In het jaar 2066 verlaat de Republiek Hontworl, een medeoprichter van de Verenigde Naties, de organisatie zonder haar motieven uit te leggen. Dit veroorzaakt verontwaardiging binnen de VN en zet de veiligheid van de wereld op scherp. Kort na dit incident wordt Myori, de hoofdstad van de Republiek Triad, aangevallen door een vogelachtig, vliegend fort dat bekend staat als de Turtle King. De Internationale Wetenschapsorganisatie, onder leiding van Dr. Kouzaburou Nanbu, heeft de taak deze mysterieuze vijand aan te pakken. Tegelijkertijd verdwijnen de leidende wetenschappers van de ISO. De vijf leden van het Science Ninja Team, de Gatchaman-krijgers, worden opgeroepen om de zaken tot op de bodem uit te zoeken.

In the year 2066, the Republic of Hontworl, a charter member of the United Nations, leaves the organization without explaining its motives. This causes an outrage within the U.N. and places the security of the world on edge. Soon after this incident, Myori, the capital of the Republic of Triad, is attacked by a bird-like, flying fortress known as the Turtle King. The International Science Organization, which is headed by Dr. Kouzaburou Nanbu, is tasked to deal with this mysterious enemy. At the same time, the leading scientists of the ISO are disappearing. The five members of the Science Ninja Team, the Gatchaman warriors, are called upon to get to the bottom of things.

La squadra di Gachaman si ritrova affrontare una razza aliena di nome Galactor, intenzionata a distruggere un progetto che prevede l'unificazione delle risorse energetiche del mondo.

龙子之七十年代动画原作《科学忍者队》（台译《科学小飞侠》）的1994年重制的全3话OVA，梅津泰臣负责人设以及作画监督。

지구 정복을 노리는 비밀 결사 캐릭터에 맞서는 5명의 소년 특공대의 활약을 그린 애니메이션