Le Docteur, Vicki et Steven Taylor se retrouvent sur une planète silencieuse où ils croisent de petits robots que Vicki surnomme les Chumblies, et dont ils ignorent les intentions. Capturés par un des Chumblies, ils sont alors libérés par deux femmes guerrières qui paralysent l'un des robots et elles ramènent le Docteur et ses compagnons à leur quartier général. Ce sont les Drahvins, dont la planète Drahva se trouve dans la même galaxie que celle sur laquelle le TARDIS a atterri, la Galaxie 4. Les Drahvins sont des clones, génétiquement modifiés, qui ont pour seul but d'être soldats et d'obéir à une femme, menaçante et hautaine, qui a pour nom Maaga. La planète des Drahvins est présentée comme étant une race où un petit groupe d'hommes sert pour la reproduction, les autres étant tués. Maaga prétend être en guerre contre une autre race, les Rills, des reptiliens, qui sont les créateurs des Chumblies. Maaga cherche à obtenir le vaisseau des Drills pour retourner sur Drahva.

La planète va exploser dans quatorze aubes selon les Rills, qui ont proposé leur aide aux Drahvins. Mais Maaga décrit ces derniers comme étant des créatures sanguinaires qu'il faut exterminer, ce en quoi le Docteur ne croit pas. Steven et lui obtiennent alors de Maaga le droit de retourner au TARDIS pour faire quelques mesures, mais le verdict du Docteur est étonnant : il ne reste non pas quatorze, mais deux journées à la planète avant qu'elle se détruise.

Le Docteur et Steven retournent chercher Vicki restée avec les Drahvins. Mais un Chumbley tente de les empêcher de quitter le TARDIS et cherche à leur faire faire demi-tour. Une fois la voie libre, ils rejoignent le vaisseau des Drahvins, où Maaga leur demande de les aider. Devant leur refus, elle pointe sur eux une arme. Steven est pris en otage et le Docteur et Vicki sont envoyés par les Drahvins afin qu'ils aillent voler le vaisseau des Rills. Une fois à l'intérieur, ils sont tous deux impressionnés par la technologie de ceux-ci. En pleine exploration, Vicki aperçoit un des Rills qui les observe par une fenêtre.

Alors qu'ils tentent de fuir pour échapper aux Chumblies, le Docteur et Vicki sont séparés. La jeune fille est emmenée par les Chumblies et rencontre le chef des Rills. Il lui apprend par télépathie que ses intentions sont pacifiques, qu'ils ont proposé aux Drahvins leur aide, mais qu'elles l'on refusée et veulent le vaisseau des Rills pour elles seules. Comprenant que Maaga a menti au sujet des Rills, elle court donc en informer le Docteur qui était sur le point de saboter un convertisseur d'ammoniac, nécessaire aux Rills pour leur respiration. Une fois le malentendu dissipé, le Docteur leur apprend l'explosion imminente de la planète, et accepte d'aider les Rills à réparer leur vaisseau.

Pendant ce temps, Steven entend le plan des Drahvins et les discours de supériorité de Maaga. Il tente de s'échapper, mais se retrouve coincé par Maaga dans un sas, qui décide de l'enfermer et de le condamner à choisir entre étouffer ou se rendre.

Alors que Steven est sur le point de mourir de suffocation, le Docteur et Vicki arrivent avec des Chumblies pour le sauver. Les Chumblies forcent les Drahvins à rester dans leur vaisseau tandis que le Docteur et ses amis retournent auprès des Rills. Ils entreprennent alors de transférer de l’énergie du TARDIS vers le vaisseau des Rills pour leur permettre de décoller avant que la planète n'explose. Entretemps, le Docteur, Steven et Vicki voient la vraie apparence des Rills et en concluent que malgré leurs différences physiques, leurs peuples partagent la même philosophie. Au vaisseau Drahvin, Maaga et ses soldats parviennent à s'échapper et tentent d'attaquer le vaisseau Rill, mais les Chumblies réussissent à défendre le vaisseau assez longtemps pour qu'il décolle sans accroc. Un Chumbley réussit à ramener le Docteur et ses compagnons au TARDIS, qui se dématérialise peu de temps avant l'explosion de la planète, laissant les Drahvins seules face à leur fin.

Alors qu'elle se trouve dans le TARDIS, Vicki regarde une planète et demande ce qui s'y trouve. L'action se déplace vers une des jungles de cette planète où un homme semble obsédé par l'idée de tuer.

Sur la planète Kembel, trois astronautes terriens perdus cherchent à réparer leur vaisseau. L'un d'entre eux sera témoin d'une alliance secrète entre les Daleks et différentes races de l'univers dont le plan est de conquérir et détruire la galaxie, en commençant par la Terre.

