ナゾの宇宙船に乗っていたのは、なんと子供たちだけだった。フリーザに故郷を滅ぼされた彼らは、悟飯たちをなかなか信じてくれない。その時、宇宙船がピンチに！悟飯たちは、子供たちと力を合わせて流星群から船を守る。その結果、誤解もとけて、再びナメック星を目指すことになるが、今度は宇宙潮流に巻き込まれ…。

宇宙潮流に巻き込まれた悟飯たち。潮流を乗り越えた先に、ついにナメック星らしき惑星を発見する。さっそくドラゴンボールを探そうとした悟飯たちは、ガケ崩れに襲われたところを、ナメック星人のライチとザークロに助けられる。親切なライチの手助けもあり、思っていた以上に順調にことは運んでゆく。

早くも３個のドラゴンボールを見つけた悟飯たち。一方、地球では悟空がケガを治して激しい特訓を開始。さらに、ベジータもフリーザの基地にたどりついて治療を受け、復活を果たしていた。悟飯たちのドラゴンボール集めはその間も順調に続き、さらに２個のドラゴンボールの入手に成功していた！

順調に、ナメック星でのドラゴンボール集めを進めてゆく悟飯たち。氷の洞窟内にあった６個目のドラゴンボールも、数々の難関を突破し、なんとか手に入れることに成功する。ついに、最後の１個がある場所を突き止めるが、そこにはライチとザークロが待ち構えていた。彼らの行動に隠された秘密とは…？

ライチとザークロは、悟飯たちの宇宙船をだまし取ろうとして、ナメック星人になりすましていた別の宇宙人だった。すんでのところで宇宙船を奪い返し、今度こそ本当のナメック星に到着した一行。しかし、時を同じくしてベジータもドラゴンボールを求め、ナメック星に到着した。悟飯たちに危機が迫る！

悟飯たちやベジータより一足先に、ナメック星に到着した一団がいた。永遠の命を得るために、ドラゴンボールを狙うフリーザ一味だ。同じ目的を持つベジータは、一味のキュイと闘い、かつては同等だった相手を難なく倒す。また、悟飯たちもフリーザの手下を一蹴するが、命綱の宇宙船を破壊されてしまう。

ドラゴンボールを探して、ナメック星を移動するフリーザ一味。悟飯とクリリンは、近くを通り過ぎるフリーザから身を隠すが、その強大な気に恐怖を覚える。一方、地球では、復活した悟空がベジータとフリーザの存在を聞きつけ、ブリーフ博士の改造した宇宙船でナメック星に急行しようとしていた。

フリーザたちの後を追う悟飯とクリリンは、ナメック星人の村に到着した。村を襲ったフリーザたちはドラゴンボールを渡すよう村人を脅すものの、それが通じないと知るや村人たちを殺し始める！長老は一味がスカウターを頼りに村を探していることを知り、スカウターを破壊するが、その抵抗に怒ったドドリアが…！

悟飯とクリリンを見失ったドドリアは、激怒し周囲を爆破!! ２人を抹殺したつもりでフリーザのもとへ戻ろうとするドドリアに、ベジータが不意討ちをかける。以前とはうって変わってベジータに全く歯が立たないドドリアは、フリーザこそが惑星ベジータを滅ぼした張本人であることを告白して命乞いをする。

悟空がナメック星に向かっていることをブルマから聞かされ、悟飯たちは大喜び。ところが、悟空の宇宙船に隕石が衝突し、ナメック星への軌道からずれて灼熱の惑星突入の危機に…！そのナメック星では、気を探る技も身につけたベジータが、フリーザたちを出しぬいて、残るドラゴンボールのある村へやって来ていた。

ベジータはナメック星人たちの村を襲い、力ずくでドラゴンボールを手に入れた。星の危機を知ったデンデは、悪の手から仲間を救ってほしいと悟飯たちに頼み込み、クリリンとともに最長老の家へ出発する。一方、宇宙船内で修行に励む悟空はピッコロたちが界王星に到着したという朗報に勇気づけられる。

