Les trois protagonistes voyagent dans un monde antérieur au déluge de Noé, et un conteur leur raconte les événements du jardin d'Eden. En même temps, ils apprennent leurs propres leçons d'honnêteté et de vertu après avoir eu des ennuis avec un jardinier local du pays de Nod parce qu'ils l'ont trompé en le laissant manger quatre pommes gratuitement.

Le trio se retrouve à aider Noé et sa famille à construire l'arche. Ils parviennent à rejoindre l'équipage pour le long séjour à bord de l'Arche, aidant à soigner les animaux et à maintenir l'ordre. Ils montent à bord de l'Arche juste avant que les pluies n'arrivent pour noyer l'armée maléfique qui menace de brûler le vaisseau.

Le trio se lie d'amitié avec Joseph et apprend l'existence de son manteau aux multiples couleurs. Bien qu'ils ne soient pas en mesure de modifier les événements, ils apprennent la conspiration de ses frères. Alors qu'ils poursuivent Joseph pour savoir ce qu'il va faire pendant son séjour en tant qu'esclave en Égypte, ils trouvent un autre portail de la Porte du temps et font un bond en avant de 13 ans. Ils continuent à tomber sur ces portails afin de pouvoir, en un clin d'œil, être près de Joseph pour tous les événements importants de sa vie.

Tout en essayant d'éviter les problèmes, le trio se retrouve en Égypte pour assister à la confrontation entre Moïse et Aaron et Pharaon. Ils restent avec les Hébreux pendant toute la durée des dix plaies et participent à la première Pâque. Ils se joignent à l'Exode et assistent même à la séparation de la mer Rouge et à la noyade de l'armée de Pharaon.

En faisant un nouveau saut dans le temps, les voyageurs voient Josué et les Israélites tenter de vaincre la ville maléfique de Jéricho et de s'assurer un passage vers le pays de Canaan. Au début, Moki, soupçonné d'être un espion israélite, est capturé par l'armée de Jéricho. Derek et Margo trouvent refuge dans le camp israélite. Ils sauvent Moki juste avant que les Israélites ne prennent Jéricho.

Derek, Margo et Moki assistent à l'époque des Juges, et plus particulièrement au mandat de Samson. Ils apprennent que Samson était un homme fort et qu'il a fini par tomber aux mains de ses ennemis à cause d'une femme nommée Dalila.

Les trois hommes font un nouveau saut dans le temps et se retrouvent perdus. Alors qu'ils cherchent des informations, ils sont menacés par des animaux sauvages. Un jeune berger arrive sur les lieux et les sauve. Ils apprennent que ce berger se trouve être le futur roi David. Ils suivent David jusqu'à Jérusalem, où ils l'observent alors qu'il tente d'apaiser le mauvais caractère de Saül. Enfin, ils assistent à la défaite de Goliath.

Le trio de voyageurs dans le temps se retrouve à Babylone. Se distinguant immédiatement de la foule, ils sont soudain pris en amitié par le prophète Daniel. Il les accueille dans sa maison et leur donne des vêtements pour les aider à mieux s'intégrer. Un serviteur du roi leur propose des emplois, mais à contrecœur. Malgré quelques hésitations, le roi Belshazzar et le serviteur chargé de l'organisation de la fête acceptent d'utiliser des coupes volées dans le temple de Salomon pour la célébration. La main de Dieu, en colère, intervient après que le roi a utilisé les gobelets pour blasphémer, et écrit sur le mur les mots "Mene Mene Tekel Parsin", jurant la fin de Babylone. Daniel met en garde contre la signification de cette écriture, qui implique que la Perse et la Médie sont sur le point de co-conquérir la région. L'avertissement est ignoré. Belshazaar est assassiné et le roi mède Darius le remplace.

Quelque temps plus tard, les voyageurs se retrouvent en Perse dans la ville de Suse (Shushan dans la vidéo). Le roi Assuérus (également connu sous le nom de Xerxès Ier de Perse) est revenu d'une défaite humiliante contre les Grecs, la bataille de Platée, et décide d'organiser une fête. Esther et son vieux cousin Mardochée se lient d'amitié avec les voyageurs du temps et tentent de les aider à s'intégrer à la fête, en leur fournissant des vêtements. Les voyageurs confondent régulièrement leurs anciens hôtes avec l'argot et la terminologie technologique du XXe siècle. Lorsque la reine, Vashti, rejette une demande du roi en l'insultant, celui-ci se met en colère contre elle et demande le divorce, l'envoyant en exil.

Jonas raconte aux trois hommes ses tentatives pour échapper à sa vocation et comment il a fini par témoigner pour Dieu dans la ville de Ninive.

Tout en s'attirant des ennuis sur la place du marché de Jérusalem, les trois protagonistes apprennent l'arrivée de l'ange Gabriel auprès de la Vierge Marie. Ils savent que le moment de la naissance de Jésus est proche. Pendant qu'ils agissent, le roi Hérode devient hystérique à l'idée de l'arrivée d'un nouveau roi. Il passe son temps en se moquant des autres avec son singe. Avec l'histoire d'Esther et de l'arche de Noé, La Nativité est l'un des trois épisodes dans lesquels l'utilisation par les voyageurs de termes du XXe siècle laisse les autochtones perplexes (Margo fait référence à des "canettes de boisson gazeuse", ce que le propriétaire du chameau remet en question). Lorsque les mages arrivent au palais d'Hérode, celui-ci tente de les piéger pour qu'ils révèlent l'emplacement de l'enfant Jésus. Le plan échoue lorsque les mages décident de ne pas retourner chez Hérode. Les voyageurs du temps suivent de loin Marie et Joseph sur leur chemin vers Bethléem.

Les voyageurs du temps font un bond de quelques années en avant et rencontrent une version âgée du jeune homme ressuscité des morts dans la ville de Nain. Il leur raconte les événements entourant les différents miracles de la vie de Jésus.

Dernière étape des voyageurs du temps avant d'être renvoyés au 20e siècle, ils rencontrent Marc alors qu'il rassemble du matériel pour écrire l'Évangile de Marc. Il les informe des événements entourant le jardin de Gethsémané, des nombreux procès de Jésus devant Annas, Caïphe, Hérode et Pilate, ainsi que de la crucifixion et de la résurrection. Il termine en leur parlant de l'Ascension. Les voyageurs s'éloignent finalement en remerciant Marc pour ses informations.