Sur les champs de bataille de la guerre de Troie, Achille et Hector se battent en duel. Mais l'arrivée soudaine du TARDIS et l'apparition du Docteur déconcertent Hector, l'amenant à se faire tuer par Achille. Ce dernier prend le Docteur pour Zeus et lui offre l'hospitalité. Dans le campement grec, Agamemnon et Ulysse sont suspicieux par rapport à cette "apparition divine". Ils tiennent à ce que le Docteur les aide à gagner la guerre dans laquelle ils sont enlisés depuis dix ans. Les deux compagnons étant restés à bord du TARDIS, Steven décide de partir à la recherche du Docteur en laissant Vicki seule, mais "le Cyclope", un homme borgne à la solde d'Ulysse, le remarque et court l'annoncer à Ulysse. Celui-ci capture alors Steven, qui est considéré comme un espion troyen. Usant d'une ruse, le Docteur demande à le sacrifier dans son "temple" (le TARDIS), mais le lendemain matin, les grecs lui apprennent que celui-ci a disparu.

Lorsque le Docteur et Steven découvrent la disparition du TARDIS, Agamemnon ordonne à Ulysse de les tuer. Contraints de révéler leur véritable identité à Ulysse, celui-ci se montre sceptique avant de décider de leur laisser la vie sauve, à la condition qu’ils mettent au point un plan pour mener les Grecs à la victoire dans les deux jours à venir. Le TARDIS a été enlevé par Pâris qui y voit un présage des dieux, mais Cassandre est convaincue que le TARDIS, à bord duquel se trouve toujours Vicki, est un piège des Grecs. Elle demande alors qu’il soit brûlé, ce qui pousse Vicki à en sortir. La jeune fille est plutôt bien accueillie par le roi Priam et ses fils Troilus et Pâris. Voyant en elle une oracle, ils l'amènent chez eux et lui donnent le nom de Cressida.

Sommé de tuer Achille, Pâris rencontre Steven, qui a pris les armes du défunt Diomède et les deux hommes se combattent. Steven réussit à se faire faire prisonnier afin de pouvoir entrer dans Troie. Dans un mouvement de joie, Vicki le reconnait, ce qui ruine leur couverture.

Vicki et Steven sont conduits en cellule, ce qui n'empêchera pas Troilus de se rendre en prison pour voir Vicki et flirter avec elle. Dans le camp grec, le Docteur tente de soumettre à Ulysse l'idée d'une machine volante, mais cela conduit Ulysse à vouloir le faire voyager dans une catapulte. Bien qu'il s'était refusé à cette idée au départ, le Docteur finit par suggérer la construction d'un cheval de bois géant qui serait rempli de soldats et laissé en cadeau aux Troyens. Ils mettent leur plan à exécution : Ulysse réussit à convaincre Ménélas et Agamemnon de lever les voiles, tandis qu'il se place à l'intérieur du cheval de bois avec le Docteur et des soldats. Au petit matin, ayant vu les grecs en fuite, Pâris prend le cheval géant pour un présage des dieux et l’amène en ville. Les grecs étant repartis, Vicki est relâchée par Priam, tandis qu'elle voit le cheval de bois qui entre dans la ville malgré les cris de Cassandre.

Relâchée, Vicki libère Steven et le cache avec la complicité de Katarina, une servante de Cassandre qui était chargé initialement de surveiller Vicki. Celle-ci va retrouver Troilus, pour le persuader de quitter la ville. À la nuit tombée, le Docteur, Ulysse et les soldats grecs sortent du cheval et le Docteur tente alors de retrouver ses amis au milieu du pillage de Troie. Priam et Pâris sont tués et Cassandre a le temps de maudire Ulysse une dernière fois avant d'être promise à Agamemnon. Au-dehors de la ville, Troilus recherche Diomède mais ne trouve qu'Achille, un combat s'engage alors contre les deux hommes et Achille est tué.

Le Docteur retrouve Vicki et Katarina. Vicki quitte le TARDIS après avoir envoyé Katarina aller chercher Steven. Celui-ci a été blessé dans un affrontement contre un soldat troyen et pendant que Katarina le ramène dans le "temple", le Docteur et Ulysse se disputent une dernière fois. Le Docteur finira par faire disparaitre son vaisseau sous les yeux incrédules du roi d'Ithaque. Alors que Troilus voit Troie tomber sous les assauts des grecs, Vicki vient le rejoindre afin de le réconforter. Dans le TARDIS, le Docteur se retrouve avec Steven, délirant à la suite de ses blessures, et une Katarina persuadée d'être dans les limbes de la mort.