界王はナメック星に感じる超特大の気の主を察知し、絶対フリーザには近づくなと悟空に警告する。暴虐の限りを尽くすフリーザの行状を聞いたピッコロたちは、より強くなろうと、界王のもとで修行させてもらうための課題・ダジャレに挑戦。その頃ナメック星では、ベジータが単独行動中のザーボンに闘いをしかけていた。

ベジータの猛攻により追いつめられたザーボンが、ついに真の力をあらわにする。醜悪な姿に変身し、強大なパワーでベジータを圧倒！絶対的な力の差を見せつけベジータを完膚無きまでにたたきのめし、フリーザへ報告に向かう。同じ頃、クリリンとデンデは最後のドラゴンボールを持つ最長老のもとへ到着していた。

最長老に面会したクリリンは、最後のドラゴンボールを受け取り、さらに自分の中に眠っている力を最大限に引きだしてもらう。一方、ドラゴンボールのありかを吐かせるため、ザーボンは息も絶え絶えなベジータをフリーザの宇宙船に連れ帰り、不本意ながらもメディカルマシーンでの治療を開始する。

界王星ではバブルスやグレゴリーを相手に天津飯たちの修行が続けられていたが、修行の成果に疑問を抱くピッコロは１人だけ参加しない。しかし、いざ組み手を始めると、ピッコロは以前より格段に上がったヤムチャの腕に驚く。一方ナメック星では、メディカルマシーンで治療を受けたベジータが復活を果たしていた。

ベジータがフリーザの宇宙船からドラゴンボールを奪って逃亡！一気にすべてを集めてしまおうと、最後の１つを持ってブルマのもとへと急ぐクリリンを追いかけるが、その追跡劇に気付いたザーボンも現れ、一触即発の危機に陥る。そのころ悟飯は、ベジータの隙をつき、池に沈めてあったドラゴンボールを手に入れていた。

クリリンのドラゴンボールを狙うベジータと、ベジータを追いかけてきたザーボンが、再び相まみえる。だが、変身後のザーボンをいともたやすくベジータは倒す。その強さに観念したクリリンは、最後のドラゴンボールを渡してしまう。同じ頃、宇宙船内の悟空は磁気嵐が原因で生じた100倍超重力と闘い続けていた。

惑星フリーザからギニュー特戦隊が発進！その目的地であるナメック星では、ドラゴンボールを持ってブルマのもとへ戻る悟飯が、ベジータに見つかってしまう。しかし、とっさの機転でベジータからドラゴンボールを隠しおおせた悟飯は、休むまもなく、潜在能力を引き出してもらうためにクリリンと最長老の家へ急ぐ。

フリーザが放った超特大のエネルギーが大地を震わせ、ブルマの持つ四星球が海中へ転落する。慌てて潜水艇で海中に潜ったブルマは、ドラゴンボールと無数の卵を守る巨大蟹と対決！なんとか無事にドラゴンボールを取り戻して地上に帰還するが、今度はフリーザの手下・ブールベリとラーズベリに捕まってしまう。

フリーザ配下のブールベリとラーズベリは、ブルマの話を聞き、ドラゴンボールを自分たちのものにしようと企み始める。ブルマは海にまだ残りのドラゴンボールがあると２人を騙して、潜水艇で海中を案内するが、途中で２人についた嘘がバレてしまう！その頃、宇宙船の中の悟空は100倍重力をも克服していた。

無事に修行を終えた悟空は、ナメック星での決戦に備えて宇宙船内で休息に入る。一方、クリリンと悟飯は最長老のもとへようやく到着するが、そこでベジータと遭遇。なんとか悟飯の能力を引きだすことに成功するものの、ベジータの力には及ばない。と、その時５つの大きな気が接近。もしや、この気の正体は…。

ついにナメック星に到着したギニュー特戦隊。倒すためにはドラゴンボールの力でベジータを不死身にするしかない…。ベジータと協力してドラゴンボールを集めるクリリンたちだが、あと一歩というところでギニュー特戦隊が現れてしまう。グルドVSクリリン＆悟飯、リクームVSベジータの闘いが始まった！

クリリンたちを獲物と決めたグルド。特戦隊の中では戦闘力の劣るグルドは、なんと時間を止める超能力を持っていた。それでもスピードをいかしてグルドを追い詰めるクリリンたちだったが、ついにはグルドの最終奥義である金縛りの術で動きを封じられてしまう。身動きの取れないクリリンたちは絶体絶命の危機に陥る！

