία η φίλη του Light στο κολέγιο. Οι υποψίες του Aizawa για τον Light μεγαλώνουν.

Ο Near πηγαίνει στην Ιαπωνία, ως δόλωμα για τον Kira. Ακολουθώντας τις οδηγίες του Light, η Takada ζητά από Mikami να στείλει πέντε σελίδες του Death Note. Της λέει ότι θα συνεχίσει τη δουλειά του σε ένα ψεύτικο βιβλίο που μοιάζει με πραγματικό.

Ο Aizawa καταλαβαίνει τι συμβαίνει και το λέει στο Near, που ήδη γνωρίζει τα notes. Ο Near δίνει εντολή στον Aizawa να συνεχίσει να παρακολουθεί τον Light και στη συνέχεια βάζει σε εφαρμογή το σχέδιο για να διαχωρίσει τη Misa από τον Light.

Η Ιαπωνική ειδική ομάδα και το SPK συναντιούνται επιτέλους στην αποθήκη YellowBox στις 28 Ιανουαρίου. Ωστόσο, ένα τρίτο πρόσωπο έχει έρθει επίσης στην αποθήκη, κατόπιν εντολής του Kira, για να σκοτώσει όλους τους άλλους εκεί.

Παρόλο που ο Mikami έγραψε όλα τα ονόματα των ερευνητών στο Death Note, περνάει ένα λεπτό και είναι όλοι ακόμα ζωντανοί. Ο Near κατασχά το Death Note του Mikami και όλα επιτέλους αποκαλύπτονται.