Année 4000, sur la planète Kembel, deux agents de la SSS, Kert Gantry and Bret Vyon font des recherches sur la disparition des agents Cory, Garvey et Lowery. Après avoir vu son partenaire se faire tuer par les Daleks, Vyon se retrouvera face au TARDIS, abandonné par le Docteur. Celui-ci est parti chercher un médicament et a laissé la garde de son vaisseau à un Steven gravement blessé et à une Katarina persuadée qu'elle est dans un temple divin voguant dans les limbes. Vyon tente de prendre le contrôle du TARDIS mais il se retrouvera finalement ligoté par l'équipage.

En parallèle de cet épisode, une émission de télé nous présente le gardien du système solaire, le tout puissant Mavic Chen qui semble avoir garanti la paix depuis plus de 25 ans. Prétextant partir pour une semaine de vacances, Chen s'en va pactiser avec les Daleks. Le Docteur aperçoit le vaisseau de Chen (un « Spar ») atterrir sur Kembel. Retournant au TARDIS, il le retrouve entouré de Daleks.

Alors que dans le TARDIS, Vyon collabore avec les compagnons du Docteur en leur livrant le moyen de soigner Steven, les Daleks mettent le feu à la jungle. En fuite, tous découvrent le Spar de Mavic Chen près des vaisseaux Daleks, ce qui étonne Vyon. Ayant assommé un leader extra-terrestre, Zephon, le Docteur se fait passer pour lui à la conférence. Il est alors témoin de la trahison de Chen : en échange d'une partie de l'univers, il offre aux Daleks un noyau composé exclusivement de Taranium (un métal extrêmement rare que l'on ne trouve que sur Uranus), vital pour faire fonctionner leur prochaine machine, le Destructeur Temporel. Entretemps, le réel Zephon se réveille et sonne alors l'alarme. Dans la confusion, le Docteur réussit à s'enfuir avec le Taranium. Ayant pris le Spar de Chen, Vyon est prêt à décoller sans attendre le retour du Docteur.

Le Docteur arrive in-extremis dans le vaisseau peu de temps après, tandis que les Daleks tuent Zephon estimant qu'il est responsable de ce désastre. Le Docteur, Steven et Vyon décident de prévenir la Terre de la trahison de Chen et de mettre le Taranium en lieu sûr, mais un vaisseau Dalek qui les a pris en chasse, les font changer de direction. Arrivant sur la planète prison de Desperus, le Docteur et Katarina réussissent à faire fuir des prisonniers qui tentent de mettre la main sur le Spar, pendant que Steven et Vyon réparent la panne. Alors que le vaisseau redémarre, l'un des prisonniers, Kirksen a réussi à s'introduire à l'intérieur et prend alors Katarina en otage.

La prise d'otage se déroule très mal et finalement, Katarina ouvrira un des sas ce qui l'éjectera dans l'espace ainsi que Kirksen. Si Steven pense que cet acte est accidentel, le Docteur explique tristement qu'il est plus probable qu'il s'agisse d'un sacrifice délibéré. Ils font route vers la Terre, mais hélas, Mavic Chen a déjà signalé Vyon comme étant un traître. En arrivant dans les locaux de la SSS, ils rencontrent un ami de Vyon, Daxtar, mais le Docteur ne tarde pas à se rendre compte que ce dernier travaillait pour Chen. Vyon ayant tué Daxtar, ils se retrouvent rapidement poursuivis par les gardes de la sécurité. Leur chef, la très zélée Sara Kingdom réussira à tuer Vyon avant de se mettre en chasse de Steven et du Docteur.

Sara poursuit le Docteur et Steven à l'intérieur d'un laboratoire de la SSS. Tous trois se retrouvent accidentellement dans une expérience de dissémination moléculaire et se font alors téléporter sur la planète Mira.

Prétendant avoir prévu cet accident, Mavic Chen donne aux Daleks la position du lieu où se trouvent Docteur et Steven. Sur Mira, Sara Kingdom (qui se révèle être la sœur de Vyon) est forcée d'aider le Docteur et Steven face à des créatures invisibles appelées les Visians. Le Docteur et Steven réussissent à convaincre Sara de la trahison de Chen et de son alliance avec les Daleks. C'est alors qu'arrive un vaisseau Dalek. Ces derniers réussissent à faire battre en retraite les Visians, mais se trouvent dangereusement proche du Docteur et de ses compagnons.

À la suite d'une nouvelle attaque des Visians contre les Daleks, le Docteur et ses compagnons réussissent à voler le vaisseau des Daleks. Celui-ci répond à un contrôle extérieur qui les force à ré-atterrir sur la planète Kembel. Réalisant que le temps presse, le Docteur tente de fabriquer un faux cœur en Taranium afin que les Daleks ne tombent pas sur le vrai. Au cours de l'expérience, Steven se retrouve chargé par une sorte d’énergie négative.