不意討ちによりグルドを倒したベジータは、リクームとの対決に望む。パワー全開で先制攻撃をしかけるベジータだったが、戦闘力２万の攻撃もリクームには通用しない。パワフルな攻撃の前に瀕死状態となるベジータ。とどめのリクームイレイザーガンの攻撃にさらされたその時、クリリンの機転が彼を救う。

７つのドラゴンボールをすべて集めたフリーザは、願いをかなえる方法を突き止めるために最長老のもとへ向かう。一方、リクームに対して攻撃をしかける悟飯。全力を振り絞って闘うが、リクームは余裕の表情。渾身の力で放った魔閃光弾も片手で受け止められてしまう。そして、悟飯は遊び飽きたリクームによって…。

ついに悟空が到着。すべての状況を理解した悟空は、悟飯とクリリンだけでなくベジータにも仙豆を与えるのだった。３人が元気になったことを確認すると、リクームに対し１人で立ち向かう悟空。あまりにも落ち着いているその姿に不安を覚えるクリリンたちだったが、悟空はたった一撃でリクームを倒してしまう。

ジースとバータはスカウターで見た悟空の5000という戦闘力に油断して、攻撃を開始する。しかし、自慢のスピードを活かした直接攻撃を２人がかりで仕掛けても、一撃も当てることができない。格闘戦に不利を感じた２人は、ついに合体技であるパープルコメットボールを発動。多数の光弾が悟空を襲う！

ジースとバータに手を引かせるため、バータを一撃で気絶させて実力の差を見せつける悟空。その力に恐れをなしたジースは、ギニュー隊長のもとへ飛び去ってしまう。ジースを逃がしたことに憤慨するベジータは、バータとリクームにとどめをさし、悟空の甘さをののしる。一方、ギニューはジースの報告を受けて…。

ギニューの強さを認めた悟空は、クリリンと悟飯を逃がすために、ドラゴンボールの探索に向かわせる。それを見たベジータは隙をついて戦闘を離脱、クリリンたちの後を追いかけていってしまった。ただ１人ギニューたちに立ち向かう悟空。ギニューはその実力を確認するかのように、一騎打ちを仕掛けてきた！

18万にも達した悟空の戦闘力を見て、超サイヤ人の伝説が真実であったと恐れを隠せないギニュー。一方のクリリンと悟飯は、ドラゴンボール探索のためにブルマの隠れている場所に戻ったのだが、ブルマの姿はそこにはなかった…。そうした状況のなか、ついに最長老のもとにフリーザが到着してしまう。

デンデがクリリンたちに神龍を呼び出すための合い言葉を無事に伝えられるよう、ネイルはフリーザに対して時間稼ぎの闘いを挑む。また、悟空はギニューとの無益な闘いを避けるために圧倒的なパワーを見せつける！しかし、ギニューは不利な状況を楽しむかのように、なぜか自らを傷付け始める…。

ギニューと体が入れ替わってしまった悟空は、不慣れなうえに傷ついている体でギニューの後を追う。一方、悟飯とクリリンはフリーザの宇宙船で全てのドラゴンボールを発見するが、合言葉がわからずに神龍を呼び出すことはできない。そこに悟空の姿をしたギニューが到着。クリリンたちは悟空の登場に喜ぶが…。

悟空の体でパワーを全開にするギニューだが、戦闘力は思うように上がらない。悟飯たちの攻撃に、不慣れな体のギニューは大苦戦。しかし、体になれてくると形勢は逆転し、今度は悟飯たちがピンチに。そこにジースを倒したベジータが参戦。再び窮地に追い込まれたギニューは、ベジータとのボディチェンジを狙う。

ベジータとのボディチェンジが行われようとしたまさにその瞬間、２人の間に悟空が飛び込んだ。元の姿へと戻った悟空だが、そのダメージはあまりに大きく、最後の力をふりしぼったかめはめ波もギニューをとらえることはできない。再びベジータとのボディチェンジを狙うギニューに対し、悟空がとっさにとった策は…？