Depuis l'arrivée de sa petite soeur Isabelle, Flore se sent rejetée. Jalouse et malheureuse, elle décide de quitter la maison.

Flore décide de réaliser un reportage sur la véritable histoire de la famille royale. Tout le monde au palais est paniqué, car les photos prises par Flore sont plutôt embarrassantes.

Pomme et Alexandre sont chargés de surveiller leur petite soeur, Isabelle, en l'absence de leurs parents. Mais absorbés par leurs jeux et distraits par leurs plaisanteries, ils en oublient leur mission et ne remarquent même pas la disparition de la cadette...

Babar a promis de récompenser celui qui lui rendrait les morceaux d'une vieille pièce de monnaie. Rataxès lui présente un morceau de la pièce et exige d'être nommé roi de Célesteville.

A l'occasion d'une visite au pays des rhinocéros pour fêter la signature d'un traité de paix entre les deux royaumes, Babar et Rataxès se disputent à nouveau. Ils doivent pourtant renoncer à se quereller et s'entraider pour sauver leurs enfants qui se sont perdus dans un labyrinthe.

Alexandre et Victor décident de se servir des épreuves père-fils lors d'un pique-nique familial, pour juger lequel des deux a le meilleur père. Les tricheries de Rataxès lui coûtent non seulement la victoire, mais également le respect de son fils.

Convaincu que le seul espoir de sauver Flore d'une piqûre de serpent réside dans la magie, Alexandre s'aventure sans hésiter dans la forêt à la recherche d'une vieille dame à la réputation de guérisseuse.

Accablé par les responsabilités, Babar souhaiterait, en son for intérieur, ne plus être roi. Lorsque son voeu est exaucé sans qu'il l'ait même exprimé, il est consterné. Célesteville est devenue Rataxèsville...

Quand oncle Arthur, le voyageur et explorateur, arrive au palais, ses histoires fabuleuses donnent de mauvaises idées aux enfants. Ils se retrouvent impliqués dans une aventure dangereuse sur les quais.

Une créature mystérieuse est aperçue dans le lac de Célesteville. Babar fait appel à un explorateur des mers pour l'aider à protéger le spécimen de Rataxès...

Babar montre soudain un comportement pour le moins étrange. Son entourage s'inquiète de sa santé quand il déclare que son attitude est due aux apparitions mystérieuses du fantôme du vieux roi des éléphants...

Babar part avec oncle Arthur et Zéphir pour revivre la vieille chasse au trésor de leur enfance. Comme à cette époque, Rataxès tente de les devancer.