Sur Kembel, tous trois sont arrêtés par Chen qui négocie avec eux le cœur en Taranium. Ils s'enfuient après avoir leur laissé le faux cœur entre les mains de Steven, qui réussit à survivre aux tirs des Daleks grâce à l'énergie qui l’emplissait créant alors un champ de force autour de lui ; cette expérience le laissera toutefois inconscient.

Après avoir quittés Kembel, le TARDIS atterrit dans une zone que le Docteur estime totalement empoisonnée.

Le groupe semble avoir en réalité atterrit dans une Angleterre des années 1960, mais complètement polluée. Non loin d'un poste de police, ils sont arrêtés pour occupation interdite d'une cabine de police. Ils réussissent à s'enfuir et atterrissent au milieu d'un studio de cinéma muet des années 1920 où ils provoquent la pagaille (le Docteur est pris pour un spécialiste culturel et une actrice pense qu'elle va être remplacée par Sara). De retour au TARDIS, tous portent un toast à la fête de Noël.

Pendant ce temps là, les Daleks tentent d'utiliser leur Destructeur Temporel sur Trantis, un de leurs alliés qu'ils considèrent comme inutile. En présence de Mavic Chen et d'un autre de leur partenaire, l'expérience échoue. Chen en déduit que le Docteur les a dupé avec un faux cœur de Taranium et les Daleks décident alors de repartir à sa poursuite.

Après avoir atterri sur Terre lors d'un match de cricket, le TARDIS apparait sur Tigus, une planète volcanique. Là, ils se retrouvent piégé par le Moine, ce dernier ayant réussi à reprendre le contrôle de son vaisseau. Il bloquera la porte du TARDIS, les laissant prisonnier éternellement sur Tigus, mais le Docteur réussit à la rouvrir en utilisant le reflet du soleil sur sa bague.

Le Docteur et ses compagnons se retrouvent en Angleterre lors de la veille du jour de l'an 1966, tandis que les Daleks rejoignent le Dalek Suprême sur Kembel avec leur machine à voyager dans le temps.

Le TARDIS apparait dans l'antiquité Égyptienne, près des pyramides de Gizeh où le Docteur répare la serrure de son vaisseau, en attendant le retour du Moine. Partis inspecter les environs, Steven et Sara sont faits prisonniers par des gardes de la pyramide qui les prennent pour des pilleurs de tombes, pendant que Mavic Chen et les Daleks à la recherche du Taranium, massacrent des égyptiens. Ils tombent bientôt sur le Moine et le menacent afin qu'il leur livre le Docteur.

De son côté, le Docteur découvre le TARDIS du Moine et décide de changer sa forme afin qu'il ressemble à une cabine de police. Puis, apercevant le Moine, il décide de le suivre et l'entend donc comploter avec les Daleks. Le Docteur, faisant mine de n'avoir rien vu, continue de le suivre et se montre pour négocier avec lui. À l'intérieur de la pyramide, Steven et Sara échappent aux gardes, et se cachent dans une salle lorsqu'ils voient une étrange main enrubannée sortir d'un sarcophage.

Steven et Sara se retrouvent face à une momie qui s'avère être le Moine que le Docteur a emprisonné. Tous se retrouvent face aux Daleks et à Mavic Chen qui les prennent en otage en échange du cœur en Taranium. Annonçant par des haut-parleurs leur ultimatum au Docteur, ils intriguent la population locale qui les prennent pour des dieux. Lors de la négociation, le Docteur est forcé de redonner le cœur à Mavic Chen mais il réussit à prendre la fuite avec ses compagnons lors d'une révolte des égyptiens.

Le Moine retourne à son propre TARDIS. Son vaisseau l'ayant emmené sur une planète glacée, il s'aperçoit que le Docteur lui a volé son unité directionnelle et qu'il est contraint d'errer dans l'espace-temps (tout comme le TARDIS du Docteur). Le Docteur souhaite utiliser cette unité afin de retourner sur Kembel avant que les Daleks ne complètent le destructeur temporel, mais celle-ci provenant d'un TARDIS différent, il n'est pas compatible et grille lors du décollage.

Malgré le grillage de l'unité directionnelle (celle du moine appartenant à un modèle plus récent que celle du Docteur) le TARDIS a tout de même atterri sur Kembel. Non loin de là, les Daleks trahissent leur collaboration avec l'alliance galactique. S'aventurant dans la jungle, Steven et Sara perdent le Docteur et tombent sur une cité Dalek abandonnée dans laquelle ils retrouvent Mavic Chen et les membres de l'alliance galactique emprisonnés par les Daleks. Les ayant libérés, tous retournent à leur vaisseau, sauf le Spar de Mavic Chen qui explose au décollage.

À la recherche de la vraie ville des Daleks, Steven et Sara se retrouvent face à Mavic Chen, qui a simulé sa mort afin d'endormir leurs soupçons. Il les prend en otage et les emmène vers la cité secrète des Daleks.

