Răpit de pirați moderni și declarat mort de compania lui, omul de afaceri Rokuro Okajima se alătură celor care l-au capturat, pe nava lor, Black Lagoon.

Rock pune la cale un plan pentru a distruge nava înarmată care pare să fi prins Black Lagoon într-o capcană. Între timp, Lagoon Company îl acceptă pe Rock ca nou membru.

Un gangster pe nume Chin îi atrage pe Dutch și pe cei din echipajul Black Lagoon într-o bătălie pe mare împotriva lui Luak, liderul unor pirați rivali.

În timp ce încearcă să recupereze un tablou valoros de pe un submarin eșuat, echipa este atacată cu rachete de o grupare neonazistă.

Rock și Revy găsesc tabloul pe submarinul scufundat, iar apoi se ceartă cu privire la continuarea jafului. Între timp, scufundătorii neonaziștilor se apropie de epavă.

Violentul raid făcut de Dutch și Revy pe vasul neonazist duce la descoperiri surprinzătoare despre Revy și despre misiunea Black Lagoon de recuperare a tabloului.

Echipajul Black Lagoon trebuie să livreze un ostatic unui cartel columbian, însă Dutch are o criză de conștiință atunci când află cine este băiatul.

În timp ce încearcă să fugă alături de Garcia, echipa Black Lagoon descoperă prea târziu că Roberta este un oponent formidabil pe care s-a pus recompensă.

Rock află adevărul despre trupele lui Balalaika când acestea intervin în confruntarea fără limite dintre Revy și Roberta.

În drum spre CIA, cu informații despre o organizație teroristă, echipa Black Lagoon este atacată de către teroriști.

La interogatoriu, Rock află adevărul despre Takenaka. Iar după ce reușește să evadeze, cu ajutorul lui Revy și Shenhua, el are parte de o surpriză și mai mare.

O serie de crime care au în obiectiv Hotelul Moscova îl determină pe Chang să organizeze o reuniune a capilor lumii interlope. Suspecții principali sunt doi copii, frați.

Rock și Chang află că gemenii sunt originari din România și pornesc în urmărirea acestora, intrând într-un joc letal de-a șoarecele și pisica.

Gretel o ia ostatică pe Eda și cere un vas cu care să fugă alături de fratele său. Între timp, Hansel înfruntă singur întreaga echipă a Balalaikăi.

Mafioții din Florida și vânătorii de recompense descind la Church of Violence în urmărirea falsificatoarei Greenback Jane, care vrea să devină adeptă.

Eda vrea s-o ajute pe Jane să scape de vânătorii de recompense, dar acțiunile ei, între care și evadarea din Black Lagoon, sunt zădărnicite la tot pasul.

Dutch și Benny încearcă salvarea lui Jane și a celorlalți, iar vânătorii de recompense se află în urmărirea lor, la sfârșitul căreia ies multe lucruri la iveală.

Rock și Revy o însoțesc pe Balalaika în Japonia, unde pun în scenă. dar și în pericol, misiunea de a elimina o bandă yakuza în numele alteia.

Se iscă dispute între Balalaika și clanul Washimine, iar Rock află amănunte șocante despre Yukio, fata pe care a întâlnit-o la festival.

Yukio este răpită în ziua în care preia controlul asupra grupului Washimine, iar Rock vrea să o salveze alături de Revy odată ce are acordul lui Ginji.

Revy și Ginji vor s-o salveze pe Yukio în lupta cu Chaka și oamenii lui. Apoi, Yukio îl critică pe Rock pentru că a încercat s-o salveze de viața de criminal.

Balalaika a distrus aproape complet grupul Washimine, dar Yukio află ceva despre strategia Hotelului Moscova și folosește asta în avantajul ei.

Rock încearcă s-o scoată forțat pe Yukio din lumea criminalilor, dar planul lui bine pus la punct poate scăpa de sub control din cauza unor evenimente neprevăzute.