Уничтожив робота, Джонни необъяснимым образом исчезает. Он оказывается на стадионе, заполненном инопланетянами, где он предстал перед судом за преступления против Империи Кри, а Ронан Обвинитель выступает в роли судьи. Тем временем Бен пытается развлечь гостей на благотворительном мероприятии. Рида вызывают в качестве адвоката Джонни, а Бена и Сью вызывают в качестве свидетелей.

Четвёрка возвращаются с тушения пожара, который начал Джонни, Бен и Сью расстроены из-за него. Джонни извиняется, говоря, что сделает все, чтобы исправить это. Доктор Дум меняется телом с Ридом, вводя ему анестезию. Когда Рид застрял в теле Дума, он медленно сбегает из логова Дума. На следующий день Джонни просыпается и находит в своей комнате съемочную группу. Сью объясняет, что в качестве расплаты за вчерашний день за Джонни должен учавствовать в «День из жизни», чтобы зрители могли узнать, на что похож день из жизни Фантастической четверки. Когда Дум в роли Рида говорит Сью отменить лекции, трое понимают что что-то не так. Рид в роли Дума появляется в здании Бакстера, где его приветствуют четверо. Полагая, что он Дум, они ловят его. Рид в конце концов убеждает Сью доверять ему, и вместе они не дают Думу превратить здание Бакстера в оружие, а также возвращают свои тела обратно.

Рида обвиняют в преднамеренном воздействии космических лучей на Фантастическую четверку. Вскоре он узнает, что статья была изменена доктором Думом, который планирует открыть другое измерение.

Брюс Бэннер навещает Рида.Но Баннер превращается в Халка, и теперь Фантастическая четверка должна остановить его буйство в Нью-Йорке и уберечь его от захвата агентом Праттом, который хочет использовать Халка для своих собственных целей.

Скруллы выдают себя за соседей Фантастической четверки, чтобы собрать образцы тканей Фантастической четверки. В конце концов, командир Скруллов Кл’рт сообщает Ронану Обвинителю, что все образцы были собраны для него, чтобы он начал создавать величайшего воина, которого когда-либо знала вселенная.

Один из экспериментов Рида с микровселенной заставляет Фантастическую четверку уменьшиться, подвергая их риску, когда Г. Е.Р. Б.И. принимает их за паразитов и пытается их истребить. Когда дело доходит до лаборатории, Фантастической четверке помогает Человек-муравей.

Ситуация меняется к худшему, когда Джонни делает своей подруге Фрэнки несанкционированную экскурсию в лабораторию Рида. Фрэнки затягивается в другое измерение, Джонни идет за ней, чтобы никто не узнал. Но когда он это делает, через межпространственный портал появляется небольшая проблема.

Нэмор прибывает с указом, запрещающим человечеству выходить в Мировой океан. Сьюзен и Джонни уходят под воду, чтобы вести переговоры, но попадают в плен в Атлантиде.

Отчим Алисии получает запас глины, облученной от упавшего куска злополучной космической станции Рида, что позволяет ему управлять другими.

Кудесник доставлен на Землю одним из космических зондов Рида и немедленно начинает доставлять неприятности всем.

Доктор Дум крадет один из экспериментов Рида, направленных на восстановление Бена в человеческую форму, и заставляет Фантастическую четверку обмениваться силами друг с другом.

Фантастическая четверка попадает в Негативную зону, где они сталкиваются лицом к лицу с Аннигилусом. Как будто этого было недостаточно, прибывает Доктор Дум, похищая источник энергии Аннигилуса и угрожая Земле.

Человек-Крот использует Гиганто для нападения на Бакстер Билдинг в надежде заманить Фантастическую четверку в его подземное логово.

Фантастическая четверка проводит конкурс, победитель которого проводит день с Фантастической четверкой. Победителем стал фанат по имени Руперт Гик. Получив образцы тканей Скруллы теперь обладают технологией, позволяющей дублировать способности Фантастической четверки.

После похищения Бена Человеком-Кром он пытается заставить Существо объединить усилия с ним, чтобы создать подземный рай, где внешность не имеет значения.

Кукловод направляет город против Фантастической четверки контролируя его государственных чиновников, таких как мэр Нью-Йорка и начальник полиции.

Думботы вторгаются в здание Бакстера посреди ночи, но их атака - всего лишь отвлечение Доктора Дума, чтобы запустить здание в космос.

Reed finally cures the Thing, but the cure also takes away all of his memories since the formation of the Fantastic Four. When the Mole Man attacks, She-Hulk must fill in for the Thing while the powerless Ben Grimm must find a way to save the day.

The Fantastic Four return to New York to find that Doom has taken over the city and due to a change in history, they never got their powers. The Four must go back in time to set things right and to stop Doom.

The Sub-Mariner returns, but this time he needs help to defeat Attuma, who has taken over Atlantis. While Reed, Susan, and Ben head off to help free Atlantis, Johnny stays behind and faces an attack on the city from a giant mutant whale.

After several attacks from Iron Man suits, the Fantastic Four track down Tony Stark. It turns out Doom was behind the attacks, and now the Four have to face both Iron Doom and Iron Man under Doom's control.

During a confrontation with Diablo, Johnny is exposed to a potion that makes him more powerful. Unfortunately, the potion also begins to turn him evil.

The Grandmaster forces the Fantastic Four to battle Ronan the Accuser, Impossible Man, Annihilus, and Super Skrull. The fate of humanity depends on the winners of this mighty contest.

Доктор Дум создает супер-думбота, чтобы противостоять Фантастической четверке. Четверка пытается переучить этого робота, чтобы он стал одним из хороших парней. В конце концов, Бен становится другом супер-думбота и называет его «Громилой», но затем контроль Дума становится слишком сильным, и супер-думбот захватывает Сьюзан и Рида. Джонни и Бен должны спасти Сьюзен и Рида и сразиться с Думом.

Terminus, an alien scavenger, comes to steal all of Earth's resources. While the Fantastic Four try to stop him, they realize he may be unbeatable.