Mavic Chen est persuadé que le Docteur cherche à le doubler et à prendre une place influente auprès des Daleks. Arrivant de façon arrogante auprès du Dalek Suprême, il se déclare chef de l'alliance galactique. Il déchantera vite en voyant que les Daleks ne lui obéissent pas et se fera exterminer dans un couloir. Cet évènement ayant distrait les Daleks, le Docteur a subtilisé le Destructeur Temporel et s'enfuit dans la jungle de Kembel avec Steven et Sara.

Alors que Steven se retrouve seul à rejoindre le TARDIS, Sara et le Docteur sont témoins des effets du Destructeur Temporel : la jungle se met à vieillir et à se changer en poussière et bientôt Sara est victime des effets du vieillissement accéléré. Tentant de protéger le Docteur coûte que coûte, elle s'écroulera à l'état de squelette non loin du TARDIS, tandis que le Docteur tombera inconscient. Sorti du TARDIS, Steven inversera involontairement le Destructeur Temporel, ce qui aura pour effet de ranimer le Docteur in-extremis et de faire flétrir les Daleks.

Le Destructeur Temporel rendu inutilisable, Steven et le Docteur rendent une dernière fois hommage à leurs compagnons morts et repartent dans le TARDIS.

Arrivant dans le Paris de 1572, Steven et le Docteur se rendent dans une taverne. Le Docteur décide d’aller rendre visite à un apothicaire du nom de Preslin, dont les recherches sur les microbes l'intéressent. Au moment où il sort, Steven aperçoit un homme qui le suit. Steven souhaite enquêter sur cette histoire, mais il est retenu par le propriétaire de la taverne qui veut qu'on le paye. C'est alors qu'une jeune servante Huguenote, Anne Chaplet, entre dans la taverne, poursuivie par des gardes. Celle-ci est au service de l'abbé d'Amboise et aurait entendu parler d'un massacre perpétré dans sa ville natale. Steven, ainsi que Gaston et Nicholas, deux huguenots avec lesquels il a sympathisé, décident de la protéger.

Le Docteur rencontre Preslin. Celui-ci se montre méfiant, pensant qu'il va être accusé d'hérésie, mais il se ravise lorsque le Docteur lui parle de science. Le Docteur n'étant toujours pas revenu à la taverne et le couvre-feu étant imminent, Steven accepte l'invitation de Gaston et Nicholas de dormir chez leur maître, l'amiral de Coligny. Un espion dans la taverne, Simon Duval, vient en informer l'abbé d'Amboise qui se trouve être le parfait sosie du Docteur.

Le lendemain, chez l’amiral de Coligny, Gaston et Nicholas, bavardent de la possibilité d’un massacre des huguenots par les catholiques dans les jours à venir à la suite des dires de Anne. Steven leur demande de l’aide pour se rendre à l’échoppe de Preslin et retrouver le Docteur. Mais, apercevant, par la fenêtre l’abbé d’Amboise, il le prend pour celui-ci. Gaston et Nicholas l’accusent alors d’être un espion catholique. Steven se rend donc chez Preslin avec Nicholas afin d'en avoir le cœur net, mais devant le témoignage des voisins qui jurent que la maison est vide, les doutes de Nicholas s'amplifient et Steven est forcé de prendre la fuite.

Pendant ce temps là, à la cour de Charles IX, l'amiral de Coligny persuade le roi de pouvoir faire alliance avec la Hollande contre l'Espagne. De retour d'une réunion avec la reine Catherine de Médicis, Simon, Roger Colbert et le Maréchal Tavannes parlent de la mort prochaine d'un traître qu'ils surnomment "the sea beggar" ("le mendiant des mers"). Steven surprenant leur conversation en informe Gaston mais celui-ci refuse de le croire et le chasse en sortant son épée. Cette insistance à vouloir faire de Steven un espion va dégoûter Anne, qui s’enfuira rejoindre Steven. Tous deux se cachent dans la maison abandonnée de Preslin. De retour de son entretien avec le roi, Coligny affirme à Gaston que le roi l'a surnommé "le mendiant des mers".

Après une nuit passée dans l’échoppe abandonnée de Preslin, Steven convainc Anne d'aller voir l’abbé, toujours persuadé qu’il s’agit du Docteur déguisé. Anne finit par accepter et déguise Steven, mais sur place, ils surprennent une conversation qui leur apprend que les catholiques vont tenter d’assassiner de Coligny. De plus, l'abbé ne semble pas reconnaitre Steven, mais celui-ci prend cela pour une feinte. Steven s’empresse d’aller prévenir Nicholas et ensemble, ils retrouvent de Coligny juste au moment où celui-ci se fait tirer dessus.

