Delta City büszkesége, a Robotzsaru már a tizedik születésnapját ünnepli, az egész város hálás neki, hiszen sikeresen tartja féken a bűnözést. Lourdes és Sandra eközben egy terroristával próbál közös nevezőre jutni, aki egyelőre nem hajlandó tárgyalni velük és nem akar semmilyen kompromisszumot kötni. Az OCP Fogyasztói Termékközpontnál közben nagy gondok vannak, a cég ugyanis a pénzügyi összeomlás szélén áll, ám ismét van egy korszakalkotó tervük: létrehozni egy gépet, aminek önálló gondolatai vannak. Mielőtt tehát a Delta felszámolja őket, meg akarják valósítani az álmukat, a Saint nevű gondolkodó robotot. Cable-ről pedig kiderül, hogy ő a Delta főnöke és egyben a rettegett Csontgépezet is, aki sok terrorcselekmény miatt felelős

Robotzsaru nagyon megváltozott, amióta elveszítette főnökét és barátját, John Cable-t. Az eset óta hűvös, kimért és kegyetlen lett, munkáját brutálisan és erőszakosan végzi. Az OCP elveit ezzel megsérti, hiszen ők azt a teóriát vallják, hogy minél kevesebb erőszakkal oldják meg az egyes ügyeket. A cég ezért elhatározásra jut: mivel nem tudják a gépet jobb belátásra bírni, ezért deaktiválni kell. Murphy menekül a vadászok elől a régi Detroiton keresztül, és hamarosan sokkoló dolog történik vele. Viszontlátja barátját, Cable-t, de ő nem olyan már mint régen. Kiderül, hogy az OCP belőle is robotot gyártott, ám nem túl rokonszenves típust. Megkezdődik hát a harc a két gépezet között.

Az OCP új igazgatója, Damian Lowe teljesen SAINT bolondjává válik. SAINT egyfajta mesterséges értelem, ami arra született, hogy Delta Cityből egy komplett mechanikailag vezérelt és Lowe által irányított várost csináljon. Az őrült Dr. Kaydick közben pedig azt tervezi, hogy bio-vírusával megfertőzi SAINT-et, aki mind az embereket, mind a gépeket meg fogja semmisíteni. A Robotzsarunak egyetlen esélye van, hogy megmentse a város, ha saját magát is megsemmisíti.