Magnus 1898-ban Londonig üldözte Adam Worthot, hogy megakadályozza abban, hogy megváltoztassa, és valószínűleg teljesen elpusztítsa a jövőt. Miközben azért küzd, hogy megállítsa Worthot, rejtve kell maradnia múltbéli énje előtt, és kerülni minden olyan lépést, amely megváltoztathatja a történelem eseményeit. Azt is ki kell találnia, hogyan térhet vissza saját jelenkori idővonalához.

Miközben az Üreges Föld továbbra is tömegesen érkeznek a felszínre az abnormálisok, Will, Henry, Kate és Nagyláb azon igyekeznek, hogy megakadályozzák a teljes háborút a Lotus biztonsági erőkkel. Mindeközben Magnus holléte és biztonsága miatt aggódnak, aki Praxis-ba tartott a város elpusztítása előtt.

Magnus egy távoli afrikai szigetre repül, hogy találkozzon a Menedék új szigorúan titkos tanácsadójával, de egy halálos túszhelyzet kellős közepébe csöppen.

A csapat egy abnormális szökevény nyomába ered, és rájön, hogy Tesla egy titkos kutatólaboratórium vezetője egy belbiztonsági ügynökségnél, amely abnormálisokon végez teszteket.

Will váratlan gondokba és személyes problémákba ütközik libériai Menedékbe tett utazása során. Ezalatt Magnust néhány szerencsétlen repülő abnormális segítségét kéri egy megkérdőjelezhető tervhez.

Amikor a brit Menedék csapata bajba kerül egy megrekedt jégtörőn a Bering-tengeren, Magnusnak és Willnek rá kell jönnie, hogy ki áll a rejtélyes tengeri események mögött.

Egy titokzatos abnormális megtámadja Abbyt. Magnus és Will pedig rájönnek, hogy csak egyféleképpen lehet kommunikálni ezzel a szokatlan ellenséggel, a zenén keresztül.

Pont akkor, amikor Magnus azt hitte, Adam Worth örökre eltűnt, ő és Tesla egy virtuális Menedék csapdájába esnek, ahol megtámadja őket Worth avatárja. Aki elhatározta, hogy belép a „valódi” világba.

Kate azzal a hírrel tér vissza az Üreges Földről, hogy a felkelők egy föld feletti célpontra fognak lecsapni és belső segítséget kaphatnak a Menedék Csapat egy megbízható tagjától.

Egy legendás abnormális elfogására indított küldetés során Will és Magnus megsérülnek, és egy barlangban rekednek Bolíviában. Itt szembesülnek a maguk és kapcsolatuk igazságaival. Henry videóleveleket rögzít egy különleges személynek, miközben egy találmányon dolgozik.

Magnust megkeresi az Üreges Föld egyik hírhedt vezetője. A segítségét kéri abban, hogy új otthont építsen a felkelőknek a felszínen. Azonban problémák merülnek fel, amikor a világ kormánya beavatkozik. Addison újraaktiválja Will szövetségi megbízását.

Az abnormálisok új szülőföldje immár nyíltan fenyegetés alatt áll. Henry és Tesla megtudja, hogy a SCIU fegyverré alakította Tesla munkáját, hogy az abnormálisok ellen használhassa. Nagyláb és Kate Caleb hatalomra jutását, Will és Abby pedig Magnus múltját vizsgálják.