Le roi apprend la blessure de l'amiral en plein milieu d'une partie de tennis ce qui l'énerve furieusement, il comprend trop tard que la reine mère et Tavannes sont derrière tout cela et qu'ils accusent les huguenots d'être cause de l'instabilité du royaume. De retour chez lui, Coligny est soigné et sa vie n'est plus en danger mais il reste faible. Tenant l'abbé d'Amboise pour la cause de l'échec de cet attentat, le maréchal de Tavannes le fait tuer par ses gardes. Steven retrouve le corps de celui-ci dans la rue, pendant que la colère commence à gronder dans la ville contre ce meurtre que la foule attribue aux huguenots. Pris à partie par la foule, Steven s'enfuit, désespéré.

Steven retrouve Anne à l’échoppe et lui annonce la mort du Docteur. Ils cherchent ensemble les vêtements de celui-ci, espérant y trouver la clé du TARDIS, quand le Docteur, bien en vie, fait son apparition. Anne ayant parlé des fêtes de la St Barthélemy se déroulant le jour même, le Docteur lui demande l'année, fait le lien et l'envoie se cacher chez sa tante. Il enjoint Steven à le suivre et à retourner au TARDIS.

À peine sont-ils partis que le massacre des huguenots, planifié par la reine mère et par le maréchal Tavannes sous couvert de l'autorisation du roi, s'abat sur la ville de Paris. Dans le TARDIS, le Docteur explique à Steven le bilan du massacre de la Saint-Barthélemy auquel ils ont échappé. Steven reproche au Docteur sa passivité, mais celui-ci lui explique qu'il ne pouvait changer l'Histoire. Écœuré que le Docteur n'ait pas au moins sauvé Anne Chaplet, Steven lui demande de le débarquer à leur prochain voyage, sans même chercher à savoir où ils se trouvent. Le Docteur se retrouve alors seul, lorsqu'une jeune fille entre dans le TARDIS afin d'alerter la police sur un accident dont elle a été témoin. Le retour de Steven dans le TARDIS obligera le Docteur a décoller et à emmener la jeune fille avec eux. Elle dit s'appeler « Dodo », un diminutif pour Dorothée Chaplet, ce qui en ferait la descendante d'une Anne qui aurait donc réchappé au massacre.

Le TARDIS se matérialise dans une forêt où l'on trouve une multitude d'animaux terrestres venant de tous les continents. Dodo, pensant toujours être sur Terre, estime être dans une sorte de zoo, à Londres. Cependant, ils sont vite approchés par un groupe d'être humains, les gardiens, accompagnés par des Monoïds, des extraterrestres cyclopéens ayant leur œil à la place de la bouche ; les Monoïds étant au service des humains. Ils apprennent alors être à bord d’un immense vaisseau spatial qui a quitté la Terre à l'approche de l'an 10 000 000 lorsque celle-ci était sûr le point d'être détruite par le Soleil. Voyageant pour une durée de plus de 700 ans, les derniers humains et les Monoïds envisagent d'atteindre ensemble la planète Refusis.

Alors que le commandant du vaisseau est assez curieux de l'apparition de ces voyageurs venus d'un autre temps, un rhume contracté par Dodo, va infecter différents membres du vaisseau, humains et Monoïds, et commencer à tuer une partie d'entre eux.

À la suite de la pandémie qui commence à s'installer, les différents gardiens du vaisseau accusent le Docteur et ses compagnons d'être des extra-terrestres venus de Refusis pour infiltrer le vaisseau afin qu'ils ne puissent pas atteindre leur destination finale. Le Commandant étant touché par la fièvre, son second, Zentos, bien moins clément, entreprend de les juger. Alors que Steven tente d'assurer leur défense, la fièvre le touche et finit par s’effondrer. Alors qu'ils sont jugés coupables et près à être poussés par une foule en rage dans l'espace, le commandant intervient pour que le Docteur puisse trouver un vaccin en se servant de Steven comme d'un cobaye.

Finalement, grâce à l'aide des Monoïds, des gardiens et d'une partie des animaux ramenés par les humains, le Docteur trouve un remède. L'ensemble de l'équipage est guéri, alors que le Docteur et ses compagnons rentrent dans le TARDIS. Leur prochain voyage les conduit de nouveau à l'intérieur du vaisseau, 700 ans plus tard, et les Monoïds semblent alors avoir pris le pouvoir.

