L'officier renégat Dolph Laserhawk et son partenaire Alex exécutent leur plan pour voler un gadget inestimable et quitter à jamais l'oppression d'Eden.
En mission pour mettre la main sur un dispositif high-tech, l'équipe de ghosts de la Directrice infiltre la forteresse de Pagan Min, le chef de la Triade.
Une nouvelle mission place Dolph et Alex sur la même trajectoire, tandis que les ghosts tentent d'empêcher les rancœurs anti-hybrides de dégénérer en carnage mortel.
Après un brusque changement de décor, la Directrice parle à Dolph de son histoire, de sa famille et de la sombre réalité qui se cache derrière les systèmes d'Eden.
Dolph passe du temps à la plage tandis que Rayman, désabusé, veut connaître la vérité. Marcus se demande s'il doit donner une seconde chance à une vieille ennemie.
Alors que l'exécution de Bullfrog approche, Dolph et Marcus doivent se battre contre le temps et un virus. Rayman élabore un plan et Sarah fait une proposition.