Emprisonnés, le Docteur et ses compagnons constatent que les choses ont bien changé : 700 ans se sont écoulés, le vaisseau – à présent appelé l’Arche – approche de Refusis. Les Monoïds parlent dorénavant et ils ont réduit les humains en esclavage. Leur chef, Un et son subalterne, Deux, souhaitent coloniser Refusis pour eux seuls et détruire les humains. Un envoie le Docteur, Dodo et Deux explorer Refusis. Là, ils tombent sur un château, dans lequel se trouve un être invisible qui leur explique que les Refusiens ont atteint un niveau de conscience supérieur et qu'ils ont préparé la venue de l'Arche depuis de nombreux siècles en aménageant leur planète pour accueillir les nouveaux venus. Cela n'empêche pas Deux d'avoir des volontés belliqueuses. Il tente d'alerter Un, mais son vaisseau est détruit par le Refusien. Le Docteur et Dodo n'ont alors plus aucun moyen de retourner à l'Arche.

À bord de l’Arche, Quatre, un des Monoïds commence à remettre en question les volontés guerrières de Un. Celui-ci souhaite que les Monoïds atterrissent tous sur Refusis pendant que dans l'espace, une bombe nucléaire, placée dans une statue géante de Monoïd explosera, détruisant la totalité de la civilisation humaine survivante. La tension commence à se développer lors de la découverte de la navette de Deux, détruite, au moment de l'arrivée des Monoïds sur Refusis. Une guerre civile éclate, tandis qu’à bord de l’Arche, les humains cherchent à localiser et à désactiver la bombe laissée par les Monoïds. Finalement, c'est le Refusien, que le Docteur aura laissé rentrer dans une des navettes, qui aidera Steven et Venussa, une des gardiennes à trouver la bombe et l'expulsera dans l'espace.

La guerre entre les Monoïds étant finie, le Refusien acceptera que tout le monde sur s'installe sur Refusis à la condition que les humains et les Monoïds vivent ensemble sans domination d'un peuple sur l'autre. Le Docteur et ses compagnons repartent dans le TARDIS, et tout semble se passer normalement quand, à la suite d'un éternuement, le Docteur se met à devenir transparent.

Une nouvelle épreuve commence pour Dodo et Steven, dont les adversaires ne sont autres que la famille de Cœur d’un jeu de cartes auquel le Fabricant de Jouets a donné la vie. Il s’agit pour eux de trouver la bonne chaise parmi les sept, six d’entre elles étant mortellement piégées. Lorsque le Docteur tente de leur donner la solution, le Fabricant lui enlève la capacité de parler. Ayant trouvé des poupées géantes, Dodo et Steven tentent de les mettre sur les chaises afin d'en tester le danger, mais sont doublés par le Roi et la Reine de Cœur qui tentent eux aussi de déterminer la véritable chaise. À la fin, Dodo s'assiéra sur une chaise piégée qui tentera de la geler, mais le Roi et la Reine s'étant tous deux assis sur une même chaise, le sort sera rompu. Steven et Dodo atteignent encore un faux TARDIS alors que le Docteur en est au mouvement 700. Tandis qu'ils découvrent une nouvelle énigme, ils sont poursuivis par des poupées ballerines.

Steven et Dodo arrivent à s'enfuir en passant la porte de la nouvelle épreuve. Ils se retrouvent à présent dans une cuisine, en compagnie de Mrs Wiggs et le Sergent Rugg, deux nouvelles créatures du Fabricant de Jouets destinés à les énerver. Ils doivent fouiller la cuisine de fond en comble pour trouver la clé de la porte qui mène à la piste de danse, la suite de l’épreuve. Le sergent, par bêtise, les aidera involontairement, et il ne tardent alors pas à trouver la fameuse clé, cachée dans une tourte. Ils ouvrent la porte et se retrouvent dans une salle de bal. Lorsqu'ils la traversent, ils ne peuvent s'empêcher de danser. Steven et Dodo réussissent à en réchapper en changeant de partenaire de danse et atteignent une nouvelle fois un faux TARDIS. Le Docteur en est au mouvement 902 lorsque ses deux compagnons se retrouvent face à Cyril, un homme étrange déguisé en écolier.

Le dernier jeu est une sorte de marelle. Chaque joueur doit lancer des dés pour avancer d’un certain nombre de cases et être le premier à atteindre l’arrivée. Face à eux, Cyril se montre exécrable et ne cesse de leur mettre des bâtons dans les roues, mais finalement, il finira par perdre en glissant sur sa propre poudre glissante. Steven et Dodo gagnent alors que le Docteur est à son avant-dernier mouvement. Le Fabricant le somme de finir la partie, ce que le Docteur ne veut pas, car cela pourrait entraîner la destruction de l'univers céleste et par conséquent, celle du Docteur et du TARDIS. Ils réussissent néanmoins à s'en sortir en s'enfuyant et en imitant la voix du Fabricant pour que le dernier mouvement soit amorcé.

Steven propose alors au Docteur quelques bonbons laissés par Cyril. En ayant avalé un, le Docteur se met à crier.

Le TARDIS se matérialise dans la ville de Tombstone, à l'époque du Far West. Après s'être fait interroger par le Shérif Wyatt Earp, le Docteur, ayant très mal aux dents décide d'aller voir l'unique dentiste de la ville, un certain Doc Holliday tandis que Steven et Dodo se rendent dans un saloon pour y réserver des chambres. À l’intérieur, les frères Clanton et Seth Harper les entendant parler du Docteur, pensent qu'il s'agit du Doc Holliday qu'ils cherchent à tuer. À la suite de quelques quiproquos, Doc Holliday a vent de cette méprise et, profitant de la situation, donne son arme au Docteur pour le faire passer pour lui. Alors que le Docteur se rend dans le Saloon de la dernière Chance, les Clanton forcent Dodo à jouer du piano et Steven à chanter.

Le Docteur entre dans le saloon où il est pris pour Holliday et se sent rapidement menacé. Alors qu’il tente d’expliquer pourquoi il est en possession de l’arme d’Holliday, il tire accidentellement, arrachant un pistolet de la main d’un des Clanton. Lorsque le shérif Masterson et le marshal Earp entrent à leur tour, ils arrêtent le Docteur. Pendant ce temps là, Holliday et sa compagne, Kate, ont pris Dodo en otage. Ils fuient la ville avec elle après qu'Holliday eut tué Seth Harper. Ce soir-là, Steven tente de faire évader le Docteur quitte à lui faire passer en douce une arme, mais le Docteur ne souhaite pas d'acte violent et en fait part à Wyatt Earp. À l'extérieur de la prison, les Clanton ont provoqué une émeute et menacent de pendre Steven si le Docteur ne leur est pas livré.

Les Clanton menacent toujours de pendre Steven si « Holliday » ne leur est pas remis, mais Wyatt Earp, sorti par derrière, a fait discrètement le tour de la foule et réussit alors à assommer Phineas Clanton au moment où celui-ci passait la corde au cou de Steven. Il libère ce dernier et calme la foule. Ayant mis Phineas Clanton en prison, il libérera Steven et le Docteur en leur demandant de quitter la ville, mais ceux-ci ne peuvent repartir sans Dodo. C'est alors qu'arrive Johnny Ringo qui lui aussi en veut personnellement à Doc Holliday pour une histoire de jalousie à propos de Kate. Ringo tuera Charlie, le barman du saloon, après que celui-ci l'ait reconnu. Ringo tombe alors sur Steven et le Docteur à la recherche de Dodo et se joint à eux.

Pendant ce temps là, Dodo réussit à forcer Doc Holliday à les ramener à Tombstone, tandis que le Docteur se retrouve avec Wyatt Earp, qui vient d'accueillir ses frères Warren et Virgil. Ringo, suivi par Steven, tombe sur Kate qui lui affirme que Doc Holliday est parti au Nouveau-Mexique. Content que Kate soit de nouveau "libre", il la menace pour qu'elle les rejoigne. À Tombstone, les frères Clanton feront évader Phineas, tirant mortellement sur Warren Earp au passage.

Le Docteur est nommé shérif adjoint de Tombstone en dépit de ses protestations. Wyatt et Virgil Earp découvrent leur frère Warren mourant, mortellement blessé par Ike et Billy Clanton. Wyatt décide alors d’en finir avec les Clanton et envoie Virgil leur transmettre le message au moment où Holliday revient avec Dodo et décide de se ranger au côté de Wyatt. Un affrontement se prépare alors à O.K. Corral entre les frères Earp et les frères Clanton, les uns aidés par Holliday, les autres par Johnny Ringo.

À la fin de la fusillade, Ringo et trois des Clanton seront tués tandis que Doc Holliday est en cavale. Wyatt Earp dégage le Docteur de ses obligations et lui, Steven et Dodo rejoignent le TARDIS. Lors de l'atterrissage, le Docteur affirme qu'ils sont arrivés dans le futur à un âge de prospérité sans précédent. Pourtant, le scanner ne montre qu'un homme sauvage qui s'approche dangereusement du TARDIS.

Le Docteur, Steven et Dodo arrive dans un futur lointain et sont accueillis par la civilisation avancée des Aînés. Ils commencent rapidement à suspecter qu'ils cachent un secret.

Le Doctor, Steven et Dodo étudient pourquoi il y a des Sauvages dans la cité des Aînés et découvrent le prix à payer pour cette société parfaite.

Le Docteur a été capturé et fait l'objet de la procédure d'extraction des Aînés. Steven et Dodo doivent revenir à la ville pour le sauver.

Le Docteur exhorte les Sauvages à mettre enfin un terme à l'oppression des Aînés et sollicite l'aide d'un allié improbable.

Le Docteur et Dodo sont revenus dans l'Angleterre de 1966. Un nouveau super-ordinateur, WOTAN, est sur le point d'y être lancé. S'étant approché trop près de celui-ci, Dodo devient comme possédée par la machine.

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